Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0TPV4

Protein Details
Accession A0A4U0TPV4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
195-215EDGKMRGRKRQRIPHTAVERRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
200-204RGRKR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0046983  F:protein dimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11395  bHLHzip_SREBP_like  
Amino Acid Sequences MPDDREGGWSHGYYRHETPTLTGEWADHGAQIGNMQDVDLRMFHPGHDYYGEPYASASGSTFLPRDAHEHGDGSHWAHDVDVATPSTATFSNDVAEGYRHLTRISDANLLRPPENRLSLGPPLINTTGRAVAQQPRHALDTTQDAYNHRPTINRSATAPEPRHCLSTVPSPTLPALKRSGTSEDGEDDYNPPPGEDGKMRGRKRQRIPHTAVERRYRENLNTHLDRLRQTVPALAARSGKMCEGGTQEGVKPSKCEILNGAIEHIGVLQEENLGLRDEVKVLKARVDDAFRGHARGSAFDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.35
3 0.33
4 0.33
5 0.33
6 0.32
7 0.31
8 0.28
9 0.24
10 0.19
11 0.19
12 0.21
13 0.18
14 0.14
15 0.13
16 0.12
17 0.11
18 0.12
19 0.1
20 0.09
21 0.09
22 0.08
23 0.09
24 0.09
25 0.1
26 0.09
27 0.09
28 0.11
29 0.12
30 0.12
31 0.16
32 0.16
33 0.17
34 0.18
35 0.19
36 0.18
37 0.23
38 0.22
39 0.17
40 0.17
41 0.15
42 0.14
43 0.13
44 0.1
45 0.07
46 0.08
47 0.1
48 0.1
49 0.1
50 0.11
51 0.12
52 0.16
53 0.17
54 0.21
55 0.2
56 0.21
57 0.2
58 0.22
59 0.22
60 0.19
61 0.18
62 0.14
63 0.13
64 0.12
65 0.13
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.12
90 0.14
91 0.16
92 0.2
93 0.18
94 0.22
95 0.26
96 0.27
97 0.27
98 0.25
99 0.27
100 0.24
101 0.26
102 0.23
103 0.21
104 0.22
105 0.23
106 0.24
107 0.2
108 0.16
109 0.17
110 0.17
111 0.16
112 0.13
113 0.13
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.12
118 0.17
119 0.2
120 0.23
121 0.23
122 0.23
123 0.25
124 0.24
125 0.22
126 0.17
127 0.2
128 0.18
129 0.18
130 0.17
131 0.17
132 0.19
133 0.23
134 0.23
135 0.17
136 0.18
137 0.19
138 0.27
139 0.29
140 0.26
141 0.24
142 0.25
143 0.28
144 0.34
145 0.34
146 0.26
147 0.29
148 0.29
149 0.3
150 0.27
151 0.24
152 0.2
153 0.25
154 0.26
155 0.24
156 0.24
157 0.23
158 0.23
159 0.27
160 0.25
161 0.19
162 0.2
163 0.18
164 0.19
165 0.2
166 0.24
167 0.21
168 0.21
169 0.2
170 0.18
171 0.19
172 0.18
173 0.16
174 0.14
175 0.13
176 0.14
177 0.13
178 0.11
179 0.1
180 0.11
181 0.13
182 0.12
183 0.17
184 0.24
185 0.33
186 0.35
187 0.43
188 0.52
189 0.59
190 0.68
191 0.73
192 0.73
193 0.74
194 0.79
195 0.8
196 0.81
197 0.79
198 0.76
199 0.75
200 0.69
201 0.63
202 0.62
203 0.55
204 0.49
205 0.47
206 0.46
207 0.46
208 0.44
209 0.43
210 0.42
211 0.41
212 0.39
213 0.37
214 0.33
215 0.27
216 0.25
217 0.25
218 0.24
219 0.25
220 0.25
221 0.23
222 0.23
223 0.22
224 0.23
225 0.21
226 0.19
227 0.17
228 0.15
229 0.15
230 0.17
231 0.19
232 0.2
233 0.2
234 0.22
235 0.26
236 0.28
237 0.26
238 0.24
239 0.24
240 0.28
241 0.27
242 0.27
243 0.24
244 0.28
245 0.31
246 0.3
247 0.29
248 0.22
249 0.22
250 0.2
251 0.17
252 0.11
253 0.07
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.11
265 0.13
266 0.16
267 0.21
268 0.2
269 0.25
270 0.25
271 0.27
272 0.31
273 0.34
274 0.33
275 0.31
276 0.38
277 0.35
278 0.37
279 0.34
280 0.32
281 0.28