FuNGI

A0A4U0X601

Protein Details

Accession

A0A4U0X601

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
108-128	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQ	Hydrophilic
420-443	KEAAQKRREEHKNRDNNKRQRMSG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
411-438	KRRRETEVRKEAAQKRREEHKNRDNNKR

Subcellular Location(s)

mito 12, cyto 8, nucl 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSKKYPKIISHVVEDLPEEVENDDGTTTKIPVDGRKPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPAPASEEEMMIAIFEYTDRVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAAEKDAAAADFHAQMLAKGATQDDGDEAEKPKKTWDSNSITPGTPFMDLLASSLRYWVSYKLSTDPAWERLKVIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRSSPTHDPNTRHVIYGLDADLIMLGIATHEPHFRVLREDVFANDTKPGHCRKCNQPGHMADQCRGAPKPKPGEEEVKKPLKPFIWLHVSILREYLAVEMSVPNQPFRFDLERALDDWVFMCYFVGNDFLPHLPSLDIREDGIDTLIAIWRDNIPIMGGYITKDGHVDLTRAQTIMEGLAKQEDAIFKRRRETEVRKEAAQKRREEHKNRDNNKRQRMSGNGSGFADSPSGYDETLVRRGARGGIIRGEQAPDINALPTFAPGEAQTRSDPRFANAAALTHADIVGNANRANKSAAAALKEQLISSKKPADNQKAELEALFAGTNGAATGSEPNPVLGKRTRNMIDEANDDASSDPSTPGRTTPNREIADPISTGASRGTSGALGGTSKDTVDVMPEDTVKLWEDGYEGRYYEQKFHVSPEDREFRHKVARAYVEGLCWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFTNMSEQVVAFDKGKPFRPYEQLMGVMPALSNHTIPPVFHPLMTEDESPIIEFYPTDFEVDLNGKKFAWQGVALLPFIDETRLLAAMQEKYPLLTADEQRRNAFGAEALIFSTKHPLYDDVATKFYGKRQGKEKFKLDAATSEGLAGKVAKEEGYIPNSGLTYPLEEGGSQEEFTSLEQDDSATVQFYMPVIPGIHKSMLLPGVQFAEPVLDYNDVRITRENAGKSGRQYGGVQLSRDGGRSDGQRVNYAARGGGQESGARYGGGGGGRGQHNGGGGGGWQGNNGYGANGGYGSGSGSGHHAGSGGYGGQAAQAFTQLPPHLAQQAAAHGFPPPGMPPMPPAGYAPPQQPPPQQRNGGGGGYGGQQGGYGGGGGYGGQQGGYGGGGNGNGNGWQGGRNGGDGGGRRRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.63
3	0.66
4	0.71
5	0.66
6	0.62
7	0.59
8	0.51
9	0.42
10	0.39
11	0.32
12	0.24
13	0.2
14	0.15
15	0.12
16	0.11
17	0.11
18	0.1
19	0.09
20	0.08
21	0.1
22	0.11
23	0.11
24	0.11
25	0.14
26	0.16
27	0.23
28	0.32
29	0.4
30	0.46
31	0.56
32	0.6
33	0.64
34	0.65
35	0.61
36	0.57
37	0.51
38	0.48
39	0.41
40	0.4
41	0.33
42	0.3
43	0.26
44	0.22
45	0.18
46	0.12
47	0.09
48	0.07
49	0.08
50	0.08
51	0.09
52	0.1
53	0.12
54	0.18
55	0.21
56	0.23
57	0.29
58	0.34
59	0.37
60	0.41
61	0.41
62	0.4
63	0.37
64	0.37
65	0.31
66	0.26
67	0.22
68	0.18
69	0.15
70	0.11
71	0.09
72	0.07
73	0.05
74	0.05
75	0.06
76	0.06
77	0.08
78	0.08
79	0.09
80	0.1
81	0.16
82	0.26
83	0.33
84	0.36
85	0.37
86	0.39
87	0.41
88	0.41
89	0.39
90	0.32
91	0.29
92	0.27
93	0.25
94	0.24
95	0.21
96	0.2
97	0.18
98	0.15
99	0.1
100	0.13
101	0.19
102	0.26
103	0.37
104	0.46
105	0.55
106	0.66
107	0.74
108	0.8
109	0.82
110	0.79
111	0.76
112	0.76
113	0.73
114	0.7
115	0.71
116	0.63
117	0.59
118	0.56
119	0.49
120	0.39
121	0.32
122	0.25
123	0.16
124	0.14
125	0.11
126	0.1
127	0.1
128	0.11
129	0.09
130	0.08
131	0.12
132	0.11
133	0.1
134	0.1
135	0.1
136	0.11
137	0.11
138	0.11
139	0.09
140	0.1
141	0.11
142	0.13
143	0.16
144	0.21
145	0.23
146	0.23
