FuNGI

A0A4U0WGT0

Protein Details

Accession

A0A4U0WGT0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
402-440	GNDHRSTTARRKEKKASEGKSTTNKEKARKKNFLMTLGK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
258-262	LAKKR
410-472	ARRKEKKASEGKSTTNKEKARKKNFLMTLGKAKRKGKMSLVERGKVLKAHVERGKRGGRRGNI

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, mito_nucl 10.333, cyto_mito 6.833, cyto 6.5, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

GFAEKLFAQHLQPSQPKVRLNLEQKLLVLNLVSRLVGLHKLTLIPLYSYFIKFLTPRQPSVTGFLASLAQASHSLVPPDVLDPLVQKIANEFVSEAAASEVASAGLNGIREVCVRQPLAMNETLLQDLVQYRKSKDKGVQMAARGLLSLYREVGAEMLRKRDRGRDAALKLRSKDGDGGLDRRFGQVDEGGIEGLDLLEKWKEEQGLDEDEEEAKGWENWDAESDSSESSGGWVNVESDGEDIDVSDSEDEKEKEAKLAKKRKLAESEAEKENLQSETAPTPTDADTTSRATASLEPEAALKREEQRISTLATTRILTPADLAKLAELRQSAAITASLPSAKRRKLAQQASAAAQARHADDAVTASDIAGLAKFSHKTTREEKVAMARGERPDENGRFGAAGNDHRSTTARRKEKKASEGKSTTNKEKARKKNFLMTLGKAKRKGKMSLVERGKVLKAHVERGKRGGRRGNIG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.52
3	0.54
4	0.54
5	0.58
6	0.58
7	0.61
8	0.62
9	0.59
10	0.55
11	0.51
12	0.48
13	0.41
14	0.32
15	0.25
16	0.18
17	0.16
18	0.14
19	0.13
20	0.1
21	0.11
22	0.12
23	0.16
24	0.15
25	0.14
26	0.15
27	0.16
28	0.16
29	0.18
30	0.17
31	0.14
32	0.14
33	0.17
34	0.19
35	0.19
36	0.19
37	0.18
38	0.19
39	0.19
40	0.25
41	0.31
42	0.32
43	0.35
44	0.39
45	0.43
46	0.42
47	0.45
48	0.42
49	0.33
50	0.28
51	0.26
52	0.21
53	0.17
54	0.16
55	0.11
56	0.08
57	0.08
58	0.09
59	0.1
60	0.11
61	0.12
62	0.11
63	0.12
64	0.12
65	0.12
66	0.12
67	0.1
68	0.09
69	0.1
70	0.12
71	0.14
72	0.14
73	0.13
74	0.13
75	0.17
76	0.17
77	0.16
78	0.14
79	0.11
80	0.12
81	0.12
82	0.11
83	0.07
84	0.07
85	0.06
86	0.06
87	0.05
88	0.05
89	0.05
90	0.04
91	0.04
92	0.05
93	0.06
94	0.06
95	0.06
96	0.06
97	0.07
98	0.09
99	0.11
100	0.15
101	0.15
102	0.16
103	0.19
104	0.21
105	0.24
106	0.24
107	0.22
108	0.19
109	0.2
110	0.19
111	0.15
112	0.13
113	0.09
114	0.11
115	0.12
116	0.16
117	0.17
118	0.19
119	0.28
120	0.3
121	0.35
122	0.38
123	0.45
124	0.48
125	0.53
126	0.55
127	0.48
128	0.5
129	0.45
130	0.39
131	0.29
132	0.22
133	0.15
134	0.12
135	0.1
136	0.08
137	0.08
138	0.08
139	0.08
140	0.08
141	0.09
142	0.13
143	0.14
144	0.21
145	0.22
146	0.25
147	0.26
148	0.33
149	0.36
150	0.36
151	0.41
152	0.42
153	0.45
154	0.51
155	0.56
156	0.54
157	0.5
158	0.49
159	0.44
160	0.36
161	0.34
162	0.27
163	0.26
164	0.23
165	0.26
166	0.23
167	0.25
168	0.24
169	0.22
170	0.21
171	0.15
172	0.14
173	0.11
174	0.11
175	0.09
176	0.09
177	0.08
178	0.07
179	0.07
180	0.05
181	0.04
182	0.03
183	0.03
184	0.03
