Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0W7V8

Protein Details
Accession A0A4U0W7V8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-260ATSKSHPPYSLRRRRRRLGTSDHRDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
248-252RRRRR
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_nucl 7.5, mito 7, nucl 4.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047107  DNA-dir_RNA_pol1_lsu_C  
IPR045867  DNA-dir_RpoC_beta_prime  
IPR007081  RNA_pol_Rpb1_5  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003899  F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04998  RNA_pol_Rpb1_5  
CDD cd02735  RNAP_I_Rpa1_C  
Amino Acid Sequences ENRIRGDRKTNDITRFAFDDEKGDTCTFTLEYDSSTAKLLMLHLVENATRAALIQSVPGISTAILDEAATKDAAGVPILATSGVNIPAMWAFQNVLNPNHIYTNSIHALLLHYGVEAARAAIVIELQSVFGGHGISVDPRHLMLIADYMTRGGVYQSFSRMGYRGNPSPFMKMSFETTVGFLRDAVLEGEWDDLTNPSARIVTGSMAKVGTGGFDVLMGVRGSNAGGAEREEDGDATSKSHPPYSLRRRRRRLGTSDHRDALKEAEKASRFPFLTLAPELRNRLYRGLLLFHVSYACQPRSLAMCKAGSRGGVCTSEYVLKMKVASLCLEYFLDGLDVDALEESLPAEGLERWVEAAKIRFWRSWAGIMVFAMGSNSPGMGGRFESVEGSARV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.54
3 0.49
4 0.43
5 0.35
6 0.32
7 0.29
8 0.28
9 0.27
10 0.25
11 0.22
12 0.19
13 0.2
14 0.17
15 0.15
16 0.16
17 0.12
18 0.13
19 0.16
20 0.17
21 0.15
22 0.16
23 0.16
24 0.13
25 0.14
26 0.13
27 0.14
28 0.14
29 0.13
30 0.13
31 0.14
32 0.14
33 0.14
34 0.13
35 0.1
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.07
54 0.07
55 0.09
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.09
60 0.09
61 0.08
62 0.07
63 0.06
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.05
68 0.05
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.13
81 0.16
82 0.17
83 0.19
84 0.19
85 0.2
86 0.21
87 0.2
88 0.17
89 0.16
90 0.2
91 0.19
92 0.19
93 0.18
94 0.16
95 0.17
96 0.15
97 0.15
98 0.09
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.05
104 0.05
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.05
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.06
141 0.07
142 0.08
143 0.1
144 0.12
145 0.12
146 0.13
147 0.13
148 0.13
149 0.16
150 0.2
151 0.24
152 0.24
153 0.28
154 0.29
155 0.31
156 0.31
157 0.28
158 0.25
159 0.2
160 0.22
161 0.19
162 0.19
163 0.16
164 0.16
165 0.15
166 0.14
167 0.13
168 0.09
169 0.08
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.04
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.04
203 0.03
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.1
225 0.13
226 0.14
227 0.15
228 0.16
229 0.19
230 0.29
231 0.39
232 0.48
233 0.56
234 0.66
235 0.73
236 0.8
237 0.86
238 0.84
239 0.81
240 0.81
241 0.81
242 0.8
243 0.78
244 0.73
245 0.63
246 0.55
247 0.48
248 0.42
249 0.36
250 0.28
251 0.23
252 0.26
253 0.27
254 0.28
255 0.29
256 0.3
257 0.25
258 0.24
259 0.25
260 0.19
261 0.22
262 0.22
263 0.23
264 0.19
265 0.22
266 0.24
267 0.25
268 0.28
269 0.26
270 0.26
271 0.25
272 0.25
273 0.23
274 0.23
275 0.22
276 0.21
277 0.19
278 0.17
279 0.16
280 0.14
281 0.16
282 0.19
283 0.19
284 0.17
285 0.17
286 0.18
287 0.23
288 0.27
289 0.26
290 0.25
291 0.28
292 0.28
293 0.31
294 0.3
295 0.26
296 0.23
297 0.23
298 0.21
299 0.18
300 0.18
301 0.17
302 0.17
303 0.19
304 0.19
305 0.19
306 0.17
307 0.17
308 0.16
309 0.18
310 0.19
311 0.17
312 0.17
313 0.18
314 0.18
315 0.18
316 0.18
317 0.16
318 0.13
319 0.12
320 0.1
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.04
329 0.05
330 0.05
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.05
335 0.06
336 0.08
337 0.09
338 0.09
339 0.1
340 0.11
341 0.11
342 0.14
343 0.17
344 0.21
345 0.28
346 0.32
347 0.32
348 0.34
349 0.4
350 0.39
351 0.41
352 0.4
353 0.34
354 0.32
355 0.3
356 0.29
357 0.23
358 0.19
359 0.15
360 0.1
361 0.09
362 0.07
363 0.07
364 0.06
365 0.08
366 0.09
367 0.09
368 0.11
369 0.11
370 0.12
371 0.13
372 0.14
373 0.14