Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V5N3P4

Protein Details
Accession A0A4V5N3P4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-38ARGEQATKRVKEKKAKAKHDIHNEQLCSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-28KRVKEKKAKAK
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 10, mito_nucl 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR045844  RRM_Ist3-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12411  RRM_ist3_like  
Amino Acid Sequences MSREALFSLVARGEQATKRVKEKKAKAKHDIHNEQLCSIAQGTFRWKLSAEVRQRVIETAENSRHESAFTLICEQPQQLLYTNIVGCDFAHERIAIFSMQSIRQVERLNDIELQKVVPPNASWHTDYRDTAYIYIGGLPFELSEGDILTILSQYGNPVHINLVRDKETGKSRGFCFLKYEDQRSCDLAVDNLSGASVMGRMMSVDHTRYKKKEGEIETVGDNIEDEGDETDKEGTARSKRRKTESESEEERPTIKEEVELAKLKRDMDDDDPMKGYMVKEKQAEVEEALKAVSLQKAKGKDSEVMITRTTTGGNMADRTGTVQSLLILARTSKDMGRAGRAGGEQRRQSQMMIGVGSGEEIRVSGRCLIAQEAVRGVRDDIDTVMLPLSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.27
3 0.33
4 0.36
5 0.46
6 0.54
7 0.62
8 0.67
9 0.75
10 0.79
11 0.81
12 0.86
13 0.87
14 0.89
15 0.89
16 0.89
17 0.87
18 0.85
19 0.82
20 0.73
21 0.63
22 0.55
23 0.46
24 0.36
25 0.29
26 0.22
27 0.15
28 0.16
29 0.22
30 0.25
31 0.26
32 0.25
33 0.25
34 0.28
35 0.33
36 0.4
37 0.43
38 0.46
39 0.49
40 0.5
41 0.5
42 0.46
43 0.42
44 0.37
45 0.31
46 0.32
47 0.34
48 0.35
49 0.37
50 0.38
51 0.35
52 0.31
53 0.29
54 0.23
55 0.2
56 0.18
57 0.2
58 0.19
59 0.2
60 0.21
61 0.2
62 0.19
63 0.18
64 0.18
65 0.15
66 0.16
67 0.16
68 0.18
69 0.18
70 0.16
71 0.15
72 0.14
73 0.12
74 0.15
75 0.16
76 0.12
77 0.14
78 0.13
79 0.13
80 0.14
81 0.15
82 0.1
83 0.09
84 0.1
85 0.12
86 0.12
87 0.16
88 0.17
89 0.16
90 0.2
91 0.23
92 0.22
93 0.24
94 0.26
95 0.24
96 0.27
97 0.26
98 0.24
99 0.22
100 0.22
101 0.19
102 0.19
103 0.17
104 0.14
105 0.14
106 0.16
107 0.19
108 0.22
109 0.22
110 0.22
111 0.27
112 0.28
113 0.29
114 0.28
115 0.28
116 0.25
117 0.23
118 0.21
119 0.17
120 0.14
121 0.15
122 0.12
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.07
143 0.06
144 0.07
145 0.08
146 0.11
147 0.13
148 0.14
149 0.17
150 0.17
151 0.18
152 0.18
153 0.2
154 0.23
155 0.26
156 0.27
157 0.27
158 0.27
159 0.35
160 0.35
161 0.32
162 0.31
163 0.29
164 0.35
165 0.35
166 0.39
167 0.32
168 0.34
169 0.35
170 0.32
171 0.3
172 0.22
173 0.19
174 0.14
175 0.13
176 0.1
177 0.09
178 0.07
179 0.06
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.05
190 0.06
191 0.08
192 0.14
193 0.18
194 0.22
195 0.24
196 0.29
197 0.32
198 0.33
199 0.39
200 0.39
201 0.41
202 0.39
203 0.39
204 0.34
205 0.31
206 0.27
207 0.19
208 0.14
209 0.08
210 0.06
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.11
222 0.18
223 0.27
224 0.36
225 0.44
226 0.5
227 0.58
228 0.63
229 0.67
230 0.7
231 0.67
232 0.66
233 0.64
234 0.62
235 0.57
236 0.5
237 0.43
238 0.34
239 0.3
240 0.23
241 0.17
242 0.14
243 0.14
244 0.17
245 0.2
246 0.24
247 0.22
248 0.25
249 0.27
250 0.26
251 0.25
252 0.24
253 0.23
254 0.22
255 0.31
256 0.27
257 0.27
258 0.28
259 0.26
260 0.25
261 0.23
262 0.19
263 0.18
264 0.21
265 0.23
266 0.24
267 0.25
268 0.27
269 0.28
270 0.28
271 0.23
272 0.22
273 0.18
274 0.17
275 0.16
276 0.12
277 0.11
278 0.11
279 0.14
280 0.12
281 0.14
282 0.19
283 0.23
284 0.26
285 0.29
286 0.3
287 0.3
288 0.31
289 0.35
290 0.34
291 0.32
292 0.31
293 0.28
294 0.26
295 0.23
296 0.2
297 0.14
298 0.12
299 0.12
300 0.13
301 0.13
302 0.13
303 0.13
304 0.12
305 0.15
306 0.14
307 0.11
308 0.1
309 0.09
310 0.09
311 0.11
312 0.11
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.1
317 0.11
318 0.13
319 0.12
320 0.16
321 0.21
322 0.22
323 0.28
324 0.28
325 0.27
326 0.29
327 0.3
328 0.33
329 0.36
330 0.41
331 0.41
332 0.44
333 0.49
334 0.47
335 0.45
336 0.42
337 0.39
338 0.34
339 0.29
340 0.24
341 0.19
342 0.17
343 0.18
344 0.13
345 0.09
346 0.05
347 0.05
348 0.06
349 0.07
350 0.09
351 0.11
352 0.12
353 0.13
354 0.15
355 0.18
356 0.22
357 0.23
358 0.23
359 0.25
360 0.26
361 0.26
362 0.26
363 0.24
364 0.22
365 0.21
366 0.2
367 0.16
368 0.17
369 0.17
370 0.16