Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0XRJ3

Protein Details
Accession A0A4U0XRJ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
196-222SNSPTQPAPKKRGGRKRKAEIEQEKAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
204-214PKKRGGRKRKA
Subcellular Location(s) nucl 8.5, cyto_nucl 7.5, mito 6, cyto 5.5, plas 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
IPR019006  Sre1_C  
Gene Ontology GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0032933  P:SREBP signaling pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF09427  DUF2014  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11399  bHLHzip_scHMS1_like  
Amino Acid Sequences MDSTLPWPGGFNNAAPAFGQQFANGQAGDDWEDWLRWDPAAEPTSPDDGTFHSGSSKNDSPLQDPALPVQPDFFGKTHGDETLAPPLIVGEDALDFGADSMPGNEPFLFGLSNDAASGFDFDAQAYQPIEPELPMIDTNWTLPSNAQPENVSLSALSNEQGQLPFDTLPPYNTPSLHYSPGPSSQQRTSLSGNSDSNSPTQPAPKKRGGRKRKAEIEQEKAAENGDSQDGDEPPVKKTSHNVIEKRYRNNLNDKIVELRNAVPALRAMGRANEGGGEEDLEGLTPAHKLNKATVMGKATEYIKHLEKRNKTMADEMESLQDRLAAVEAAIGKSKDRQVSNSPPSPSASMRPRQASGASQNSAQGFLSVPQEVPRYSGQSVGQQQQQQQYTQAQQQPTYAPQPRPPVEAQNQQPQYVYGRGRGGVMGKVMMGAMTSIMVMEGFSSQQQDGDDARQLFAVPTLFKRSLAESTSSSPATLAKQAALPFLKLMCIIGALLYLLTPLLTFSPRRKLQRSRHAVRLPQMPSLASPVEVRRKAWLTALQTVYVPKHFLLEVAAVTAKMISLSLRRLVGSETWNAITGTNKEEEAARFKAWDIAVDAQLAGGDAEVSYHRLLLTLMASGTLPDSPTRLMQKAVHFRVFFWELSNAGYGNMVGFKALTEKVGRIYWDSARKMQKELTQLQHRRGGQRREDEEVELLPDHLASLVELDCDDVLNDEMIQRAWNLAWNKPSAFNTTPNSPRDSVVEDHAIRSPLDAVAAWYANMVTDDTLLDATSEHPSSLDTEYYLNLAISVTPPASATQARALAAKAVLSNSRRDANIVAALEALPPTSPNASSMNLVNHAPAAPDVRVALTLAKLLALLSPSTNSPSAAQARERAYDRLATLHLPPSNLTLLTAVACYQLLRLTSQDRVDLPGRAARGVEDTAGNLRLWIGTSAGRKAGLEGEECGRVVDLCLKVVGKVGGWGAGEGDSGYGSAYGSGEGSPTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.24
4 0.21
5 0.22
6 0.22
7 0.14
8 0.16
9 0.18
10 0.2
11 0.17
12 0.15
13 0.14
14 0.15
15 0.18
16 0.16
17 0.16
18 0.15
19 0.15
20 0.16
21 0.19
22 0.19
23 0.15
24 0.15
25 0.15
26 0.22
27 0.24
28 0.24
29 0.23
30 0.25
31 0.29
32 0.29
33 0.27
34 0.21
35 0.21
36 0.26
37 0.23
38 0.2
39 0.21
40 0.23
41 0.25
42 0.33
43 0.34
44 0.32
45 0.37
46 0.39
47 0.37
48 0.4
49 0.43
50 0.37
51 0.34
52 0.34
53 0.36
54 0.35
55 0.31
56 0.27
57 0.24
58 0.24
59 0.27
60 0.23
61 0.19
62 0.2
63 0.24
64 0.24
65 0.23
66 0.23
67 0.21
68 0.24
69 0.28
70 0.28
71 0.24
72 0.22
73 0.21
74 0.19
75 0.18
76 0.14
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.09
89 0.1
90 0.12
91 0.12
92 0.12
93 0.12
94 0.13
95 0.11
96 0.09
97 0.13
98 0.11
99 0.12
100 0.11
101 0.11
102 0.1
103 0.1
104 0.12
105 0.08
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.1
110 0.1
111 0.12
