Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0TX47

Protein Details
Accession A0A4U0TX47    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
111-134GKVASSEEPKKKKRKVAPAESGAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-127PKKKKRKVA
453-492QKKKAKPAEDMANGAGEGKGKRKAGEDDDGKGLPLGKKPK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MSKDTSTSTSYSSFTSRAKDQLMTMDSITEDSAEVRMKPEELPTKLDQLKASATREYSLKNYAAAVELYSEAAEVQDEMNGEMVPENADLLYQYGRCLYHVAVAKSDVLGGKVASSEEPKKKKRKVAPAESGAAGASKGNTAGLLGDAMKTGEQKTAEEVVEAAVDEKDGVEKDESAEGNKPFFQITGDENWTDSEDDEDEAGAEAEEDEDDFAIAYEILDVARVLLGRKLESVQQAAGKETTEQSEVRHLKERLADTHDLQAEISLENERFADAINDTRDSLALKLELYTQENSLIAEAHFKLSLALEFASVTSTADGEGESSDTKVAQVDEKMRAEAAAEMEKAIASCRLRISKEEESLASLEAAKAEERRKTIQDVKEMVADMEQRLIDLQNPAVSLSGAAATGPAGAPDGSDPLRGVLGAMLGESKIEQQRRLQEATSQANDLSGLVKQKKKAKPAEDMANGAGEGKGKRKAGEDDDGKGLPLGKKPKSENGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.3
3 0.31
4 0.34
5 0.36
6 0.36
7 0.34
8 0.38
9 0.37
10 0.34
11 0.31
12 0.26
13 0.23
14 0.22
15 0.2
16 0.13
17 0.1
18 0.08
19 0.11
20 0.12
21 0.12
22 0.14
23 0.15
24 0.16
25 0.17
26 0.25
27 0.3
28 0.31
29 0.37
30 0.37
31 0.45
32 0.46
33 0.49
34 0.41
35 0.36
36 0.4
37 0.39
38 0.39
39 0.34
40 0.33
41 0.32
42 0.33
43 0.33
44 0.3
45 0.3
46 0.28
47 0.24
48 0.24
49 0.22
50 0.22
51 0.19
52 0.15
53 0.11
54 0.11
55 0.1
56 0.09
57 0.09
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.05
62 0.05
63 0.06
64 0.06
65 0.07
66 0.08
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.09
79 0.08
80 0.09
81 0.11
82 0.11
83 0.12
84 0.14
85 0.13
86 0.17
87 0.22
88 0.23
89 0.22
90 0.23
91 0.23
92 0.21
93 0.22
94 0.16
95 0.11
96 0.11
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.13
103 0.21
104 0.29
105 0.39
106 0.48
107 0.57
108 0.65
109 0.73
110 0.78
111 0.81
112 0.83
113 0.84
114 0.85
115 0.81
116 0.76
117 0.67
118 0.57
119 0.46
120 0.35
121 0.24
122 0.15
123 0.09
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.08
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.14
143 0.17
144 0.16
145 0.15
146 0.14
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.08
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.05
156 0.05
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.12
162 0.12
163 0.13
164 0.17
165 0.17
166 0.18
167 0.18
168 0.17
169 0.14
170 0.14
171 0.13
172 0.1
173 0.12
174 0.15
175 0.17
176 0.16
177 0.16
178 0.17
179 0.17
180 0.15
181 0.13
182 0.09
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.04
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.04
212 0.04
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.11
219 0.12
220 0.13
221 0.12
222 0.14
223 0.14
224 0.15
225 0.14
226 0.12
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.18
234 0.2
235 0.21
236 0.28
237 0.27
238 0.27
239 0.31
240 0.32
241 0.26
242 0.3
243 0.29
244 0.23
245 0.28
246 0.26
247 0.22
248 0.2
249 0.17
250 0.12
251 0.11
252 0.1
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.06
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.05
262 0.09
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.11
267 0.11
268 0.1
269 0.1
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.07
274 0.08
275 0.09
276 0.11
277 0.12
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.1
283 0.09
284 0.06
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.07
316 0.08
317 0.11
318 0.15
319 0.2
320 0.21
321 0.21
322 0.2
323 0.19
324 0.18
325 0.16
326 0.14
327 0.11
328 0.11
329 0.1
330 0.1
331 0.11
332 0.1
333 0.09
334 0.11
335 0.1
336 0.12
337 0.16
338 0.2
339 0.22
340 0.25
341 0.32
342 0.34
343 0.37
344 0.37
345 0.33
346 0.31
347 0.3
348 0.28
349 0.2
350 0.14
351 0.11
352 0.09
353 0.09
354 0.08
355 0.12
356 0.15
357 0.19
358 0.22
359 0.26
360 0.29
361 0.35
362 0.43
363 0.44
364 0.49
365 0.48
366 0.46
367 0.45
368 0.43
369 0.35
370 0.29
371 0.24
372 0.17
373 0.15
374 0.13
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.12
380 0.12
381 0.11
382 0.11
383 0.12
384 0.11
385 0.11
386 0.09
387 0.08
388 0.07
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.04
393 0.05
394 0.05
395 0.04
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.06
400 0.09
401 0.1
402 0.11
403 0.11
404 0.11
405 0.11
406 0.11
407 0.1
408 0.07
409 0.07
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.05
414 0.06
415 0.06
416 0.1
417 0.16
418 0.19
419 0.22
420 0.28
421 0.37
422 0.43
423 0.45
424 0.42
425 0.4
426 0.45
427 0.5
428 0.47
429 0.39
430 0.33
431 0.31
432 0.3
433 0.25
434 0.18
435 0.13
436 0.18
437 0.24
438 0.29
439 0.36
440 0.45
441 0.52
442 0.61
443 0.68
444 0.67
445 0.7
446 0.74
447 0.78
448 0.72
449 0.69
450 0.6
451 0.51
452 0.44
453 0.34
454 0.26
455 0.19
456 0.17
457 0.19
458 0.24
459 0.25
460 0.27
461 0.31
462 0.38
463 0.41
464 0.49
465 0.48
466 0.46
467 0.5
468 0.48
469 0.43
470 0.37
471 0.35
472 0.29
473 0.32
474 0.37
475 0.37
476 0.45
477 0.5