147	0.28
148	0.33
149	0.36
150	0.4
151	0.47
152	0.49
153	0.53
154	0.59
155	0.57
156	0.5
157	0.47
158	0.41
159	0.33
160	0.25
161	0.19
162	0.13
163	0.11
164	0.1
165	0.11
166	0.12
167	0.12
168	0.11
169	0.13
170	0.12
171	0.12
172	0.14
173	0.16
174	0.18
175	0.19
176	0.22
177	0.24
178	0.28
179	0.28
180	0.32
181	0.32
182	0.35
183	0.36
184	0.34
185	0.31
186	0.3
187	0.33
188	0.27
189	0.26
190	0.21
191	0.18
192	0.2
193	0.19
194	0.18
195	0.14
196	0.14
197	0.12
198	0.12
199	0.11
200	0.1
201	0.1
202	0.09
203	0.13
204	0.15
205	0.16
206	0.18
207	0.23
208	0.3
209	0.32
210	0.33
211	0.37
212	0.41
213	0.47
214	0.5
215	0.55
216	0.57
217	0.61
218	0.63
219	0.62
220	0.66
221	0.59
222	0.52
223	0.43
224	0.34
225	0.29
226	0.27
227	0.21
228	0.12
229	0.11
230	0.1
231	0.09
232	0.08
233	0.06
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.03
238	0.04
239	0.05
240	0.07
241	0.08
242	0.11
243	0.13
244	0.14
245	0.18
246	0.2
247	0.21
248	0.23
249	0.23
250	0.21
251	0.23
252	0.24
253	0.2
254	0.2
255	0.19
256	0.18
257	0.22
258	0.29
259	0.32
260	0.37
261	0.44
262	0.5
263	0.6
264	0.67
265	0.66
266	0.67
267	0.64
268	0.66
269	0.66
270	0.58
271	0.48
272	0.45
273	0.41
274	0.36
275	0.33
276	0.3
277	0.29
278	0.35
279	0.43
280	0.43
281	0.47
282	0.47
283	0.57
284	0.57
285	0.6
286	0.6
287	0.59
288	0.56
289	0.52
290	0.52
291	0.43
292	0.44
293	0.38
294	0.37
295	0.37
296	0.36
297	0.37
298	0.36
299	0.36
300	0.3
301	0.29
302	0.22
303	0.14
304	0.13
305	0.11
306	0.07
307	0.06
308	0.07
309	0.06
310	0.08
311	0.12
312	0.12
313	0.13
314	0.13
315	0.13
316	0.14
317	0.18
318	0.21
319	0.18
320	0.22
321	0.25
322	0.26
323	0.26
324	0.29
325	0.23
326	0.19
327	0.18
328	0.15
329	0.1
330	0.09
331	0.08
332	0.05
333	0.05
334	0.06
335	0.07
336	0.06
337	0.06
338	0.08
339	0.08
340	0.09
341	0.09
342	0.09
343	0.08
344	0.09
345	0.12
346	0.12
347	0.12
348	0.11
349	0.12
350	0.12
351	0.11
352	0.11
353	0.07
354	0.05
355	0.05
356	0.07
357	0.07
358	0.06
359	0.07
360	0.07
361	0.08
362	0.08
363	0.07
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.1
376	0.1
377	0.1
378	0.11
379	0.14
380	0.14
381	0.14
382	0.14
383	0.11
384	0.11
385	0.11
386	0.1
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.07
392	0.08
393	0.1
394	0.12
395	0.2
396	0.26
397	0.27
398	0.33
399	0.36
400	0.39
401	0.45
402	0.52
403	0.54
404	0.59
405	0.6
406	0.58
407	0.64
408	0.68
409	0.68
410	0.65
411	0.59
412	0.54
413	0.62
414	0.68
415	0.68
416	0.7
417	0.71
418	0.75
419	0.78
420	0.84
421	0.84
422	0.84
423	0.86
424	0.81
425	0.74
426	0.67
427	0.66
428	0.61
429	0.59
430	0.51
431	0.43
432	0.38
433	0.35
434	0.31
435	0.25
436	0.18
437	0.1
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.07
442	0.07
443	0.08
444	0.1
445	0.13
446	0.14
447	0.13
448	0.13
449	0.13
450	0.14
451	0.15
452	0.14
453	0.13
454	0.14
455	0.15
456	0.15
457	0.15
458	0.15
459	0.12
460	0.11
461	0.1
462	0.08
463	0.08
