Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0U2C3

Protein Details
Accession A0A4U0U2C3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
428-451QHVNSKAHKKLVSKRRKQAADGSKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
435-446HKKLVSKRRKQA
Subcellular Location(s) mito 14.5, cyto_mito 9.5, nucl 7, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR030666  IPP_transferase_euk  
IPR018022  IPT  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
Amino Acid Sequences MARTPPSSPLIAVIGATGTGKSQLAIALAQRYNGEIINGDAMQLYSGLPVITNKITFEEQQGVPHHLLGCIGLREQTWVVGTFVRNALKSIDEIRSRGKLPILVGGTHYYTQSLLFHDRLAEAQDGEGKELQHADEEYEDCPILQQSTETLLEELKKVDPVMAERWHPRDRRKIQRSLQIYLKTGEQASRVYAEQRQRKPAFTNGNAEHKVSVTRSPMRFPTLLFWVHAETRALQERLDRRVDKMLDSGLLNEVRMLNAHAEAENLAGRSIDETRGIWVSIGYKEFKSYMTALESGSATTKELERLQAEALDRTKAATRQYAKRQVRWIRIKLVHALNEVDAASSLYILDGSDASAFDSAVIQPAATLAEDFLNGSALPSPEAAAPPSLAELLKPKREYDVSARPETWTKQHCEICDVTCVVQEQWQQHVNSKAHKKLVSKRRKQAADGSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.1
4 0.08
5 0.06
6 0.08
7 0.08
8 0.08
9 0.08
10 0.09
11 0.09
12 0.11
13 0.13
14 0.19
15 0.2
16 0.21
17 0.21
18 0.21
19 0.21
20 0.2
21 0.18
22 0.11
23 0.11
24 0.14
25 0.13
26 0.12
27 0.11
28 0.11
29 0.1
30 0.1
31 0.08
32 0.05
33 0.06
34 0.06
35 0.06
36 0.07
37 0.1
38 0.12
39 0.13
40 0.13
41 0.16
42 0.19
43 0.2
44 0.23
45 0.25
46 0.24
47 0.29
48 0.31
49 0.32
50 0.3
51 0.31
52 0.28
53 0.21
54 0.21
55 0.16
56 0.16
57 0.13
58 0.13
59 0.12
60 0.11
61 0.14
62 0.14
63 0.14
64 0.13
65 0.13
66 0.13
67 0.15
68 0.16
69 0.16
70 0.2
71 0.21
72 0.2
73 0.2
74 0.2
75 0.18
76 0.19
77 0.2
78 0.23
79 0.23
80 0.25
81 0.29
82 0.31
83 0.32
84 0.32
85 0.3
86 0.26
87 0.24
88 0.28
89 0.26
90 0.22
91 0.23
92 0.23
93 0.22
94 0.2
95 0.19
96 0.13
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.13
101 0.15
102 0.15
103 0.15
104 0.15
105 0.16
106 0.15
107 0.17
108 0.14
109 0.11
110 0.1
111 0.14
112 0.13
113 0.15
114 0.16
115 0.13
116 0.13
117 0.14
118 0.13
119 0.11
120 0.11
121 0.1
122 0.1
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.11
139 0.12
140 0.12
141 0.13
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.11
146 0.1
147 0.12
148 0.17
149 0.18
150 0.21
151 0.24
152 0.3
153 0.36
154 0.4
155 0.44
156 0.5
157 0.58
158 0.65
159 0.69
160 0.73
161 0.73
162 0.77
163 0.75
164 0.69
165 0.66
166 0.58
167 0.52
168 0.43
169 0.37
170 0.29
171 0.25
172 0.21
173 0.15
174 0.12
175 0.11
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.17
180 0.23
181 0.31
182 0.35
183 0.44
184 0.44
185 0.46
186 0.47
187 0.5
188 0.5
189 0.44
190 0.48
191 0.41
192 0.47
193 0.46
194 0.43
195 0.36
196 0.28
197 0.26
198 0.19
199 0.19
200 0.16
201 0.21
202 0.22
203 0.24
204 0.25
205 0.27
206 0.27
207 0.24
208 0.22
209 0.19
210 0.19
211 0.17
212 0.16
213 0.14
214 0.14
215 0.14
216 0.12
217 0.09
218 0.11
219 0.15
220 0.14
221 0.13
222 0.17
223 0.21
224 0.25
225 0.3
226 0.28
227 0.26
228 0.32
229 0.32
230 0.28
231 0.25
232 0.22
233 0.17
234 0.17
235 0.15
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.07
242 0.08
243 0.08
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.1
263 0.1
264 0.09
265 0.08
266 0.1
267 0.1
268 0.12
269 0.13
270 0.12
271 0.13
272 0.14
273 0.14
274 0.14
275 0.13
276 0.13
277 0.14
278 0.14
279 0.13
280 0.14
281 0.14
282 0.12
283 0.12
284 0.1
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.11
289 0.12
290 0.14
291 0.14
292 0.15
293 0.15
294 0.17
295 0.17
296 0.18
297 0.18
298 0.16
299 0.15
300 0.15
301 0.18
302 0.17
303 0.19
304 0.23
305 0.28
306 0.36
307 0.46
308 0.56
309 0.58
310 0.62
311 0.69
312 0.7
313 0.74
314 0.75
315 0.71
316 0.69
317 0.69
318 0.65
319 0.63
320 0.59
321 0.52
322 0.44
323 0.4
324 0.3
325 0.27
326 0.24
327 0.17
328 0.12
329 0.09
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.06
347 0.08
348 0.08
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.06
354 0.07
355 0.05
356 0.06
357 0.06
358 0.07
359 0.06
360 0.07
361 0.06
362 0.07
363 0.09
364 0.08
365 0.09
366 0.09
367 0.1
368 0.1
369 0.12
370 0.12
371 0.11
372 0.11
373 0.1
374 0.11
375 0.11
376 0.1
377 0.1
378 0.18
379 0.24
380 0.31
381 0.33
382 0.33
383 0.37
384 0.39
385 0.44
386 0.44
387 0.47
388 0.47
389 0.51
390 0.51
391 0.48
392 0.51
393 0.49
394 0.49
395 0.46
396 0.45
397 0.48
398 0.52
399 0.51
400 0.51
401 0.5
402 0.44
403 0.42
404 0.37
405 0.29
406 0.27
407 0.27
408 0.22
409 0.25
410 0.27
411 0.24
412 0.29
413 0.34
414 0.34
415 0.38
416 0.46
417 0.45
418 0.51
419 0.58
420 0.59
421 0.6
422 0.65
423 0.67
424 0.69
425 0.75
426 0.77
427 0.78
428 0.81
429 0.84
430 0.85
431 0.81