Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V5NHT6

Protein Details
Accession A0A4V5NHT6    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21EASRGPPRVKNKAPAPQQISHydrophilic
52-71EYQGRKRKDFEDYVRRNRLNHydrophilic
616-643EREAVAKQMPRRVKKRRRLDDDSFEEYMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
622-633KQMPRRVKKRRR
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 10.833, cyto_mito 8.166, mito 7.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF13432  TPR_16  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MEASRGPPRVKNKAPAPQQISAEQLLREAVDRQEPALTAPTQRFADLEELHEYQGRKRKDFEDYVRRNRLNMGNWMRYAAWELEQKEYRRARSVFERALDCEPTNVQLWVRYVESEMKERNINHARNVLDRAVTIMPRVDKLWYKYVYMEEMLGNVAGTRAVFERWMSWEPDEAAWNAYIKLEKRYGEYERARNIFERFTIVHPEARNWIKWARFEEENGTSDLVRDVFGMSIETLGDEFMDEKIFIAYARFEAKLKEYERAQAIYKYALDRMPRSKSAILHKEYTTFEKQFGDREGVEDVVLAKRRVMYEEQVKENPKSYDTWFDYARLEESSPSSDPERVRDVYERAIAQVPPSQEKRHWRRYIYLWIFYALYEELQARDNTRAAQVYSEALKLVPHKHFTFAKLWVRKAQFHLRQSDLTQARKTMGLAVGMCPKNKLFRAYVEIELQLFEFLRCRTLYEKWIEWDSGNCSAWIKFAELERGLDDLERARAIYELAVTQPVLDMPELLWKAYIDFEEEAAEEAEEYERARKLYERLLQKTEHVKVWISYAQFELNVPDFEHPESEAVAPKSITRARAVFERAHKLYKDRRLVEERVALLSAWKSFEDTHGGEKEREAVAKQMPRRVKKRRRLDDDSFEEYMDYVFPADDEGSAGMSKLMAMAQKWKREQEEGAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.81
3 0.79
4 0.74
5 0.7
6 0.63
7 0.58
8 0.51
9 0.44
10 0.34
11 0.28
12 0.22
13 0.19
14 0.18
15 0.17
16 0.17
17 0.2
18 0.2
19 0.21
20 0.22
21 0.22
22 0.22
23 0.25
24 0.23
25 0.23
26 0.24
27 0.28
28 0.27
29 0.27
30 0.25
31 0.23
32 0.28
33 0.24
34 0.25
35 0.25
36 0.25
37 0.26
38 0.3
39 0.28
40 0.29
41 0.36
42 0.39
43 0.37
44 0.41
45 0.45
46 0.5
47 0.59
48 0.62
49 0.65
50 0.69
51 0.76
52 0.81
53 0.77
54 0.69
55 0.67
56 0.64
57 0.58
58 0.58
59 0.56
60 0.52
61 0.52
62 0.53
63 0.46
64 0.39
65 0.38
66 0.29
67 0.24
68 0.24
69 0.25
70 0.31
71 0.37
72 0.39
73 0.44
74 0.48
75 0.48
76 0.51
77 0.5
78 0.48
79 0.52
80 0.58
81 0.55
82 0.54
83 0.53
84 0.48
85 0.51
86 0.49
87 0.39
88 0.32
89 0.27
90 0.25
91 0.23
92 0.21
93 0.17
94 0.17
95 0.18
96 0.19
97 0.19
98 0.17
99 0.18
100 0.23
101 0.25
102 0.28
103 0.29
104 0.29
105 0.33
106 0.33
107 0.41
108 0.44
109 0.44
110 0.42
111 0.45
112 0.44
113 0.43
114 0.46
115 0.38
116 0.29
117 0.26
118 0.26
119 0.22
120 0.21
121 0.18
122 0.17
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.19
127 0.22
128 0.26
129 0.33
130 0.31
131 0.32
132 0.33
133 0.34
134 0.33
135 0.28
136 0.25
137 0.17
138 0.15
139 0.14
140 0.12
141 0.09
142 0.07
143 0.06
144 0.05
145 0.04
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.08
151 0.1
152 0.14
153 0.17
154 0.18
155 0.18
156 0.2
157 0.21
158 0.22
159 0.22
160 0.18
161 0.16
162 0.15
163 0.14
164 0.12
165 0.12
166 0.14
167 0.13
168 0.17
169 0.2
170 0.2
171 0.23
172 0.28
173 0.31
174 0.37
175 0.43
176 0.45
177 0.49
178 0.5
179 0.48
180 0.46
181 0.44
182 0.36
183 0.3
184 0.27
185 0.21
186 0.21
187 0.25
188 0.24
189 0.26
190 0.25
191 0.26
192 0.29
193 0.3
194 0.29
195 0.26
196 0.29
197 0.28
198 0.31
199 0.34
200 0.32
201 0.3
202 0.31
203 0.33
204 0.32
205 0.3
206 0.27
207 0.24
208 0.19
209 0.18
210 0.17
211 0.12
212 0.09
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.11
241 0.14
242 0.2
243 0.2
244 0.23
245 0.22
246 0.26
247 0.27
248 0.28
249 0.27
250 0.22
251 0.22
252 0.2
253 0.2
254 0.16
255 0.16
256 0.17
257 0.17
258 0.19
259 0.24
260 0.27
261 0.27
262 0.3
263 0.31
264 0.33
265 0.4
266 0.44
267 0.42
268 0.41
269 0.4
270 0.4
271 0.38
272 0.39
273 0.35
274 0.28
275 0.26
276 0.25
277 0.25
278 0.23
