Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0UF73

Protein Details
Accession A0A4U0UF73    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-128DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
409-438KRRRETDVKREAGQRRREAEKARREGNKRQ
Subcellular Location(s) mito 10, cyto 9, nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSKKYPKIVSSVIEEREEEIENGDGSKTKVPVDGRKPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPPPADEEEMMIAVFEYTDRVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAAEKDAAAAEYHLEMLAKGVNTENGGADSDKPKKTWDSNSITPGTPFMDLLAASLRYWVSYKLSTDPAWEKLKVIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRSSATHDPNTRHVIYGLDADLIMLGIATHEPHFRVLREDVFANDTKPGHCRKCNQPGHMADSCRGAPKEQEGIVKPPKPFIWLHVSILREYLAIEMSVPNQPFKFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIREDGIDTLIAIWRDNIPVMGGYVTKDGHVDLARAQTILEGLAKQEDAIFKRRRETDVKREAGQRRREAEKARREGNKRQRFSNSNDSAPSGYDESVIRRGPRGGVMRGEQAPDINALPTFAPGQAQTRNDPRFGGGLTHADVVGNANQANRSAAAALKEQLMSSKKPADNQKAELESLFAGATNGAQNGNGPQAVLGKRTRDMIDSAAGDNDPSSSAPSTPGRNTPNKEIADPITNGPAGHGTSGALGGNNKDSQGAAPEDTVRLWEDGYQDRYYEQKFHASVDDIELRHRVARSYVEGLCWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDMDKQVVSFEKGKPFRPYEQLMGVMPAASNHTLPAVFHPLMTEDESPIKEFYPVDFEVDLNGKKFAWQGVALLPFIDERRLLDAMHTKYPLLSQDEQRRNAFGTEALIFSTQHPLYEEVATNFYSKKAGTPKFKLDSRITEGLAGRVEKEEKFFPHSELAFPLESGNQDAYTGLDQNESATVSYFMPTIPGIHKSMLLPGVHFADPVLDYQDVQATREMARKSGRSHGGVQLSHNGDRSDGRRMNFAARGGGGANAHRGGGGHGYGANGGYGYGQAAQQVFGSLPPQLAQQAATHGFPAMQGMPPLPPGFPPVFPPGNGGQQGGPGSYGGGQGGPQGGYQRDQYRPNGGGYGGGYGAGGGRGGGYQGGRGGGGRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.6
3 0.62
4 0.62
5 0.57
6 0.56
7 0.55
8 0.51
9 0.44
10 0.42
11 0.38
12 0.35
13 0.33
14 0.25
15 0.2
16 0.18
17 0.16
18 0.16
19 0.15
20 0.14
21 0.14
22 0.18
23 0.18
24 0.18
25 0.23
26 0.28
27 0.37
28 0.46
29 0.54
30 0.58
31 0.67
32 0.7
33 0.72
34 0.69
35 0.63
36 0.57
37 0.5
38 0.48
39 0.41
40 0.4
41 0.33
42 0.3
43 0.26
44 0.22
45 0.18
46 0.12
47 0.09
48 0.07
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.1
53 0.12
54 0.18
55 0.21
56 0.23
57 0.31
58 0.39
59 0.44
60 0.49
61 0.49
62 0.48
63 0.48
64 0.48
65 0.39
66 0.34
67 0.29
68 0.24
69 0.2
70 0.15
71 0.12
72 0.09
73 0.09
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.07
78 0.07
79 0.09
80 0.1
81 0.16
82 0.26
83 0.33
84 0.36
85 0.37
86 0.39
87 0.41
88 0.41
89 0.39
90 0.32
91 0.29
92 0.26
93 0.25
94 0.24
95 0.21
96 0.2
97 0.18
98 0.15
99 0.1
100 0.13
101 0.19
102 0.26
103 0.36
104 0.45
105 0.55
106 0.66
107 0.74
108 0.8
109 0.82
110 0.79
111 0.76
112 0.76
113 0.73
114 0.7
115 0.7
116 0.63
117 0.59
118 0.56
119 0.49
120 0.39
121 0.32
122 0.25
123 0.15
124 0.13
125 0.1
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.06
131 0.07
132 0.09
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.12
140 0.1
141 0.11
142 0.12
143 0.14
144 0.2
145 0.26
146 0.28
147 0.28
148 0.31
149 0.36
150 0.42
151 0.48
152 0.51
153 0.51
154 0.55
155 0.61
156 0.61
157 0.55
158 0.49
159 0.41
160 0.33
161 0.25
162 0.19
163 0.13
164 0.11
165 0.1
166 0.1
167 0.12
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.11
172 0.1
173 0.12
174 0.13
175 0.14
176 0.16
177 0.18
178 0.21
179 0.25
180 0.24
181 0.29
182 0.31
183 0.34
184 0.35
185 0.34
186 0.31
187 0.31
188 0.36
189 0.3
190 0.29
191 0.24
192 0.21
193 0.24
194 0.24
195 0.21
196 0.15
197 0.15
198 0.13
199 0.13
200 0.12
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.13
205 0.14
206 0.16
207 0.18
208 0.22
209 0.3
210 0.3
211 0.32
212 0.32
213 0.35
214 0.4
215 0.44
216 0.48
217 0.48
218 0.52
219 0.53
220 0.56
221 0.58
222 0.51
223 0.44
224 0.36
225 0.29
226 0.24
227 0.24
228 0.18
229 0.12
230 0.11
231 0.1
232 0.09
233 0.08
234 0.06
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.04
240 0.05
241 0.07
242 0.08
243 0.11
244 0.13
245 0.14
246 0.18
247 0.2
248 0.21
249 0.23
250 0.23
251 0.21
252 0.23
253 0.23
254 0.2
255 0.2
256 0.19
257 0.18
258 0.22
259 0.29
260 0.32
261 0.37
262 0.43
263 0.5
264 0.6
265 0.67
266 0.66
267 0.67
268 0.64
269 0.65
270 0.63
271 0.55
272 0.45
273 0.41
274 0.37
275 0.33
276 0.3
277 0.23
278 0.2
279 0.22
280 0.26
281 0.25
282 0.29
283 0.27
284 0.34
285 0.41
286 0.44
287 0.4
288 0.39
289 0.36
290 0.35
291 0.33
292 0.3
293 0.31
294 0.29
295 0.32
296 0.32
297 0.33
298 0.29
299 0.29
300 0.25
301 0.16
302 0.14
303 0.11
304 0.07
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.08
309 0.12
310 0.12
311 0.13
312 0.12
313 0.13
314 0.14
315 0.17
316 0.2
317 0.17
318 0.22
319 0.24
320 0.26
321 0.26
322 0.29
323 0.25
324 0.2
325 0.19
326 0.15
327 0.11
328 0.09
329 0.08
330 0.05
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.08
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.07
342 0.08
343 0.11
344 0.12
345 0.12
346 0.11
347 0.12
348 0.11
349 0.11
350 0.11
351 0.07
352 0.05
353 0.05
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.07
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.07
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.07
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.12
378 0.12
379 0.12
380 0.11
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.07
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.07
391 0.1
392 0.12
393 0.2
394 0.26
395 0.26
396 0.33
397 0.35
398 0.39
399 0.44
400 0.5
401 0.53
402 0.57
403 0.59
404 0.57
405 0.62
406 0.66
407 0.66
408 0.65
409 0.61
410 0.56
411 0.57
412 0.58
413 0.58
414 0.59
415 0.61
416 0.59
417 0.6
418 0.62
419 0.64
420 0.7
421 0.72
422 0.73
423 0.65
424 0.64
425 0.65
426 0.62
427 0.63
428 0.63
429 0.56
430 0.48
431 0.46
432 0.42
433 0.35
434 0.31
435 0.26
436 0.16
437 0.12
438 0.11
439 0.11
440 0.11
441 0.15
442 0.16
443 0.15
444 0.14
445 0.15
446 0.14
447 0.19
448 0.21
449 0.19
450 0.21
451 0.22
452 0.24
453 0.24
454 0.25
455 0.19
456 0.15
457 0.14
458 0.12
459 0.11
460 0.07
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.06
465 0.07
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.09
470 0.12
471 0.14
472 0.17
473 0.24
474 0.26
475 0.26
476 0.25
477 0.24
478 0.21
479 0.19
480 0.18
481 0.11
482 0.11
483 0.11
484 0.11
485 0.1
486 0.09
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.07
491 0.06
492 0.06
493 0.07
494 0.07
495 0.08
496 0.07
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.07
501 0.08
502 0.09
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.12
507 0.13
508 0.13
509 0.14
510 0.21
511 0.2
512 0.26
513 0.33
514 0.39
515 0.4
516 0.42
517 0.44
518 0.38
519 0.38
520 0.32
521 0.26
522 0.17
523 0.14
524 0.1
525 0.06
526 0.05
527 0.04
528 0.05
529 0.04
530 0.05
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.05
535 0.06
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.09
540 0.09
541 0.12
542 0.13
543 0.14
544 0.15
545 0.17
546 0.18
547 0.15
548 0.16
549 0.14
550 0.15
551 0.14
552 0.14
553 0.12
554 0.11
555 0.1
556 0.09
557 0.07
558 0.05
559 0.05
560 0.06
561 0.05
562 0.06
563 0.09
564 0.11
565 0.14
566 0.15
567 0.21
568 0.25
569 0.31
570 0.34
571 0.36
572 0.42
573 0.4
574 0.39
575 0.35
576 0.32
577 0.29
578 0.27
579 0.22
580 0.16
581 0.16
582 0.15
583 0.13
584 0.12
585 0.09
586 0.08
587 0.07
588 0.05
589 0.05
590 0.06
591 0.06
592 0.05
593 0.05
594 0.06
595 0.08
596 0.08
597 0.08
598 0.07
599 0.07
600 0.07
601 0.09
602 0.1
603 0.09
604 0.09
605 0.1
606 0.1
607 0.1
608 0.1
609 0.09
610 0.08
611 0.07
612 0.08
613 0.1
614 0.14
615 0.18
616 0.17
617 0.16
618 0.17
619 0.2
620 0.19
621 0.2
622 0.17
623 0.19
624 0.19
625 0.2
626 0.21
627 0.2
628 0.19
629 0.2
630 0.22
631 0.17
632 0.18
633 0.17
634 0.16
635 0.17
636 0.17
637 0.13
638 0.11
639 0.13
640 0.15
641 0.19
642 0.19
643 0.17
644 0.18
645 0.17
646 0.15
647 0.13
648 0.1
649 0.05
650 0.05
651 0.06
652 0.07
653 0.07
654 0.08
655 0.08
656 0.09
657 0.09
658 0.14
659 0.17
660 0.16
661 0.2
662 0.21
663 0.26
664 0.29
665 0.31
666 0.28
667 0.24
668 0.24
669 0.21
670 0.21
671 0.16
672 0.13
673 0.1
674 0.08
675 0.09
676 0.1
677 0.09
678 0.08
679 0.08
680 0.07
681 0.08
682 0.09
683 0.1
684 0.12
685 0.16
686 0.24
687 0.27
688 0.31
689 0.37
690 0.4
691 0.42
692 0.44
693 0.44
694 0.39
695 0.39
696 0.36
697 0.3
698 0.27
699 0.22
700 0.17
701 0.13
702 0.1
703 0.09
704 0.08
705 0.08
706 0.06
707 0.07
708 0.07
709 0.07
710 0.1
711 0.14
712 0.14
713 0.14
714 0.14
715 0.15
716 0.16
717 0.19
718 0.16
719 0.12
720 0.15
721 0.15
722 0.16
723 0.16
724 0.14
725 0.13
726 0.13
727 0.12
728 0.15
729 0.15
730 0.16
731 0.16
732 0.15
733 0.16
734 0.19
735 0.19
736 0.14
737 0.14
738 0.12
739 0.12
740 0.14
741 0.13
742 0.12
743 0.11
744 0.12
745 0.15
746 0.17
747 0.16
748 0.14
749 0.14
750 0.12
751 0.12
752 0.12
753 0.08
754 0.08
755 0.11
756 0.12
757 0.12
758 0.14
759 0.22
760 0.24
761 0.28
762 0.27
763 0.24
764 0.23
765 0.25
766 0.25
767 0.23
768 0.24
769 0.28
770 0.38
771 0.46
772 0.5
773 0.5
774 0.48
775 0.43
776 0.4
777 0.32
778 0.22
779 0.17
780 0.14
781 0.13
782 0.13
783 0.12
784 0.12
785 0.12
786 0.18
787 0.15
788 0.14
789 0.15
790 0.17
791 0.18
792 0.2
793 0.21
794 0.16
795 0.18
796 0.18
797 0.18
798 0.16
799 0.15
800 0.14
801 0.12
802 0.16
803 0.24
804 0.31
805 0.39
806 0.45
807 0.53
808 0.58
809 0.62
810 0.63
811 0.58
812 0.58
813 0.56
814 0.53
815 0.45
816 0.42
817 0.39
818 0.35
819 0.32
820 0.25
821 0.19
822 0.18
823 0.2
824 0.17
825 0.19
826 0.21
827 0.21
828 0.27
829 0.28
830 0.28
831 0.31
832 0.31
833 0.3
834 0.28
835 0.28
836 0.22
837 0.21
838 0.19
839 0.14
840 0.14
841 0.14
842 0.13
843 0.1
844 0.1
845 0.1
846 0.1
847 0.1
848 0.12
849 0.1
850 0.1
851 0.1
852 0.1
853 0.11
854 0.1
855 0.09
856 0.08
857 0.1
858 0.09
859 0.1
860 0.09
861 0.08
862 0.09
863 0.09
864 0.11
865 0.12
866 0.14
867 0.16
868 0.17
869 0.18
870 0.18
871 0.21
872 0.23
873 0.21
874 0.18
875 0.18
876 0.21
877 0.2
878 0.19
879 0.15
880 0.13
881 0.13
882 0.13
883 0.14
884 0.1
885 0.1
886 0.11
887 0.16
888 0.15
889 0.15
890 0.16
891 0.15
892 0.17
893 0.23
894 0.23
895 0.23
896 0.28
897 0.31
898 0.34
899 0.41
900 0.45
901 0.43
902 0.46
903 0.49
904 0.5
905 0.47
906 0.46
907 0.44
908 0.42
909 0.4
910 0.38
911 0.31
912 0.26
913 0.29
914 0.3
915 0.32
916 0.32
917 0.31
918 0.34
919 0.36
920 0.41
921 0.4
922 0.39
923 0.31
924 0.27
925 0.27
926 0.22
927 0.22
928 0.18
929 0.15
930 0.17
931 0.14
932 0.14
933 0.13
934 0.12
935 0.12
936 0.13
937 0.12
938 0.1
939 0.1
940 0.11
941 0.11
942 0.11
943 0.1
944 0.07
945 0.07
946 0.06
947 0.05
948 0.06
949 0.06
950 0.06
951 0.09
952 0.09
953 0.1
954 0.09
955 0.1
956 0.1
957 0.09
958 0.1
959 0.09
960 0.09
961 0.09
962 0.1
963 0.11
964 0.11
965 0.12
966 0.12
967 0.17
968 0.19
969 0.18
970 0.18
971 0.17
972 0.16
973 0.15
974 0.17
975 0.12
976 0.11
977 0.12
978 0.13
979 0.13
980 0.16
981 0.17
982 0.15
983 0.14
984 0.18
985 0.2
986 0.2
987 0.23
988 0.28
989 0.29
990 0.29
991 0.33
992 0.31
993 0.36
994 0.36
995 0.33
996 0.26
997 0.27
998 0.28
999 0.24
1000 0.21
1001 0.13
1002 0.13
1003 0.12
1004 0.12
1005 0.09
1006 0.09
1007 0.08
1008 0.09
1009 0.11
1010 0.11
1011 0.11
1012 0.14
1013 0.15
1014 0.18
1015 0.24
1016 0.29
1017 0.33
1018 0.39
1019 0.42
1020 0.46
1021 0.47
1022 0.46
1023 0.42
1024 0.36
1025 0.32
1026 0.27
1027 0.25
1028 0.17
1029 0.15
1030 0.12
1031 0.1
1032 0.1
1033 0.08
1034 0.07
1035 0.04
1036 0.05
1037 0.05
1038 0.05
1039 0.08
1040 0.07
1041 0.08
1042 0.1
1043 0.11
1044 0.11
1045 0.12