Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0TMD7

Protein Details
Accession A0A4U0TMD7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-100PKNPRSWWKVYRKLMREEERHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
349-368AKKRPASTASIFMPKKKVRR
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPAPSLITVAQRACVKVIPNITDVAETPYELILPVLKRIRNPQQLREIEEKSSHIADADAELWRSFIARDIPNWQDKIVEPKNPRSWWKVYRKLMREEERAKEEDDAKLAAAMSGAKQEKNANRAQFVSKVLPEVGPGTRPAFLDGNPNPYYHKQSGITKVPALKNAKRGTDVLAALKKQSAQAAKDRSIHRKNGFDRTLTAVSDNKSQIKALPAWMVNEQKKPQPAAAASFSPATKGRMPTQSVFAPRKGLTAQEKTVNEAIRKSNAEKEARLRALTGSKPVATTAPSPPASARPTARVAAAARLSPPQSVPGRASSPPAPAGLTATVAAAARLSPPKPVAGEAAGSAKKRPASTASIFMPKKKVRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.25
3 0.26
4 0.32
5 0.3
6 0.29
7 0.3
8 0.29
9 0.27
10 0.26
11 0.25
12 0.19
13 0.16
14 0.16
15 0.14
16 0.13
17 0.12
18 0.12
19 0.11
20 0.11
21 0.18
22 0.23
23 0.25
24 0.29
25 0.38
26 0.48
27 0.54
28 0.6
29 0.61
30 0.66
31 0.68
32 0.71
33 0.69
34 0.62
35 0.55
36 0.51
37 0.44
38 0.37
39 0.34
40 0.27
41 0.2
42 0.17
43 0.14
44 0.14
45 0.13
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.11
50 0.1
51 0.1
52 0.09
53 0.11
54 0.16
55 0.16
56 0.19
57 0.24
58 0.3
59 0.35
60 0.36
61 0.33
62 0.29
63 0.28
64 0.36
65 0.35
66 0.38
67 0.38
68 0.46
69 0.54
70 0.57
71 0.61
72 0.57
73 0.61
74 0.63
75 0.68
76 0.69
77 0.7
78 0.75
79 0.77
80 0.79
81 0.8
82 0.78
83 0.77
84 0.73
85 0.7
86 0.65
87 0.6
88 0.53
89 0.47
90 0.41
91 0.33
92 0.28
93 0.22
94 0.17
95 0.15
96 0.14
97 0.1
98 0.08
99 0.07
100 0.06
101 0.12
102 0.13
103 0.12
104 0.14
105 0.2
106 0.24
107 0.29
108 0.34
109 0.3
110 0.31
111 0.33
112 0.34
113 0.31
114 0.3
115 0.28
116 0.23
117 0.22
118 0.21
119 0.18
120 0.16
121 0.16
122 0.13
123 0.11
124 0.12
125 0.12
126 0.13
127 0.13
128 0.15
129 0.13
130 0.13
131 0.21
132 0.21
133 0.26
134 0.25
135 0.25
136 0.26
137 0.27
138 0.33
139 0.26
140 0.28
141 0.24
142 0.29
143 0.35
144 0.38
145 0.37
146 0.33
147 0.37
148 0.35
149 0.39
150 0.4
151 0.36
152 0.39
153 0.41
154 0.4
155 0.36
156 0.35
157 0.32
158 0.3
159 0.28
160 0.24
161 0.23
162 0.22
163 0.2
164 0.2
165 0.17
166 0.14
167 0.16
168 0.15
169 0.14
170 0.21
171 0.25
172 0.28
173 0.33
174 0.36
175 0.43
176 0.45
177 0.5
178 0.47
179 0.5
180 0.5
181 0.54
182 0.52
183 0.43
184 0.4
185 0.39
186 0.36
187 0.29
188 0.26
189 0.2
190 0.19
191 0.22
192 0.22
193 0.19
194 0.18
195 0.18
196 0.18
197 0.18
198 0.18
199 0.15
200 0.17
201 0.16
202 0.17
203 0.21
204 0.26
205 0.26
206 0.3
207 0.31
208 0.3
209 0.33
210 0.32
211 0.29
212 0.27
213 0.25
214 0.24
215 0.25
216 0.22
217 0.2
218 0.2
219 0.19
220 0.17
221 0.17
222 0.16
223 0.17
224 0.19
225 0.23
226 0.27
227 0.31
228 0.3
229 0.33
230 0.34
231 0.38
232 0.39
233 0.35
234 0.34
235 0.3
236 0.31
237 0.27
238 0.28
239 0.28
240 0.3
241 0.32
242 0.35
243 0.35
244 0.36
245 0.4
246 0.37
247 0.32
248 0.3
249 0.3
250 0.28
251 0.3
252 0.29
253 0.32
254 0.36
255 0.38
256 0.38
257 0.41
258 0.45
259 0.45
260 0.42
261 0.36
262 0.32
263 0.34
264 0.33
265 0.32
266 0.26
267 0.24
268 0.24
269 0.24
270 0.22
271 0.19
272 0.2
273 0.19
274 0.24
275 0.24
276 0.25
277 0.25
278 0.3
279 0.3
280 0.32
281 0.3
282 0.28
283 0.31
284 0.31
285 0.3
286 0.28
287 0.27
288 0.27
289 0.27
290 0.23
291 0.21
292 0.23
293 0.24
294 0.21
295 0.21
296 0.22
297 0.23
298 0.25
299 0.26
300 0.27
301 0.3
302 0.3
303 0.35
304 0.3
305 0.31
306 0.3
307 0.28
308 0.24
309 0.2
310 0.22
311 0.18
312 0.16
313 0.13
314 0.11
315 0.11
316 0.1
317 0.1
318 0.07
319 0.07
320 0.1
321 0.14
322 0.15
323 0.18
324 0.19
325 0.22
326 0.23
327 0.25
328 0.24
329 0.22
330 0.22
331 0.2
332 0.26
333 0.27
334 0.26
335 0.27
336 0.28
337 0.3
338 0.3
339 0.32
340 0.29
341 0.34
342 0.37
343 0.43
344 0.44
345 0.5
346 0.51
347 0.53
348 0.57