FuNGI

A0A4U0U061

Protein Details

Accession

A0A4U0U061

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
118-137	NRETDYQKRRFQRNLNEETE	Hydrophilic
202-221	EEDGQPKPRARKRRWDSSEE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
209-214	PRARKR

Subcellular Location(s)

plas 18, nucl 4.5, cyto_nucl 4, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like IPR034085 TOG
Gene Ontology	GO:0005856 C:cytoskeleton GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MADAEFERVRAAQAERNAAGKKGGRDTQRKNDTKASMTSNFDTELYGNDSGDKFAGYNTSIATADEDDAMAIDAEDAESGKLVGQYTATSAQMNEWTTGDAAEADILDSREKQAQIANRETDYQKRRFQRNLNEETEGQTYREAMQERELQREEERVKRAIEDKRKETIAKGDDEEMTGVEQHQATLKDGSAGEGATQAVVEEDGQPKPRARKRRWDSSEEPTANGEAAAAEGASANGGTATKRSRWDSAAAPDGEARKSKWDVAPGTNGATQSTTPATPVQPIVGFGTEVSSRNAALSDEELDAMLPCEGFKILTPPPGYEPLRAPVRRLAPPATPVNTGGFMMQQPVDARSMGKQLPSDIPGVGDLQFFKTEDMTYFSKLVDGADENELSVEDLKQRKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQLTDNARHFGAGPLFDQILPLLMEKSLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDELVRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLSKAAGLAHMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPTLLPFLKAVCKSKKSWQARHTGVKIVQQIPILMGCAVLPHLRGLVDCIGENLNDEQPKVRTVTSLALGALAEASHPYGIESFDDILNPLWTGARKQRGKGLAGYLKAVGYIIPLMDEEYSNYYTSQIMEILLREFATPDEEMKKVVLKVVSQCSGTSGVHPGFLKDTVLPDFFKNFWVRRMALDKRNYKSVVETTVDLANKVGCAAIMKQIVPNLRDESEAYRKMTVETIEKVLSSLGSADLDHRLAEQLVDGIVYAFQEQSVEDIVMLNGFGTVAVSLGERIKEYLPQIYTTILVRLNNKSATVRQQAADLISQLAPVMRQCNEDALMGRLGGVLYEYLGEEYPEVLGSILGAMRSIVSVVGISSMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVAERQSRVCTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMAKDYVYAVVPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHVALGVVGLGCEDAMLHLLNLLWPNLFETSPHVIDRVIEAIDAIRLSVGTGPVMNYVWAGLFHPARKVRTPYWRLYNDAYVQSADAMVPYYPPVEDEKMKRHELMIVL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.33
3	0.39
4	0.39
5	0.36
6	0.39
7	0.38
8	0.38
9	0.39
10	0.45
11	0.49
12	0.58
13	0.66
14	0.71
15	0.77
16	0.77
17	0.75
18	0.77
19	0.73
20	0.68
21	0.65
22	0.61
23	0.56
24	0.56
25	0.52
26	0.45
27	0.41
28	0.36
29	0.31
30	0.24
31	0.21
32	0.2
33	0.19
34	0.17
35	0.19
36	0.19
37	0.19
38	0.19
39	0.16
40	0.11
41	0.11
42	0.14
43	0.12
44	0.13
45	0.12
46	0.14
47	0.14
48	0.14
49	0.16
50	0.14
51	0.14
52	0.13
53	0.12
54	0.1
55	0.1
56	0.1
57	0.07
58	0.06
59	0.05
60	0.05
61	0.05
62	0.05
63	0.05
64	0.05
65	0.05
66	0.05
67	0.06
68	0.08
69	0.08
70	0.09
71	0.09
72	0.1
73	0.13
74	0.15
75	0.15
76	0.14
77	0.14
78	0.15
79	0.19
80	0.2
81	0.18
82	0.16
83	0.17
84	0.16
85	0.16
86	0.14
87	0.1
