Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0TIR2

Protein Details
Accession A0A4U0TIR2    Localization Confidence High Confidence Score 19.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-48SSSAPNKRAKPSHHHQQKRRDARQLSTQTRHydrophilic
124-143KTPTVTARRRKKSGPMRLRLHydrophilic
146-174VRKLRALGSSKKQKKEDKKNEKNDKASDSHydrophilic
194-220LSRPSTPPAKFRKRQRHKSWLPTHLFHHydrophilic
760-785LYAASRDQRSSRKRQHSNPNTTLREAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-30KRAKPS
115-118RGKR
128-212VTARRRKKSGPMRLRLETVRKLRALGSSKKQKKEDKKNEKNDKASDSAAKTTQAIPTRRPKVKPATLSRPSTPPAKFRKRQRHKS
Subcellular Location(s) mito 12, cyto 8, nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MPPSAPHTLKRKQPASTPSSSAPNKRAKPSHHHQQKRRDARQLSTQTRTAAFHHGELDVDKYVKSREYEIRALEEGLQRSKKGLNQRAFQLVPKDLRRRTASHNVKRVPQRLQERGKREMADDKTPTVTARRRKKSGPMRLRLETVRKLRALGSSKKQKKEDKKNEKNDKASDSAAKTTQAIPTRRPKVKPATLSRPSTPPAKFRKRQRHKSWLPTHLFHAKRARMTIPSAPLWRFAIPLSPTAKSHRPTHRARSERGCVAWDMSYMATIALEGREDRLLWALKGVGVEEERGGKGGKWIQGLRTRTVVLKACEGGMLAPATVIWCAPASRAESEKGERVRQVWIRVHPAAFLQVWEEVVKLAKTARPQVKVEDLRFEVGSIEISGPGATEALAGALWAFPAPDSNSSMASNSGEKASNLTAATTNNTRPLVPIPTALAETLQALAPLTNPSLLPGDALLAFNIQDPRLHHPPRRRAIPAPTAENQAALLNLCATWPPDIHLPISPPQIFSRAARQAAQRGLRSQKAINRRRALVGPGEVPGVQAGDTGVPVLLYTNSPNVSAVTSSSSSSSSSYTLLLPPKALPAVWYSIMYTPLSTGQQPRFAGLDELRWGAFESGGAWFPGDFPGTEAGWAWEVGVRRANQPVKPKAKQAKEQRETPGCAWEKLLQPKDDGTPGKEGAAPRISGLTQVPPALALKLFPHQHTTTKASPPPALPPTLDPEKALLAVHLTLLTRGVPNERANIYRLPRTQPRRDAWLALYAASRDQRSSRKRQHSNPNTTLREAKEGGGSELPEYISNRRLAHSLLHPSPPPQAGEANYPDCPCEEDLIGFITTGGFSLAGGKGRGVGNLVLSKIRSADGEGTENRESARLCIVRNIGEKVGRLGAWEVVGAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.7
3 0.68
4 0.65
5 0.58
6 0.61
7 0.63
8 0.61
9 0.6
10 0.63
11 0.64
12 0.68
13 0.72
14 0.7
15 0.73
16 0.76
17 0.78
18 0.79
19 0.83
20 0.83
21 0.86
22 0.9
23 0.91
24 0.9
25 0.89
26 0.84
27 0.79
28 0.81
29 0.81
30 0.77
31 0.72
32 0.67
33 0.6
34 0.57
35 0.52
36 0.45
37 0.42
38 0.36
39 0.32
40 0.31
41 0.28
42 0.26
43 0.25
44 0.25
45 0.19
46 0.18
47 0.16
48 0.16
49 0.18
50 0.21
51 0.22
52 0.26
53 0.31
54 0.37
55 0.43
56 0.44
57 0.46
58 0.43
59 0.42
60 0.41
61 0.38
62 0.35
63 0.37
64 0.37
65 0.33
66 0.34
67 0.36
68 0.37
69 0.42
70 0.48
71 0.49
72 0.52
73 0.57
74 0.62
75 0.6
76 0.59
77 0.53
78 0.5
79 0.5
80 0.53
81 0.57
82 0.52
83 0.59
84 0.6
85 0.59
86 0.61
87 0.64
88 0.66
89 0.67
90 0.74
91 0.71
92 0.75
93 0.79
94 0.77
95 0.74
96 0.72
97 0.71
98 0.71
99 0.77
100 0.78
101 0.75
102 0.75
103 0.73
104 0.65
105 0.59
106 0.58
107 0.53
108 0.52
109 0.49
110 0.44
111 0.4
112 0.39
113 0.37
114 0.36
115 0.39
116 0.4
117 0.48
118 0.55
119 0.59
120 0.64
121 0.73
122 0.76
123 0.79
124 0.8
125 0.79
126 0.77
127 0.75
128 0.76
129 0.72
130 0.69
131 0.66
132 0.62
133 0.59
134 0.52
135 0.49
136 0.46
137 0.47
138 0.47
139 0.47
140 0.5
141 0.55
142 0.63
143 0.69
144 0.76
145 0.78
146 0.82
147 0.85
148 0.86
149 0.86
150 0.88
151 0.92
152 0.95
153 0.94
154 0.9
155 0.85
156 0.78
157 0.7
158 0.63
159 0.58
160 0.49
161 0.44
162 0.37
163 0.33
164 0.29
165 0.27
166 0.3
167 0.31
168 0.31
169 0.34
170 0.43
171 0.52
172 0.58
173 0.59
174 0.61
175 0.64
176 0.7
