Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0TJN0

Protein Details
Accession A0A4U0TJN0    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-132YQTVDERMDRRRKVRREAREQQERDDBasic
165-186VGDLTGRNRRNKQNERQRFYAVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 9.5, cyto_mito 8.5, nucl 8, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13428  TPR_14  
PF13432  TPR_16  
Amino Acid Sequences MSGRKDFLSQKAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEEQLKEALAKRAAALGTAAPTAYGVSKKKDDDGEVDEDQFRDAENEEGLFATGNYDREDDEADRIYQTVDERMDRRRKVRREAREQQERDDFERNNPKIQQQFADLKRALGTVSDEDWANIPEVGDLTGRNRRNKQNERQRFYAVPDSVLAGARDGSQLGTEVQDEGMATDANVSAEQADGTMTNFADIGAARNRVMQVRLDAAAQSQQSTGGTDSVAGTSTAIDPKGYLTSLTKSERLASEIPVGDIKRARMLLESVIKRNPRHGPGWIAAARLEEYAGKVQAAQNVIRRGTEMCPKSEDVWLEAIRLSASHGNKANAKIIAANAIKSNDRSVKLWVEAMGLEDQSVAKKRVLRKALDHIPQSVAIWKEAVNLEEDPSDAKLMLAKATEIIPLSVELWLALARLETPEEAQKVLNKARKAVPASYEIWIAAARLQEQTGQTEMVFKVMDRGIKGLARESAMLKREEWIQQAEICEEEGAPLTCQAIIRETLGWGLDEDDDRKQIWIDDGKASINRGKYETARAIYAYAIRVFYNRKTVWLAAAELERQHGTRQSLWDLLDEAVKSCPTSEVLWMQLAREKWQAGDIDEARRVLGLAFQQNPGNEDIWLAAVKLEADNGEMEKARILLADARNEAGTDRVWIKSVVFEREIKKDSDEALALVNEALQIYPKAAKLWMLKGQIYESRNMLPQAREAFNTGTRTCPQSTPLWLLASRLEEKMGVLVKARSILDRARLAIKNSPALWTESVRLEYRAKNLPAANQKMAQALQACPTSGLVWSERIWHLEARTQRKPRILEAIQKADSDPILFVTAARIFWGERKLEKAESWFQKAVVLDPDLGDTWAWWYKFSLQHGTAEKREELVAKCVLNEPRHGEVWAPVRKAPENAGMGIETVLKMVVKLLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.4
3 0.36
4 0.33
5 0.25
6 0.18
7 0.16
8 0.15
9 0.13
10 0.13
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.27
37 0.28
38 0.27
39 0.31
40 0.29
41 0.24
42 0.21
43 0.16
44 0.15
45 0.15
46 0.14
47 0.1
48 0.1
49 0.1
50 0.11
51 0.16
52 0.17
53 0.23
54 0.29
55 0.31
56 0.36
57 0.39
58 0.4
59 0.4
60 0.42
61 0.42
62 0.39
63 0.4
64 0.36
65 0.32
66 0.29
67 0.24
68 0.19
69 0.13
70 0.13
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.1
78 0.08
79 0.09
80 0.11
81 0.12
82 0.13
83 0.13
84 0.14
85 0.15
86 0.18
87 0.17
88 0.18
89 0.19
90 0.19
91 0.18
92 0.18
93 0.18
94 0.16
95 0.16
96 0.17
97 0.18
98 0.22
99 0.24
100 0.34
101 0.43
102 0.48
103 0.55
104 0.61
105 0.67
106 0.73
107 0.8
108 0.81
109 0.83
110 0.87
111 0.89
112 0.89
113 0.83
114 0.8
115 0.78
116 0.71
117 0.65
118 0.62
119 0.53
120 0.51
121 0.59
122 0.54
123 0.52
124 0.51
125 0.53
126 0.51
127 0.53
128 0.46
129 0.42
130 0.5
131 0.46
132 0.52
133 0.45
134 0.4
135 0.38
136 0.35
137 0.29
138 0.2
139 0.2
140 0.14
141 0.15
142 0.15
143 0.14
144 0.14
145 0.15
146 0.15
147 0.13
148 0.11
149 0.09
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.12
156 0.2
157 0.26
158 0.34
159 0.41
160 0.5
161 0.6
162 0.7
163 0.76
164 0.8
165 0.85
166 0.84
167 0.82
168 0.78
169 0.69
170 0.64
171 0.62
172 0.52
173 0.42
174 0.35
175 0.31
176 0.27
177 0.26
178 0.2
179 0.11
180 0.11
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.08
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.07
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.09
218 0.11
219 0.13
220 0.13
221 0.15
222 0.16
223 0.18
224 0.19
225 0.17
226 0.16
227 0.17
228 0.18
229 0.17
230 0.16
231 0.14
232 0.17
233 0.15
234 0.14