88	0.08
89	0.07
90	0.07
91	0.06
92	0.08
93	0.09
94	0.1
95	0.1
96	0.13
97	0.18
98	0.18
99	0.19
100	0.22
101	0.29
102	0.34
103	0.41
104	0.42
105	0.38
106	0.43
107	0.45
108	0.49
109	0.51
110	0.51
111	0.52
112	0.58
113	0.65
114	0.69
115	0.76
116	0.77
117	0.79
118	0.81
119	0.77
120	0.72
121	0.65
122	0.59
123	0.54
124	0.44
125	0.34
126	0.26
127	0.22
128	0.19
129	0.23
130	0.21
131	0.18
132	0.22
133	0.3
134	0.31
135	0.38
136	0.38
137	0.36
138	0.36
139	0.43
140	0.43
141	0.42
142	0.45
143	0.4
144	0.4
145	0.42
146	0.47
147	0.49
148	0.54
149	0.56
150	0.57
151	0.59
152	0.63
153	0.6
154	0.55
155	0.54
156	0.49
157	0.44
158	0.41
159	0.37
160	0.34
161	0.33
162	0.3
163	0.21
164	0.17
165	0.13
166	0.11
167	0.11
168	0.1
169	0.1
170	0.13
171	0.14
172	0.16
173	0.17
174	0.16
175	0.17
176	0.17
177	0.18
178	0.15
179	0.13
180	0.11
181	0.11
182	0.11
183	0.07
184	0.07
185	0.06
186	0.05
187	0.05
188	0.06
189	0.08
190	0.11
191	0.13
192	0.17
193	0.2
194	0.25
195	0.35
196	0.43
197	0.5
198	0.55
199	0.64
200	0.69
201	0.78
202	0.8
203	0.79
204	0.78
205	0.75
206	0.78
207	0.68
208	0.61
209	0.51
210	0.44
211	0.35
212	0.28
213	0.2
214	0.09
215	0.07
216	0.06
217	0.04
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.04
226	0.04
227	0.08
228	0.11
229	0.15
230	0.2
231	0.24
232	0.27
233	0.3
234	0.33
235	0.35
236	0.37
237	0.42
238	0.37
239	0.34
240	0.33
241	0.33
242	0.32
243	0.28
244	0.24
245	0.22
246	0.24
247	0.27
248	0.27
249	0.32
250	0.34
251	0.36
252	0.41
253	0.36
254	0.37
255	0.35
256	0.32
257	0.25
258	0.22
259	0.18
260	0.15
261	0.15
262	0.12
263	0.12
264	0.14
265	0.14
266	0.15
267	0.16
268	0.15
269	0.13
270	0.14
271	0.15
272	0.13
273	0.12
274	0.1
275	0.12
276	0.12
277	0.12
278	0.13
279	0.12
280	0.11
281	0.12
282	0.12
283	0.1
284	0.1
285	0.1
286	0.1
287	0.1
288	0.1
289	0.1
290	0.09
291	0.09
292	0.09
293	0.07
294	0.05
295	0.04
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.1
301	0.11
302	0.17
303	0.18
304	0.19
305	0.22
306	0.29
307	0.31
308	0.29
309	0.29
310	0.3
311	0.39
312	0.38
313	0.37
314	0.36
315	0.4
316	0.41
317	0.42
318	0.39
319	0.33
320	0.38
321	0.4
322	0.37
323	0.33
324	0.3
325	0.28
326	0.25
327	0.23
328	0.18
329	0.14
330	0.11
331	0.11
332	0.1
333	0.1
334	0.1
335	0.11
336	0.11
337	0.11
338	0.11
339	0.11
340	0.16
341	0.15
342	0.17
343	0.16
344	0.18
345	0.2
346	0.21
347	0.21
348	0.16
349	0.15
350	0.14
351	0.15
352	0.12
353	0.11
354	0.09
355	0.1
356	0.1
357	0.1
358	0.1
359	0.1
360	0.1
361	0.1
362	0.14
363	0.14
364	0.15
365	0.16
366	0.15
367	0.15
368	0.14
369	0.14
370	0.11
371	0.1
372	0.1