464	0.07
465	0.06
466	0.06
467	0.06
468	0.06
469	0.06
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.08
474	0.08
475	0.1
476	0.11
477	0.14
478	0.16
479	0.19
480	0.18
481	0.17
482	0.19
483	0.17
484	0.19
485	0.16
486	0.15
487	0.12
488	0.13
489	0.12
490	0.09
491	0.09
492	0.06
493	0.05
494	0.06
495	0.07
496	0.07
497	0.08
498	0.1
499	0.1
500	0.11
501	0.12
502	0.11
503	0.1
504	0.12
505	0.13
506	0.13
507	0.14
508	0.14
509	0.15
510	0.14
511	0.13
512	0.14
513	0.14
514	0.13
515	0.15
516	0.21
517	0.21
518	0.26
519	0.34
520	0.39
521	0.4
522	0.43
523	0.43
524	0.37
525	0.36
526	0.31
527	0.24
528	0.15
529	0.12
530	0.09
531	0.06
532	0.04
533	0.04
534	0.04
535	0.03
536	0.03
537	0.02
538	0.03
539	0.05
540	0.05
541	0.07
542	0.07
543	0.07
544	0.08
545	0.08
546	0.11
547	0.13
548	0.17
549	0.17
550	0.22
551	0.24
552	0.25
553	0.27
554	0.27
555	0.25
556	0.23
557	0.24
558	0.19
559	0.17
560	0.16
561	0.13
562	0.11
563	0.1
564	0.08
565	0.07
566	0.07
567	0.08
568	0.08
569	0.09
570	0.15
571	0.19
572	0.24
573	0.29
574	0.38
575	0.37
576	0.38
577	0.38
578	0.33
579	0.32
580	0.26
581	0.2
582	0.12
583	0.11
584	0.11
585	0.09
586	0.08
587	0.06
588	0.06
589	0.06
590	0.05
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.04
595	0.05
596	0.05
597	0.05
598	0.05
599	0.05
600	0.05
601	0.05
602	0.06
603	0.06
604	0.07
605	0.07
606	0.07
607	0.07
608	0.08
609	0.08
610	0.08
611	0.08
612	0.06
613	0.06
614	0.07
615	0.08
616	0.09
617	0.09
618	0.09
619	0.09
620	0.14
621	0.14
622	0.17
623	0.18
624	0.19
625	0.19
626	0.21
627	0.28
628	0.28
629	0.3
630	0.33
631	0.38
632	0.36
633	0.41
634	0.41
635	0.36
636	0.39
637	0.4
638	0.35
639	0.34
640	0.36
641	0.33
642	0.34
643	0.31
644	0.24
645	0.21
646	0.19
647	0.13
648	0.1
649	0.08
650	0.05
651	0.04
652	0.05
653	0.06
654	0.07
655	0.07
656	0.08
657	0.08
658	0.09
659	0.14
660	0.17
661	0.16
662	0.19
663	0.2
664	0.25
665	0.28
666	0.3
667	0.28
668	0.24
669	0.24
670	0.21
671	0.2
672	0.16
673	0.14
674	0.11
675	0.09
676	0.11
677	0.13
678	0.13
679	0.11
680	0.1
681	0.09
682	0.1
683	0.12
684	0.11
685	0.09
686	0.12
687	0.16
688	0.18
689	0.24
690	0.26
691	0.27
692	0.3
693	0.35
694	0.36
695	0.36
696	0.35
697	0.32
698	0.29
699	0.26
700	0.22
701	0.16
702	0.12
703	0.09
704	0.09
705	0.08
706	0.08
707	0.07
708	0.09
709	0.09
710	0.09
711	0.13
712	0.19
713	0.19
714	0.18
715	0.19
716	0.19
717	0.22
718	0.25
719	0.22
720	0.15
721	0.15
722	0.15
723	0.14
724	0.13
725	0.09
726	0.06
727	0.06
728	0.06
729	0.09
730	0.1
731	0.1
732	0.1
733	0.1
734	0.12
735	0.15
736	0.17
737	0.14
738	0.15
739	0.14
740	0.14
741	0.15
742	0.14
743	0.13
744	0.11
745	0.11
746	0.14
747	0.16
748	0.15
749	0.14
750	0.13
751	0.11
752	0.11
753	0.1
754	0.06
755	0.05
756	0.06
757	0.06
758	0.06
759	0.07
760	0.1
761	0.13
762	0.13
763	0.14
764	0.13
765	0.13
766	0.14
767	0.13
768	0.12
769	0.14
770	0.2
771	0.28
772	0.35
773	0.37
774	0.37
