Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0UDF3

Protein Details
Accession A0A4U0UDF3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
181-203QEYEDVPKKKRRREGGQDVDKGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
188-193KKKRRR
721-736ERRKADAAKRQAGKRT
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14, nucl 13.5, cyto 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDNDNNNNTEAIASSRIFIKGLPPTFSDADFRKHFAQKNREVTDAKIFPNRRIGYVGFKTPEDAQKAVKYFNKTFIRMSRIGVELARPIADAKSVKPKGSAPTAIRQSSNDGDTSTEAGSKRKRQSDANKDQDPKLKEFLDAYKPKSKKKAWEVEQPEPEETVAEKPQGTDAAFEGFSDQEYEDVPKKKRRREGGQDVDKGAVPEQRHDVPAPEEKEQLGDPPLDRLEEGTNNVAEASNDRPAVSDSDWARSRTSRLLGLLDDDEDDAATTGRPGTAASETSDGENEDLARDVSRASMKNGKVASPDHILHFDNDNDAASEPKSEEKAAVPASKRLFIRNLPYNLQKEDLAAVFEPYGHLEEVHVPLDTRTGSGKGFAYIQFDDSDAAEQALTNKDGQTFQGRLLHVLPASAKRENKLDEFELSKLPLKKQQQIRKKREASQTTFNWNALYMNADAVVSSVADRLGLAKSEVLDPTSSDAAVKQAHAETHIIQETKSYFKQQGVDLDSFKKSQRGDTAILVKNIPYDCSKDELKRLFEEHGEIKRFLMPPSGIIAIVEYPNPVQCKSAFGALAYKKVKSSILFLEKAPKDFLSGQHHVINDAATSEGIAKTSAADLKDADFNVPDASGTATLFVRNLNFSTTTQQLTETFMPLDGFMSGRVKTKTDPKKPGQVLSMGFGFLEFRSPQQAQTALKAMDGYALDGHKLQIRASHKGADAAEERRKADAAKRQAGKRTKVIIKNLPFETTKKDIRTLFSAYGQLRSVRVPKKMDRAARGFAFADFTTPKEAESAMDALRDTHLLGRRLVLDYAEGEPEDAEAEIEKMQKKVGSQVNKMALQNLTSGGRKKFTTANEEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.18
4 0.18
5 0.18
6 0.18
7 0.21
8 0.25
9 0.29
10 0.31
11 0.3
12 0.35
13 0.36
14 0.37
15 0.37
16 0.32
17 0.36
18 0.36
19 0.39
20 0.4
21 0.46
22 0.52
23 0.56
24 0.63
25 0.65
26 0.73
27 0.72
28 0.71
29 0.66
30 0.62
31 0.62
32 0.57
33 0.51
34 0.49
35 0.48
36 0.45
37 0.54
38 0.51
39 0.43
40 0.43
41 0.41
42 0.42
43 0.45
44 0.48
45 0.4
46 0.39
47 0.4
48 0.4
49 0.45
50 0.4
51 0.36
52 0.33
53 0.38
54 0.4
55 0.43
56 0.44
57 0.45
58 0.44
59 0.52
60 0.54
61 0.5
62 0.55
63 0.55
64 0.57
65 0.52
66 0.51
67 0.46
68 0.4
69 0.39
70 0.34
71 0.29
72 0.24
73 0.23
74 0.2
75 0.16
76 0.15
77 0.14
78 0.18
79 0.17
80 0.18
81 0.28
82 0.31
83 0.32
84 0.34
85 0.37
86 0.39
87 0.44
88 0.48
89 0.42
90 0.48
91 0.55
92 0.55
93 0.52
94 0.47
95 0.46
96 0.42
97 0.39
98 0.31
99 0.23
100 0.22
101 0.22
102 0.23
103 0.17
104 0.17
105 0.16
106 0.22
107 0.3
108 0.37
109 0.44
110 0.5
111 0.53
112 0.6
113 0.7
114 0.74
115 0.78
116 0.79
117 0.79
118 0.76
119 0.77
120 0.75
121 0.69
122 0.61
123 0.56
124 0.47
125 0.4
126 0.39
127 0.4
128 0.42
129 0.43
130 0.45
131 0.49
132 0.52
133 0.58
134 0.64
135 0.64
136 0.64
137 0.69
138 0.74
139 0.71
140 0.78
141 0.79
142 0.79
143 0.8
144 0.72
145 0.63
146 0.53
147 0.45
148 0.35
149 0.28
150 0.23
151 0.17
152 0.16
153 0.15
154 0.15
155 0.17
156 0.18
157 0.17
158 0.14
159 0.13
160 0.14
161 0.14
162 0.13
163 0.13
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.07
169 0.08
170 0.12
171 0.17
172 0.24
173 0.3
174 0.38
175 0.47
176 0.55
177 0.63
178 0.69
179 0.73
180 0.77
181 0.83
182 0.84
183 0.86
184 0.82
185 0.74
186 0.65
187 0.55
188 0.45
189 0.36
190 0.28
191 0.19
192 0.18
193 0.21
