Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0XWN1

Protein Details
Accession A0A4U0XWN1    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
385-412DVGGEKQKVTKKRPSTESKTKKAKKVKTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-53KKRKSTGEAAAAASKKVKTAKSASKPAPLKSALKKAVPKDEVAAKK
73-106KSVREKAVKEKPVKVSKESVKEKSVKASKVKAPK
280-323GRRKKPAPRNKMEGGALKRGKVREQWEKKIGVEEKKRAEKAGKL
392-412KVTKKRPSTESKTKKAKKVKT
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 12, mito_nucl 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MATQTVTKKRKSTGEAAAAASKKVKTAKSASKPAPLKSALKKAVPKDEVAAKKVKTGETSEEQSVKQRTVGEKSVREKAVKEKPVKVSKESVKEKSVKASKVKAPKQPAEEGAEPADAPAALQDAADRGAALTEDQTAALIAGFSSSEDEAEDDEADGVAISKLPQVPSLGDVRQRIKDATTADPERTPGVVYVGRIPHGFYEPQMRAYFSQFGTISNMRLARNRKTGKSQHYAFVEFSSKAVAEIVAKTMDKYLLFGHIMQVRTVPREQIKENMWDGTGRRKKPAPRNKMEGGALKRGKVREQWEKKIGVEEKKRAEKAGKLREMGYEFEMPGLKAVSEVPLKAKAVEDGAAVDAEGTAKEVEEMEEPKEVLAESSAAIETPVDVGGEKQKVTKKRPSTESKTKKAKKVKT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.63
3 0.6
4 0.61
5 0.53
6 0.48
7 0.43
8 0.34
9 0.29
10 0.32
11 0.31
12 0.32
13 0.4
14 0.49
15 0.55
16 0.65
17 0.66
18 0.7
19 0.72
20 0.68
21 0.67
22 0.61
23 0.59
24 0.58
25 0.63
26 0.59
27 0.61
28 0.65
29 0.63
30 0.69
31 0.63
32 0.56
33 0.51
34 0.54
35 0.52
36 0.5
37 0.5
38 0.4
39 0.43
40 0.45
41 0.43
42 0.37
43 0.35
44 0.38
45 0.37
46 0.42
47 0.41
48 0.4
49 0.39
50 0.42
51 0.41
52 0.35
53 0.31
54 0.32
55 0.31
56 0.35
57 0.42
58 0.43
59 0.47
60 0.51
61 0.57
62 0.56
63 0.53
64 0.5
65 0.51
66 0.54
67 0.55
68 0.57
69 0.56
70 0.62
71 0.7
72 0.71
73 0.66
74 0.65
75 0.64
76 0.68
77 0.67
78 0.63
79 0.61
80 0.62
81 0.6
82 0.61
83 0.6
84 0.56
85 0.55
86 0.58
87 0.57
88 0.63
89 0.68
90 0.67
91 0.68
92 0.68
93 0.67
94 0.64
95 0.6
96 0.56
97 0.5
98 0.44
99 0.36
100 0.3
101 0.24
102 0.2
103 0.16
104 0.09
105 0.07
106 0.06
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.04
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.06
150 0.07
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.11
156 0.15
157 0.14
158 0.17
159 0.21
160 0.23
161 0.24
162 0.25
163 0.24
164 0.21
165 0.23
166 0.22
167 0.22
168 0.25
169 0.25
170 0.24
171 0.24
172 0.24
173 0.22
174 0.19
175 0.15
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.13
181 0.13
182 0.14
183 0.13
184 0.14
185 0.12
186 0.13
187 0.12
188 0.09
189 0.16
190 0.15
191 0.19
192 0.19
193 0.19
194 0.18
195 0.2
196 0.23
197 0.16
198 0.18
199 0.15
200 0.15
201 0.19
202 0.18
203 0.17
204 0.16
205 0.18
206 0.15
207 0.21
208 0.24
209 0.25
210 0.34
211 0.38
212 0.39
213 0.45
214 0.52
215 0.55
216 0.59
217 0.56
218 0.52
219 0.5
220 0.49
221 0.41
222 0.35
223 0.3
224 0.22
225 0.2
226 0.15
227 0.12
228 0.1
229 0.09
230 0.08
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.11
244 0.11
245 0.14
246 0.17
247 0.17
248 0.16
249 0.19
250 0.17
251 0.19
252 0.2
253 0.2
254 0.2
255 0.24
256 0.25
257 0.28
258 0.29
259 0.31
260 0.32
261 0.29
262 0.25
263 0.23
264 0.23
265 0.29
266 0.34
267 0.31
268 0.34
269 0.39
270 0.48
271 0.57
272 0.67
273 0.67
274 0.67
275 0.73
276 0.72
277 0.71
278 0.66
279 0.63
280 0.57
281 0.56
282 0.49
283 0.44
284 0.44
285 0.41
286 0.41
287 0.39
288 0.42
289 0.44
290 0.51
291 0.57
292 0.6
293 0.6
294 0.57
295 0.6
296 0.58
297 0.57
298 0.56
299 0.56
300 0.58
301 0.64
302 0.64
303 0.59
304 0.57
305 0.55
306 0.57
307 0.6
308 0.57
309 0.5
310 0.51
311 0.52
312 0.5
313 0.44
314 0.38
315 0.29
316 0.23
317 0.23
318 0.23
319 0.17
320 0.16
321 0.14
322 0.1
323 0.09
324 0.09
325 0.12
326 0.12
327 0.13
328 0.15
329 0.19
330 0.2
331 0.2
332 0.2
333 0.17
334 0.17
335 0.17
336 0.15
337 0.12
338 0.12
339 0.11
340 0.1
341 0.08
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.05
347 0.05
348 0.06
349 0.06
350 0.08
351 0.11
352 0.13
353 0.13
354 0.15
355 0.16
356 0.15
357 0.15
358 0.14
359 0.11
360 0.1
361 0.09
362 0.07
363 0.09
364 0.09
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.08
374 0.15
375 0.18
376 0.18
377 0.24
378 0.31
379 0.4
380 0.48
381 0.56
382 0.6
383 0.66
384 0.76
385 0.8
386 0.83
387 0.85
388 0.88
389 0.89
390 0.9
391 0.89
392 0.9