Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A4U0XSK4

Protein Details
Accession A0A4U0XSK4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
346-367DGTERFRKSKGKKGGKESAEQEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
352-361RKSKGKKGGK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
IPR034392  TatSF1-like_RRM1  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
CDD cd12281  RRM1_TatSF1_like  
cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MASTLEPFPIESADFAADDRVSFSKTANTHLLEAEDGTEWEWLARASKWVPVTSEEDLEKQQRAYMVEGVDENAPAVDLRKRKAQDGDAESIVTSTKKQKAEPKERVNTAVYITSLPEDVDVEELHQVFSRYGVIAESLDSDAPRIKLYTDDEGEFKGEALIDLVFFRPESVQLAINMLDESDFRLGQQLPTGPMRVRAAEASYKSQKDQPLKTDEAKKKGTSANRDRQKVIQKTQEMNNRLADWDDDDPQALPDTSSRWDKVVVLKKMFTLSDLATDPHAISDITEDVREECKKFGEIANITLFDLEEDGVVTVRFTDARAAQACIGTFEGRWFDARQIVAYTADGTERFRKSKGKKGGKESAEQEAERLEAFSRSIEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.13
4 0.12
5 0.11
6 0.14
7 0.13
8 0.14
9 0.14
10 0.15
11 0.19
12 0.2
13 0.26
14 0.29
15 0.29
16 0.3
17 0.3
18 0.3
19 0.24
20 0.23
21 0.19
22 0.14
23 0.12
24 0.11
25 0.1
26 0.09
27 0.08
28 0.08
29 0.07
30 0.09
31 0.09
32 0.13
33 0.14
34 0.19
35 0.22
36 0.23
37 0.25
38 0.26
39 0.31
40 0.29
41 0.31
42 0.28
43 0.27
44 0.3
45 0.31
46 0.29
47 0.24
48 0.24
49 0.23
50 0.23
51 0.23
52 0.23
53 0.2
54 0.19
55 0.19
56 0.19
57 0.17
58 0.15
59 0.12
60 0.08
61 0.08
62 0.06
63 0.08
64 0.12
65 0.16
66 0.19
67 0.27
68 0.29
69 0.33
70 0.39
71 0.43
72 0.46
73 0.48
74 0.5
75 0.43
76 0.42
77 0.37
78 0.31
79 0.26
80 0.17
81 0.14
82 0.16
83 0.22
84 0.24
85 0.3
86 0.38
87 0.49
88 0.59
89 0.67
90 0.7
91 0.72
92 0.72
93 0.71
94 0.64
95 0.54
96 0.45
97 0.36
98 0.26
99 0.18
100 0.16
101 0.13
102 0.11
103 0.1
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.08
116 0.09
117 0.09
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.08
134 0.11
135 0.14
136 0.18
137 0.17
138 0.18
139 0.18
140 0.19
141 0.19
142 0.16
143 0.13
144 0.09
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.04
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.09
165 0.07
166 0.06
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.1
176 0.1
177 0.11
178 0.12
179 0.14
180 0.11
181 0.14
182 0.14
183 0.13
184 0.13
185 0.12
186 0.13
187 0.15
188 0.16
189 0.19
190 0.23
191 0.23
192 0.24
193 0.27
194 0.31
195 0.34
196 0.36
197 0.36
198 0.38
199 0.4
200 0.45
201 0.51
202 0.51
203 0.51
204 0.51
205 0.46
206 0.44
207 0.45
208 0.46
209 0.46
210 0.51
211 0.54
212 0.58
213 0.61
214 0.59
215 0.61
216 0.64
217 0.61
218 0.58
219 0.56
220 0.54
221 0.55
222 0.6
223 0.61
224 0.54
225 0.49
226 0.45
227 0.37
228 0.32
229 0.28
230 0.22
231 0.16
232 0.15
233 0.15
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.12
238 0.13
239 0.1
240 0.08
241 0.07
242 0.09
243 0.12
244 0.15
245 0.16
246 0.15
247 0.16
248 0.18
249 0.26
250 0.34
251 0.37
252 0.36
253 0.36
254 0.36
255 0.38
256 0.36
257 0.28
258 0.21
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.15
263 0.13
264 0.14
265 0.13
266 0.1
267 0.11
268 0.07
269 0.06
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.11
276 0.16
277 0.18
278 0.18
279 0.17
280 0.18
281 0.19
282 0.21
283 0.22
284 0.26
285 0.25
286 0.27
287 0.29
288 0.28
289 0.27
290 0.25
291 0.22
292 0.13
293 0.12
294 0.09
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.1
306 0.11
307 0.17
308 0.19
309 0.2
310 0.21
311 0.22
312 0.22
313 0.19
314 0.2
315 0.15
316 0.14
317 0.14
318 0.15
319 0.14
320 0.17
321 0.16
322 0.17
323 0.21
324 0.21
325 0.21
326 0.2
327 0.21
328 0.2
329 0.19
330 0.17
331 0.13
332 0.14
333 0.14
334 0.16
335 0.22
336 0.26
337 0.28
338 0.31
339 0.41
340 0.46
341 0.56
342 0.63
343 0.67
344 0.71
345 0.78
346 0.84
347 0.79
348 0.8
349 0.73
350 0.72
351 0.67
352 0.58
353 0.49
354 0.4
355 0.35
356 0.28
357 0.25
358 0.16
359 0.12
360 0.12
361 0.13