177 0.72
178 0.71
179 0.72
180 0.73
181 0.75
182 0.7
183 0.65
184 0.59
185 0.56
186 0.5
187 0.48
188 0.51
189 0.56
190 0.61
191 0.67
192 0.76
193 0.8
194 0.88
195 0.9
196 0.9
197 0.89
198 0.93
199 0.91
200 0.9
201 0.85
202 0.76
203 0.71
204 0.69
205 0.61
206 0.57
207 0.56
208 0.5
209 0.47
210 0.48
211 0.45
212 0.38
213 0.41
214 0.4
215 0.36
216 0.35
217 0.37
218 0.34
219 0.34
220 0.33
221 0.29
222 0.24
223 0.2
224 0.22
225 0.18
226 0.23
227 0.24
228 0.23
229 0.24
230 0.29
231 0.36
232 0.33
233 0.41
234 0.45
235 0.5
236 0.56
237 0.66
238 0.7
239 0.7
240 0.72
241 0.72
242 0.68
243 0.64
244 0.58
245 0.49
246 0.4
247 0.35
248 0.3
249 0.21
250 0.16
251 0.12
252 0.11
253 0.09
254 0.08
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.04
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.11
266 0.12
267 0.11
268 0.12
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.09
274 0.08
275 0.09
276 0.08
277 0.1
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.12
283 0.16
284 0.19
285 0.21
286 0.22
287 0.27
288 0.34
289 0.36
290 0.34
291 0.32
292 0.3
293 0.28
294 0.31
295 0.3
296 0.24
297 0.24
298 0.22
299 0.2
300 0.19
301 0.18
302 0.13
303 0.1
304 0.08
305 0.06
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.07
316 0.09
317 0.12
318 0.14
319 0.15
320 0.17
321 0.2
322 0.25
323 0.26
324 0.26
325 0.25
326 0.25
327 0.3
328 0.3
329 0.35
330 0.34
331 0.35
332 0.38
333 0.39
334 0.38
335 0.31
336 0.28
337 0.24
338 0.19
339 0.15
340 0.1
341 0.09
342 0.09
343 0.08
344 0.08
345 0.06
346 0.07
347 0.07
348 0.06
349 0.07
350 0.08
351 0.11
352 0.19
353 0.25
354 0.28
355 0.3
356 0.32
357 0.4
358 0.44
359 0.42
360 0.39
361 0.34
362 0.31
363 0.3
364 0.27
365 0.18
366 0.13
367 0.12
368 0.07
369 0.07
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.02
384 0.02
385 0.02
386 0.02
387 0.02
388 0.04
389 0.05
390 0.06
391 0.08
392 0.09
393 0.11
394 0.11
395 0.12
396 0.11
397 0.11
398 0.1
399 0.09
400 0.1
401 0.09
402 0.09
403 0.1
404 0.09
405 0.1
406 0.1
407 0.1
408 0.09
409 0.09
410 0.12
411 0.12
412 0.12
413 0.14
414 0.14
415 0.14
416 0.13
417 0.15
418 0.16
419 0.14
420 0.14
421 0.12
422 0.12
423 0.12
424 0.11
425 0.09
426 0.07
427 0.06
428 0.06
429 0.05
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.06
439 0.07
440 0.07
441 0.06
442 0.05
443 0.06
444 0.06
445 0.06
446 0.05
447 0.04
448 0.05
449 0.06
450 0.07
451 0.06
452 0.08
453 0.09
454 0.16
455 0.24
456 0.28
457 0.31
458 0.39
459 0.49
460 0.54
461 0.58
462 0.55
463 0.51
464 0.54
465 0.58
466 0.52
467 0.48
468 0.43
469 0.4
470 0.36
471 0.32
472 0.25
473 0.17
474 0.14
475 0.09
476 0.07
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.05
483 0.05
484 0.07
485 0.09
486 0.1
487 0.11
488 0.12
489 0.13
490 0.16
491 0.21
492 0.19
493 0.19
494 0.18
495 0.2
496 0.21
497 0.19
498 0.24
499 0.23
500 0.24
501 0.26
502 0.27
503 0.29
504 0.33
505 0.36
506 0.3
507 0.3
508 0.34
509 0.33
510 0.34
511 0.33
512 0.33
513 0.4
514 0.46
515 0.51
516 0.51
517 0.5
518 0.5
519 0.49
520 0.45
521 0.38
522 0.32
523 0.24
524 0.2
525 0.19
526 0.16
527 0.14
528 0.12
529 0.08
530 0.06
531 0.05
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.04
537 0.03
538 0.03
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.05
543 0.08
544 0.08
545 0.09
546 0.09
547 0.09
548 0.09
549 0.09
550 0.09
551 0.09
552 0.1
553 0.1
554 0.11
555 0.11
556 0.11
557 0.12
558 0.12
559 0.1
560 0.1
561 0.11
562 0.11
563 0.14
564 0.16
565 0.16
566 0.15
567 0.15
568 0.15
569 0.15
570 0.14
571 0.11
572 0.1
573 0.13
574 0.13
575 0.13
576 0.13
577 0.13
578 0.15
579 0.14
580 0.12
581 0.1
582 0.11
583 0.12
584 0.13
585 0.17
586 0.18
587 0.24
588 0.24
589 0.24
590 0.23
591 0.22
592 0.24
593 0.19
594 0.19
595 0.15
596 0.16
597 0.14
598 0.14
599 0.14
600 0.11
601 0.1
602 0.07
603 0.06
604 0.07
605 0.08
606 0.07
607 0.07
608 0.06
609 0.07
610 0.08
611 0.08
612 0.06
613 0.07
614 0.09
615 0.09
616 0.1
617 0.09
618 0.09
619 0.09
620 0.09
621 0.08
622 0.08
623 0.09
624 0.1
625 0.15
626 0.15
627 0.16
628 0.24
629 0.29
630 0.31
631 0.4
632 0.48
633 0.53
634 0.55
635 0.63
636 0.65
637 0.68
638 0.73
639 0.74
640 0.76
641 0.72
642 0.76
643 0.75
644 0.72
645 0.68
646 0.6
647 0.58
648 0.49
649 0.44
650 0.4
651 0.36
652 0.36
653 0.41
654 0.45
655 0.37
656 0.36
657 0.38
658 0.38
659 0.39
660 0.34
661 0.28
662 0.27
663 0.27
664 0.26
665 0.27
666 0.25
667 0.24
668 0.25
669 0.23
670 0.18
671 0.2
672 0.18
673 0.17
674 0.18
675 0.16
676 0.14
677 0.14
678 0.14
679 0.13
680 0.13
681 0.13
682 0.11
683 0.09
684 0.1
685 0.16
686 0.19
687 0.19
688 0.25
689 0.26
690 0.3
691 0.34
692 0.39
693 0.38
694 0.43
695 0.46
696 0.43
697 0.44
698 0.41
699 0.44
700 0.41
701 0.37
702 0.31
703 0.29
704 0.33
705 0.35
706 0.34
707 0.27
708 0.25
709 0.24
710 0.24
711 0.21
712 0.15
713 0.11
714 0.1
715 0.1
716 0.1
717 0.09
718 0.08
719 0.09
720 0.09
721 0.09
722 0.1
723 0.13
724 0.17
725 0.19
726 0.24
727 0.26
728 0.27
729 0.29
730 0.34
731 0.35
732 0.38
733 0.4
734 0.42
735 0.5
736 0.57
737 0.64
738 0.66
739 0.67
740 0.67
741 0.66
742 0.63
743 0.55
744 0.54
745 0.44
746 0.37
747 0.33
748 0.25
749 0.26
750 0.25
751 0.24
752 0.19
753 0.24
754 0.32
755 0.39
756 0.5
757 0.57
758 0.64
759 0.73
760 0.81
761 0.87
762 0.88
763 0.9
764 0.89
765 0.88
766 0.81
767 0.76
768 0.72
769 0.63
770 0.58
771 0.49
772 0.41
773 0.35
774 0.32
775 0.31
776 0.27
777 0.25
778 0.19
779 0.19
780 0.19
781 0.16
782 0.18
783 0.18
784 0.21
785 0.25
786 0.25
787 0.26
788 0.27
789 0.26
790 0.29
791 0.33
792 0.37
793 0.36
794 0.4
795 0.4
796 0.4
797 0.44
798 0.41
799 0.35
800 0.28
801 0.28
802 0.26
803 0.31
804 0.35
805 0.33
806 0.34
807 0.33
808 0.31
809 0.28
810 0.28
811 0.23
812 0.2
813 0.17
814 0.15
815 0.15
816 0.17
817 0.17
818 0.14
819 0.13
820 0.1
821 0.09
822 0.08
823 0.08
824 0.05
825 0.05
826 0.08
827 0.1
828 0.12
829 0.13
830 0.13
831 0.16
832 0.17
833 0.17
834 0.16
835 0.15
836 0.17
837 0.2
838 0.21
839 0.2
840 0.2
841 0.21
842 0.2
843 0.2
844 0.16
845 0.16
846 0.2
847 0.21
848 0.26
849 0.27
850 0.32
851 0.33
852 0.32
853 0.3
854 0.28
855 0.25
856 0.21
857 0.28
858 0.25
859 0.25
860 0.31
861 0.34
862 0.38
863 0.41
864 0.44
865 0.39
866 0.4
867 0.4
868 0.37
869 0.37
870 0.3
871 0.27
872 0.25
873 0.22
874 0.19