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.12
116 0.12
117 0.11
118 0.11
119 0.09
120 0.1
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.12
126 0.15
127 0.14
128 0.13
129 0.13
130 0.18
131 0.21
132 0.23
133 0.23
134 0.21
135 0.22
136 0.27
137 0.26
138 0.21
139 0.16
140 0.15
141 0.14
142 0.14
143 0.13
144 0.1
145 0.1
146 0.12
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.13
151 0.14
152 0.13
153 0.16
154 0.14
155 0.16
156 0.18
157 0.21
158 0.21
159 0.21
160 0.24
161 0.27
162 0.3
163 0.3
164 0.28
165 0.28
166 0.29
167 0.34
168 0.37
169 0.35
170 0.36
171 0.35
172 0.41
173 0.41
174 0.42
175 0.39
176 0.38
177 0.38
178 0.38
179 0.37
180 0.31
181 0.31
182 0.28
183 0.26
184 0.24
185 0.22
186 0.19
187 0.26
188 0.33
189 0.39
190 0.45
191 0.52
192 0.6
193 0.68
194 0.77
195 0.8
196 0.82
197 0.85
198 0.88
199 0.89
200 0.88
201 0.88
202 0.86
203 0.82
204 0.77
205 0.68
206 0.58
207 0.48
208 0.41
209 0.3
210 0.22
211 0.16
212 0.11
213 0.1
214 0.09
215 0.12
216 0.11
217 0.13
218 0.18
219 0.17
220 0.18
221 0.23
222 0.23
223 0.21
224 0.26
225 0.33
226 0.38
227 0.46
228 0.49
229 0.53
230 0.62
231 0.67
232 0.69
233 0.69
234 0.66
235 0.63
236 0.68
237 0.66
238 0.64
239 0.59
240 0.54
241 0.51
242 0.46
243 0.42
244 0.34
245 0.28
246 0.24
247 0.22
248 0.21
249 0.15
250 0.14
251 0.15
252 0.14
253 0.14
254 0.12
255 0.13
256 0.15
257 0.14
258 0.14
259 0.12
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.09
274 0.12
275 0.13
276 0.15
277 0.21
278 0.24
279 0.24
280 0.27
281 0.26
282 0.25
283 0.24
284 0.24
285 0.2
286 0.19
287 0.19
288 0.19
289 0.22
290 0.27
291 0.34
292 0.4
293 0.45
294 0.5
295 0.57
296 0.56
297 0.52
298 0.52
299 0.48
300 0.45
301 0.41
302 0.34
303 0.31
304 0.28
305 0.27
306 0.21
307 0.19
308 0.13
309 0.11
310 0.11
311 0.06
312 0.05
313 0.06
314 0.07
315 0.07
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.12
320 0.16
321 0.19
322 0.2
323 0.24
324 0.3
325 0.4
326 0.47
327 0.5
328 0.48
329 0.44
330 0.44
331 0.43
332 0.37
333 0.34
334 0.33
335 0.33
336 0.36
337 0.38
338 0.37
339 0.36
340 0.36
341 0.33
342 0.33
343 0.33
344 0.29
345 0.26
346 0.28
347 0.26
348 0.25
349 0.21
350 0.15
351 0.09
352 0.1
353 0.11
354 0.09
355 0.09
356 0.1
357 0.12
358 0.12
359 0.14
360 0.14
361 0.16
362 0.16
363 0.18
364 0.17
365 0.22
366 0.26
367 0.27
368 0.3
369 0.3
370 0.33
371 0.36
372 0.36
373 0.31
374 0.29
375 0.28
376 0.27
377 0.31
378 0.32
379 0.27
380 0.27
381 0.28
382 0.27
383 0.26
384 0.3
385 0.29
386 0.27
387 0.31
388 0.38
389 0.38
390 0.4
391 0.39
392 0.39
393 0.4
394 0.45
395 0.44
396 0.46
397 0.46
398 0.42
399 0.4
400 0.34
401 0.31
