Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0XC78

Protein Details
Accession A0A4U0XC78    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-59KNAKNSTKSRIAKTKKTPKPMPLKFDCHydrophilic
256-276EEFIEKKYKRCPNKAGCNANIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-51ESAPKNAKNSTKSRIAKTKKTPK
189-202AKARRASKRGKAKK
Subcellular Location(s) mito 18, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031127  E3_UB_ligase_RBR  
IPR002867  IBR_dom  
IPR044066  TRIAD_supradom  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd20335  BRcat_RBR  
Amino Acid Sequences MAPRKPAVPAAPLVNPPARRSARLNPPQESAPKNAKNSTKSRIAKTKKTPKPMPLKFDCTICGRALAASSLPDHLAPDHCEHLINTCKQCVKAWIAAQLDSTTYDRVSCPECPEIMTKADVKQMAAKDVYARYEEMERRGVAERIPGWRWCLNSKCRAGQVYEPLLKAAAVAAREGGDFGVAEDRETGAKARRASKRGKAKKPTVDLPHDDDDDDDIFTCNECGEKACVPCDRPYHDGETCAEYRERRTYDDKTSEEFIEKKYKRCPNKAGCNANIEKDGGCDFVFCTRCKTQFCWRCLADYRDINKGLGHNKGCVYAAPGAIDPHAMHVQPPLPAAVAAPAQAHGGAGGAGGGILQNVAAMVAAFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.38
3 0.36
4 0.42
5 0.41
6 0.4
7 0.45
8 0.5
9 0.55
10 0.62
11 0.68
12 0.62
13 0.62
14 0.64
15 0.64
16 0.58
17 0.54
18 0.55
19 0.54
20 0.55
21 0.59
22 0.6
23 0.61
24 0.64
25 0.64
26 0.64
27 0.63
28 0.67
29 0.71
30 0.72
31 0.75
32 0.79
33 0.83
34 0.81
35 0.85
36 0.84
37 0.83
38 0.86
39 0.84
40 0.82
41 0.79
42 0.78
43 0.7
44 0.64
45 0.57
46 0.51
47 0.46
48 0.36
49 0.3
50 0.22
51 0.2
52 0.19
53 0.16
54 0.12
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.1
61 0.11
62 0.13
63 0.15
64 0.17
65 0.18
66 0.18
67 0.19
68 0.18
69 0.22
70 0.27
71 0.3
72 0.29
73 0.32
74 0.34
75 0.35
76 0.36
77 0.35
78 0.32
79 0.32
80 0.32
81 0.34
82 0.33
83 0.32
84 0.32
85 0.27
86 0.23
87 0.19
88 0.18
89 0.12
90 0.11
91 0.11
92 0.1
93 0.12
94 0.15
95 0.15
96 0.18
97 0.2
98 0.2
99 0.21
100 0.23
101 0.23
102 0.22
103 0.21
104 0.19
105 0.18
106 0.22
107 0.21
108 0.19
109 0.21
110 0.2
111 0.21
112 0.2
113 0.18
114 0.18
115 0.18
116 0.19
117 0.16
118 0.15
119 0.13
120 0.19
121 0.2
122 0.2
123 0.22
124 0.2
125 0.21
126 0.23
127 0.23
128 0.17
129 0.19
130 0.18
131 0.2
132 0.22
133 0.21
134 0.23
135 0.24
136 0.26
137 0.28
138 0.32
139 0.34
140 0.4
141 0.43
142 0.41
143 0.42
144 0.42
145 0.38
146 0.35
147 0.35
148 0.33
149 0.32
150 0.29
151 0.26
152 0.25
153 0.22
154 0.19
155 0.13
156 0.08
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.05
164 0.04
165 0.03
166 0.04
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.13
177 0.16
178 0.24
179 0.3
180 0.35
181 0.41
182 0.49
183 0.56
184 0.63
185 0.7
186 0.71
187 0.73
188 0.76
189 0.76
190 0.75
191 0.7
192 0.66
193 0.59
194 0.55
195 0.5
196 0.42
197 0.36
198 0.29
199 0.24
200 0.18
201 0.15
202 0.1
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.08
212 0.11
213 0.12
214 0.15
215 0.18
216 0.2
217 0.24
218 0.27
219 0.29
220 0.29
221 0.31
222 0.34
223 0.32
224 0.32
225 0.29
226 0.3
227 0.26
228 0.25
229 0.24
230 0.19
231 0.23
232 0.28
233 0.28
234 0.27
235 0.33
236 0.36
237 0.42
238 0.48
239 0.47
240 0.43
241 0.44
242 0.41
243 0.38
244 0.34
245 0.29
246 0.33
247 0.33
248 0.35
249 0.41
250 0.49
251 0.55
252 0.63
253 0.69
254 0.69
255 0.78
256 0.83
257 0.82
258 0.76
259 0.75
260 0.68
261 0.6
262 0.52
263 0.41
264 0.31
265 0.25
266 0.22
267 0.15
268 0.13
269 0.11
270 0.1
271 0.16
272 0.19
273 0.18
274 0.24
275 0.27
276 0.32
277 0.36
278 0.4
279 0.45
280 0.5
281 0.54
282 0.56
283 0.52
284 0.53
285 0.56
286 0.56
287 0.53
288 0.53
289 0.52
290 0.51
291 0.51
292 0.46
293 0.41
294 0.41
295 0.37
296 0.36
297 0.35
298 0.31
299 0.31
300 0.32
301 0.3
302 0.26
303 0.25
304 0.21
305 0.2
306 0.18
307 0.18
308 0.17
309 0.16
310 0.17
311 0.14
312 0.15
313 0.16
314 0.15
315 0.14
316 0.17
317 0.19
318 0.19
319 0.2
320 0.16
321 0.14
322 0.14
323 0.14
324 0.13
325 0.11
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.07
333 0.07
334 0.06
335 0.05
336 0.04
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.03