Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0XWS9

Protein Details
Accession A0A4U0XWS9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
146-167ADQYKSQKRRLRRTERGSNNGGHydrophilic
297-320YDIPIRQAKRKGRKGSSAKPSPKVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
303-319QAKRKGRKGSSAKPSPK
Subcellular Location(s) mito 23, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027040  PSMD4  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0008540  C:proteasome regulatory particle, base subcomplex  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
Amino Acid Sequences MPGQRARLFAVGTKTGIVLLWNMRTPAPKTWTASSTVGPVRIIYTESPQISCLALSSLFLIHGGNDGLVQAWDPLGSSFQPIRTLSSRFASRARRQLAQAQASPQGVGINLFAAGALCLDPDPTVLRGMVSLGVRILYWSYSSSAADQYKSQKRRLRRTERGSNNGGAQFSGAARSNLKDYIANEKFELDREKQHRRKEAQRFAGRFGTELMGGSEEEMLAYAAMLSQETLEQETLRRSSDTSTAVATNHSTLATDKAASSGSLSPPVQPKSDEELDADVAEAIRQSLAALPTVGAYDIPIRQAKRKGRKGSSAKPSPKVSPNLAGSSKAVEMSDLEFAMQLSLAEEQSKHPTADCFPALASRGSIDGGDSGKGKQRQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.21
3 0.2
4 0.16
5 0.14
6 0.15
7 0.18
8 0.19
9 0.2
10 0.21
11 0.26
12 0.29
13 0.33
14 0.35
15 0.37
16 0.4
17 0.44
18 0.44
19 0.45
20 0.44
21 0.37
22 0.38
23 0.36
24 0.33
25 0.28
26 0.26
27 0.22
28 0.2
29 0.21
30 0.16
31 0.18
32 0.22
33 0.24
34 0.24
35 0.23
36 0.23
37 0.21
38 0.2
39 0.15
40 0.11
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.06
49 0.08
50 0.07
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.07
63 0.07
64 0.1
65 0.12
66 0.13
67 0.18
68 0.18
69 0.23
70 0.25
71 0.27
72 0.27
73 0.31
74 0.32
75 0.3
76 0.37
77 0.42
78 0.46
79 0.52
80 0.53
81 0.51
82 0.51
83 0.56
84 0.58
85 0.54
86 0.49
87 0.42
88 0.42
89 0.39
90 0.36
91 0.28
92 0.2
93 0.14
94 0.13
95 0.1
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.04
107 0.04
108 0.05
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.07
113 0.08
114 0.07
115 0.08
116 0.1
117 0.09
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.07
122 0.08
123 0.07
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.1
131 0.14
132 0.15
133 0.15
134 0.17
135 0.24
136 0.32
137 0.37
138 0.43
139 0.44
140 0.53
141 0.63
142 0.71
143 0.73
144 0.75
145 0.8
146 0.82
147 0.85
148 0.83
149 0.75
150 0.66
151 0.58
152 0.5
153 0.4
154 0.29
155 0.21
156 0.15
157 0.11
158 0.11
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.21
169 0.22
170 0.22
171 0.21
172 0.22
173 0.21
174 0.21
175 0.24
176 0.15
177 0.21
178 0.27
179 0.37
180 0.43
181 0.49
182 0.56
183 0.58
184 0.66
185 0.69
186 0.72
187 0.72
188 0.74
189 0.69
190 0.64
191 0.62
192 0.52
193 0.42
194 0.34
195 0.24
196 0.16
197 0.14
198 0.11
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.03
208 0.03
209 0.02
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.07
221 0.1
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.13
227 0.17
228 0.17
229 0.16
230 0.16
231 0.16
232 0.16
233 0.16
234 0.15
235 0.12
236 0.1
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.1
246 0.09
247 0.11
248 0.11
249 0.11
250 0.15
251 0.16
252 0.18
253 0.24
254 0.26
255 0.25
256 0.23
257 0.26
258 0.29
259 0.31
260 0.29
261 0.24
262 0.24
263 0.24
264 0.23
265 0.19
266 0.12
267 0.09
268 0.08
269 0.07
270 0.05
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.06
283 0.06
284 0.08
285 0.08
286 0.12
287 0.16
288 0.18
289 0.24
290 0.34
291 0.43
292 0.52
293 0.61
294 0.68
295 0.71
296 0.8
297 0.83
298 0.84
299 0.85
300 0.85
301 0.83
302 0.8
303 0.77
304 0.73
305 0.71
306 0.67
307 0.61
308 0.58
309 0.54
310 0.53
311 0.5
312 0.45
313 0.38
314 0.35
315 0.31
316 0.24
317 0.19
318 0.13
319 0.13
320 0.13
321 0.14
322 0.11
323 0.11
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.09
328 0.07
329 0.06
330 0.07
331 0.08
332 0.09
333 0.1
334 0.13
335 0.2
336 0.22
337 0.22
338 0.22
339 0.25
340 0.27
341 0.33
342 0.31
343 0.25
344 0.23
345 0.26
346 0.27
347 0.25
348 0.22
349 0.16
350 0.15
351 0.15
352 0.14
353 0.12
354 0.12
355 0.12
356 0.14
357 0.14
358 0.16
359 0.24