Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0TKK0

Protein Details
Accession A0A4U0TKK0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
242-261EGERRKIREREEREKKEPTTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-257KVLEGERRKIREREEREKK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 11.5, cyto 7, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047574  AD  
IPR039683  Lsm12-like  
IPR019181  LSM12_ABD  
Pfam View protein in Pfam  
PF09793  AD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52001  AD  
Amino Acid Sequences MADSKRGGYGGGGGSGGGGVASRVATPKTTSTSTTSQAAPMGDTFEALGKAIGARLRLTTAAPHAQTYEGSLFTACPILNVVALNTRSTSTSTSTTNPPSAAQEPGDYSIIPISSIQSFQLLSLASPSAGAAEKGGKSTANPTSFTAARPAIGQLDLKRLRAREADAIRKRKDYDNDRGRGVTKEAQAIFDSFKRINLPIRWHNQEMIVHEAVIITPPYRAEDCKGAKEKQEVLNRVRKVLEGERRKIREREEREKKEPTTAGVATGSEGLAGPRKGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.1
4 0.05
5 0.04
6 0.03
7 0.03
8 0.04
9 0.05
10 0.07
11 0.08
12 0.1
13 0.13
14 0.16
15 0.21
16 0.23
17 0.25
18 0.29
19 0.32
20 0.34
21 0.34
22 0.32
23 0.28
24 0.28
25 0.25
26 0.21
27 0.17
28 0.16
29 0.13
30 0.12
31 0.11
32 0.1
33 0.1
34 0.09
35 0.09
36 0.06
37 0.07
38 0.08
39 0.1
40 0.09
41 0.1
42 0.1
43 0.12
44 0.12
45 0.13
46 0.13
47 0.16
48 0.21
49 0.21
50 0.2
51 0.2
52 0.2
53 0.19
54 0.2
55 0.17
56 0.12
57 0.11
58 0.11
59 0.1
60 0.1
61 0.12
62 0.09
63 0.07
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.11
70 0.12
71 0.12
72 0.12
73 0.12
74 0.12
75 0.14
76 0.15
77 0.13
78 0.15
79 0.17
80 0.19
81 0.22
82 0.25
83 0.25
84 0.23
85 0.21
86 0.23
87 0.22
88 0.21
89 0.17
90 0.15
91 0.15
92 0.16
93 0.16
94 0.12
95 0.11
96 0.1
97 0.09
98 0.08
99 0.07
100 0.06
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.11
126 0.16
127 0.16
128 0.17
129 0.17
130 0.2
131 0.21
132 0.21
133 0.2
134 0.15
135 0.14
136 0.13
137 0.12
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.09
142 0.18
143 0.19
144 0.2
145 0.22
146 0.22
147 0.24
148 0.24
149 0.26
150 0.25
151 0.29
152 0.38
153 0.44
154 0.51
155 0.51
156 0.52
157 0.52
158 0.5
159 0.53
160 0.5
161 0.53
162 0.55
163 0.56
164 0.54
165 0.53
166 0.49
167 0.42
168 0.39
169 0.33
170 0.25
171 0.27
172 0.26
173 0.26
174 0.25
175 0.24
176 0.22
177 0.18
178 0.2
179 0.15
180 0.16
181 0.17
182 0.18
183 0.23
184 0.26
185 0.32
186 0.37
187 0.44
188 0.49
189 0.48
190 0.48
191 0.45
192 0.43
193 0.38
194 0.35
195 0.28
196 0.22
197 0.2
198 0.19
199 0.15
200 0.14
201 0.11
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.1
206 0.11
207 0.13
208 0.15
209 0.24
210 0.27
211 0.35
212 0.41
213 0.41
214 0.45
215 0.49
216 0.53
217 0.52
218 0.58
219 0.55
220 0.57
221 0.63
222 0.59
223 0.56
224 0.5
225 0.43
226 0.4
227 0.43
228 0.46
229 0.46
230 0.53
231 0.6
232 0.65
233 0.71
234 0.7
235 0.69
236 0.7
237 0.7
238 0.73
239 0.74
240 0.78
241 0.79
242 0.82
243 0.76
244 0.73
245 0.66
246 0.58
247 0.54
248 0.45
249 0.4
250 0.32
251 0.3
252 0.22
253 0.21
254 0.17
255 0.1
256 0.1
257 0.09
258 0.14