Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0TV47

Protein Details
Accession A0A4U0TV47    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-68DLLGDQAKPRKRIRKSPEEIKAQLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-58KPRKRIRK
563-597AGKGGRGGRGQNARGGQQRGGANQRGGPQQRGRGQ
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_nucl 11.5, nucl 7.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MIASKAVAKHHELAVEAAVMSHDLTERLADLSIAADRLESNIEDLLGDQAKPRKRIRKSPEEIKAQLEKEFLTPSTSFSPAWLDRLQRRWDAPTDHNELFTLAPTQTRTIIRFKREGLEGRVTDYTEVTVPSNSATAKNSTSLLRKPANRADFVRGAAGFFPFAPGGLDAVEATAAYEDDLLAQSRSAVDAGKTNKLDRVIDFAAEGGLLEVPPGFSRGLDVEGEPAGDEQASQEVEKVLEEQSEQTDATVKAATNGVVNGTAEENDDEDGDEELDALLPVEFPALAPHRALTVARNKQGGREWAHMVDVNRDITNFKELVPEMARDWPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRQIFDDVGILTGDVQIQPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDSERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWIGRTKKKDIYVISTTKRPVPLEHYLWADKRMFKIVDANRSFTEKGWKDANDALSGRDKQIAAEQKAKEKEDAAVAAGKGGRGGRGQNARGGQQRGGANQRGGPQQRGRGQPAARGQGNIARTGRGGGRTTAAQDRNIWVHLVQHLRKEELLPCCIFVFSKKRCEENADALANLDFCTASEKSAIHMILEKSLARLKGDDRTLPQIRRTRELLSRGIAVHHGGMLPIVKECVEILFAKTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKYDNKSFRDLLPGEYTQMAGRAGRRGLDKVGYVIIVSPGADEAPPAGRLRQMMLGDPTKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHEKQIKLSEADLDKIKREPCEICDRDMDLCHQSSVDFVNLTQQLHLSMLATPVGRRMFQPKRLVVFKGKNDVRTAGILLREGVTKGTGVQVLQVLYHNDRHRQDADFLPYLPRFRRRFVPLPQTAEDMDLGISMIPLENIEALTGCHMQVDIQAILRRDPTEMAKVKTDLVTTCSSWTSSSWDELDHIKFLKEMNVRNMLDERANKAQTAQNRECIHCPQLPKHFAMAHDQWVVKDKIDSIRQLMSDQNLQLLPDYEQRINVLKELGFIDDNSRVELKGKVACEIHSADELVLTELVLENVLADYEPEEIVALLSSFVFQEKTDATPNITPALERGQETIVKIAEKVNHYQTLHQVILSSDDSNDFVSRPRFGLVEVVYQWARGMPFSRITELTDVLEGTIVRVITRLDETCREVKNAARIIGDPSLFTKMQTCQELIKRDICATASLPAGSLPEAVSERYWEGPQYQSGTSGFNIMLHVPGGFVYLRDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.22
3 0.17
4 0.13
5 0.11
6 0.1
7 0.08
8 0.08
9 0.07
10 0.07
11 0.07
12 0.08
13 0.09
14 0.09
15 0.09
16 0.09
17 0.08
18 0.09
19 0.1
20 0.1
21 0.09
22 0.09
23 0.08
24 0.1
25 0.12
26 0.1
27 0.11
28 0.11
29 0.11
30 0.11
31 0.11
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.17
36 0.24
37 0.31
38 0.38
39 0.47
40 0.53
41 0.61
42 0.71
43 0.76
44 0.81
45 0.84
46 0.87
47 0.87
48 0.86
49 0.8
50 0.76
51 0.74
52 0.64
53 0.57
54 0.48
55 0.4
56 0.33
57 0.33
58 0.26
59 0.23
60 0.21
61 0.23
62 0.25
63 0.26
64 0.24
65 0.22
66 0.29
67 0.25
68 0.3
69 0.3
70 0.33
71 0.38
72 0.47
73 0.51
74 0.5
75 0.52
76 0.52
77 0.55
78 0.55
79 0.54
80 0.54
81 0.55
82 0.5
83 0.48
84 0.43
85 0.37
86 0.31
87 0.25
88 0.2
89 0.13
90 0.14
91 0.15
92 0.17
93 0.21
94 0.24
95 0.26
96 0.34
97 0.41
98 0.45
99 0.49
100 0.5
101 0.51
102 0.54
103 0.57
104 0.53
105 0.55
106 0.49
107 0.48
108 0.46
