Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0TR94

Protein Details
Accession A0A4U0TR94    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
401-428GGERDRTQRERQRAEKRREAQREMRQKNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
228-243PKHKMKKVPRGPPSPP
410-420ERQRAEKRREA
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MATTGSRTSLARALPKPHYTGEDENLPSHTQQKGPRVVGARELESSQLVVKRSGPPPYGQRAGWRPRGAEDFGDGGAFPEIAVAQYPLDMGKKGGAPSESNALALRVDNEGKVKYDDIARRGHSEKRVIHASFKDLIPLRQRADVGEISLERPSEEDVQESKDRTQKALQTLVDGTLAAQKPKNVKGTSRPEPTFVRYTPANQMGDSSKKQDRIMKIVQRQQDPMEPPKHKMKKVPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEAWRIPPPVSNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFAEALHTADRHAREEVQQRQRMQQRLAEKEKEQKEDNLRMLAQKARQEREAAITETKPARKEVRSRSRSLDSRSSYDSRSSRSRSSSYSRSPSRSDDGGERDRTQRERQRAEKRREAQREMRQKNMGHERRLQMMAREQNRDIGEKVALGLAKPTQNKETMYDSRLFNQSSGFAAGFNEDQPYDKPLFAERDALNSIYRPSVGEDDEEDAGETMEKIQNTKRFDTLGKAPKEGFKGTDTKEARTGPVMFERDRGDDPFGVDAMIAEVAKGAGKRSAEDADGREKGKRARVDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.51
3 0.51
4 0.5
5 0.5
6 0.48
7 0.48
8 0.46
9 0.46
10 0.44
11 0.41
12 0.41
13 0.38
14 0.33
15 0.32
16 0.3
17 0.28
18 0.33
19 0.41
20 0.47
21 0.47
22 0.52
23 0.53
24 0.51
25 0.54
26 0.51
27 0.44
28 0.38
29 0.36
30 0.31
31 0.26
32 0.25
33 0.21
34 0.2
35 0.19
36 0.19
37 0.22
38 0.28
39 0.32
40 0.39
41 0.37
42 0.39
43 0.45
44 0.52
45 0.53
46 0.46
47 0.5
48 0.53
49 0.59
50 0.63
51 0.59
52 0.53
53 0.53
54 0.57
55 0.51
56 0.42
57 0.36
58 0.29
59 0.25
60 0.24
61 0.19
62 0.14
63 0.12
64 0.1
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.07
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.11
79 0.14
80 0.15
81 0.18
82 0.19
83 0.19
84 0.21
85 0.26
86 0.23
87 0.21
88 0.21
89 0.18
90 0.16
91 0.15
92 0.14
93 0.12
94 0.13
95 0.13
96 0.16
97 0.16
98 0.18
99 0.19
100 0.18
101 0.17
102 0.24
103 0.28
104 0.29
105 0.34
106 0.34
107 0.37
108 0.4
109 0.45
110 0.43
111 0.46
112 0.46
113 0.46
114 0.52
115 0.47
116 0.51
117 0.46
118 0.45
119 0.4
120 0.37
121 0.37
122 0.31
123 0.34
124 0.35
125 0.37
126 0.35
127 0.34
128 0.34
129 0.29
130 0.32
131 0.28
132 0.22
133 0.2
134 0.19
135 0.16
136 0.17
137 0.16
138 0.11
139 0.11
140 0.13
141 0.14
142 0.13
143 0.15
144 0.16
145 0.21
146 0.24
147 0.25
148 0.27
149 0.28
150 0.29
151 0.29
152 0.33
153 0.33
154 0.35
155 0.4
156 0.36
157 0.34
158 0.34
159 0.31
160 0.26
161 0.21
162 0.16
163 0.16
164 0.16
165 0.15
166 0.16
167 0.18
168 0.23
169 0.28
170 0.35
171 0.3
172 0.34
173 0.42
174 0.5
175 0.56
176 0.6
177 0.55
178 0.52
179 0.54
180 0.54
181 0.5
182 0.41
183 0.36
184 0.28
185 0.31
186 0.33
187 0.35
188 0.31
189 0.25
190 0.27
191 0.27
192 0.31
193 0.29
194 0.28
195 0.27
196 0.29
197 0.32
198 0.36
199 0.36
200 0.38
201 0.45
202 0.48
203 0.52
204 0.55
205 0.58
206 0.55
207 0.54
208 0.48
209 0.45
210 0.41
211 0.41
212 0.43
213 0.39
214 0.41
215 0.49
216 0.55
217 0.52
218 0.57
219 0.6
220 0.62
221 0.7
222 0.76
223 0.74
224 0.75
225 0.76
226 0.76
227 0.73
228 0.69
229 0.63
230 0.55
231 0.52
232 0.49
233 0.49
234 0.5
235 0.5
236 0.48
237 0.48
238 0.51
239 0.46
240 0.43
241 0.42
242 0.41
243 0.4
244 0.37
245 0.34
246 0.34
247 0.33
248 0.32
249 0.28
250 0.21
251 0.15
252 0.16
253 0.18
254 0.25
255 0.29
256 0.36
257 0.41
258 0.46
259 0.52
260 0.49
261 0.49
262 0.42
263 0.4
264 0.38
265 0.4
266 0.38
267 0.38
268 0.39
269 0.35
270 0.33
271 0.33
272 0.28
273 0.2
274 0.18
275 0.14
276 0.14
277 0.15
278 0.14
279 0.11
280 0.12
281 0.12
282 0.15
283 0.13
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.13
288 0.11
289 0.11
290 0.06
291 0.06
292 0.08
293 0.09
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.09
298 0.12
299 0.13
300 0.12
301 0.11
302 0.12
303 0.17
304 0.25
305 0.34
306 0.4
307 0.44
308 0.43
309 0.5
310 0.56
311 0.55
312 0.49
313 0.44
314 0.42
315 0.46
316 0.51
317 0.47
318 0.43
319 0.48
320 0.51
321 0.5
322 0.44
323 0.42
324 0.43
325 0.45
326 0.44
327 0.38
328 0.33
329 0.31
330 0.31
331 0.29
332 0.25
333 0.25
334 0.29
335 0.29
336 0.3
337 0.3
338 0.29
339 0.3
340 0.29
341 0.26
342 0.22
343 0.2
344 0.23
345 0.25
346 0.27
347 0.23
348 0.24
349 0.27
350 0.3
351 0.38
352 0.45
353 0.53
354 0.56
355 0.58
356 0.61
357 0.64
358 0.64
359 0.61
360 0.59
361 0.51
362 0.49
363 0.5
364 0.47
365 0.4
366 0.42
367 0.38
368 0.34
369 0.37
370 0.38
371 0.37
372 0.4
373 0.41
374 0.39
375 0.44
376 0.47
377 0.48
378 0.52
379 0.53
380 0.53
381 0.53
382 0.52
383 0.5
384 0.43
385 0.38
386 0.34
387 0.36
388 0.38
389 0.39
390 0.37
391 0.37
392 0.41
393 0.43
394 0.47
395 0.48
396 0.51
397 0.56
398 0.63
399 0.7
400 0.76
401 0.8
402 0.81
403 0.81
404 0.82
405 0.82
406 0.8
407 0.79
408 0.79
409 0.81
410 0.75
411 0.74
412 0.69
413 0.63
414 0.64
415 0.65
416 0.62
417 0.56
418 0.59
419 0.55
420 0.54
421 0.55
422 0.47
423 0.39
424 0.41
425 0.44
426 0.42
427 0.44
428 0.39
429 0.41
430 0.42
431 0.4
432 0.33
433 0.27
434 0.22
435 0.17
436 0.17
437 0.14
438 0.13
439 0.1
440 0.11
441 0.12
442 0.17
443 0.19
444 0.22
445 0.23
446 0.25
447 0.27
448 0.29
449 0.33
450 0.33
451 0.34
452 0.36
453 0.34
454 0.36
455 0.39
456 0.36
457 0.29
458 0.25
459 0.23
460 0.2
461 0.2
462 0.16
463 0.12
464 0.11
465 0.13
466 0.12
467 0.12
468 0.12
469 0.1
470 0.11
471 0.12
472 0.16
473 0.16
474 0.16
475 0.17
476 0.2
477 0.24
478 0.24
479 0.3
480 0.26
481 0.29
482 0.3
483 0.3
484 0.27
485 0.23
486 0.23
487 0.17
488 0.17
489 0.13
490 0.14
491 0.17
492 0.17
493 0.17
494 0.17
495 0.19
496 0.19
497 0.18
498 0.16
499 0.13
500 0.12
501 0.11
502 0.09
503 0.09
504 0.11
505 0.12
506 0.14
507 0.2
508 0.27
509 0.32
510 0.35
511 0.34
512 0.35
513 0.36
514 0.4
515 0.44
516 0.47
517 0.45
518 0.45
519 0.45
520 0.47
521 0.5
522 0.46
523 0.38
524 0.33
525 0.37
526 0.38
527 0.46
528 0.43
529 0.41
530 0.45
531 0.44
532 0.42
533 0.39
534 0.37
535 0.31
536 0.37
537 0.38
538 0.33
539 0.36
540 0.36
541 0.36
542 0.37
543 0.36
544 0.32
545 0.29
546 0.3
547 0.28
548 0.24
549 0.2
550 0.17
551 0.14
552 0.11
553 0.1
554 0.08
555 0.06
556 0.06
557 0.07
558 0.09
559 0.09
560 0.1
561 0.13
562 0.14
563 0.16
564 0.19
565 0.22
566 0.23
567 0.27
568 0.29
569 0.34
570 0.38
571 0.38
572 0.38
573 0.4
574 0.44
575 0.48
576 0.52