194 0.21
195 0.23
196 0.23
197 0.23
198 0.24
199 0.31
200 0.31
201 0.29
202 0.28
203 0.26
204 0.27
205 0.25
206 0.23
207 0.17
208 0.16
209 0.14
210 0.15
211 0.16
212 0.15
213 0.14
214 0.14
215 0.15
216 0.15
217 0.17
218 0.16
219 0.15
220 0.15
221 0.15
222 0.13
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.13
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.14
231 0.17
232 0.16
233 0.2
234 0.17
235 0.24
236 0.27
237 0.28
238 0.28
239 0.27
240 0.29
241 0.27
242 0.29
243 0.24
244 0.23
245 0.23
246 0.21
247 0.22
248 0.2
249 0.16
250 0.14
251 0.11
252 0.1
253 0.08
254 0.08
255 0.05
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.06
264 0.08
265 0.09
266 0.1
267 0.12
268 0.12
269 0.13
270 0.13
271 0.11
272 0.1
273 0.09
274 0.08
275 0.06
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.08
282 0.12
283 0.12
284 0.16
285 0.23
286 0.23
287 0.28
288 0.29
289 0.28
290 0.26
291 0.27
292 0.27
293 0.24
294 0.25
295 0.21
296 0.23
297 0.22
298 0.21
299 0.22
300 0.18
301 0.14
302 0.14
303 0.12
304 0.1
305 0.1
306 0.09
307 0.07
308 0.08
309 0.08
310 0.09
311 0.1
312 0.1
313 0.11
314 0.1
315 0.14
316 0.16
317 0.2
318 0.19
319 0.23
320 0.25
321 0.28
322 0.28
323 0.27
324 0.28
325 0.26
326 0.32
327 0.35
328 0.37
329 0.36
330 0.41
331 0.41
332 0.39
333 0.38
334 0.3
335 0.23
336 0.21
337 0.17
338 0.13
339 0.1
340 0.09
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.08
350 0.1
351 0.1
352 0.09
353 0.08
354 0.08
355 0.1
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.1
362 0.1
363 0.09
364 0.11
365 0.11
366 0.13
367 0.12
368 0.13
369 0.12
370 0.12
371 0.11
372 0.1
373 0.1
374 0.07
375 0.07
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.07
380 0.08
381 0.07
382 0.08
383 0.08
384 0.09
385 0.1
386 0.13
387 0.12
388 0.13
389 0.18
390 0.18
391 0.18
392 0.18
393 0.18
394 0.14
395 0.14
396 0.13
397 0.12
398 0.15
399 0.17
400 0.17
401 0.18
402 0.21
403 0.23
404 0.23
405 0.23
406 0.21
407 0.19
408 0.2
409 0.2
410 0.18
411 0.17
412 0.19
413 0.18
414 0.18
415 0.23
416 0.25
417 0.31
418 0.39
419 0.47
420 0.53
421 0.63
422 0.7
423 0.74
424 0.76
425 0.77
426 0.77
427 0.76
428 0.71
429 0.68
430 0.63
431 0.58
432 0.53
433 0.46
434 0.36
435 0.28
436 0.23
437 0.15
438 0.13
439 0.08
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.03
447 0.03
448 0.04
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.04
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.06
458 0.07
459 0.08
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.09
464 0.09
465 0.08
466 0.07
467 0.07
468 0.09
469 0.09
470 0.09
471 0.08
472 0.09
473 0.09
474 0.1
475 0.11
476 0.1
477 0.12
478 0.14
479 0.13
480 0.12
481 0.14
482 0.14
483 0.17
484 0.17
485 0.17
486 0.17
487 0.19
488 0.21
489 0.21
490 0.25
491 0.26
492 0.27
493 0.26
494 0.27
495 0.26
496 0.25
497 0.24
498 0.22
499 0.18
500 0.2
501 0.23
502 0.24
503 0.25
504 0.28
505 0.35
506 0.35
507 0.35
508 0.32
509 0.27
510 0.26
