Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0U242

Protein Details
Accession A0A4U0U242    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
165-188KTIWSKAKYMLRKRNKYLKRFTALHydrophilic
403-431AQKSGKRGAYFKKRRRWHRCKTIVDETRQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
407-418GKRGAYFKKRRR
569-575GRGKRRK
Subcellular Location(s) mito 10cyto 10cyto_mito 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MDLHSHIKPHTWLFLRLPNKTVKCLEIKPNQIIDVGKIGSFPSNLLLGRPYYYTYEIQERAPDEAYCRLRIVPPSELNADIVAEESTPSESRGEPATPPNGESDLPVTYDLLANGAATEKTNRLTVDDASRQALSQPEIEELKKTAQGKEIIEKILAGHAGLDEKTIWSKAKYMLRKRNKYLKRFTALPMDLGNLIGYVLEKEPARILDMREETLGLMMAWSNAHTQVAQTVERSAEGKQIGGGRWLAVDETGGLVVAAMAERMNLLHKPTAPESNPQSHVNGASEDANPSSDTTMPDIPVTTPNDTTTSAESPTKPPDQDSSTHIHHDFPIPATTNTITVLHPAVQPNLSLLKHFSYDTNNPDPTHPLHTHLKPLSWLQLLHPTSDPTYLEPPTLDPNVLAAQKSGKRGAYFKKRRRWHRCKTIVDETRQQSPGIFDGLVIASNMHPSTILPHTVPLIRGGGTIVIYSPTPEPLVQLMDLYSKERRTAYIQALAAGETPDPEDFPVDPRLLLAPMLQTSRVRAWQVLPSRTHPLMTGKGGSEGFVFTARRVVPVEGGVEARGNFGGAGRGKRRKVGGGEASAAVAGAEVIERG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.51
3 0.51
4 0.52
5 0.54
6 0.53
7 0.54
8 0.52
9 0.48
10 0.48
11 0.52
12 0.58
13 0.57
14 0.61
15 0.62
16 0.62
17 0.57
18 0.53
19 0.46
20 0.39
21 0.35
22 0.28
23 0.21
24 0.19
25 0.19
26 0.18
27 0.17
28 0.16
29 0.12
30 0.15
31 0.15
32 0.15
33 0.17
34 0.16
35 0.17
36 0.18
37 0.18
38 0.19
39 0.22
40 0.23
41 0.25
42 0.31
43 0.31
44 0.32
45 0.34
46 0.32
47 0.31
48 0.31
49 0.27
50 0.23
51 0.3
52 0.32
53 0.29
54 0.29
55 0.28
56 0.3
57 0.35
58 0.37
59 0.36
60 0.36
61 0.38
62 0.39
63 0.38
64 0.35
65 0.29
66 0.25
67 0.17
68 0.14
69 0.1
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.11
77 0.11
78 0.13
79 0.16
80 0.17
81 0.18
82 0.23
83 0.28
84 0.27
85 0.27
86 0.28
87 0.27
88 0.25
89 0.23
90 0.2
91 0.15
92 0.15
93 0.15
94 0.13
95 0.11
96 0.12
97 0.11
98 0.09
99 0.08
100 0.07
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.09
106 0.1
107 0.12
108 0.14
109 0.14
110 0.15
111 0.17
112 0.19
113 0.25
114 0.27
115 0.28
116 0.28
117 0.28
118 0.25
119 0.25
120 0.25
121 0.19
122 0.17
123 0.16
124 0.17
125 0.19
126 0.2
127 0.2
128 0.19
129 0.19
130 0.22
131 0.23
132 0.22
133 0.25
134 0.29
135 0.3
136 0.34
137 0.35
138 0.32
139 0.3
140 0.27
141 0.22
142 0.2
143 0.17
144 0.11
145 0.08
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.09
153 0.11
154 0.12
155 0.11
156 0.14
157 0.2
158 0.28
159 0.37
160 0.46
161 0.55
162 0.65
163 0.73
164 0.79
165 0.83
166 0.84
167 0.84
168 0.84
169 0.82
170 0.77
171 0.71
172 0.66
173 0.65
174 0.56
175 0.48
176 0.39
177 0.3
178 0.25
179 0.21
180 0.18
181 0.08
182 0.07
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.09
191 0.09
192 0.12
193 0.12
194 0.13
195 0.18
196 0.2
197 0.2
198 0.19
199 0.19
200 0.17
201 0.15
202 0.14
203 0.06
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.08
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.11
221 0.12
222 0.1
223 0.12
224 0.12
225 0.11
226 0.12
227 0.14
228 0.14
229 0.15
230 0.14
231 0.1
232 0.1
233 0.1
234 0.08
235 0.06
236 0.05
237 0.04
238 0.04
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.02
246 0.02
247 0.02
248 0.02
249 0.02
250 0.03
251 0.04
252 0.05
253 0.07
254 0.08
255 0.1
256 0.13
257 0.15
258 0.2
259 0.2
260 0.24
261 0.27
262 0.31
263 0.33
264 0.31
265 0.3
266 0.25
267 0.25
268 0.21
269 0.17
270 0.12
271 0.11
272 0.1
273 0.1
274 0.09
275 0.09
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.12
288 0.14
289 0.13
290 0.13
291 0.13
292 0.15
293 0.15
294 0.16
295 0.14
296 0.13
297 0.13
298 0.15
299 0.15
300 0.16
301 0.2
302 0.21
303 0.19
304 0.2
305 0.22
306 0.22
307 0.23
308 0.24
309 0.25
310 0.24
311 0.27
312 0.26
313 0.23
314 0.21
315 0.22
316 0.19
317 0.15
318 0.16
319 0.15
320 0.14
321 0.15
322 0.15
323 0.13
324 0.13
325 0.13
326 0.11
327 0.1
328 0.1
329 0.1
330 0.11
331 0.12
332 0.12
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.14
337 0.13
338 0.11
339 0.12
340 0.12
341 0.13
342 0.14
343 0.14
344 0.16
345 0.2
346 0.25
347 0.29
348 0.3
349 0.3
350 0.3
351 0.32
352 0.28
353 0.31
354 0.26
355 0.25
356 0.3
357 0.31
358 0.37
359 0.36
360 0.34
361 0.29
362 0.3
363 0.3
364 0.24
365 0.23
366 0.17
367 0.25
368 0.25
369 0.25
370 0.24
371 0.21
372 0.21
373 0.22
374 0.21
375 0.14
376 0.17
377 0.16
378 0.16
379 0.15
380 0.15
381 0.17
382 0.18
383 0.15
384 0.11
385 0.12
386 0.15
387 0.16
388 0.14
389 0.11
390 0.16
391 0.19
392 0.22
393 0.24
394 0.22
395 0.24
396 0.29
397 0.38
398 0.44
399 0.52
400 0.59
401 0.66
402 0.73
403 0.83
404 0.88
405 0.89
406 0.89
407 0.89
408 0.91
409 0.89
410 0.88
411 0.88
412 0.84
413 0.79
414 0.77
415 0.68
416 0.64
417 0.57
418 0.48
419 0.38
420 0.32
421 0.28
422 0.21
423 0.18
424 0.11
425 0.11
426 0.11
427 0.1
428 0.09
429 0.08
430 0.06
431 0.08
432 0.08
433 0.07
434 0.07
435 0.06
436 0.1
437 0.12
438 0.14
439 0.13
440 0.14
441 0.16
442 0.18
443 0.18
444 0.16
445 0.15
446 0.13
447 0.13
448 0.13
449 0.11
450 0.1
451 0.09
452 0.08
453 0.07
454 0.07
455 0.08
456 0.09
457 0.09
458 0.1
459 0.1
460 0.11
461 0.11
462 0.14
463 0.12
464 0.12
465 0.11
466 0.12
467 0.13
468 0.15
469 0.18
470 0.18
471 0.2
472 0.21
473 0.23
474 0.25
475 0.32
476 0.34
477 0.37
478 0.36
479 0.35
480 0.34
481 0.32
482 0.27
483 0.21
484 0.16
485 0.09
486 0.1
487 0.08
488 0.08
489 0.09
490 0.1
491 0.1
492 0.13
493 0.17
494 0.16
495 0.16
496 0.16
497 0.17
498 0.16
499 0.15
500 0.13
501 0.12
502 0.14
503 0.15
504 0.17
505 0.16
506 0.19
507 0.23
508 0.26
509 0.25
510 0.25
511 0.27
512 0.33
513 0.41
514 0.44
515 0.44
516 0.44
517 0.49
518 0.48
519 0.46
520 0.4
521 0.37
522 0.36
523 0.36
524 0.35
525 0.28
526 0.31
527 0.3
528 0.28
529 0.23
530 0.19
531 0.16
532 0.16
533 0.16
534 0.13
535 0.19
536 0.18
537 0.2
538 0.21
539 0.22
540 0.2
541 0.21
542 0.22
543 0.17
544 0.18
545 0.16
546 0.16
547 0.15
548 0.14
549 0.12
550 0.11
551 0.1
552 0.09
553 0.15
554 0.18
555 0.26
556 0.34
557 0.43
558 0.45
559 0.51
560 0.55
561 0.56
562 0.57
563 0.59
564 0.58
565 0.55
566 0.55
567 0.5
568 0.46
569 0.38
570 0.32
571 0.22
572 0.13
573 0.07
574 0.04