279 0.24
280 0.21
281 0.16
282 0.16
283 0.16
284 0.13
285 0.13
286 0.1
287 0.1
288 0.09
289 0.11
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.12
294 0.14
295 0.15
296 0.17
297 0.23
298 0.28
299 0.31
300 0.33
301 0.36
302 0.34
303 0.36
304 0.32
305 0.24
306 0.22
307 0.2
308 0.24
309 0.24
310 0.26
311 0.23
312 0.24
313 0.24
314 0.22
315 0.21
316 0.14
317 0.11
318 0.09
319 0.1
320 0.11
321 0.11
322 0.12
323 0.12
324 0.15
325 0.15
326 0.17
327 0.2
328 0.18
329 0.2
330 0.21
331 0.22
332 0.2
333 0.22
334 0.19
335 0.17
336 0.18
337 0.16
338 0.14
339 0.15
340 0.14
341 0.16
342 0.19
343 0.19
344 0.22
345 0.32
346 0.4
347 0.47
348 0.52
349 0.5
350 0.53
351 0.56
352 0.63
353 0.57
354 0.51
355 0.41
356 0.37
357 0.34
358 0.29
359 0.25
360 0.14
361 0.1
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.09
367 0.09
368 0.1
369 0.11
370 0.11
371 0.12
372 0.12
373 0.11
374 0.11
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.09
380 0.08
381 0.09
382 0.11
383 0.16
384 0.17
385 0.2
386 0.21
387 0.25
388 0.27
389 0.29
390 0.3
391 0.32
392 0.38
393 0.39
394 0.4
395 0.43
396 0.44
397 0.44
398 0.47
399 0.49
400 0.48
401 0.48
402 0.51
403 0.47
404 0.45
405 0.43
406 0.46
407 0.41
408 0.37
409 0.34
410 0.29
411 0.28
412 0.26
413 0.26
414 0.19
415 0.16
416 0.14
417 0.13
418 0.14
419 0.21
420 0.22
421 0.22
422 0.2
423 0.2
424 0.23
425 0.25
426 0.26
427 0.2
428 0.22
429 0.28
430 0.3
431 0.32
432 0.29
433 0.27
434 0.24
435 0.22
436 0.19
437 0.13
438 0.1
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.1
443 0.1
444 0.12
445 0.15
446 0.17
447 0.23
448 0.26
449 0.28
450 0.29
451 0.31
452 0.3
453 0.27
454 0.26
455 0.24
456 0.24
457 0.22
458 0.19
459 0.18
460 0.17
461 0.18
462 0.16
463 0.14
464 0.11
465 0.12
466 0.17
467 0.17
468 0.18
469 0.17
470 0.17
471 0.16
472 0.14
473 0.13
474 0.1
475 0.1
476 0.09
477 0.09
478 0.08
479 0.08
480 0.09
481 0.08
482 0.08
483 0.07
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.08
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.06
492 0.06
493 0.05
494 0.12
495 0.13
496 0.13
497 0.13
498 0.12
499 0.13
500 0.14
501 0.14
502 0.1
503 0.1
504 0.11
505 0.11
506 0.11
507 0.11
508 0.1
509 0.1
510 0.07
511 0.07
512 0.07
513 0.07
514 0.07
515 0.1
516 0.11
517 0.12
518 0.13
519 0.16
520 0.19
521 0.27
522 0.33
523 0.39
524 0.44
525 0.48
526 0.48
527 0.5
528 0.55
529 0.51
530 0.47
531 0.39
532 0.35
533 0.31
534 0.34
535 0.32
536 0.25
537 0.22
538 0.2
539 0.19
540 0.18
541 0.18
542 0.17
543 0.15
544 0.15
545 0.15
546 0.15
547 0.16
548 0.16
549 0.17
550 0.14
551 0.13
552 0.13
553 0.14
554 0.18
555 0.17
556 0.18
557 0.17
558 0.17
559 0.23
560 0.25
561 0.26
562 0.24
563 0.25
564 0.26
565 0.32
566 0.36
567 0.36
568 0.4
569 0.47
570 0.46
571 0.5
572 0.49
573 0.51
574 0.56
575 0.59
576 0.62
577 0.57
578 0.62
579 0.64
580 0.66
581 0.64
582 0.62
583 0.53
584 0.45
585 0.42
586 0.33
587 0.28
588 0.26
589 0.21
590 0.16
591 0.15
592 0.15
593 0.15
594 0.17
595 0.21
596 0.21
597 0.26
598 0.29
599 0.32
600 0.31
601 0.31
602 0.33
603 0.29
604 0.29
605 0.24
606 0.24
607 0.29
608 0.36
609 0.4
610 0.44
611 0.51
612 0.59
613 0.69
614 0.75
615 0.78
616 0.81
617 0.88
618 0.9
619 0.91
620 0.9
621 0.89
622 0.89
623 0.86
624 0.82
625 0.71
626 0.6
627 0.51
628 0.41
629 0.32
630 0.22
631 0.14
632 0.08
633 0.07
634 0.06
635 0.08
636 0.08
637 0.08
638 0.08
639 0.08
640 0.09
641 0.09
642 0.09
643 0.08
644 0.07
645 0.07
646 0.07
647 0.08
648 0.09
649 0.11
650 0.21
651 0.28
652 0.37
653 0.43
654 0.49
655 0.52
656 0.54