511 0.24
512 0.22
513 0.14
514 0.14
515 0.15
516 0.18
517 0.21
518 0.21
519 0.28
520 0.31
521 0.32
522 0.31
523 0.31
524 0.29
525 0.27
526 0.28
527 0.27
528 0.28
529 0.29
530 0.27
531 0.26
532 0.28
533 0.29
534 0.25
535 0.24
536 0.18
537 0.16
538 0.18
539 0.18
540 0.14
541 0.12
542 0.12
543 0.09
544 0.1
545 0.09
546 0.07
547 0.06
548 0.09
549 0.1
550 0.1
551 0.11
552 0.11
553 0.14
554 0.14
555 0.17
556 0.15
557 0.14
558 0.21
559 0.21
560 0.29
561 0.26
562 0.26
563 0.23
564 0.25
565 0.27
566 0.2
567 0.23
568 0.23
569 0.28
570 0.29
571 0.29
572 0.38
573 0.37
574 0.37
575 0.35
576 0.27
577 0.24
578 0.24
579 0.3
580 0.28
581 0.3
582 0.31
583 0.33
584 0.33
585 0.3
586 0.28
587 0.23
588 0.14
589 0.12
590 0.09
591 0.05
592 0.06
593 0.06
594 0.06
595 0.06
596 0.06
597 0.06
598 0.06
599 0.08
600 0.1
601 0.09
602 0.1
603 0.1
604 0.12
605 0.15
606 0.15
607 0.14
608 0.11
609 0.12
610 0.11
611 0.11
612 0.09
613 0.06
614 0.07
615 0.07
616 0.07
617 0.08
618 0.08
619 0.08
620 0.08
621 0.09
622 0.09
623 0.1
624 0.1
625 0.11
626 0.13
627 0.14
628 0.18
629 0.19
630 0.19
631 0.18
632 0.19
633 0.18
634 0.21
635 0.21
636 0.18
637 0.16
638 0.15
639 0.15
640 0.13
641 0.13
642 0.09
643 0.08
644 0.08
645 0.1
646 0.1
647 0.15
648 0.16
649 0.17
650 0.21
651 0.31
652 0.4
653 0.48
654 0.56
655 0.58
656 0.67
657 0.69
658 0.7
659 0.63
660 0.58
661 0.49
662 0.42
663 0.37
664 0.26
665 0.22
666 0.18
667 0.15
668 0.1
669 0.12
670 0.1
671 0.1
672 0.16
673 0.17
674 0.18
675 0.21
676 0.25
677 0.23
678 0.26
679 0.31
680 0.25
681 0.25
682 0.24
683 0.2
684 0.18
685 0.17
686 0.14
687 0.11
688 0.11
689 0.12
690 0.12
691 0.13
692 0.14
693 0.15
694 0.14
695 0.19
696 0.23
697 0.29
698 0.31
699 0.34
700 0.31
701 0.35
702 0.34
703 0.33
704 0.32
705 0.33
706 0.38
707 0.36
708 0.37
709 0.34
710 0.34
711 0.32
712 0.35
713 0.38
714 0.4
715 0.46
716 0.53
717 0.57
718 0.66
719 0.72
720 0.71
721 0.69
722 0.69
723 0.69
724 0.68
725 0.72
726 0.72
727 0.7
728 0.72
729 0.66
730 0.6
731 0.53
732 0.48
733 0.47
734 0.44
735 0.43
736 0.39
737 0.43
738 0.42
739 0.44
740 0.47
741 0.45
742 0.41
743 0.37
744 0.41
745 0.36
746 0.36
747 0.34
748 0.3
749 0.26
750 0.28
751 0.34
752 0.33
753 0.39
754 0.44
755 0.49
756 0.58
757 0.65
758 0.68
759 0.68
760 0.68
761 0.68
762 0.62
763 0.59
764 0.49
765 0.41
766 0.37
767 0.28
768 0.26
769 0.2
770 0.2
771 0.21
772 0.21
773 0.2
774 0.17
775 0.18
776 0.15
777 0.17
778 0.18
779 0.14
780 0.15
781 0.15
782 0.15
783 0.16
784 0.15
785 0.13
786 0.16
787 0.22
788 0.23
789 0.24
790 0.26
791 0.27
792 0.29
793 0.29
794 0.23
795 0.18
796 0.18
797 0.19
798 0.18
799 0.16
800 0.14
801 0.13
802 0.12
803 0.11
804 0.09
805 0.07
806 0.06
807 0.08
808 0.1
809 0.15
810 0.17
811 0.17
812 0.2
813 0.21
814 0.22
815 0.3
816 0.36
817 0.41
818 0.44
819 0.52
820 0.57
821 0.6
822 0.6
823 0.55
824 0.47
825 0.39
826 0.35
827 0.3
828 0.26
829 0.26
830 0.31
831 0.31
832 0.34
833 0.33
834 0.35
835 0.39
836 0.41
837 0.46