402 0.28
403 0.25
404 0.18
405 0.18
406 0.18
407 0.18
408 0.18
409 0.17
410 0.12
411 0.12
412 0.09
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.06
417 0.04
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.02
423 0.02
424 0.02
425 0.02
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.04
430 0.05
431 0.05
432 0.06
433 0.06
434 0.08
435 0.08
436 0.09
437 0.13
438 0.12
439 0.12
440 0.11
441 0.12
442 0.1
443 0.1
444 0.1
445 0.07
446 0.08
447 0.13
448 0.13
449 0.13
450 0.14
451 0.15
452 0.16
453 0.17
454 0.18
455 0.15
456 0.17
457 0.19
458 0.19
459 0.17
460 0.14
461 0.14
462 0.13
463 0.13
464 0.11
465 0.09
466 0.11
467 0.11
468 0.14
469 0.13
470 0.12
471 0.11
472 0.1
473 0.1
474 0.08
475 0.07
476 0.04
477 0.04
478 0.04
479 0.03
480 0.03
481 0.03
482 0.03
483 0.02
484 0.02
485 0.02
486 0.02
487 0.02
488 0.02
489 0.03
490 0.05
491 0.06
492 0.09
493 0.18
494 0.24
495 0.29
496 0.36
497 0.45
498 0.54
499 0.63
500 0.71
501 0.67
502 0.72
503 0.72
504 0.68
505 0.63
506 0.61
507 0.52
508 0.44
509 0.39
510 0.29
511 0.25
512 0.24
513 0.19
514 0.12
515 0.11
516 0.13
517 0.2
518 0.21
519 0.21
520 0.22
521 0.24
522 0.24
523 0.25
524 0.26
525 0.22
526 0.27
527 0.28
528 0.24
529 0.23
530 0.24
531 0.22
532 0.18
533 0.16
534 0.09
535 0.1
536 0.09
537 0.09
538 0.08
539 0.08
540 0.07
541 0.07
542 0.07
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.04
547 0.03
548 0.04
549 0.04
550 0.05
551 0.07
552 0.09
553 0.1
554 0.1
555 0.1
556 0.12
557 0.13
558 0.14
559 0.14
560 0.14
561 0.13
562 0.14
563 0.14
564 0.13
565 0.13
566 0.12
567 0.12
568 0.12
569 0.11
570 0.1
571 0.12
572 0.13
573 0.16
574 0.17
575 0.15
576 0.15
577 0.15
578 0.19
579 0.17
580 0.17
581 0.14
582 0.14
583 0.14
584 0.14
585 0.13
586 0.09
587 0.09
588 0.08
589 0.05
590 0.03
591 0.03
592 0.02
593 0.03
594 0.03
595 0.05
596 0.05
597 0.05
598 0.05
599 0.06
600 0.06
601 0.06
602 0.07
603 0.06
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.05
608 0.06
609 0.05
610 0.06
611 0.05
612 0.06
613 0.07
614 0.1
615 0.13
616 0.14
617 0.16
618 0.2
619 0.28
620 0.36
621 0.4
622 0.42
623 0.39
624 0.38
625 0.41
626 0.4
627 0.32
628 0.24
629 0.21
630 0.16
631 0.17
632 0.17
633 0.12
634 0.09
635 0.09
636 0.07
637 0.06
638 0.06
639 0.05
640 0.04
641 0.04
642 0.04
643 0.07
644 0.07
645 0.08
646 0.09
647 0.1
648 0.12
649 0.14
650 0.14
651 0.14
652 0.17
653 0.21
654 0.28
655 0.3
656 0.35
657 0.41
658 0.42
659 0.42
660 0.43
661 0.42
662 0.42
663 0.46
664 0.48
665 0.51
666 0.54
667 0.56
668 0.59
669 0.57
670 0.58
671 0.6
672 0.59
673 0.56
674 0.61
675 0.6
676 0.59
677 0.58
678 0.51
679 0.43
680 0.35
681 0.29
682 0.2
683 0.17
684 0.11
685 0.09
686 0.07
687 0.06
688 0.06
689 0.04
690 0.05
691 0.05
692 0.05
693 0.05
694 0.06
695 0.05
696 0.05
697 0.05
698 0.05
699 0.05
700 0.05
701 0.05
702 0.05
703 0.06
704 0.06
705 0.07
706 0.06
707 0.06
708 0.06
709 0.12
710 0.14
711 0.17
712 0.2
713 0.22
714 0.24
715 0.27
716 0.28
717 0.3
718 0.3
719 0.32
720 0.33
721 0.38
722 0.43
723 0.41
724 0.44
725 0.39
726 0.37
727 0.34
728 0.34
729 0.28
730 0.26
731 0.3
732 0.26
733 0.26
734 0.28
735 0.27
736 0.22
737 0.21
738 0.18
739 0.11
740 0.11
741 0.1
742 0.08
743 0.09
744 0.1
745 0.09
746 0.08
747 0.08
748 0.07
749 0.08
750 0.07
751 0.05
752 0.05
753 0.05
754 0.06
755 0.06
756 0.06
757 0.05
758 0.05
759 0.07
760 0.1
761 0.1
762 0.09
763 0.09
764 0.1
765 0.13
766 0.14
767 0.13
768 0.11
769 0.11
770 0.12
771 0.12
772 0.12
773 0.09
774 0.08
775 0.07
776 0.07
777 0.07
778 0.08
779 0.07
780 0.07
781 0.08
782 0.08
783 0.11
784 0.11
785 0.12
786 0.15
787 0.17
788 0.18
789 0.18
790 0.18
791 0.17
792 0.16
793 0.15
794 0.12
795 0.12
796 0.17
797 0.18
798 0.22
799 0.23
800 0.26
801 0.25
802 0.26
803 0.26
804 0.23
805 0.26
806 0.23
807 0.2
808 0.17
809 0.17
810 0.15
811 0.14
812 0.11
813 0.06
814 0.06
815 0.08
816 0.09
817 0.09
818 0.11
819 0.13
820 0.15
821 0.16
822 0.19
823 0.2
824 0.21
825 0.21
826 0.19
827 0.17
828 0.16
829 0.15
830 0.13
831 0.13
832 0.11
833 0.12
834 0.12
835 0.11
836 0.12
837 0.12
838 0.12
839 0.09
840 0.1
841 0.09
842 0.09
843 0.08
844 0.08
845 0.08
846 0.08
847 0.08
848 0.08
849 0.09
850 0.1
851 0.14
852 0.14
853 0.14
854 0.14
855 0.2
856 0.24
857 0.27
858 0.29
859 0.32
860 0.34
861 0.39
862 0.4
863 0.37
864 0.34
865 0.34
866 0.32
867 0.29
868 0.27
869 0.24
870 0.24
871 0.28
872 0.28
873 0.25
874 0.25
875 0.25
876 0.25
877 0.23
878 0.21
879 0.15
880 0.14
881 0.13
882 0.13
883 0.1
884 0.09
885 0.09
886 0.08
887 0.08
888 0.1
889 0.1
890 0.11
891 0.14
892 0.17
893 0.22
894 0.24
895 0.26
896 0.25
897 0.29
898 0.3
899 0.29
900 0.29
901 0.27
902 0.27
903 0.24
904 0.24
905 0.2
906 0.21
907 0.19
908 0.18
909 0.15
910 0.15
911 0.18
912 0.19
913 0.18
914 0.14
915 0.13
916 0.12
917 0.13
918 0.12
919 0.11
920 0.14
921 0.18
922 0.21
923 0.22
924 0.22
925 0.21
926 0.22
927 0.25
928 0.22
929 0.2
930 0.21
931 0.22
932 0.23
933 0.23
934 0.22
935 0.17
936 0.15
937 0.15
938 0.19
939 0.17
940 0.16
941 0.18
942 0.18
943 0.18
944 0.21
945 0.21
946 0.14
947 0.15
948 0.15
949 0.15
950 0.15
951 0.15
952 0.13
953 0.12
954 0.12
955 0.09
956 0.09
957 0.06
958 0.06
959 0.06
960 0.05
961 0.05
962 0.06
963 0.06
964 0.06
965 0.07
966 0.07