Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0XJX8

Protein Details
Accession A0A4U0XJX8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-37DESMGRDEKRSKSKKQWRVPRRNDHGAVQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-30GRDEKRSKSKKQWRVPRR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.5, cyto 6.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011009  Kinase-like_dom_sf  
IPR004114  THUMP_dom  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF02926  THUMP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51165  THUMP  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MDGAKRKADESMGRDEKRSKSKKQWRVPRRNDHGAVQAKAIQPGDSGIWATCNKGREGKCVGELQDLFTEYAELLYGPALDTGETGGADVEESDAADIESEIQAEVAGIRKPSAVQLFTSVRLNVQCVVFFKTVSPIEPVSFVQKICEDAANNSALKRTRFAKRLSPMTLMGRASADDLGKVAAEVLAPHFHQPSARSRKFAIRPSLRNHNILTRDSVIKQIANIVGPNHSVDLKNYELLIIVEIYQRYNLAEIFDPTPKEVSKEVQATSAEPEGAIDDSADVADLKAPPTGLRTVRIERLHGYLFRTYRLTTFKGFFYLLRCRPSHNVRLLRHEEDRLETEAIALRTLSSRVDGFSARLIEYHTTTIPIGSKYLISGPFEGSILADIEPSLSRQECANIDRSLGQYVRSLSAVTGTVFGSVRQAPAFGSQSWGRVFAGMLETILRDGEDALINLPYDSMKDLVRRHRASLDQITQPRLVLLELSADENVVVNTQTNRVTGLLDFSTAFWGDPYMSDCWYKPTKSFAEGFGKLPNADTDERTRQYLYVLYHALLAIVRHSYRPSEGSDELDARRDLTTAIRQLTAMVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.58
3 0.6
4 0.64
5 0.67
6 0.66
7 0.68
8 0.77
9 0.83
10 0.87
11 0.89
12 0.9
13 0.93
14 0.94
15 0.94
16 0.93
17 0.93
18 0.86
19 0.79
20 0.78
21 0.74
22 0.64
23 0.56
24 0.52
25 0.43
26 0.43
27 0.39
28 0.29
29 0.22
30 0.22
31 0.2
32 0.15
33 0.14
34 0.11
35 0.14
36 0.15
37 0.18
38 0.19
39 0.21
40 0.23
41 0.3
42 0.32
43 0.35
44 0.41
45 0.41
46 0.42
47 0.44
48 0.44
49 0.43
50 0.41
51 0.37
52 0.34
53 0.32
54 0.27
55 0.22
56 0.21
57 0.13
58 0.13
59 0.1
60 0.07
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.07
94 0.09
95 0.09
96 0.1
97 0.1
98 0.11
99 0.16
100 0.19
101 0.18
102 0.17
103 0.23
104 0.25
105 0.27
106 0.29
107 0.25
108 0.22
109 0.22
110 0.23
111 0.19
112 0.17
113 0.17
114 0.17
115 0.22
116 0.2
117 0.2
118 0.19
119 0.22
120 0.22
121 0.21
122 0.22
123 0.18
124 0.18
125 0.2
126 0.2
127 0.19
128 0.2
129 0.19
130 0.17
131 0.17
132 0.18
133 0.18
134 0.2
135 0.16
136 0.16
137 0.18
138 0.19
139 0.19
140 0.17
141 0.2
142 0.2
143 0.21
144 0.22
145 0.26
146 0.31
147 0.37
148 0.41
149 0.46
150 0.5
151 0.57
152 0.57
153 0.55
154 0.5
155 0.47
156 0.47
157 0.38
158 0.31
159 0.24
160 0.2
161 0.18
162 0.16
163 0.13
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.06
174 0.07
175 0.08
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.12
180 0.14
181 0.23
182 0.32
183 0.34
184 0.35
185 0.37
186 0.46
187 0.51
188 0.56
189 0.56
190 0.54
191 0.59
192 0.62
193 0.71
194 0.65
195 0.61
196 0.55
197 0.51
198 0.45
199 0.4
200 0.38
201 0.3
202 0.29
203 0.26
204 0.28
205 0.23
206 0.19
207 0.18
208 0.18
209 0.16
210 0.14
211 0.14
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.12
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.12
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.09
241 0.11
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.14
246 0.13
247 0.14
248 0.13
249 0.13
250 0.16
251 0.19
252 0.19
253 0.2
254 0.2
255 0.19
256 0.19
257 0.18
258 0.13
259 0.1
260 0.09
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.04
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.04
269 0.03
270 0.03
271 0.04
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.08
278 0.11
279 0.11
280 0.13
281 0.17
282 0.19
283 0.25
284 0.26
285 0.25
286 0.23
287 0.25
288 0.24
289 0.22
290 0.22
291 0.2
292 0.2
293 0.2
294 0.19
295 0.17
296 0.19
297 0.21
298 0.21
299 0.19
300 0.2
301 0.19
302 0.2
303 0.2
304 0.18
305 0.19
306 0.25
307 0.26
308 0.29
309 0.29
310 0.3
311 0.36
312 0.41
313 0.44
314 0.44
315 0.49
316 0.47
317 0.55
318 0.57
319 0.55
320 0.51
321 0.46
322 0.38
323 0.32
324 0.32
325 0.26
326 0.21
327 0.17
328 0.15
329 0.16
330 0.15
331 0.13
332 0.1
333 0.08
334 0.08
335 0.09
336 0.08
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.11
344 0.12
345 0.11
346 0.11
347 0.12
348 0.11
349 0.12
350 0.13
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.12
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.09
359 0.09
360 0.08
361 0.12
362 0.12
363 0.12
364 0.13
365 0.13
366 0.13
367 0.13
368 0.13
369 0.09
370 0.08
371 0.08
372 0.07
373 0.06
374 0.05
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.09
382 0.12
383 0.14
384 0.16
385 0.2
386 0.18
387 0.19
388 0.2
389 0.21
390 0.21
391 0.19
392 0.18
393 0.16
394 0.17
395 0.17
396 0.16
397 0.15
398 0.11
399 0.12
400 0.12
401 0.1
402 0.1
403 0.08
404 0.1
405 0.1
406 0.1
407 0.11
408 0.11
409 0.12
410 0.1
411 0.11
412 0.1
413 0.13
414 0.16
415 0.13
416 0.17
417 0.17
418 0.2
419 0.2
420 0.21
421 0.17
422 0.15
423 0.15
424 0.12
425 0.13
426 0.1
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.06
433 0.05
434 0.05
435 0.06
436 0.06
437 0.07
438 0.07
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.07
444 0.07
445 0.08
446 0.08
447 0.1
448 0.15
449 0.21
450 0.3
451 0.4
452 0.42
453 0.44
454 0.48
455 0.49
456 0.52
457 0.55
458 0.51
459 0.49
460 0.51
461 0.52
462 0.47
463 0.43
464 0.36
465 0.27
466 0.22
467 0.14
468 0.1
469 0.09
470 0.09
471 0.11
472 0.1
473 0.09
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.07
478 0.06
479 0.07
480 0.08
481 0.11
482 0.13
483 0.13
484 0.14
485 0.14
486 0.15
487 0.13
488 0.16
489 0.13
490 0.13
491 0.14
492 0.13
493 0.14
494 0.13
495 0.13
496 0.09
497 0.1
498 0.09
499 0.09
500 0.12
501 0.12
502 0.13
503 0.15
504 0.16
505 0.22
506 0.27
507 0.28
508 0.27
509 0.34
510 0.36
511 0.39
512 0.41
513 0.41
514 0.44
515 0.44
516 0.44
517 0.41
518 0.39
519 0.34
520 0.33
521 0.28
522 0.24
523 0.24
524 0.26
525 0.29
526 0.36
527 0.38
528 0.39
529 0.38
530 0.33
531 0.33
532 0.34
533 0.29
534 0.27
535 0.26
536 0.24
537 0.24
538 0.23
539 0.21
540 0.17
541 0.15
542 0.11
543 0.14
544 0.14
545 0.15
546 0.18
547 0.2
548 0.22
549 0.25
550 0.27
551 0.29
552 0.3
553 0.32
554 0.35
555 0.37
556 0.34
557 0.37
558 0.33
559 0.27
560 0.26
561 0.22
562 0.19
563 0.2
564 0.27
565 0.28
566 0.3
567 0.3
568 0.29