Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0TSQ6

Protein Details
Accession A0A4U0TSQ6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-63LHTHTNRGHKLKRSTRYAKTGRLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
487-500RRVGGRRRRVVGKG
Subcellular Location(s) mito 18.5, cyto_mito 11.5, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039602  Rxt2  
IPR013904  RXT2_N  
Gene Ontology GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08595  RXT2_N  
Amino Acid Sequences MAAQQIAFAETLRAMKLAIRRNRAASPASSSSDSGDDDGLHTHTNRGHKLKRSTRYAKTGRLDTTGGQQAWKRKVQHAGHERYVVNKRPKLYDEDGDVVDPQDLPSDLEEEDQHLYGEPIRENAFGGVRLEALLRPLTSAAELPEHPSLREAYTSKALTQMCDDAADMVRREKAALWKAKRLLQRFRGDGGWMACGKFETEQDDLLLQDEQAEGGASTLPSIVETELSAMPRPEEAAEGVHDKGELSEQDETGGDAMNGVEGHDHFADTLARTEQAEGYQNGQFEGHEHDLQPAENANGEHAQDQAPHPAIAELRDKDDSDSRSSTSNPSAPSHAMTTRARARSPPPATSPSPSPSDSASIPSVHPWFIASTSCLPDRDLGLPPQEAEETRRLLMLYVQKQENIVRQLGTLYESLQRADRLRRETFRACKAEGHMVPDGKGGVMTEMSDGEDWYDPEDWGLTARDLKDGKLEKGKDEVEDVAEEEGRRVGGRRRRVVGKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.14
3 0.21
4 0.3
5 0.37
6 0.43
7 0.47
8 0.52
9 0.56
10 0.57
11 0.53
12 0.47
13 0.46
14 0.43
15 0.43
16 0.4
17 0.37
18 0.34
19 0.32
20 0.3
21 0.23
22 0.19
23 0.15
24 0.13
25 0.15
26 0.14
27 0.14
28 0.14
29 0.16
30 0.2
31 0.27
32 0.33
33 0.41
34 0.47
35 0.54
36 0.64
37 0.71
38 0.76
39 0.79
40 0.81
41 0.81
42 0.84
43 0.82
44 0.81
45 0.78
46 0.76
47 0.68
48 0.62
49 0.56
50 0.46
51 0.46
52 0.44
53 0.37
54 0.33
55 0.34
56 0.38
57 0.43
58 0.48
59 0.45
60 0.44
61 0.54
62 0.56
63 0.63
64 0.65
65 0.66
66 0.65
67 0.67
68 0.61
69 0.59
70 0.61
71 0.59
72 0.59
73 0.54
74 0.53
75 0.53
76 0.55
77 0.55
78 0.53
79 0.49
80 0.45
81 0.44
82 0.41
83 0.36
84 0.34
85 0.26
86 0.21
87 0.16
88 0.11
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.1
94 0.09
95 0.11
96 0.11
97 0.12
98 0.13
99 0.12
100 0.12
101 0.1
102 0.11
103 0.12
104 0.14
105 0.12
106 0.13
107 0.15
108 0.15
109 0.15
110 0.16
111 0.15
112 0.13
113 0.13
114 0.11
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.1
129 0.11
130 0.13
131 0.18
132 0.18
133 0.17
134 0.18
135 0.18
136 0.16
137 0.2
138 0.18
139 0.16
140 0.22
141 0.22
142 0.21
143 0.26
144 0.25
145 0.22
146 0.23
147 0.21
148 0.15
149 0.15
150 0.15
151 0.1
152 0.12
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.13
157 0.13
158 0.13
159 0.14
160 0.2
161 0.26
162 0.34
163 0.37
164 0.42
165 0.46
166 0.51
167 0.55
168 0.54
169 0.56
170 0.56
171 0.58
172 0.54
173 0.53
174 0.48
175 0.42
176 0.39
177 0.3
178 0.25
179 0.19
180 0.16
181 0.14
182 0.13
183 0.13
184 0.11
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.12
190 0.12
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.04
203 0.03
204 0.03
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.06
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.09
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.07
234 0.08
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.04
248 0.04
249 0.06
250 0.05
251 0.06
252 0.05
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.11
264 0.1
265 0.13
266 0.14
267 0.14
268 0.13
269 0.13
270 0.12
271 0.1
272 0.14
273 0.14
274 0.13
275 0.14
276 0.15
277 0.15
278 0.15
279 0.15
280 0.1
281 0.08
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.13
293 0.13
294 0.12
295 0.12
296 0.12
297 0.12
298 0.13
299 0.18
300 0.15
301 0.17
302 0.18
303 0.18
304 0.19
305 0.24
306 0.24
307 0.23
308 0.23
309 0.22
310 0.22
311 0.23
312 0.24
313 0.23
314 0.24
315 0.22
316 0.22
317 0.24
318 0.24
319 0.24
320 0.24
321 0.21
322 0.23
323 0.21
324 0.26
325 0.31
326 0.32
327 0.32
328 0.32
329 0.35
330 0.4
331 0.44
332 0.42
333 0.4
334 0.43
335 0.45
336 0.45
337 0.45
338 0.38
339 0.37
340 0.34
341 0.3
342 0.26
343 0.26
344 0.23
345 0.22
346 0.2
347 0.17
348 0.17
349 0.19
350 0.19
351 0.17
352 0.16
353 0.13
354 0.12
355 0.12
356 0.13
357 0.12
358 0.13
359 0.17
360 0.18
361 0.18
362 0.18
363 0.19
364 0.2
365 0.2
366 0.2
367 0.2
368 0.21
369 0.21
370 0.2
371 0.21
372 0.19
373 0.17
374 0.18
375 0.2
376 0.19
377 0.19
378 0.2
379 0.18
380 0.17
381 0.22
382 0.27
383 0.28
384 0.32
385 0.33
386 0.33
387 0.35
388 0.38
389 0.39
390 0.34
391 0.29
392 0.23
393 0.22
394 0.22
395 0.21
396 0.2
397 0.14
398 0.12
399 0.15
400 0.15
401 0.16
402 0.18
403 0.2
404 0.22
405 0.3
406 0.35
407 0.37
408 0.44
409 0.48
410 0.53
411 0.59
412 0.63
413 0.65
414 0.63
415 0.58
416 0.55
417 0.55
418 0.57
419 0.49
420 0.47
421 0.43
422 0.39
423 0.37
424 0.34
425 0.3
426 0.2
427 0.19
428 0.14
429 0.09
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.1
438 0.11
439 0.11
440 0.13
441 0.13
442 0.12
443 0.12
444 0.13
445 0.11
446 0.11
447 0.13
448 0.12
449 0.16
450 0.17
451 0.23
452 0.23
453 0.23
454 0.31
455 0.33
456 0.38
457 0.43
458 0.44
459 0.4
460 0.47
461 0.48
462 0.41
463 0.39
464 0.35
465 0.27
466 0.26
467 0.25
468 0.2
469 0.2
470 0.18
471 0.16
472 0.15
473 0.14
474 0.14
475 0.16
476 0.23
477 0.3
478 0.4
479 0.48
480 0.55