109 0.41
110 0.35
111 0.29
112 0.24
113 0.16
114 0.17
115 0.14
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.14
120 0.13
121 0.14
122 0.16
123 0.18
124 0.19
125 0.21
126 0.22
127 0.24
128 0.29
129 0.31
130 0.37
131 0.41
132 0.45
133 0.51
134 0.58
135 0.59
136 0.59
137 0.58
138 0.57
139 0.53
140 0.5
141 0.46
142 0.36
143 0.32
144 0.27
145 0.24
146 0.17
147 0.13
148 0.14
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.09
153 0.09
154 0.08
155 0.09
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.15
178 0.18
179 0.25
180 0.27
181 0.28
182 0.31
183 0.33
184 0.35
185 0.29
186 0.33
187 0.27
188 0.25
189 0.24
190 0.2
191 0.17
192 0.14
193 0.13
194 0.06
195 0.05
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.05
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.08
205 0.09
206 0.11
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.11
213 0.1
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.05
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.09
227 0.09
228 0.1
229 0.11
230 0.11
231 0.13
232 0.13
233 0.11
234 0.15
235 0.14
236 0.15
237 0.16
238 0.14
239 0.14
240 0.15
241 0.15
242 0.12
243 0.12
244 0.11
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.05
264 0.05
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.08
272 0.11
273 0.12
274 0.12
275 0.13
276 0.13
277 0.15
278 0.15
279 0.17
280 0.24
281 0.31
282 0.34
283 0.39
284 0.39
285 0.42
286 0.47
287 0.48
288 0.43
289 0.4
290 0.39
291 0.35
292 0.37
293 0.35
294 0.31
295 0.28
296 0.25
297 0.23
298 0.2
299 0.19
300 0.18
301 0.17
302 0.2
303 0.16
304 0.14
305 0.16
306 0.16
307 0.2
308 0.21
309 0.21
310 0.19
311 0.26
312 0.26
313 0.22
314 0.23
315 0.2
316 0.19
317 0.18
318 0.19
319 0.15
320 0.17
321 0.19
322 0.18
323 0.17
324 0.17
325 0.18
326 0.19
327 0.19
328 0.17
329 0.15
330 0.15
331 0.14
332 0.15
333 0.14
334 0.1
335 0.07
336 0.06
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.06
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.05
357 0.07
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.1
364 0.11
365 0.18
366 0.19
367 0.21
368 0.23
369 0.26
370 0.26
371 0.3
372 0.38
373 0.38
374 0.47
375 0.47
376 0.52
377 0.53
378 0.55
379 0.61
380 0.52
381 0.45
382 0.42
383 0.41
384 0.34
385 0.3
386 0.29
387 0.17
388 0.17
389 0.15
390 0.08
391 0.06
392 0.06
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.06
400 0.06
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.06
408 0.07
409 0.07
410 0.08
411 0.08
412 0.07
413 0.08
414 0.11
415 0.1
416 0.09
417 0.1
418 0.11
419 0.11
420 0.11
421 0.11
422 0.09
423 0.09
424 0.1
425 0.08
426 0.07
427 0.07
428 0.09
429 0.07
430 0.06
431 0.08
432 0.08
433 0.09
434 0.1
435 0.09
436 0.08
437 0.1
438 0.11
439 0.08
440 0.08
441 0.1
442 0.11
443 0.1
444 0.1
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.06
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.04
459 0.03
460 0.03
461 0.04
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.06
466 0.06
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.09
472 0.1
473 0.1
474 0.16
475 0.22
476 0.26
477 0.29
478 0.34
479 0.38
480 0.4
481 0.45
482 0.41
483 0.42
484 0.44
485 0.48
486 0.46
487 0.44
488 0.42
489 0.39
490 0.4
491 0.33
492 0.28
493 0.28
494 0.32
495 0.31
496 0.32
497 0.33
498 0.33
499 0.33
500 0.34
501 0.3
502 0.25
503 0.23
504 0.25
505 0.22
506 0.19
507 0.28
508 0.29
509 0.36
510 0.36
511 0.37
512 0.33
513 0.36
514 0.36
515 0.28
516 0.34
517 0.25
518 0.26
519 0.28
520 0.28
521 0.27
522 0.3
523 0.31
524 0.24
525 0.23
526 0.22
527 0.23
528 0.23
529 0.21
530 0.2
531 0.19
532 0.16
533 0.21
534 0.27
535 0.25
536 0.32
537 0.32
538 0.36
539 0.4
540 0.41
541 0.36
542 0.29
543 0.27
544 0.21
545 0.2
546 0.14
547 0.13
548 0.11
549 0.12
550 0.11
551 0.1
552 0.09
553 0.09
554 0.09
555 0.08
556 0.09
557 0.14
558 0.19
559 0.2
560 0.23
561 0.24
562 0.26
563 0.3
564 0.31
565 0.26
566 0.26
567 0.26
568 0.26
569 0.29
570 0.28
571 0.24
572 0.24
573 0.27
574 0.28
575 0.28
576 0.3
577 0.28
578 0.33
579 0.38
580 0.4
581 0.4
582 0.4
583 0.39
584 0.4
585 0.42
586 0.41
587 0.36
588 0.32
589 0.29
590 0.26
591 0.26
592 0.24
593 0.19
594 0.14
595 0.13
596 0.14
597 0.15
598 0.14
599 0.14
600 0.11
601 0.12
602 0.12
603 0.15
604 0.19
605 0.19
606 0.18
607 0.18
608 0.19
609 0.19
610 0.19
611 0.17
612 0.11
613 0.11
614 0.14
615 0.19
616 0.19
617 0.22
618 0.23
619 0.23
620 0.23
621 0.23
622 0.24
623 0.21
624 0.23
625 0.18
626 0.18
627 0.17
628 0.17
629 0.16
630 0.15
631 0.2
632 0.21
633 0.3
634 0.31
635 0.34
636 0.35
637 0.4
638 0.4
639 0.37
640 0.4
641 0.31
642 0.29
643 0.27
644 0.26
645 0.2
646 0.16
647 0.1
648 0.04
649 0.04
650 0.08
651 0.07
652 0.08
653 0.09
654 0.09
655 0.09
656 0.12
657 0.12
658 0.09
659 0.12
660 0.12
661 0.12
662 0.12
663 0.12
664 0.1
665 0.12
666 0.13
667 0.1
668 0.11
669 0.11
670 0.16
671 0.17
672 0.18
673 0.18
674 0.25
675 0.3
676 0.3
677 0.35
678 0.36
679 0.36
680 0.38
681 0.39
682 0.35
683 0.35
684 0.38
685 0.34
686 0.29
687 0.29
688 0.25
689 0.23
690 0.2
691 0.15
692 0.11
693 0.09
694 0.07
695 0.05
696 0.05
697 0.05
698 0.05
699 0.04
700 0.05
701 0.04
702 0.04
703 0.04
704 0.04
705 0.05
706 0.05
707 0.06
708 0.07
709 0.07
710 0.08
711 0.08
712 0.09
713 0.08
714 0.08
715 0.07
716 0.07
717 0.08
718 0.08
719 0.09
720 0.08
721 0.08
722 0.07
723 0.07
724 0.07
725 0.06
726 0.07
727 0.06
728 0.07
729 0.06
730 0.06
731 0.06
732 0.07
733 0.07
734 0.08
735 0.09
736 0.11
737 0.16
738 0.17
739 0.19
740 0.21
741 0.25
742 0.31
743 0.36
744 0.36
745 0.36
746 0.37
747 0.36
748 0.4
749 0.37
750 0.32
751 0.29
752 0.27
753 0.23
754 0.21
755 0.21
756 0.13
757 0.13
758 0.11
759 0.08
760 0.09
761 0.1
762 0.11
763 0.12
764 0.14
765 0.14
766 0.15
767 0.16
768 0.15
769 0.13
770 0.13
771 0.11
772 0.09
773 0.08
774 0.07
775 0.06
776 0.05
777 0.04
778 0.04
779 0.04
780 0.04
781 0.04
782 0.04
783 0.05
784 0.06
785 0.07
786 0.07
787 0.08
788 0.09
789 0.1
790 0.14
791 0.13
792 0.13
793 0.17
794 0.18
795 0.18
796 0.19
797 0.19
798 0.18
799 0.2
800 0.2
801 0.19
802 0.23
803 0.28
804 0.31
805 0.36
806 0.35
807 0.37
808 0.38
809 0.36
810 0.31
811 0.25
812 0.21
813 0.14
814 0.13
815 0.09
816 0.07
817 0.06
818 0.05
819 0.06
820 0.06
821 0.07
822 0.09
823 0.11
824 0.13
825 0.14
826 0.14
827 0.14
828 0.15
829 0.17
830 0.17
831 0.19
832 0.19
833 0.2
834 0.2
835 0.19
836 0.18
837 0.17
838 0.16
839 0.14
840 0.14
841 0.17
842 0.18
843 0.18
844 0.19
845 0.21
846 0.22
847 0.2
848 0.18
849 0.2
850 0.18
851 0.2
852 0.23
853 0.21
854 0.2
855 0.23
856 0.25
857 0.21
858 0.23
859 0.23
860 0.23
861 0.33
862 0.33
863 0.32
864 0.32
865 0.33
866 0.31
867 0.3
868 0.28
869 0.2
870 0.19
871 0.17
872 0.14
873 0.13
874 0.12
875 0.12
876 0.11
877 0.08
878 0.07
879 0.12
880 0.14
881 0.15
882 0.14
883 0.13
884 0.12
885 0.13
886 0.13
887 0.08
888 0.07
889 0.07
890 0.08
891 0.08
892 0.08
893 0.11
894 0.12
895 0.12
896 0.13
897 0.22
898 0.27
899 0.35
900 0.43
901 0.43
902 0.48
903 0.51
904 0.54
905 0.53
906 0.54
907 0.51
908 0.53
909 0.51
910 0.48
911 0.47
912 0.45
913 0.38
914 0.31
915 0.28
916 0.2
917 0.18
918 0.15
919 0.14
920 0.13
921 0.12
922 0.11
923 0.1
924 0.08
925 0.07
926 0.07
927 0.08
928 0.08
929 0.08
930 0.08
931 0.1
932 0.09
933 0.1
934 0.11
935 0.12
936 0.13
937 0.2
938 0.21
939 0.26
940 0.27
941 0.31
942 0.32
943 0.32
944 0.34
945 0.33
946 0.36
947 0.31
948 0.31
949 0.31
950 0.3
951 0.31
952 0.32
953 0.36
954 0.33
955 0.35
956 0.42
957 0.46
958 0.52
959 0.57
960 0.64
961 0.61
962 0.65
963 0.62
964 0.57
965 0.49
966 0.42
967 0.34
968 0.23
969 0.16
970 0.1
971 0.08
972 0.06
973 0.05
974 0.04
975 0.04
976 0.03
977 0.03
978 0.04
979 0.04
980 0.04
981 0.04
982 0.04
983 0.04
984 0.07
985 0.07
986 0.07
987 0.07
988 0.07
989 0.07
990 0.08
991 0.11
992 0.1
993 0.12
994 0.15
995 0.15
996 0.17
997 0.18
998 0.17
999 0.15
1000 0.17
1001 0.17
1002 0.24
1003 0.28
1004 0.29
1005 0.31
1006 0.31
1007 0.32
1008 0.31
1009 0.29
1010 0.21
1011 0.2
1012 0.21
1013 0.18
1014 0.19
1015 0.18
1016 0.17
1017 0.17
1018 0.17
1019 0.18
1020 0.16
1021 0.18
1022 0.17
1023 0.17
1024 0.18
1025 0.21
1026 0.22
1027 0.19
1028 0.18
1029 0.16
1030 0.16
1031 0.17
1032 0.22
1033 0.23
1034 0.26
1035 0.3
1036 0.38
1037 0.38
1038 0.39
1039 0.41
1040 0.35
1041 0.35
1042 0.33
1043 0.33
1044 0.31
1045 0.32
1046 0.29
1047 0.3
1048 0.33
1049 0.34
1050 0.42
1051 0.39
1052 0.41
1053 0.44
1054 0.46
1055 0.47
1056 0.47
1057 0.45
1058 0.39
1059 0.41
1060 0.4
1061 0.46
1062 0.47
1063 0.46
1064 0.46
1065 0.43
1066 0.4
1067 0.43
1068 0.39
1069 0.34
1070 0.35
1071 0.33
1072 0.29
1073 0.33
1074 0.33
1075 0.25
1076 0.24
1077 0.22
1078 0.25
1079 0.29
1080 0.3
1081 0.27
1082 0.3
1083 0.3
1084 0.3
1085 0.3
1086 0.26
1087 0.26
1088 0.24
1089 0.23
1090 0.2
1091 0.2
1092 0.19
1093 0.18
1094 0.17
1095 0.18
1096 0.22
1097 0.2
1098 0.2
1099 0.22
1100 0.26
1101 0.26
1102 0.25
1103 0.21
1104 0.17
1105 0.19
1106 0.19
1107 0.19
1108 0.15
1109 0.15
1110 0.17
1111 0.18
1112 0.19
1113 0.19
1114 0.19
1115 0.17
1116 0.18
1117 0.2
1118 0.2
1119 0.2
1120 0.21
1121 0.23
1122 0.23
1123 0.24
1124 0.26
1125 0.26
1126 0.24
1127 0.21
1128 0.21
1129 0.16
1130 0.16
1131 0.16
1132 0.13
1133 0.11
1134 0.08
1135 0.07
1136 0.07
1137 0.07
1138 0.06
1139 0.05
1140 0.04
1141 0.04
1142 0.04
1143 0.04
1144 0.04
1145 0.05
1146 0.06
1147 0.06
1148 0.06
1149 0.06
1150 0.06
1151 0.06
1152 0.06
1153 0.06
1154 0.05
1155 0.05
1156 0.05
1157 0.05
1158 0.06
1159 0.07
1160 0.06
1161 0.09
1162 0.11
1163 0.14
1164 0.18
1165 0.19
1166 0.23
1167 0.25
1168 0.26
1169 0.26
1170 0.25
1171 0.22
1172 0.19
1173 0.24
1174 0.22
1175 0.2
1176 0.21
1177 0.21
1178 0.23
1179 0.24
1180 0.26
1181 0.21
1182 0.2
1183 0.2
1184 0.21
1185 0.24
1186 0.25
1187 0.3
1188 0.32
1189 0.37
1190 0.37
1191 0.4
1192 0.42
1193 0.43
1194 0.4
1195 0.35
1196 0.3
1197 0.23
1198 0.27
1199 0.25
1200 0.2
1201 0.14
1202 0.14
1203 0.15
1204 0.16
1205 0.16
1206 0.12
1207 0.16
1208 0.18
1209 0.2
1210 0.2
1211 0.2
1212 0.19
1213 0.19
1214 0.25
1215 0.22
1216 0.25
1217 0.23
1218 0.27
1219 0.25
1220 0.25
1221 0.24
1222 0.2
1223 0.19
1224 0.15
1225 0.16
1226 0.15
1227 0.22
1228 0.25
1229 0.29
1230 0.28
1231 0.3
1232 0.31
1233 0.3
1234 0.28
1235 0.22
1236 0.19
1237 0.15
1238 0.16
1239 0.13
1240 0.11
1241 0.11
1242 0.1
1243 0.09
1244 0.1
1245 0.1
1246 0.11
1247 0.15
1248 0.16
1249 0.19
1250 0.23
1251 0.28
1252 0.34
1253 0.36
1254 0.36
1255 0.35
1256 0.37
1257 0.42
1258 0.43
1259 0.4
1260 0.36
1261 0.34
1262 0.36
1263 0.39
1264 0.35
1265 0.27
1266 0.24
1267 0.26
1268 0.24
1269 0.24
1270 0.23
1271 0.23
1272 0.29
1273 0.31
1274 0.31
1275 0.33
1276 0.4
1277 0.47
1278 0.47
1279 0.47
1280 0.43
1281 0.41
1282 0.42
1283 0.35
1284 0.31
1285 0.26
1286 0.25
1287 0.22
1288 0.19
1289 0.18
1290 0.16
1291 0.16
1292 0.14
1293 0.13
1294 0.1
1295 0.11
1296 0.12
1297 0.14
1298 0.14
1299 0.16
1300 0.17
1301 0.2
1302 0.21
1303 0.19
1304 0.21
1305 0.23
1306 0.27
1307 0.29
1308 0.27
1309 0.27
1310 0.27
1311 0.27
1312 0.25
1313 0.24
1314 0.19
1315 0.16
1316 0.17
1317 0.14
1318 0.14
1319 0.12
1320 0.11
1321 0.09
1322 0.09
1323 0.1
1324 0.09