373	0.11
374	0.11
375	0.1
376	0.1
377	0.1
378	0.09
379	0.08
380	0.07
381	0.11
382	0.14
383	0.15
384	0.19
385	0.2
386	0.23
387	0.27
388	0.33
389	0.35
390	0.41
391	0.5
392	0.52
393	0.57
394	0.55
395	0.53
396	0.53
397	0.5
398	0.47
399	0.45
400	0.43
401	0.42
402	0.45
403	0.44
404	0.42
405	0.48
406	0.5
407	0.45
408	0.43
409	0.42
410	0.46
411	0.53
412	0.51
413	0.42
414	0.34
415	0.32
416	0.31
417	0.29
418	0.21
419	0.14
420	0.12
421	0.12
422	0.12
423	0.11
424	0.11
425	0.08
426	0.08
427	0.07
428	0.07
429	0.06
430	0.05
431	0.06
432	0.06
433	0.09
434	0.11
435	0.12
436	0.12
437	0.13
438	0.16
439	0.18
440	0.18
441	0.16
442	0.15
443	0.14
444	0.18
445	0.2
446	0.18
447	0.18
448	0.18
449	0.18
450	0.18
451	0.18
452	0.13
453	0.13
454	0.14
455	0.14
456	0.15
457	0.17
458	0.16
459	0.17
460	0.18
461	0.19
462	0.16
463	0.15
464	0.13
465	0.14
466	0.14
467	0.13
468	0.12
469	0.09
470	0.09
471	0.09
472	0.09
473	0.06
474	0.04
475	0.03
476	0.04
477	0.05
478	0.05
479	0.06
480	0.06
481	0.06
482	0.07
483	0.09
484	0.1
485	0.12
486	0.12
487	0.14
488	0.14
489	0.15
490	0.14
491	0.12
492	0.1
493	0.08
494	0.08
495	0.06
496	0.05
497	0.05
498	0.05
499	0.06
500	0.06
501	0.06
502	0.06
503	0.06
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.08
508	0.1
509	0.11
510	0.11
511	0.13
512	0.14
513	0.15
514	0.16
515	0.14
516	0.12
517	0.11
518	0.11
519	0.11
520	0.1
521	0.1
522	0.09
523	0.08
524	0.09
525	0.08
526	0.07
527	0.06
528	0.06
529	0.04
530	0.04
531	0.04
532	0.03
533	0.03
534	0.04
535	0.03
536	0.04
537	0.04
538	0.05
539	0.09
540	0.12
541	0.18
542	0.23
543	0.26
544	0.29
545	0.37
546	0.47
547	0.51
548	0.58
549	0.59
550	0.62
551	0.65
552	0.7
553	0.64
554	0.58
555	0.51
556	0.47
557	0.45
558	0.38
559	0.33
560	0.26
561	0.24
562	0.19
563	0.17
564	0.13
565	0.08
566	0.06
567	0.04
568	0.04
569	0.04
570	0.04
571	0.05
572	0.04
573	0.05
574	0.05
575	0.05
576	0.06
577	0.07
578	0.07
579	0.07
580	0.08
581	0.08
582	0.08
583	0.09
584	0.08
585	0.09
586	0.09
587	0.09
588	0.1
589	0.1
590	0.11
591	0.12
592	0.11
593	0.09
594	0.1
595	0.12
596	0.11
597	0.11
598	0.1
599	0.09
600	0.09
601	0.08
602	0.06
603	0.04
604	0.03
605	0.03
606	0.03
607	0.03
608	0.03
609	0.03
610	0.04
611	0.04
612	0.04
613	0.05
614	0.06
615	0.06
616	0.06
617	0.07
618	0.07
619	0.06
620	0.06
621	0.05
622	0.05
623	0.06
624	0.08
625	0.13
626	0.22
627	0.24
628	0.25
629	0.31
630	0.34
631	0.35
632	0.35
633	0.36
634	0.31
635	0.3
636	0.3
637	0.24
638	0.2
639	0.19
640	0.16
641	0.09
642	0.05
643	0.05
644	0.04
645	0.03
646	0.03
647	0.04
648	0.04
649	0.04
650	0.05