775	0.37
776	0.36
777	0.32
778	0.27
779	0.17
780	0.13
781	0.12
782	0.11
783	0.11
784	0.1
785	0.1
786	0.1
787	0.16
788	0.13
789	0.13
790	0.14
791	0.15
792	0.17
793	0.22
794	0.27
795	0.23
796	0.25
797	0.25
798	0.26
799	0.25
800	0.26
801	0.31
802	0.3
803	0.33
804	0.41
805	0.5
806	0.58
807	0.66
808	0.68
809	0.63
810	0.63
811	0.61
812	0.53
813	0.46
814	0.4
815	0.33
816	0.27
817	0.22
818	0.19
819	0.16
820	0.15
821	0.12
822	0.08
823	0.08
824	0.08
825	0.07
826	0.07
827	0.1
828	0.14
829	0.16
830	0.16
831	0.16
832	0.16
833	0.17
834	0.16
835	0.15
836	0.11
837	0.1
838	0.1
839	0.11
840	0.1
841	0.1
842	0.11
843	0.13
844	0.13
845	0.11
846	0.1
847	0.1
848	0.1
849	0.1
850	0.12
851	0.09
852	0.08
853	0.08
854	0.08
855	0.08
856	0.09
857	0.09
858	0.07
859	0.07
860	0.07
861	0.07
862	0.07
863	0.08
864	0.07
865	0.08
866	0.08
867	0.1
868	0.12
869	0.15
870	0.15
871	0.15
872	0.15
873	0.16
874	0.18
875	0.17
876	0.15
877	0.13
878	0.16
879	0.15
880	0.15
881	0.11
882	0.11
883	0.1
884	0.11
885	0.12
886	0.11
887	0.11
888	0.12
889	0.18
890	0.16
891	0.18
892	0.2
893	0.21
894	0.24
895	0.3
896	0.3
897	0.29
898	0.34
899	0.36
900	0.36
901	0.41
902	0.36
903	0.33
904	0.32
905	0.34
906	0.39
907	0.38
908	0.36
909	0.29
910	0.32
911	0.3
912	0.3
913	0.25
914	0.17
915	0.18
916	0.2
917	0.25
918	0.27
919	0.28
920	0.3
921	0.31
922	0.33
923	0.32
924	0.3
925	0.24
926	0.21
927	0.21
928	0.18
929	0.18
930	0.16
931	0.15
932	0.16
933	0.18
934	0.16
935	0.14
936	0.13
937	0.12
938	0.13
939	0.12
940	0.11
941	0.09
942	0.15
943	0.16
944	0.17
945	0.17
946	0.15
947	0.15
948	0.15
949	0.14
950	0.08
951	0.08
952	0.1
953	0.11
954	0.1
955	0.09
956	0.09
957	0.1
958	0.11
959	0.1
960	0.08
961	0.07
962	0.07
963	0.08
964	0.07
965	0.07
966	0.06
967	0.06
968	0.06
969	0.06
970	0.06
971	0.06
972	0.09
973	0.1
974	0.1
975	0.1
976	0.1
977	0.08
978	0.09
979	0.09
980	0.07
981	0.06
982	0.06
983	0.06
984	0.07
985	0.08
986	0.08
987	0.07
988	0.08
989	0.09
990	0.09
991	0.15
992	0.14
993	0.15
994	0.16
995	0.18
996	0.21
997	0.2
998	0.21
999	0.18
1000	0.24
1001	0.24
1002	0.23
1003	0.21
1004	0.19
1005	0.19
1006	0.18
1007	0.18
1008	0.12
1009	0.14
1010	0.15
1011	0.15
1012	0.17
1013	0.23
1014	0.24
1015	0.23
1016	0.24
1017	0.26
1018	0.3
1019	0.33
1020	0.34
1021	0.34
1022	0.38
1023	0.43
1024	0.49
1025	0.53
1026	0.56
1027	0.62
1028	0.64
1029	0.61
1030	0.61
1031	0.59
1032	0.52
1033	0.42
1034	0.35
1035	0.27
1036	0.23
1037	0.21
1038	0.15
1039	0.11
1040	0.09
1041	0.09
1042	0.09
1043	0.08
1044	0.06
1045	0.04
1046	0.04
1047	0.04
1048	0.04
1049	0.05
1050	0.06
1051	0.06
1052	0.06
1053	0.06
1054	0.06
1055	0.06
1056	0.06
1057	0.06
1058	0.05
1059	0.06
1060	0.07
1061	0.08
1062	0.08
1063	0.08
1064	0.08
1065	0.08
1066	0.09
1067	0.09
1068	0.1
1069	0.11
1070	0.14
1071	0.15
1072	0.15
1073	0.15
1074	0.16
1075	0.19
1076	0.22

A0A4U0X601

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer