Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0X3R0

Protein Details
Accession A0A4U0X3R0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
91-114EEPVKEPPPKKSKKAKGPLPLGQQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-108PPPKKSKKAKGP
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
PS50966  ZF_SWIM  
CDD cd16494  RING-CH-C4HC3_ZSWM2  
Amino Acid Sequences MPGPPSPVKAATDGLRRSARVRNPAKNYAAEQAEQEVSAPTPKLKRKVVSSGPGFDGGPVSAPSKKRKQAIPSSSAVLSDPANDSSEFEVEEPVKEPPPKKSKKAKGPLPLGQQERVWPHSKIYPLPGTAKSKMKGSVWHGDAAELRIQRTKSRTPMLAPGQKETRLRSYIPEPTEEYDTFLDRVNTQKMFIINRERANEEDCHAGHDDCPSEVLNIAGSKGNVYTVTISHMPSCTCPVNLFIKGGQERCCKHVLYVLHHVLKAPDHLAYQNAFLTSELCEIFDNAPDLPPETVKEEPTNDGNRKPLTDDCPICFMDFESDNKAVWCRAACGNNIHKECFGQWAKVKAGNVTCPFCRTSWESDEDGKKRKVDVAGVALPGELSASGYQNVAHLLDYE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.43
3 0.42
4 0.44
5 0.48
6 0.5
7 0.52
8 0.59
9 0.62
10 0.66
11 0.73
12 0.74
13 0.69
14 0.65
15 0.61
16 0.55
17 0.46
18 0.39
19 0.34
20 0.3
21 0.25
22 0.23
23 0.16
24 0.14
25 0.16
26 0.16
27 0.17
28 0.24
29 0.32
30 0.39
31 0.45
32 0.51
33 0.55
34 0.64
35 0.67
36 0.68
37 0.67
38 0.63
39 0.59
40 0.54
41 0.47
42 0.38
43 0.3
44 0.2
45 0.17
46 0.13
47 0.13
48 0.17
49 0.22
50 0.3
51 0.38
52 0.45
53 0.5
54 0.56
55 0.63
56 0.69
57 0.73
58 0.7
59 0.64
60 0.61
61 0.55
62 0.48
63 0.39
64 0.29
65 0.2
66 0.16
67 0.15
68 0.12
69 0.13
70 0.13
71 0.14
72 0.14
73 0.15
74 0.13
75 0.12
76 0.14
77 0.13
78 0.13
79 0.13
80 0.14
81 0.18
82 0.22
83 0.24
84 0.31
85 0.42
86 0.48
87 0.56
88 0.65
89 0.71
90 0.77
91 0.85
92 0.84
93 0.83
94 0.84
95 0.81
96 0.79
97 0.76
98 0.68
99 0.6
100 0.52
101 0.47
102 0.42
103 0.4
104 0.35
105 0.28
106 0.27
107 0.29
108 0.31
109 0.29
110 0.31
111 0.3
112 0.29
113 0.32
114 0.36
115 0.37
116 0.39
117 0.42
118 0.38
119 0.37
120 0.38
121 0.35
122 0.35
123 0.35
124 0.39
125 0.34
126 0.36
127 0.33
128 0.31
129 0.3
130 0.26
131 0.25
132 0.17
133 0.16
134 0.17
135 0.18
136 0.21
137 0.25
138 0.29
139 0.31
140 0.35
141 0.36
142 0.34
143 0.41
144 0.46
145 0.47
146 0.42
147 0.41
148 0.39
149 0.41
150 0.41
151 0.36
152 0.33
153 0.3
154 0.29
155 0.28
156 0.3
157 0.33
158 0.32
159 0.31
160 0.28
161 0.27
162 0.3
163 0.27
164 0.24
165 0.18
166 0.18
167 0.16
168 0.16
169 0.14
170 0.11
171 0.14
172 0.15
173 0.14
174 0.14
175 0.15
176 0.16
177 0.17
178 0.2
179 0.25
180 0.26
181 0.29
182 0.3
183 0.29
184 0.28
185 0.29
186 0.26
187 0.2
188 0.19
189 0.16
190 0.16
191 0.16
192 0.15
193 0.13
194 0.14
195 0.13
196 0.09
197 0.1
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.11
218 0.12
219 0.12
220 0.12
221 0.15
222 0.13
223 0.12
224 0.12
225 0.15
226 0.18
227 0.19
228 0.19
229 0.16
230 0.21
231 0.23
232 0.26
233 0.28
234 0.31
235 0.31
236 0.34
237 0.36
238 0.3
239 0.28
240 0.3
241 0.28
242 0.27
243 0.34
244 0.37
245 0.37
246 0.36
247 0.36
248 0.32
249 0.29
250 0.24
251 0.17
252 0.12
253 0.1
254 0.11
255 0.13
256 0.13
257 0.13
258 0.12
259 0.12
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.1
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.09
273 0.1
274 0.1
275 0.12
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.14
280 0.15
281 0.17
282 0.19
283 0.2
284 0.22
285 0.27
286 0.34
287 0.33
288 0.35
289 0.38
290 0.37
291 0.36
292 0.36
293 0.35
294 0.32
295 0.38
296 0.39
297 0.35
298 0.38
299 0.37
300 0.34
301 0.29
302 0.25
303 0.2
304 0.19
305 0.19
306 0.2
307 0.21
308 0.21
309 0.21
310 0.22
311 0.18
312 0.18
313 0.17
314 0.15
315 0.2
316 0.23
317 0.26
318 0.32
319 0.4
320 0.47
321 0.49
322 0.47
323 0.42
324 0.4
325 0.38
326 0.39
327 0.34
328 0.31
329 0.33
330 0.37
331 0.4
332 0.42
333 0.43
334 0.39
335 0.4
336 0.42
337 0.43
338 0.42
339 0.4
340 0.39
341 0.4
342 0.35
343 0.36
344 0.33
345 0.34
346 0.35
347 0.39
348 0.39
349 0.45
350 0.54
351 0.55
352 0.59
353 0.57
354 0.53
355 0.51
356 0.53
357 0.49
358 0.44
359 0.44
360 0.43
361 0.42
362 0.4
363 0.38
364 0.32
365 0.28
366 0.23
367 0.17
368 0.09
369 0.07
370 0.07
371 0.09
372 0.1
373 0.1
374 0.11
375 0.11
376 0.13
377 0.12