Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0XBK9

Protein Details
Accession A0A4U0XBK9    Localization Confidence High Confidence Score 25.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-38MSIDAPSKKKDKKAQRDAERRRKGRKRKHEDTIDLPEGBasic
61-85DTAPGVKAPKAKKRKRSGNDAGAANHydrophilic
136-161ADRKARTLARNLRKRRKEKEAKGIFTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-28SKKKDKKAQRDAERRRKGRKRK
67-77KAPKAKKRKRS
138-157RKARTLARNLRKRRKEKEAK
292-300GKGVKGKGR
309-335GGGGKGEGRKEKIRDKNVGLEEERRRR
350-354RRKGG
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSIDAPSKKKDKKAQRDAERRRKGRKRKHEDTIDLPEGVEQEAEPAPEFIPLETGNDAETDTAPGVKAPKAKKRKRSGNDAGAANPVTRTNGHADDATKAVVSRKKARQTSTEEPQPKPKDATFPSSQAHHDLLPADRKARTLARNLRKRRKEKEAKGIFTAPGTGTPANGTTAADETTQPDPEDPDTDPTTAPKSRSKFILFIGNLPFTTTDTSLHAHFKKLAPFTLRHRTDPTTGKSKGFAFLEFENYDRMETCLKKYHHTLFDPEDYRAEKGKFGGGGAGGGGGCGERGKGVKGKGRQINVELTAGGGGKGEGRKEKIRDKNVGLEEERRRRAELEMSEQAAAAVGRRKGGTAGGRRGGVVVKEQRGGEAETGGMHPSRLAMIKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.88
3 0.93
4 0.95
5 0.96
6 0.95
7 0.93
8 0.93
9 0.93
10 0.93
11 0.93
12 0.93
13 0.92
14 0.91
15 0.93
16 0.92
17 0.89
18 0.86
19 0.85
20 0.77
21 0.66
22 0.56
23 0.46
24 0.36
25 0.29
26 0.21
27 0.11
28 0.1
29 0.11
30 0.11
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.12
35 0.13
36 0.1
37 0.12
38 0.11
39 0.13
40 0.13
41 0.13
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.09
46 0.1
47 0.09
48 0.08
49 0.09
50 0.08
51 0.1
52 0.12
53 0.14
54 0.21
55 0.27
56 0.37
57 0.48
58 0.57
59 0.66
60 0.75
61 0.83
62 0.84
63 0.87
64 0.87
65 0.86
66 0.84
67 0.75
68 0.66
69 0.58
70 0.51
71 0.4
72 0.3
73 0.21
74 0.15
75 0.14
76 0.15
77 0.16
78 0.17
79 0.18
80 0.19
81 0.2
82 0.2
83 0.21
84 0.19
85 0.14
86 0.13
87 0.17
88 0.19
89 0.23
90 0.31
91 0.38
92 0.47
93 0.52
94 0.56
95 0.58
96 0.63
97 0.66
98 0.65
99 0.67
100 0.64
101 0.61
102 0.67
103 0.63
104 0.57
105 0.53
106 0.46
107 0.45
108 0.42
109 0.46
110 0.39
111 0.4
112 0.38
113 0.37
114 0.37
115 0.31
116 0.29
117 0.22
118 0.19
119 0.17
120 0.18
121 0.21
122 0.21
123 0.21
124 0.2
125 0.2
126 0.22
127 0.27
128 0.27
129 0.31
130 0.4
131 0.48
132 0.58
133 0.67
134 0.75
135 0.79
136 0.84
137 0.83
138 0.84
139 0.84
140 0.83
141 0.84
142 0.83
143 0.76
144 0.71
145 0.66
146 0.55
147 0.44
148 0.36
149 0.25
150 0.16
151 0.15
152 0.11
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.06
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.09
165 0.1
166 0.11
167 0.11
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.13
172 0.1
173 0.13
174 0.14
175 0.14
176 0.14
177 0.14
178 0.17
179 0.17
180 0.19
181 0.22
182 0.23
183 0.24
184 0.28
185 0.3
186 0.28
187 0.27
188 0.33
189 0.28
190 0.28
191 0.29
192 0.25
193 0.23
194 0.21
195 0.2
196 0.12
197 0.13
198 0.1
199 0.08
200 0.1
201 0.11
202 0.12
203 0.17
204 0.17
205 0.17
206 0.2
207 0.21
208 0.25
209 0.25
210 0.27
211 0.24
212 0.27
213 0.33
214 0.41
215 0.41
216 0.38
217 0.41
218 0.4
219 0.43
220 0.46
221 0.44
222 0.42
223 0.41
224 0.4
225 0.38
226 0.36
227 0.34
228 0.29
229 0.25
230 0.19
231 0.18
232 0.22
233 0.2
234 0.19
235 0.17
236 0.16
237 0.16
238 0.13
239 0.14
240 0.13
241 0.14
242 0.17
243 0.24
244 0.25
245 0.29
246 0.34
247 0.41
248 0.42
249 0.43
250 0.45
251 0.41
252 0.48
253 0.46
254 0.41
255 0.37
256 0.32
257 0.31
258 0.31
259 0.27
260 0.21
261 0.2
262 0.21
263 0.18
264 0.17
265 0.17
266 0.12
267 0.11
268 0.09
269 0.09
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.03
274 0.04
275 0.03
276 0.04
277 0.04
278 0.06
279 0.09
280 0.13
281 0.19
282 0.26
283 0.32
284 0.42
285 0.47
286 0.5
287 0.51
288 0.49
289 0.5
290 0.44
291 0.39
292 0.3
293 0.23
294 0.2
295 0.17
296 0.13
297 0.08
298 0.06
299 0.09
300 0.1
301 0.14
302 0.17
303 0.22
304 0.29
305 0.36
306 0.46
307 0.52
308 0.59
309 0.63
310 0.63
311 0.67
312 0.65
313 0.65
314 0.58
315 0.57
316 0.59
317 0.61
318 0.63
319 0.55
320 0.52
321 0.48
322 0.48
323 0.48
324 0.43
325 0.42
326 0.42
327 0.42
328 0.4
329 0.38
330 0.34
331 0.27
332 0.21
333 0.15
334 0.16
335 0.15
336 0.17
337 0.17
338 0.18
339 0.18
340 0.24
341 0.3
342 0.33
343 0.41
344 0.43
345 0.43
346 0.43
347 0.43
348 0.4
349 0.33
350 0.33
351 0.32
352 0.32
353 0.35
354 0.35
355 0.35
356 0.35
357 0.36
358 0.28
359 0.21
360 0.17
361 0.15
362 0.16
363 0.16
364 0.14
365 0.12
366 0.11
367 0.1
368 0.13