FuNGI

A0A4U0XYL5

Protein Details

Accession

A0A4U0XYL5

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
28-50	AVNIFNPKKKPIKKPLLANTHTA	Hydrophilic
127-146	EFTRPVRLYRRRPQDKPEIT	Hydrophilic
176-203	IAPTGEASKKPQQKKKPQKKVEDVYYDE	Hydrophilic
411-437	AADEERRRQKKLKKQLKRKELRVEYES	Basic
555-575	DTSRAGRSKLTRPKDRPPGSP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
19-41	RAPQPRKKAAVNIFNPKKKPIKK
184-194	KKPQQKKKPQK
416-429	RRRQKKLKKQLKRK

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSTSPAKAPSGPPLGAATRAPQPRKKAAVNIFNPKKKPIKKPLLANTHTASGQLPQHAVRPQPPPPTTNSAAPEPVIEDDPSTYQEYPIMIEKNALMRGLHYHGFRMQSRMDDNGKLLQVDPYNEGEFTRPVRLYRRRPQDKPEITEQAAAVPGEELREARRAERQAEREANQALIAPTGEASKKPQQKKKPQKKVEDVYYDESNPKFEARSQLRYEEARPWHLEDFDNKNRWVGSYEEPLSKKHVMFEVSSSGFNLVPIEKWYRMARTDKVKALDDRQIEKMMESKHKAPRWFRSDKEVETAARQAAIAAKREEFAQGRKAKREIDDDDAPAYVKQEEYRADVDEIDFEYDDEFQDDDEGHIFADQNDDDAKEVEKRIREEMRGANLPDAGVKGADDQDWVNEEKEQRDAADEERRRQKKLKKQLKRKELRVEYESDSDEGHEYMESSESDDEEEEERERLEEERKKEEAQKAAVAANGDKSGTSSKGNNTPSGRPEKKALKRDADVSDLSGNESSRKKAKLNGSALGSNGARQLSPDAAKRIPSGYGSGSDTDTSRAGRSKLTRPKDRPPGSPHHDRTPNPDSRRGSPTSSRAQSPTRPPGSALTFPALEEVKAAIPKEGVAVGDLVKVFKTRLAGRTAEFIALVKQAGKQEAVTKKIVPKD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.32
3	0.31
4	0.26
5	0.28
6	0.36
7	0.42
8	0.45
9	0.51
10	0.57
11	0.64
12	0.66
13	0.68
14	0.69
15	0.72
16	0.74
17	0.78
18	0.79
19	0.79
20	0.77
21	0.75
22	0.75
23	0.74
24	0.76
25	0.76
26	0.77
27	0.77
28	0.85
29	0.87
30	0.88
31	0.81
32	0.76
33	0.68
34	0.6
35	0.52
36	0.42
37	0.33
38	0.26
39	0.27
40	0.24
41	0.23
42	0.2
43	0.25
44	0.29
45	0.32
46	0.33
47	0.36
48	0.41
49	0.48
50	0.5
51	0.47
52	0.5
53	0.54
54	0.52
55	0.52
56	0.49
57	0.43
58	0.42
59	0.39
60	0.33
61	0.27
62	0.25
63	0.21
64	0.17
65	0.14
66	0.14
67	0.15
68	0.17
69	0.19
70	0.17
71	0.16
72	0.17
73	0.17
74	0.17
75	0.21
76	0.2
77	0.17
78	0.18
79	0.19
80	0.21
81	0.22
82	0.21
83	0.16
84	0.15
85	0.19
86	0.22
87	0.24
88	0.21
89	0.22
90	0.25
91	0.3
92	0.3
93	0.3
94	0.28
95	0.29
96	0.3
97	0.34
98	0.34
99	0.31
100	0.31
101	0.32
102	0.31
103	0.27
104	0.25
105	0.23
106	0.22
107	0.22
108	0.23
109	0.21
110	0.21
111	0.21
112	0.21
113	0.18
114	0.19
115	0.19
116	0.22
117	0.2
118	0.22
119	0.32
120	0.41
121	0.49
122	0.57
123	0.66
124	0.7
125	0.74
126	0.8
127	0.81
128	0.8
129	0.76
130	0.74
131	0.7
132	0.61
133	0.58
134	0.5
135	0.4
136	0.33
137	0.27
138	0.18
139	0.12
140	0.1
141	0.08
142	0.09
143	0.08
144	0.08
145	0.14
146	0.14
147	0.16
148	0.23
149	0.26
150	0.31
151	0.38
152	0.41
153	0.45
154	0.5
155	0.5
156	0.47
157	0.45
158	0.4
159	0.32
160	0.29
161	0.2
162	0.14
163	0.12
164	0.08
165	0.07
166	0.09
167	0.1
168	0.09
169	0.14
170	0.22
171	0.31
172	0.41
173	0.5
174	0.58
175	0.69
176	0.8
177	0.86
178	0.89
179	0.9
180	0.91
181	0.92
182	0.9
183	0.88
184	0.83
185	0.76
186	0.7
187	0.63
188	0.53
189	0.46
190	0.38
191	0.3
192	0.23
193	0.2
194	0.16
195	0.15
196	0.24
197	0.26
198	0.33
199	0.34
200	0.36
201	0.39
202	0.4
203	0.4
204	0.38
205	0.36
206	0.33
207	0.32
208	0.33
209	0.31
210	0.3
211	0.3
212	0.28
213	0.33
214	0.36
215	0.39
216	0.36
217	0.35
218	0.34
219	0.33
220	0.29
221	0.24
222	0.2
223	0.23
224	0.25
225	0.3
226	0.3
227	0.31
228	0.34
229	0.33
230	0.3
231	0.25
232	0.25
233	0.21
234	0.21
235	0.22
236	0.22
237	0.2
238	0.2
239	0.18
240	0.16
241	0.14
242	0.13
243	0.12
244	0.08
245	0.07
246	0.09
247	0.13
248	0.12
249	0.15
250	0.17
251	0.18
252	0.22
253	0.26
254	0.29
255	0.34
256	0.39
257	0.4
258	0.41
259	0.42
260	0.41
261	0.4
262	0.41
263	0.36
264	0.34
265	0.32
266	0.31
267	0.27
268	0.25
269	0.26