185	0.04
186	0.04
187	0.05
188	0.07
189	0.07
190	0.07
191	0.1
192	0.12
193	0.14
194	0.15
195	0.14
196	0.13
197	0.13
198	0.13
199	0.11
200	0.08
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.08
208	0.09
209	0.08
210	0.09
211	0.1
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.06
216	0.06
217	0.07
218	0.06
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.05
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.03
230	0.03
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.05
236	0.08
237	0.08
238	0.09
239	0.11
240	0.11
241	0.14
242	0.2
243	0.26
244	0.33
245	0.42
246	0.47
247	0.52
248	0.56
249	0.59
250	0.6
251	0.57
252	0.55
253	0.53
254	0.52
255	0.47
256	0.45
257	0.38
258	0.32
259	0.3
260	0.23
261	0.15
262	0.1
263	0.09
264	0.1
265	0.1
266	0.1
267	0.09
268	0.1
269	0.1
270	0.11
271	0.1
272	0.1
273	0.12
274	0.14
275	0.15
276	0.13
277	0.13
278	0.13
279	0.14
280	0.15
281	0.14
282	0.12
283	0.11
284	0.13
285	0.13
286	0.13
287	0.12
288	0.11
289	0.14
290	0.2
291	0.21
292	0.2
293	0.22
294	0.23
295	0.25
296	0.25
297	0.24
298	0.19
299	0.2
300	0.19
301	0.17
302	0.18
303	0.15
304	0.13
305	0.12
306	0.13
307	0.12
308	0.12
309	0.11
310	0.1
311	0.11
312	0.11
313	0.13
314	0.1
315	0.1
316	0.11
317	0.11
318	0.11
319	0.1
320	0.1
321	0.08
322	0.08
323	0.09
324	0.1
325	0.1
326	0.17
327	0.23
328	0.25
329	0.29
330	0.32
331	0.4
332	0.49
333	0.56
334	0.56
335	0.57
336	0.58
337	0.56
338	0.58
339	0.51
340	0.4
341	0.34
342	0.28
343	0.22
344	0.19
345	0.17
346	0.11
347	0.09
348	0.11
349	0.1
350	0.09
351	0.08
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.06
357	0.06
358	0.05
359	0.09
360	0.1
361	0.12
362	0.19
363	0.22
364	0.28
365	0.34
366	0.41
367	0.44
368	0.44
369	0.45
370	0.46
371	0.5
372	0.46
373	0.43
374	0.4
375	0.39
376	0.42
377	0.39
378	0.36
379	0.37
380	0.38
381	0.39
382	0.35
383	0.31
384	0.27
385	0.27
386	0.25
387	0.2
388	0.24
389	0.24
390	0.25
391	0.25
392	0.26
393	0.28
394	0.31
395	0.38
396	0.42
397	0.48
398	0.54
399	0.62
400	0.72
401	0.79
402	0.83
403	0.83
404	0.79
405	0.79
406	0.77
407	0.77
408	0.76
409	0.74
410	0.72
411	0.71
412	0.71
413	0.7
414	0.75
415	0.78
416	0.79
417	0.81
418	0.8
419	0.81
420	0.8
421	0.8
422	0.76
423	0.72
424	0.72
425	0.71
426	0.72
427	0.7
428	0.68
429	0.65
430	0.65
431	0.65
432	0.62
433	0.63
434	0.62
435	0.65
436	0.69
437	0.65
438	0.61
439	0.59
440	0.53
441	0.45
442	0.41
443	0.39
444	0.35
445	0.41
446	0.46
447	0.5
448	0.52
449	0.59
450	0.66
451	0.63
452	0.68
453	0.68

A0A4U0WGT0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer