Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0TRV8

Protein Details
Accession A0A4U0TRV8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
207-228SPSGPRRRSSAQSRRNRNEPTPHydrophilic
1135-1164FHLDKEGKPIKPKKTPKKKAGSLKPFATARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
362-364RRK
1139-1156KEGKPIKPKKTPKKKAGS
Subcellular Location(s) nucl 8.5cyto_nucl 8.5, mito 8, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039745  Vps54  
IPR012501  Vps54_C  
IPR019515  VPS54_N  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000938  C:GARP complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Pfam View protein in Pfam  
PF07928  Vps54  
PF10475  Vps54_N  
Amino Acid Sequences MSSSSPSTRFSADTILSPTSTSPTSTRSAYPFPDYPSQRRPSSSRYAPRRGSNASTLSVTSIGGSLDTAQPSKRGSTVRETSQNAISTLLQPPIVRTGLMPHTQPNTGYRAPTTRDIPPVTLTNIPHVGPENFKDYLARIGPLFESFQRGRAEEQRDDGMPKWMKKDRELEKTDRFAEALERRSASSSPSLKRQTNAATLSPLDTPSPSGPRRRSSAQSRRNRNEPTPLSTIPNVYFEEDFHLENPRTFDVVSERAEIVRPPSGAPRQEQQQSNGGPLPPRKTLATNAILQEKLSWYMDTVEVHLINSISTASSGFFQALGSLKSLQTEAEDSVAKIQGLREDLRRLDQEVAVRGLDVAAKRRKRANVEKLAKATQQVEKVVGEVKRADELVDEGSYDEAADQMEKVGRLVCGQADPAAKSEELIDLRSLKALQGLDSGLQELQYRIGAGFASRFTNILMDDLRQHVERVPQENTLKRWSRQRGVPPTYLETEKHFKDRLLSALQGLGRAGHTAPATAAYREAVQKFMKELIRKHLPSSSDEDADSMVSTSTRGGAKLSQQEKSSILARNLRSMDAQDAEKLLISVYTSVGEALRRASTQTKLLLDVTSSMQPSAPTSPIASPPKSPALGPQSPQLPSLDAQLANGSATPRIAIQTAHQNVQDELTQALDMSSLLGQAVDTAQNQITRVLKVRNEQSIRMSKERFLRYFTLNRLFADECEAVSGRGSQALRGVINAQISGFVQVKGTVEAEHIASVLDSDDWNAKDFTEKDEETLQRVLSSMSRDPPEWTQAAKPIWEDVGHSLEAQSTNTSEGKPATNGTNTPTTNGAVATGTKVASKPAYIDDNRYILVSSAIALLPALDTFLSLTATLPSMTPAISSGLLEVLKTFNSRSTQLILGAGATRSAGLKNITTKHLALASQALSFVVALVPYIRECARRHLPSGQTGVLAEFDKTKRVYQDHQSGIHDKLVDIMTSTSQSHLKAMNNTVYDDEASNSAAAGPSPFMETLTKQTITFHRVLSRHLSEFDVSLIMRRISEQYREQWIGAFGAAETRGEKGEAKLGKDAEAFAARLEKLEGFREVGEEVVGVVRARSEGGGGEGEKKGLRGLLVRVVCAAKDTGKPPLNGQGMPKFHFHLDKEGKPIKPKKTPKKKAGSLKPFATAREYWWANSNNNPKNQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.28
3 0.25
4 0.25
5 0.24
6 0.21
7 0.2
8 0.2
9 0.18
10 0.2
11 0.23
12 0.26
13 0.29
14 0.31
15 0.36
16 0.37
17 0.42
18 0.42
19 0.44
20 0.51
21 0.53
22 0.56
23 0.6
24 0.63
25 0.6
26 0.62
27 0.62
28 0.6
29 0.64
30 0.66
31 0.67
32 0.7
33 0.76
34 0.77
35 0.79
36 0.79
37 0.74
38 0.7
39 0.66
40 0.6
41 0.53
42 0.47
43 0.4
44 0.35
45 0.29
46 0.23
47 0.17
48 0.13
49 0.1
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.11
54 0.13
55 0.15
56 0.15
57 0.18
58 0.2
59 0.21
60 0.25
61 0.26
62 0.28
63 0.36
64 0.42
65 0.47
66 0.54
67 0.56
68 0.55
69 0.56
70 0.54
71 0.44
72 0.4
73 0.33
74 0.27
75 0.27
76 0.24
77 0.21
78 0.19
79 0.2
80 0.23
81 0.22
82 0.19
83 0.16
84 0.21
85 0.25
86 0.28
87 0.28
88 0.28
89 0.31
90 0.33
91 0.34
92 0.31
93 0.31
94 0.31
95 0.32
96 0.3
97 0.32
98 0.35
99 0.39
100 0.4
101 0.38
102 0.43
103 0.43
104 0.42
105 0.39
106 0.38
107 0.36
108 0.37
109 0.33
110 0.31
111 0.31
112 0.29
113 0.27
114 0.27
115 0.26
116 0.25
117 0.27
118 0.26
119 0.24
120 0.25
121 0.24
122 0.22
123 0.26
124 0.24
125 0.23
126 0.18
127 0.19
128 0.2
129 0.2
130 0.22
131 0.16
132 0.22
133 0.21
134 0.26
135 0.27
136 0.27
137 0.31
138 0.36
139 0.42
140 0.38
141 0.41
142 0.39
143 0.38
144 0.4
145 0.36
146 0.38
147 0.37
148 0.37
149 0.41
150 0.44
151 0.47
152 0.5
153 0.59
154 0.58
155 0.63
156 0.67
157 0.67
158 0.69
159 0.71
160 0.67
161 0.58
162 0.49
163 0.39
164 0.4
165 0.38
166 0.35
167 0.32
168 0.32
169 0.31
170 0.34
171 0.33
172 0.28
173 0.3
174 0.33
175 0.33
176 0.41
177 0.48
178 0.48
179 0.49
180 0.52
181 0.48
182 0.48
183 0.48
184 0.4
185 0.36
186 0.33
187 0.34
188 0.29
189 0.25
190 0.18
191 0.15
192 0.16
193 0.17
194 0.24
195 0.27
196 0.35
197 0.4
198 0.45
199 0.5
200 0.53
201 0.58
202 0.61
203 0.68
204 0.69
205 0.74
206 0.79
207 0.81
208 0.84
209 0.82
210 0.76
211 0.75
212 0.7
213 0.66
214 0.61
215 0.56
216 0.52
217 0.46
218 0.44
219 0.35
220 0.33
221 0.28
222 0.23
223 0.22
224 0.18
225 0.22
226 0.2
227 0.2
228 0.17
229 0.22
230 0.21
231 0.22
232 0.25
233 0.2
234 0.2
235 0.19
236 0.19
237 0.18
238 0.22
239 0.22
240 0.22
241 0.21
242 0.21
243 0.22
244 0.21
245 0.19
246 0.18
247 0.17
248 0.16
249 0.22
250 0.28
251 0.3
252 0.32
253 0.34
254 0.37
255 0.44
256 0.46
257 0.42
258 0.44
259 0.42
260 0.42
261 0.4
262 0.35
263 0.33
264 0.34
265 0.35
266 0.3
267 0.32
268 0.3
269 0.3
270 0.32
271 0.35
272 0.34
273 0.33
274 0.34
275 0.36
276 0.34
277 0.31
278 0.28
279 0.21
280 0.2
281 0.17
282 0.14
283 0.11
284 0.13
285 0.15
286 0.14
287 0.14
288 0.14
289 0.14
290 0.13
291 0.14
292 0.12
293 0.1
294 0.09
295 0.08
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.05
300 0.06
301 0.07
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.08
306 0.09
307 0.09
308 0.1
309 0.11
310 0.11
311 0.11
312 0.12
313 0.1
314 0.1
315 0.11
316 0.1
317 0.11
318 0.11
319 0.1
320 0.13
321 0.14
322 0.12
323 0.11
324 0.11
325 0.12
326 0.15
327 0.17
328 0.18
329 0.21
330 0.22
331 0.26
332 0.26
333 0.26
334 0.25
335 0.25
336 0.24
337 0.23
338 0.23
339 0.19
340 0.18
341 0.15
342 0.13
343 0.13
344 0.11
345 0.17
346 0.24
347 0.27
348 0.31
349 0.37
350 0.42
351 0.5
352 0.59
353 0.62
354 0.65
355 0.69
356 0.71
357 0.7
358 0.67
359 0.59
360 0.51
361 0.44
362 0.37
363 0.33
364 0.28
365 0.25
366 0.22
367 0.21
368 0.24
369 0.21
370 0.18
371 0.16
372 0.16
373 0.15
374 0.15
375 0.15
376 0.1
377 0.11
378 0.11
379 0.09
380 0.09
381 0.08
382 0.08
383 0.07
384 0.07
385 0.05
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.05
391 0.06
392 0.06
393 0.07
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.09
398 0.09
399 0.08
400 0.08
401 0.11
402 0.12
403 0.12
404 0.13
405 0.14
406 0.13
407 0.12
408 0.13
409 0.13
410 0.12
411 0.12
412 0.12
413 0.12
414 0.12
415 0.13
416 0.12
417 0.09
418 0.11
419 0.11
420 0.1
421 0.1
422 0.1
423 0.1
424 0.1
425 0.11
426 0.07
427 0.08
428 0.08
429 0.07
430 0.07
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.05
436 0.05
437 0.06
438 0.07
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.08
448 0.09
449 0.11
450 0.12
451 0.11
452 0.12
453 0.12
454 0.17
455 0.2
456 0.22
457 0.23
458 0.27
459 0.31
460 0.34
461 0.35
462 0.38
463 0.39
464 0.38
465 0.45
466 0.47
467 0.48
468 0.51
469 0.58
470 0.6
471 0.61
472 0.62
473 0.56
474 0.52
475 0.49
476 0.44
477 0.35
478 0.3
479 0.29
480 0.26
481 0.28
482 0.26
483 0.23
484 0.25
485 0.25
486 0.25
487 0.22
488 0.21
489 0.18
490 0.19
491 0.19
492 0.16
493 0.14
494 0.11
495 0.08
496 0.08
497 0.08
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.07
502 0.09
503 0.1
504 0.09
505 0.09
506 0.08
507 0.09
508 0.12
509 0.12
510 0.13
511 0.13
512 0.14
513 0.14
514 0.19
515 0.21
516 0.22
517 0.24
518 0.28
519 0.36
520 0.36
521 0.36
522 0.35
523 0.33
524 0.32
525 0.36
526 0.31
527 0.23
528 0.22
529 0.21
530 0.18
531 0.16
532 0.14
533 0.08
534 0.05
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.06
539 0.06
540 0.06
541 0.07
542 0.09
543 0.13
544 0.21
545 0.23
546 0.24
547 0.24
548 0.26
549 0.26
550 0.26
551 0.26
552 0.21
553 0.21
554 0.25
555 0.24
556 0.28
557 0.28
558 0.26
559 0.23
560 0.2
561 0.19
562 0.15
563 0.15
564 0.1
565 0.1
566 0.09
567 0.09
568 0.08
569 0.06
570 0.04
571 0.04
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.04
577 0.05
578 0.05
579 0.05
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.08
584 0.1
585 0.11
586 0.13
587 0.16
588 0.15
589 0.16
590 0.16
591 0.15
592 0.13
593 0.12
594 0.12
595 0.11
596 0.1
597 0.09
598 0.09
599 0.09
600 0.1
601 0.1
602 0.1
603 0.08
604 0.09
605 0.1
606 0.17
607 0.21
608 0.21
609 0.2
610 0.22
611 0.24
612 0.24
613 0.23
614 0.21
615 0.25
616 0.26
617 0.26
618 0.27
619 0.27
620 0.27
621 0.28
622 0.23
623 0.16
624 0.14
625 0.15
626 0.14
627 0.11
628 0.11
629 0.1
630 0.1
631 0.09
632 0.09
633 0.07
634 0.05
635 0.05
636 0.05
637 0.05
638 0.06
639 0.06
640 0.06
641 0.07
642 0.16
643 0.18
644 0.19
645 0.2
646 0.2
647 0.2
648 0.21
649 0.2
650 0.11
651 0.1
652 0.08
653 0.07
654 0.06
655 0.06
656 0.05
657 0.04
658 0.04
659 0.04
660 0.03
661 0.03
662 0.03
663 0.03
664 0.03
665 0.04
666 0.04
667 0.05
668 0.06
669 0.07
670 0.08
671 0.08
672 0.11
673 0.12
674 0.12
675 0.15
676 0.17
677 0.19
678 0.23
679 0.27
680 0.33
681 0.34
682 0.34
683 0.37
684 0.42
685 0.44
686 0.44
687 0.41
688 0.37
689 0.43
690 0.48
691 0.43
692 0.39
693 0.38
694 0.38
695 0.42
696 0.43
697 0.42
698 0.37
699 0.36
700 0.35
701 0.32
702 0.27
703 0.27
704 0.22
705 0.15
706 0.15
707 0.15
708 0.12
709 0.11
710 0.12
711 0.06
712 0.1
713 0.1
714 0.09
715 0.11
716 0.12
717 0.12
718 0.12
719 0.13
720 0.11
721 0.11
722 0.11
723 0.08
724 0.07
725 0.08
726 0.09
727 0.09
728 0.08
729 0.08
730 0.08
731 0.09
732 0.09
733 0.1
734 0.08
735 0.07
736 0.08
737 0.08
738 0.07
739 0.07
740 0.06
741 0.05
742 0.05
743 0.05
744 0.04
745 0.04
746 0.05
747 0.08
748 0.08
749 0.1
750 0.1
751 0.1
752 0.14
753 0.14
754 0.17
755 0.2
756 0.2
757 0.2
758 0.27
759 0.27
760 0.26
761 0.27
762 0.23
763 0.17
764 0.17
765 0.17
766 0.12
767 0.15
768 0.15
769 0.17
770 0.19
771 0.2
772 0.22
773 0.23
774 0.25
775 0.23
776 0.22
777 0.2
778 0.24
779 0.24
780 0.22
781 0.21
782 0.18
783 0.18
784 0.16
785 0.16
786 0.12
787 0.14
788 0.13
789 0.13
790 0.12
791 0.12
792 0.13
793 0.12
794 0.1
795 0.08
796 0.1
797 0.11
798 0.11
799 0.11
800 0.12
801 0.13
802 0.14
803 0.15
804 0.15
805 0.16
806 0.17
807 0.19
808 0.24
809 0.23
810 0.23
811 0.23
812 0.2
813 0.19
814 0.18
815 0.15
816 0.09
817 0.09
818 0.09
819 0.09
820 0.08
821 0.09
822 0.09
823 0.1
824 0.11
825 0.11
826 0.11
827 0.13
828 0.2
829 0.2
830 0.25
831 0.26
832 0.27
833 0.27
834 0.26
835 0.23
836 0.16
837 0.15
838 0.1
839 0.07
840 0.07
841 0.07
842 0.06
843 0.06
844 0.05
845 0.05
846 0.05
847 0.05
848 0.03
849 0.03
850 0.04
851 0.04
852 0.05
853 0.05
854 0.05
855 0.06
856 0.07
857 0.07
858 0.07
859 0.07
860 0.07
861 0.07
862 0.07
863 0.07
864 0.08
865 0.08
866 0.08
867 0.07
868 0.09
869 0.09
870 0.09
871 0.09
872 0.08
873 0.08
874 0.09
875 0.1
876 0.12
877 0.15
878 0.16
879 0.18
880 0.2
881 0.21
882 0.21
883 0.21
884 0.17
885 0.15
886 0.14
887 0.12
888 0.09
889 0.08
890 0.07
891 0.07
892 0.07
893 0.09
894 0.09
895 0.12
896 0.17
897 0.2
898 0.23
899 0.25
900 0.25
901 0.25
902 0.26
903 0.23
904 0.19
905 0.19
906 0.18
907 0.15
908 0.15
909 0.13
910 0.1
911 0.1
912 0.09
913 0.05
914 0.04
915 0.04
916 0.05
917 0.05
918 0.05
919 0.08
920 0.09
921 0.14
922 0.16
923 0.24
924 0.33
925 0.36
926 0.4
927 0.45
928 0.48
929 0.49
930 0.52
931 0.45
932 0.36
933 0.33
934 0.29
935 0.23
936 0.2
937 0.14
938 0.15
939 0.15
940 0.18
941 0.2
942 0.22
943 0.26
944 0.3
945 0.36
946 0.4
947 0.49
948 0.5
949 0.53
950 0.54
951 0.52
952 0.49
953 0.46
954 0.37
955 0.27
956 0.25
957 0.22
958 0.18
959 0.15
960 0.14
961 0.12
962 0.14
963 0.14
964 0.13
965 0.14
966 0.15
967 0.16
968 0.2
969 0.23
970 0.26
971 0.3
972 0.33
973 0.32
974 0.33
975 0.31
976 0.28
977 0.25
978 0.21
979 0.17
980 0.13
981 0.12
982 0.11
983 0.1
984 0.09
985 0.08
986 0.08
987 0.07
988 0.07
989 0.07
990 0.09
991 0.09
992 0.1
993 0.12
994 0.13
995 0.19
996 0.23
997 0.24
998 0.22
999 0.27
1000 0.3
1001 0.34
1002 0.35
1003 0.32
1004 0.34
1005 0.34
1006 0.38
1007 0.42
1008 0.41
1009 0.38
1010 0.37
1011 0.36
1012 0.3
1013 0.29
1014 0.27
1015 0.2
1016 0.15
1017 0.15
1018 0.17
1019 0.15
1020 0.14
1021 0.15
1022 0.19
1023 0.21
1024 0.27
1025 0.3
1026 0.33
1027 0.41
1028 0.43
1029 0.41
1030 0.38
1031 0.36
1032 0.31
1033 0.25
1034 0.2
1035 0.11
1036 0.12
1037 0.12
1038 0.11
1039 0.1
1040 0.1
1041 0.11
1042 0.12
1043 0.14
1044 0.12
1045 0.2
1046 0.23
1047 0.25
1048 0.29
1049 0.29
1050 0.3
1051 0.3
1052 0.29
1053 0.25
1054 0.24
1055 0.21
1056 0.17
1057 0.21
1058 0.18
1059 0.18
1060 0.19
1061 0.17
1062 0.17
1063 0.2
1064 0.21
1065 0.18
1066 0.19
1067 0.19
1068 0.18
1069 0.16
1070 0.13
1071 0.1
1072 0.09
1073 0.08
1074 0.09
1075 0.07
1076 0.07
1077 0.07
1078 0.07
1079 0.08
1080 0.08
1081 0.07
1082 0.07
1083 0.09
1084 0.12
1085 0.13
1086 0.17
1087 0.17
1088 0.18
1089 0.18
1090 0.18
1091 0.17
1092 0.16
1093 0.16
1094 0.15
1095 0.18
1096 0.25
1097 0.25
1098 0.25
1099 0.27
1100 0.27
1101 0.25
1102 0.23
1103 0.22
1104 0.17
1105 0.22
1106 0.24
1107 0.31
1108 0.35
1109 0.37
1110 0.38
1111 0.45
1112 0.46
1113 0.43
1114 0.47
1115 0.46
1116 0.46
1117 0.47
1118 0.47
1119 0.4
1120 0.39
1121 0.44
1122 0.4
1123 0.42
1124 0.45
1125 0.47
1126 0.54
1127 0.59
1128 0.6
1129 0.64
1130 0.7
1131 0.69
1132 0.71
1133 0.78
1134 0.8
1135 0.84
1136 0.9
1137 0.9
1138 0.93
1139 0.93
1140 0.93
1141 0.93
1142 0.93
1143 0.9
1144 0.83
1145 0.81
1146 0.72
1147 0.64
1148 0.59
1149 0.49
1150 0.42
1151 0.43
1152 0.41
1153 0.34
1154 0.4
1155 0.43
1156 0.4
1157 0.48
1158 0.55