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.12
239 0.12
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.08
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.13
260 0.18
261 0.21
262 0.21
263 0.21
264 0.23
265 0.23
266 0.25
267 0.23
268 0.2
269 0.22
270 0.2
271 0.2
272 0.21
273 0.2
274 0.19
275 0.2
276 0.18
277 0.17
278 0.17
279 0.17
280 0.15
281 0.16
282 0.18
283 0.25
284 0.27
285 0.27
286 0.32
287 0.36
288 0.35
289 0.41
290 0.42
291 0.38
292 0.38
293 0.38
294 0.38
295 0.35
296 0.42
297 0.36
298 0.3
299 0.26
300 0.24
301 0.22
302 0.16
303 0.15
304 0.08
305 0.09
306 0.1
307 0.09
308 0.08
309 0.09
310 0.1
311 0.13
312 0.15
313 0.16
314 0.19
315 0.23
316 0.23
317 0.22
318 0.21
319 0.21
320 0.22
321 0.27
322 0.24
323 0.22
324 0.25
325 0.27
326 0.27
327 0.28
328 0.26
329 0.19
330 0.22
331 0.2
332 0.17
333 0.16
334 0.15
335 0.12
336 0.11
337 0.11
338 0.12
339 0.13
340 0.16
341 0.19
342 0.21
343 0.24
344 0.26
345 0.27
346 0.22
347 0.22
348 0.18
349 0.16
350 0.21
351 0.18
352 0.17
353 0.15
354 0.16
355 0.17
356 0.16
357 0.2
358 0.17
359 0.19
360 0.19
361 0.21
362 0.22
363 0.22
364 0.22
365 0.19
366 0.15
367 0.14
368 0.14
369 0.11
370 0.09
371 0.08
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.1
376 0.1
377 0.11
378 0.16
379 0.21
380 0.29
381 0.35
382 0.36
383 0.38
384 0.46
385 0.52
386 0.53
387 0.49
388 0.43
389 0.38
390 0.36
391 0.31
392 0.26
393 0.18
394 0.13
395 0.12
396 0.1
397 0.12
398 0.12
399 0.12
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.1
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.06
409 0.05
410 0.06
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.06
415 0.07
416 0.07
417 0.08
418 0.07
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.05
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.03
431 0.03
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.05
436 0.08
437 0.08
438 0.09
439 0.09
440 0.11
441 0.15
442 0.2
443 0.24
444 0.22
445 0.25
446 0.28
447 0.33
448 0.33
449 0.31
450 0.28
451 0.27
452 0.29
453 0.26
454 0.23
455 0.17
456 0.15
457 0.13
458 0.11
459 0.08
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.08
465 0.09
466 0.1
467 0.09
468 0.09
469 0.08
470 0.1
471 0.1
472 0.09
473 0.09
474 0.08
475 0.1
476 0.11
477 0.12
478 0.1
479 0.11
480 0.11
481 0.12
482 0.13
483 0.11
484 0.11
485 0.11
486 0.11
487 0.12
488 0.15
489 0.16
490 0.17
491 0.15
492 0.15
493 0.18
494 0.19
495 0.19
496 0.17
497 0.15
498 0.16
499 0.17
500 0.16
501 0.13
502 0.11
503 0.09
504 0.07
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.07
515 0.07
516 0.08
517 0.08
518 0.08
519 0.08
520 0.07
521 0.07
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.07
526 0.08
527 0.08
528 0.09
529 0.09
530 0.09
531 0.09
532 0.09
533 0.11
534 0.13
535 0.14
536 0.15
537 0.15
538 0.16
539 0.17
540 0.18
541 0.18
542 0.17
543 0.16
544 0.16
545 0.18
546 0.18
547 0.23
548 0.25
549 0.23
550 0.22
551 0.21
552 0.19
553 0.18
554 0.18
555 0.14
556 0.11
557 0.11
558 0.1
559 0.12
560 0.14
561 0.15
562 0.22
563 0.2
564 0.22
565 0.23
566 0.24
567 0.24
568 0.22
569 0.21
570 0.15
571 0.16
572 0.15
573 0.12
574 0.13
575 0.12
576 0.11
577 0.11
578 0.13
579 0.14
580 0.16
581 0.18
582 0.19
583 0.21
584 0.21
585 0.21
586 0.18
587 0.16
588 0.16
589 0.13
590 0.12
591 0.1
592 0.1
593 0.09
594 0.08
595 0.09
596 0.08
597 0.09
598 0.11
599 0.11
600 0.13
601 0.15
602 0.15
603 0.15
604 0.16
605 0.16
606 0.17
607 0.18
608 0.16
609 0.14
610 0.17
611 0.18
612 0.15
613 0.21
614 0.21
615 0.22
616 0.23
617 0.23
618 0.19
619 0.18
620 0.17
621 0.11
622 0.11
623 0.11
624 0.14
625 0.16
626 0.17
627 0.19
628 0.19
629 0.21
630 0.2
631 0.18
632 0.13
633 0.11
634 0.1
635 0.09
636 0.09
637 0.08
638 0.06
639 0.05
640 0.06
641 0.06
642 0.06
643 0.05
644 0.05
645 0.06
646 0.06
647 0.08
648 0.08
649 0.08
650 0.08
651 0.08
652 0.07
653 0.07
654 0.07
655 0.12
656 0.15
657 0.18
658 0.18
659 0.19
660 0.19
661 0.19
662 0.18
663 0.13
664 0.11
665 0.1
666 0.11
667 0.11
668 0.12
669 0.12
670 0.12
671 0.17
672 0.2
673 0.21
674 0.22
675 0.27
676 0.29
677 0.35
678 0.37
679 0.33
680 0.31
681 0.29
682 0.28
683 0.26
684 0.23
685 0.17
686 0.16
687 0.15
688 0.13
689 0.11
690 0.09
691 0.06
692 0.06
693 0.05
694 0.05
695 0.05
696 0.06
697 0.09
698 0.09
699 0.1
700 0.1
701 0.16
702 0.18
703 0.24
704 0.29
705 0.3
706 0.31
707 0.31
708 0.34
709 0.35
710 0.33
711 0.3
712 0.25
713 0.24
714 0.25
715 0.26
716 0.26
717 0.21
718 0.25
719 0.28
720 0.28
721 0.27
722 0.27
723 0.28
724 0.29
725 0.32
726 0.28
727 0.26
728 0.27
729 0.3
730 0.3
731 0.28
732 0.27
733 0.26
734 0.3
735 0.31
736 0.32
737 0.3
738 0.28
739 0.28
740 0.27
741 0.27
742 0.26
743 0.21
744 0.19
745 0.16
746 0.16
747 0.18
748 0.18
749 0.14
750 0.14
751 0.15
752 0.15
753 0.18
754 0.19
755 0.16
756 0.17
757 0.2
758 0.24
759 0.25
760 0.27
761 0.31
762 0.33
763 0.35
764 0.38
765 0.38
766 0.37
767 0.35
768 0.36
769 0.3
770 0.31
771 0.3
772 0.26
773 0.25
774 0.23
775 0.26
776 0.24
777 0.26
778 0.28
779 0.29
780 0.32
781 0.37
782 0.36
783 0.38
784 0.38
785 0.43
786 0.48
787 0.51
788 0.49
789 0.44
790 0.44
791 0.41
792 0.39
793 0.35
794 0.27
795 0.22
796 0.23
797 0.22
798 0.21
799 0.18
800 0.19
801 0.16
802 0.15
803 0.16
804 0.13
805 0.14
806 0.15
807 0.19
808 0.2
809 0.22
810 0.22
811 0.23
812 0.23
813 0.27
814 0.35
815 0.38
816 0.47
817 0.53
818 0.56
819 0.61
820 0.62
821 0.61
822 0.63
823 0.6
824 0.6
825 0.6
826 0.63
827 0.58
828 0.55
829 0.51
830 0.42
831 0.37
832 0.28
833 0.2
834 0.12
835 0.12
836 0.12
837 0.11
838 0.13
839 0.14
840 0.13
841 0.14
842 0.13
843 0.12
844 0.17
845 0.22
846 0.22
847 0.23
848 0.29
849 0.32
850 0.34
851 0.36
852 0.38
853 0.43
854 0.46
855 0.51
856 0.47
857 0.43
858 0.43
859 0.41
860 0.38
861 0.32
862 0.27
863 0.21
864 0.2
865 0.21
866 0.18
867 0.18
868 0.15
869 0.11
870 0.13
871 0.18
872 0.17
873 0.16
874 0.18
875 0.24
876 0.3
877 0.35
878 0.39
879 0.35
880 0.42
881 0.5
882 0.54
883 0.51
884 0.51
885 0.47
886 0.39
887 0.4
888 0.38
889 0.33
890 0.32
891 0.33
892 0.28
893 0.29
894 0.34
895 0.39
896 0.36
897 0.39
898 0.39
899 0.39
900 0.4
901 0.4
902 0.34
903 0.34
904 0.4
905 0.42
906 0.39
907 0.36
908 0.4
909 0.43
910 0.44
911 0.42
912 0.41
913 0.36
914 0.35
915 0.34
916 0.29
917 0.27
918 0.25
919 0.21
920 0.13
921 0.1
922 0.1
923 0.08
924 0.08