Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V5NEF6

Protein Details
Accession A0A4V5NEF6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-61NSDNRRKRKGDFPSDRQQYGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-50RKRK
62-78SRGGGRGRDDGKRNKKG
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001406  PsdUridine_synth_TruA  
IPR020094  TruA/RsuA/RluB/E/F_N  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
Amino Acid Sequences MEHSAAILEDARKAIDGDKPSDPRPQQADSQAVDYESERQQNSDNRRKRKGDFPSDRQQYGSRGGGRGRDDGKRNKKGDMGRGDYFRDGPDKRQKTHESRQKHEAAGTSSTYGVAYSKEEIDAEERRPKRKVAVLIGYSGTGYKGMQITPTERTIEGDLFQAFIKAGAISKANADDPKKAGLVRCARTDKGVHAAGNMISLKLIVEDDSIVEKINAELSGQIRVWGIERTIGSFSCYQACDSRWYEYLIPSHAFLPPHPSSWLAKKMEEAADEVGNRGGYEERQAEVKGFWEDVDQGDVKRVLDGIDEDIKWDVVKALQGEDEAGAKVVPVDADVEGLLRAGKSVSGGQEVGGGGDEKTEEAVIIITQPSSTNDKASTADGAAASEAAKSSTISAQNDNSASIPDAMVDSVISLPPKDGKPDNAEQTAAVTDTANNPADTESTNDSAATRPEEDAADVENTM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.19
3 0.23
4 0.25
5 0.33
6 0.37
7 0.4
8 0.49
9 0.48
10 0.5
11 0.51
12 0.5
13 0.48
14 0.5
15 0.54
16 0.46
17 0.47
18 0.4
19 0.35
20 0.32
21 0.27
22 0.25
23 0.23
24 0.27
25 0.24
26 0.24
27 0.3
28 0.37
29 0.47
30 0.53
31 0.58
32 0.62
33 0.71
34 0.77
35 0.76
36 0.78
37 0.78
38 0.79
39 0.8
40 0.78
41 0.8
42 0.8
43 0.76
44 0.69
45 0.61
46 0.53
47 0.49
48 0.47
49 0.4
50 0.36
51 0.37
52 0.4
53 0.4
54 0.42
55 0.41
56 0.42
57 0.47
58 0.54
59 0.62
60 0.66
61 0.66
62 0.63
63 0.65
64 0.64
65 0.65
66 0.64
67 0.6
68 0.56
69 0.57
70 0.56
71 0.51
72 0.45
73 0.37
74 0.35
75 0.3
76 0.34
77 0.41
78 0.45
79 0.46
80 0.54
81 0.62
82 0.64
83 0.73
84 0.73
85 0.71
86 0.71
87 0.77
88 0.73
89 0.66
90 0.59
91 0.52
92 0.47
93 0.41
94 0.36
95 0.28
96 0.22
97 0.21
98 0.18
99 0.14
100 0.11
101 0.08
102 0.09
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.11
108 0.15
109 0.17
110 0.2
111 0.28
112 0.31
113 0.35
114 0.38
115 0.39
116 0.4
117 0.44
118 0.46
119 0.45
120 0.5
121 0.46
122 0.46
123 0.45
124 0.39
125 0.33
126 0.25
127 0.17
128 0.09
129 0.08
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.1
134 0.12
135 0.14
136 0.17
137 0.19
138 0.19
139 0.18
140 0.19
141 0.19
142 0.18
143 0.16
144 0.15
145 0.13
146 0.12
147 0.11
148 0.1
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.09
159 0.11
160 0.14
161 0.16
162 0.17
163 0.18
164 0.2
165 0.2
166 0.2
167 0.19
168 0.24
169 0.3
170 0.3
171 0.35
172 0.37
173 0.36
174 0.38
175 0.38
176 0.31
177 0.29
178 0.29
179 0.22
180 0.19
181 0.19
182 0.17
183 0.18
184 0.16
185 0.1
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.06
205 0.07
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.11
221 0.12
222 0.12
223 0.12
224 0.12
225 0.13
226 0.14
227 0.17
228 0.18
229 0.2
230 0.18
231 0.2
232 0.2
233 0.21
234 0.21
235 0.18
236 0.17
237 0.15
238 0.15
239 0.15
240 0.14
241 0.12
242 0.18
243 0.17
244 0.18
245 0.18
246 0.19
247 0.19
248 0.24
249 0.32
250 0.26
251 0.25
252 0.25
253 0.28
254 0.27
255 0.26
256 0.22
257 0.16
258 0.16
259 0.15
260 0.15
261 0.12
262 0.1
263 0.09
264 0.08
265 0.07
266 0.06
267 0.09
268 0.1
269 0.1
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.12
274 0.13
275 0.11
276 0.1
277 0.1
278 0.09
279 0.1
280 0.09
281 0.11
282 0.1
283 0.09
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.11
288 0.11
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.1
293 0.13
294 0.12
295 0.13
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.11
300 0.09
301 0.06
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.1
308 0.09
309 0.1
310 0.08
311 0.07
312 0.06
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.04
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.05
331 0.08
332 0.09
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.13
337 0.13
338 0.12
339 0.1
340 0.09
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.05
345 0.06
346 0.06
347 0.05
348 0.04
349 0.05
350 0.05
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.1
357 0.15
358 0.16
359 0.17
360 0.18
361 0.19
362 0.21
363 0.21
364 0.2
365 0.15
366 0.16
367 0.14
368 0.13
369 0.11
370 0.1
371 0.09
372 0.07
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.08
378 0.13
379 0.18
380 0.2
381 0.24
382 0.25
383 0.28
384 0.29
385 0.28
386 0.23
387 0.2
388 0.19
389 0.16
390 0.14
391 0.1
392 0.1
393 0.09
394 0.09
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.08
399 0.09
400 0.08
401 0.1
402 0.15
403 0.17
404 0.22
405 0.25
406 0.3
407 0.37
408 0.45
409 0.5
410 0.47
411 0.46
412 0.41
413 0.39
414 0.34
415 0.27
416 0.19
417 0.12
418 0.11
419 0.13
420 0.18
421 0.18
422 0.17
423 0.17
424 0.17
425 0.18
426 0.17
427 0.19
428 0.19
429 0.19
430 0.2
431 0.2
432 0.2
433 0.21
434 0.23
435 0.23
436 0.2
437 0.19
438 0.2
439 0.21
440 0.21
441 0.2
442 0.2