651	0.08
652	0.09
653	0.09
654	0.09
655	0.09
656	0.09
657	0.1
658	0.1
659	0.07
660	0.06
661	0.06
662	0.07
663	0.07
664	0.07
665	0.07
666	0.06
667	0.06
668	0.06
669	0.07
670	0.07
671	0.08
672	0.1
673	0.1
674	0.11
675	0.11
676	0.13
677	0.11
678	0.13
679	0.13
680	0.12
681	0.16
682	0.2
683	0.21
684	0.2
685	0.19
686	0.19
687	0.2
688	0.18
689	0.15
690	0.14
691	0.13
692	0.15
693	0.15
694	0.14
695	0.13
696	0.13
697	0.13
698	0.09
699	0.11
700	0.11
701	0.12
702	0.13
703	0.12
704	0.14
705	0.14
706	0.17
707	0.2
708	0.19
709	0.21
710	0.24
711	0.24
712	0.25
713	0.32
714	0.35
715	0.39
716	0.46
717	0.51
718	0.49
719	0.54
720	0.52
721	0.45
722	0.41
723	0.36
724	0.31
725	0.25
726	0.23
727	0.19
728	0.22
729	0.22
730	0.18
731	0.16
732	0.12
733	0.1
734	0.09
735	0.08
736	0.04
737	0.05
738	0.06
739	0.1
740	0.11
741	0.12
742	0.12
743	0.15
744	0.18
745	0.18
746	0.19
747	0.17
748	0.17
749	0.18
750	0.18
751	0.21
752	0.26
753	0.28
754	0.27
755	0.25
756	0.25
757	0.25
758	0.26
759	0.22
760	0.18
761	0.17
762	0.18
763	0.17
764	0.17
765	0.16
766	0.14
767	0.12
768	0.08
769	0.07
770	0.05
771	0.05
772	0.05
773	0.06
774	0.08
775	0.08
776	0.08
777	0.08
778	0.08
779	0.07
780	0.07
781	0.06
782	0.05
783	0.05
784	0.05
785	0.04
786	0.04
787	0.04
788	0.04
789	0.04
790	0.04
791	0.04
792	0.04
793	0.04
794	0.05
795	0.06
796	0.05
797	0.05
798	0.05
799	0.05
800	0.05
801	0.05
802	0.04
803	0.03
804	0.03
805	0.03
806	0.03
807	0.03
808	0.03
809	0.03
810	0.03
811	0.04
812	0.06
813	0.06
814	0.06
815	0.08
816	0.08
817	0.11
818	0.12
819	0.16
820	0.16
821	0.17
822	0.17
823	0.17
824	0.17
825	0.15
826	0.16
827	0.14
828	0.15
829	0.17
830	0.19
831	0.23
832	0.22
833	0.23
834	0.23
835	0.24
836	0.29
837	0.31
838	0.31
839	0.27
840	0.28
841	0.28
842	0.27
843	0.24
844	0.17
845	0.14
846	0.11
847	0.11
848	0.09
849	0.08
850	0.08
851	0.08
852	0.1
853	0.1
854	0.12
855	0.12
856	0.15
857	0.15
858	0.16
859	0.16
860	0.15
861	0.15
862	0.12
863	0.12
864	0.1
865	0.09
866	0.07
867	0.06
868	0.04
869	0.04
870	0.04
871	0.04
872	0.05
873	0.05
874	0.05
875	0.05
876	0.05
877	0.05
878	0.05
879	0.05
880	0.04
881	0.04
882	0.04
883	0.04
884	0.05
885	0.04
886	0.04
887	0.04
888	0.04
889	0.04
890	0.04
891	0.04
892	0.03
893	0.04
894	0.04
895	0.05
896	0.05
897	0.05
898	0.07
899	0.1
900	0.1
901	0.1
902	0.12
903	0.13
904	0.16
905	0.18
906	0.18
907	0.22
908	0.24
909	0.25
910	0.28
911	0.3
912	0.32
913	0.37
914	0.45
915	0.45
916	0.5
917	0.53
918	0.59
919	0.62
920	0.64
921	0.61
922	0.61
923	0.57
924	0.53
925	0.5
926	0.42
927	0.35
928	0.28
929	0.23
930	0.14
931	0.11
932	0.08
933	0.08
934	0.08
935	0.09
936	0.1
937	0.11
938	0.14
939	0.17
940	0.19
941	0.22
942	0.23
943	0.23
944	0.25
945	0.25
946	0.24
947	0.24
948	0.22
949	0.21
950	0.18
951	0.18
952	0.19
953	0.18
954	0.19
955	0.15
956	0.18
957	0.22
958	0.22
959	0.24
960	0.22
961	0.27
962	0.33
963	0.43
964	0.49
965	0.5
966	0.59
967	0.65
968	0.72
969	0.67
970	0.6
971	0.51
972	0.41
973	0.36
974	0.28
975	0.2
976	0.11
977	0.13
978	0.12
979	0.12
980	0.11
981	0.11
982	0.11
983	0.1
984	0.1
985	0.07
986	0.07
987	0.08
988	0.1
989	0.11
990	0.11
991	0.11
992	0.11
993	0.13
994	0.17
995	0.22
996	0.25
997	0.29
998	0.32
999	0.35
1000	0.36
1001	0.34
1002	0.31
1003	0.24
1004	0.22
1005	0.17
1006	0.13
1007	0.1
1008	0.08
1009	0.08
1010	0.07
1011	0.06
1012	0.04
1013	0.04
1014	0.04
1015	0.05
1016	0.05
1017	0.06
1018	0.09
1019	0.1
1020	0.1
1021	0.11
1022	0.16
1023	0.16
1024	0.18
1025	0.18
1026	0.17
1027	0.18
1028	0.18
1029	0.19
1030	0.2
1031	0.23
1032	0.25
1033	0.26
1034	0.25
1035	0.27
1036	0.27
1037	0.26
1038	0.2
1039	0.17
1040	0.14
1041	0.14
1042	0.15
1043	0.11
1044	0.11
1045	0.11
1046	0.11
1047	0.13
1048	0.12
1049	0.12
1050	0.11
1051	0.11
1052	0.11
1053	0.1
1054	0.1
1055	0.08
1056	0.09
1057	0.07
1058	0.07
1059	0.07
1060	0.08
1061	0.08
1062	0.08
1063	0.08
1064	0.06
1065	0.06
1066	0.06
1067	0.09
1068	0.09
1069	0.09
1070	0.1
1071	0.13
1072	0.17
1073	0.2
1074	0.22
1075	0.2
1076	0.2
1077	0.22
1078	0.27
1079	0.3
1080	0.27
1081	0.27
1082	0.26
1083	0.26
1084	0.25
1085	0.23
1086	0.18
1087	0.11
1088	0.1
1089	0.08
1090	0.06
1091	0.05
1092	0.05
1093	0.05
1094	0.04
1095	0.04
1096	0.04
1097	0.03
1098	0.04
1099	0.05
1100	0.05
1101	0.06
1102	0.06
1103	0.08
1104	0.1
1105	0.1
1106	0.09
1107	0.09
1108	0.11
1109	0.13
1110	0.13
1111	0.11
1112	0.16
1113	0.21
1114	0.24
1115	0.24
1116	0.23
1117	0.21
1118	0.22
1119	0.23
1120	0.2
1121	0.14
1122	0.11
1123	0.11
1124	0.11
1125	0.12
1126	0.11
1127	0.09
1128	0.07
1129	0.06
1130	0.07
1131	0.09
1132	0.09
1133	0.08
1134	0.09
1135	0.1
1136	0.12
1137	0.12
1138	0.12
1139	0.1
1140	0.09
1141	0.09
1142	0.09
1143	0.09
1144	0.13
1145	0.17
1146	0.18
1147	0.27
1148	0.32
1149	0.36
1150	0.43
1151	0.49
1152	0.52
1153	0.59
1154	0.65
1155	0.66
1156	0.7
1157	0.7
1158	0.68
1159	0.66
1160	0.65
1161	0.6
1162	0.56
1163	0.48
1164	0.39
1165	0.35
1166	0.3
1167	0.25
1168	0.17
1169	0.12
1170	0.1
1171	0.08
1172	0.08
1173	0.09
1174	0.09
1175	0.09
1176	0.11
1177	0.15
1178	0.2
1179	0.27
1180	0.33
1181	0.41
1182	0.47
1183	0.51
1184	0.5
1185	0.47

A0A4U0U061

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer