Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V5N4W7

Protein Details
Accession A0A4V5N4W7    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
127-148AAGGKKRKRGTGRGRGRPPKGTBasic
301-320QDNRAYKRLRRSKQARAAAVHydrophilic
400-422LPEHLREALRRYKKRRAGGSVGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
129-151GGKKRKRGTGRGRGRPPKGTGPR
410-415RYKKRR
Subcellular Location(s) nucl 9.5, mito 9, cyto_nucl 7, cyto 3.5, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MASPPSYGGATSPPPTTGLALPRQRPTLALPGQVPSRKPSLAPPSATAATPSAHPLRQTSFPPTDSLEAQHALAQGNNAFSRQYSPSAADSDAGGAGLEGFSDDDNDINSAISGPAGEPSSGVFDGAAGGKKRKRGTGRGRGRPPKGTGPRAGSASLVNGEEGGAGRGAKSTAGDDGDADAAASDDDEDEDDAGGRGGRAPLYEGGQMSADQLAEERERKRLFYEGITEEQRSRLAAFQRSKLRTADVRKLVNQVLGQSVPQNVVLVVGAYAKMFAGMLIEEAREVQGEWEAAEPKRADGQDNRAYKRLRRSKQARAAAVEDKTQASPPETKKGGEQTNGSQTDGAPAAESVKQEPTSPSNDHSLSNNVSEPDAELAELPSGGAAGLERDLEECDRGPLLPEHLREALRRYKKRRAGGSVGFTGLGLEGRENTAPRMGGRRLFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.24
4 0.24
5 0.26
6 0.32
7 0.39
8 0.44
9 0.48
10 0.5
11 0.47
12 0.45
13 0.43
14 0.44
15 0.4
16 0.39
17 0.36
18 0.37
19 0.44
20 0.46
21 0.43
22 0.37
23 0.38
24 0.34
25 0.34
26 0.39
27 0.41
28 0.44
29 0.45
30 0.44
31 0.45
32 0.46
33 0.44
34 0.37
35 0.29
36 0.22
37 0.2
38 0.23
39 0.21
40 0.21
41 0.22
42 0.24
43 0.27
44 0.31
45 0.33
46 0.36
47 0.36
48 0.36
49 0.37
50 0.36
51 0.35
52 0.32
53 0.3
54 0.26
55 0.22
56 0.21
57 0.21
58 0.2
59 0.17
60 0.17
61 0.16
62 0.14
63 0.15
64 0.15
65 0.14
66 0.12
67 0.12
68 0.16
69 0.17
70 0.19
71 0.18
72 0.2
73 0.22
74 0.24
75 0.24
76 0.2
77 0.18
78 0.16
79 0.14
80 0.11
81 0.08
82 0.06
83 0.05
84 0.04
85 0.04
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.07
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.06
106 0.07
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.08
111 0.07
112 0.08
113 0.1
114 0.13
115 0.12
116 0.17
117 0.2
118 0.26
119 0.29
120 0.35
121 0.41
122 0.48
123 0.57
124 0.63
125 0.71
126 0.75
127 0.83
128 0.85
129 0.83
130 0.79
131 0.72
132 0.72
133 0.7
134 0.65
135 0.6
136 0.56
137 0.54
138 0.49
139 0.45
140 0.35
141 0.27
142 0.22
143 0.18
144 0.13
145 0.1
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.07
166 0.06
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.07
189 0.09
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.1
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.07
202 0.11
203 0.11
204 0.17
205 0.18
206 0.18
207 0.19
208 0.21
209 0.21
210 0.19
211 0.23
212 0.2
213 0.23
214 0.24
215 0.24
216 0.21
217 0.2
218 0.19
219 0.14
220 0.12
221 0.12
222 0.15
223 0.22
224 0.24
225 0.29
226 0.38
227 0.39
228 0.41
229 0.38
230 0.37
231 0.36
232 0.4
233 0.42
234 0.4
235 0.4
236 0.4
237 0.43
238 0.4
239 0.36
240 0.3
241 0.23
242 0.18
243 0.16
244 0.14
245 0.12
246 0.12
247 0.1
248 0.09
249 0.08
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.08
278 0.11
279 0.11
280 0.15
281 0.14
282 0.14
283 0.19
284 0.19
285 0.21
286 0.22
287 0.31
288 0.35
289 0.42
290 0.44
291 0.45
292 0.47
293 0.49
294 0.56
295 0.57
296 0.55
297 0.59
298 0.65
299 0.7
300 0.77
301 0.8
302 0.74
303 0.67
304 0.66
305 0.6
306 0.54
307 0.45
308 0.36
309 0.29
310 0.26
311 0.23
312 0.2
313 0.17
314 0.23
315 0.25
316 0.32
317 0.32
318 0.32
319 0.34
320 0.41
321 0.43
322 0.39
323 0.39
324 0.36
325 0.44
326 0.44
327 0.41
328 0.33
329 0.28
330 0.27
331 0.25
332 0.19
333 0.11
334 0.09
335 0.11
336 0.13
337 0.14
338 0.12
339 0.16
340 0.16
341 0.18
342 0.21
343 0.22
344 0.26
345 0.28
346 0.28
347 0.3
348 0.31
349 0.31
350 0.3
351 0.31
352 0.28
353 0.28
354 0.27
355 0.22
356 0.21
357 0.2
358 0.18
359 0.15
360 0.13
361 0.11
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.07
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.04
371 0.03
372 0.04
373 0.05
374 0.05
375 0.06
376 0.07
377 0.09
378 0.1
379 0.12
380 0.11
381 0.13
382 0.13
383 0.13
384 0.16
385 0.16
386 0.21
387 0.25
388 0.26
389 0.29
390 0.33
391 0.35
392 0.34
393 0.38
394 0.42
395 0.47
396 0.56
397 0.6
398 0.66
399 0.73
400 0.8
401 0.83
402 0.82
403 0.81
404 0.79
405 0.78
406 0.71
407 0.63
408 0.54
409 0.44
410 0.35
411 0.26
412 0.18
413 0.11
414 0.09
415 0.09
416 0.11
417 0.14
418 0.15
419 0.16
420 0.19
421 0.2
422 0.21
423 0.28
424 0.3