270	0.24
271	0.26
272	0.26
273	0.31
274	0.36
275	0.4
276	0.46
277	0.47
278	0.53
279	0.55
280	0.58
281	0.53
282	0.54
283	0.55
284	0.5
285	0.48
286	0.41
287	0.33
288	0.29
289	0.29
290	0.2
291	0.15
292	0.14
293	0.1
294	0.12
295	0.13
296	0.14
297	0.14
298	0.14
299	0.14
300	0.15
301	0.17
302	0.14
303	0.15
304	0.21
305	0.26
306	0.29
307	0.32
308	0.34
309	0.34
310	0.35
311	0.39
312	0.33
313	0.33
314	0.33
315	0.3
316	0.28
317	0.26
318	0.23
319	0.17
320	0.15
321	0.09
322	0.07
323	0.06
324	0.08
325	0.09
326	0.11
327	0.13
328	0.13
329	0.13
330	0.13
331	0.13
332	0.11
333	0.11
334	0.08
335	0.07
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.05
342	0.04
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.04
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.07
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.08
360	0.08
361	0.1
362	0.12
363	0.15
364	0.17
365	0.22
366	0.25
367	0.25
368	0.28
369	0.3
370	0.32
371	0.33
372	0.31
373	0.27
374	0.24
375	0.22
376	0.18
377	0.14
378	0.09
379	0.06
380	0.05
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.07
385	0.06
386	0.07
387	0.09
388	0.1
389	0.09
390	0.11
391	0.13
392	0.13
393	0.15
394	0.14
395	0.12
396	0.13
397	0.14
398	0.15
399	0.24
400	0.26
401	0.32
402	0.42
403	0.44
404	0.46
405	0.53
406	0.59
407	0.59
408	0.68
409	0.71
410	0.72
411	0.81
412	0.87
413	0.91
414	0.91
415	0.9
416	0.89
417	0.86
418	0.81
419	0.73
420	0.67
421	0.59
422	0.52
423	0.45
424	0.34
425	0.26
426	0.21
427	0.18
428	0.14
429	0.1
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.08
434	0.07
435	0.08
436	0.08
437	0.08
438	0.08
439	0.08
440	0.09
441	0.09
442	0.1
443	0.1
444	0.1
445	0.1
446	0.1
447	0.1
448	0.11
449	0.18
450	0.23
451	0.27
452	0.33
453	0.35
454	0.38
455	0.44
456	0.48
457	0.46
458	0.43
459	0.41
460	0.36
461	0.34
462	0.33
463	0.26
464	0.21
465	0.17
466	0.14
467	0.12
468	0.1
469	0.1
470	0.11
471	0.12
472	0.14
473	0.15
474	0.19
475	0.27
476	0.3
477	0.34
478	0.36
479	0.39
480	0.43
481	0.51
482	0.49
483	0.44
484	0.5
485	0.54
486	0.59
487	0.65
488	0.66
489	0.63
490	0.62
491	0.66
492	0.62
493	0.55
494	0.47
495	0.39
496	0.33
497	0.26
498	0.25
499	0.19
500	0.17
501	0.18
502	0.19
503	0.21
504	0.25
505	0.28
506	0.29
507	0.35
508	0.44
509	0.49
510	0.52
511	0.53
512	0.52
513	0.49
514	0.47
515	0.44
516	0.35
517	0.26
518	0.23
519	0.18
520	0.13
521	0.13
522	0.15
523	0.15
524	0.19
525	0.22
526	0.25
527	0.26
528	0.28
529	0.29
530	0.28
531	0.25
532	0.23
533	0.22
534	0.18
535	0.2
536	0.2
537	0.2
538	0.2
539	0.19
540	0.18
541	0.17
542	0.17
543	0.16
544	0.16
545	0.18
546	0.18
547	0.24
548	0.3
549	0.38
550	0.47
551	0.55
552	0.63
553	0.67
554	0.76
555	0.8
556	0.8
557	0.79
558	0.76
559	0.77
560	0.74
561	0.78
562	0.73
563	0.72
564	0.75
565	0.68
566	0.69
567	0.68
568	0.69
569	0.64
570	0.67
571	0.62
572	0.59
573	0.65
574	0.6
575	0.57
576	0.55
577	0.57
578	0.58
579	0.57
580	0.55
581	0.54
582	0.56
583	0.57
584	0.59
585	0.63
586	0.57
587	0.54
588	0.51
589	0.53
590	0.53
591	0.49
592	0.43
593	0.36
594	0.32
595	0.31
596	0.32
597	0.26
598	0.2
599	0.17
600	0.15
601	0.14
602	0.17
603	0.17
604	0.15
605	0.15
606	0.15
607	0.16
608	0.15
609	0.12
610	0.1
611	0.11
612	0.1
613	0.13
614	0.13
615	0.12
616	0.12
617	0.13
618	0.13
619	0.14
620	0.19
621	0.22
622	0.26
623	0.31
624	0.34
625	0.34
626	0.4
627	0.39
628	0.34
629	0.28
630	0.24
631	0.21
632	0.19
633	0.18
634	0.14
635	0.16
636	0.19
637	0.21
638	0.21
639	0.21
640	0.28
641	0.35
642	0.38
643	0.38
644	0.4

A0A4U0XYL5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer