Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0U1W9

Protein Details
Accession A0A4U0U1W9    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-61APIFVNAKKATKKRYPPPHVSPPRPKRPPSPPREDQFADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-53KKATKKRYPPPHVSPPRPKRPPSP
291-301KRRRREYRQIK
422-439RAKRAAGRRTEDVRKRKR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MSGAESDSSGLSSAGEEEIQKLAPIFVNAKKATKKRYPPPHVSPPRPKRPPSPPREDQFADNPDIAVIAMFRSRFNEAFPTKLAHFGPQDIERGVTDQPPSPQVESLLCALLGLVLNRKKPVERGHHGRALEEAVSTMKPQWPHYWNGVNPLHGPRDFNTMPPSDRLNLLRTLIHWSLTSSEAIQTILKDRYKQQRHADDENQPLSVQPWGSDGDKRRYFLVQGLDDTDFRVYRESSRYTKNASWINVAGGIEELKALGTKLSDVDGSQMARRLAGRIQNAIPTFEASEEKRRRREYRQIKRAAFSRPEPGFSLYEGRTRGKRLRYTYDDDDDDEDGAVGGDSDATSTRRSTRNQSSARNTPFEAVPTYTASGRQVHKPRTGEYGEPLLKAALENATEELAQEEVDGAAGTDGDSEVVGNGRAKRAAGRRTEDVRKRKRVVYDDEDEDEAAEMSEEDEEAGADGWDSDRNAEDDTEMPDADDESEIEDGDAEPQSLVIKLKLSRGHAAMKGEGTTAEESTNNTATEARRNSLHEPPQHSAQQPNGLPTQTLAGADPNTASTHLPNGYASANMTNSTTTNAANQSLETSTPSPATSAYPTPASISFPSMEAAQKPPAVPAASVTELENKDGLVQGNGLLGAEAAVDGAGI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.09
4 0.1
5 0.12
6 0.12
7 0.12
8 0.11
9 0.12
10 0.13
11 0.15
12 0.18
13 0.21
14 0.3
15 0.32
16 0.38
17 0.46
18 0.52
19 0.58
20 0.64
21 0.7
22 0.72
23 0.81
24 0.83
25 0.84
26 0.87
27 0.89
28 0.89
29 0.89
30 0.9
31 0.9
32 0.91
33 0.9
34 0.87
35 0.85
36 0.86
37 0.86
38 0.84
39 0.84
40 0.82
41 0.79
42 0.81
43 0.74
44 0.68
45 0.65
46 0.6
47 0.54
48 0.45
49 0.39
50 0.3
51 0.27
52 0.22
53 0.13
54 0.09
55 0.06
56 0.08
57 0.09
58 0.1
59 0.13
60 0.17
61 0.17
62 0.19
63 0.28
64 0.27
65 0.3
66 0.31
67 0.33
68 0.29
69 0.35
70 0.33
71 0.29
72 0.29
73 0.28
74 0.31
75 0.28
76 0.3
77 0.26
78 0.26
79 0.21
80 0.21
81 0.2
82 0.19
83 0.18
84 0.19
85 0.2
86 0.23
87 0.26
88 0.25
89 0.24
90 0.23
91 0.22
92 0.21
93 0.2
94 0.17
95 0.14
96 0.12
97 0.11
98 0.1
99 0.1
100 0.09
101 0.14
102 0.17
103 0.2
104 0.22
105 0.24
106 0.25
107 0.3
108 0.39
109 0.42
110 0.48
111 0.55
112 0.61
113 0.65
114 0.63
115 0.57
116 0.5
117 0.42
118 0.33
119 0.24
120 0.16
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.13
125 0.14
126 0.15
127 0.19
128 0.26
129 0.28
130 0.32
131 0.37
132 0.43
133 0.41
134 0.48
135 0.47
136 0.4
137 0.4
138 0.4
139 0.38
140 0.31
141 0.33
142 0.25
143 0.31
144 0.3
145 0.29
146 0.29
147 0.28
148 0.28
149 0.29
150 0.3
151 0.23
152 0.26
153 0.26
154 0.25
155 0.24
156 0.24
157 0.22
158 0.2
159 0.26
160 0.23
161 0.21
162 0.19
163 0.17
164 0.17
165 0.18
166 0.18
167 0.11
168 0.11
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.1
173 0.13
174 0.18
175 0.19
176 0.21
177 0.28
178 0.38
179 0.45
180 0.52
181 0.57
182 0.61
183 0.67
184 0.72
185 0.71
186 0.68
187 0.68
188 0.61
189 0.52
190 0.42
191 0.35
192 0.28
193 0.23
194 0.16
195 0.09
196 0.09
197 0.11
198 0.12
199 0.17
200 0.22
201 0.3
202 0.33
203 0.33
204 0.33
205 0.32
206 0.32
207 0.31
208 0.32
209 0.24
210 0.22
211 0.24
212 0.24
213 0.22
214 0.22
215 0.19
216 0.13
217 0.11
218 0.12
219 0.1
220 0.13
221 0.17
222 0.22
223 0.25
224 0.3
225 0.33
226 0.36
227 0.37
228 0.4
229 0.4
230 0.37
231 0.35
232 0.3
233 0.28
234 0.25
235 0.23
236 0.16
237 0.12
238 0.1
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.03
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.05
252 0.07
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.12
257 0.11
258 0.12
259 0.12
260 0.12
261 0.14
262 0.18
263 0.19
264 0.19
265 0.2
266 0.23
267 0.23
268 0.23
269 0.2
270 0.16
271 0.14
272 0.12
273 0.14
274 0.11
275 0.21
276 0.28
277 0.34
278 0.4
279 0.47
280 0.51
281 0.57
282 0.66
283 0.68
284 0.71
285 0.75
286 0.78
287 0.74
288 0.72
289 0.68
290 0.63
291 0.56
292 0.47
293 0.45
294 0.36
295 0.36
296 0.33
297 0.32
298 0.26
299 0.23
300 0.25
301 0.17
302 0.19
303 0.2
304 0.2
305 0.19
306 0.23
307 0.28
308 0.3
309 0.35
310 0.37
311 0.43
312 0.46
313 0.51
314 0.51
315 0.5
316 0.44
317 0.39
318 0.35
319 0.28
320 0.23
321 0.16
322 0.11
323 0.07
324 0.06
325 0.05
326 0.03
327 0.02
328 0.02
329 0.02
330 0.03
331 0.04
332 0.05
333 0.06
334 0.07
335 0.11
336 0.15
337 0.18
338 0.25
339 0.33
340 0.42
341 0.47
342 0.54
343 0.57
344 0.61
345 0.62
346 0.57
347 0.48
348 0.4
349 0.35
350 0.29
351 0.23
352 0.16
353 0.14
354 0.13
355 0.13
356 0.12
357 0.12
358 0.13
359 0.16
360 0.17
361 0.24
362 0.3
363 0.34
364 0.4
365 0.41
366 0.41
367 0.42
368 0.42
369 0.36
370 0.31
371 0.34
372 0.29
373 0.27
374 0.26
375 0.19
376 0.17
377 0.16
378 0.14
379 0.07
380 0.06
381 0.06
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.06
388 0.05
389 0.04
390 0.04
391 0.03
392 0.04
393 0.04
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.04
405 0.05
406 0.07
407 0.08
408 0.1
409 0.1
410 0.11
411 0.17
412 0.23
413 0.29
414 0.33
415 0.37
416 0.42
417 0.48
418 0.58
419 0.61
420 0.65
421 0.68
422 0.72
423 0.71
424 0.7
425 0.71
426 0.68
427 0.68
428 0.64
429 0.6
430 0.55
431 0.52
432 0.47
433 0.4
434 0.33
435 0.24
436 0.17
437 0.1
438 0.07
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.03
445 0.03
446 0.04
447 0.04
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.04
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.07
456 0.08
457 0.09
458 0.09
459 0.1
460 0.1
461 0.12
462 0.13
463 0.12
464 0.11
465 0.1
466 0.1
467 0.1
468 0.09
469 0.06
470 0.06
471 0.07
472 0.07
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.07
477 0.07
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.07
482 0.08
483 0.09
484 0.08
485 0.12
486 0.13
487 0.19
488 0.23
489 0.26
490 0.29
491 0.31
492 0.35
493 0.35
494 0.36
495 0.32
496 0.29
497 0.26
498 0.23
499 0.2
500 0.17
501 0.15
502 0.13
503 0.12
504 0.11
505 0.12
506 0.15
507 0.17
508 0.14
509 0.14
510 0.16
511 0.17
512 0.25
513 0.26
514 0.25
515 0.26
516 0.3
517 0.34
518 0.4
519 0.47
520 0.45
521 0.49
522 0.51
523 0.54
524 0.55
525 0.53
526 0.48
527 0.45
528 0.46
529 0.4
530 0.4
531 0.37
532 0.32
533 0.3
534 0.26
535 0.24
536 0.17
537 0.16
538 0.13
539 0.12
540 0.12
541 0.13
542 0.13
543 0.11
544 0.11
545 0.12
546 0.12
547 0.11
548 0.15
549 0.15
550 0.16
551 0.15
552 0.16
553 0.15
554 0.15
555 0.16
556 0.14
557 0.14
558 0.14
559 0.14
560 0.14
561 0.13
562 0.15
563 0.15
564 0.13
565 0.16
566 0.17
567 0.19
568 0.18
569 0.18
570 0.18
571 0.17
572 0.18
573 0.18
574 0.17
575 0.17
576 0.17
577 0.17
578 0.15
579 0.15
580 0.18
581 0.18
582 0.19
583 0.21
584 0.21
585 0.21
586 0.24
587 0.24
588 0.25
589 0.22
590 0.22
591 0.2
592 0.19
593 0.19
594 0.18
595 0.2
596 0.19
597 0.22
598 0.23
599 0.24
600 0.24
601 0.25
602 0.27
603 0.26
604 0.23
605 0.22
606 0.24
607 0.23
608 0.24
609 0.23
610 0.27
611 0.26
612 0.28
613 0.25
614 0.19
615 0.19
616 0.21
617 0.2
618 0.13
619 0.13
620 0.12
621 0.13
622 0.13
623 0.11
624 0.08
625 0.07
626 0.06
627 0.05
628 0.05
629 0.03