FuNGI

A0A4U0TWJ0

Protein Details

Accession

A0A4U0TWJ0

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
320-345	EAPTPPPSKKKSGKKAKKTVEAEKGR	Basic
357-381	NESEPAPTKKTKKEKKGKQETASGA	Hydrophilic
464-491	LSVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
126-127	KK
325-339	PPSKKKSGKKAKKTV
364-374	TKKTKKEKKGK
470-483	KGFTKEKNKKKRGS

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MGSAKKAKTAKVAKTNSEVVPAQLWQPTSSDTPAPRMLDVLSQCAHFFDQLGYTATLTTLLDEAKGKGFRINVAEWDRGCREEHSAPLLELWEEWHRRNDGYPIVPGDEMASEEEVVAAKKDEKDKKAKKVVMKEESSESESSESESSESESSESESSESESSESESGSSSEESEDDETEGHKAGVVADEAESTSDDSSEEESESSGSEAEDSKVGHKRKRAATPSSSEASSSEDSSSDSESTSAESNARPAKRAKVQSTNDGHDSSDASDSEGESGVADVEMNDAASSSASSDSESSSDSSSSSSESEASSSSSESESEAPTPPPSKKKSGKKAKKTVEAEKGRSESNSSSTTLGNESEPAPTKKTKKEKKGKQETASGAAKSGATQQDEILAPAAAVEGEPNTAGIHPDRLKRMPATNATIQELKKQNIPFSRIPANTKVDPKFASNEYVPYDYANRAWQDLSVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDLAPKGIKFDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.67
2	0.7
3	0.61
4	0.57
5	0.48
6	0.39
7	0.35
8	0.3
9	0.26
10	0.23
11	0.24
12	0.18
13	0.19
14	0.21
15	0.21
16	0.23
17	0.26
18	0.25
19	0.3
20	0.34
21	0.35
22	0.31
23	0.29
24	0.27
25	0.28
26	0.27
27	0.26
28	0.22
29	0.21
30	0.21
31	0.22
32	0.21
33	0.15
34	0.15
35	0.12
36	0.12
37	0.13
38	0.16
39	0.15
40	0.14
41	0.14
42	0.13
43	0.13
44	0.11
45	0.1
46	0.08
47	0.08
48	0.09
49	0.1
50	0.12
51	0.17
52	0.18
53	0.18
54	0.2
55	0.21
56	0.23
57	0.27
58	0.27
59	0.29
60	0.33
61	0.36
62	0.34
63	0.38
64	0.36
65	0.33
66	0.33
67	0.27
68	0.29
69	0.27
70	0.3
71	0.29
72	0.29
73	0.27
74	0.26
75	0.25
76	0.19
77	0.16
78	0.16
79	0.19
80	0.21
81	0.22
82	0.27
83	0.28
84	0.29
85	0.31
86	0.32
87	0.31
88	0.3
89	0.31
90	0.28
91	0.28
92	0.27
93	0.25
94	0.21
95	0.15
96	0.13
97	0.11
98	0.1
99	0.08
100	0.08
101	0.08
102	0.08
103	0.08
104	0.07
105	0.07
106	0.1
107	0.14
108	0.23
109	0.3
110	0.37
111	0.47
112	0.56
113	0.65
114	0.72
115	0.74
116	0.73
117	0.76
118	0.79
119	0.77
120	0.71
121	0.64
122	0.58
123	0.55
124	0.5
125	0.4
126	0.31
127	0.23
128	0.2
129	0.19
130	0.15
131	0.13
132	0.1
133	0.1
134	0.11
135	0.1
136	0.1
137	0.09
138	0.09
139	0.1
140	0.1
141	0.1
142	0.09
143	0.09
144	0.1
145	0.1
146	0.1
147	0.09
148	0.09
149	0.1
150	0.1
151	0.1
152	0.08
153	0.08
154	0.08
155	0.09
156	0.09
157	0.08
158	0.08
159	0.08
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.08
164	0.08
165	0.08
166	0.09
167	0.09
168	0.07
169	0.07
170	0.06
171	0.06
172	0.07
173	0.07
174	0.06
175	0.06
176	0.06
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.07
186	0.07
187	0.07
188	0.07
189	0.07
190	0.07
191	0.07
192	0.07
193	0.05
194	0.05
195	0.05
196	0.06
197	0.06
198	0.07
199	0.07
200	0.11
201	0.18
202	0.22
203	0.25
204	0.29
205	0.36
206	0.42
207	0.51
208	0.54
209	0.54
210	0.55
211	0.56
212	0.55
213	0.5
214	0.43
215	0.34
216	0.27
217	0.24
218	0.2
219	0.16
220	0.12
221	0.1
222	0.11
223	0.11
224	0.12
225	0.09
226	0.08
227	0.07
228	0.07
229	0.08
230	0.08
231	0.08
232	0.08
233	0.07
234	0.11
235	0.16
236	0.16
237	0.17
238	0.19
239	0.24
240	0.3
241	0.36
242	0.38
243	0.43
244	0.45
245	0.52
246	0.54
247	0.51
248	0.46
249	0.4
250	0.35
251	0.26
252	0.24
253	0.16
254	0.13
255	0.1
256	0.09
257	0.08
258	0.08
259	0.08
260	0.07
261	0.06
262	0.05
263	0.05
264	0.04
265	0.04
266	0.04
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.03
275	0.03
276	0.04
277	0.04
278	0.04
279	0.05
280	0.06
281	0.06
282	0.07
283	0.08
284	0.08
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.09
291	0.08
292	0.08
293	0.08
294	0.08
295	0.08
296	0.08
297	0.09
298	0.08
299	0.08
300	0.09
301	0.08
302	0.08
303	0.09
304	0.1
305	0.1
306	0.11
307	0.12
308	0.12
309	0.15
310	0.18
311	0.21
312	0.27
313	0.31
314	0.39
315	0.47
316	0.57
317	0.65
318	0.73
319	0.8
320	0.83
321	0.89
322	0.88
323	0.89
324	0.85
325	0.83
326	0.82
327	0.79
328	0.72
329	0.67
330	0.6
331	0.51
332	0.45
333	0.39
334	0.3
335	0.26
336	0.24
337	0.2
338	0.2
339	0.19
340	0.2
341	0.18
342	0.17
343	0.13
344	0.13
345	0.12
346	0.14
347	0.18
348	0.19
349	0.22
350	0.27
351	0.33
352	0.42
353	0.52
354	0.59
355	0.65
356	0.74
357	0.81
358	0.86
359	0.91
360	0.91
361	0.86
362	0.85
363	0.77
364	0.74
365	0.67
366	0.56
367	0.45
368	0.36
369	0.3
370	0.22
371	0.24
372	0.2
373	0.17
374	0.18
375	0.17
376	0.2
377	0.2
378	0.2
379	0.16
380	0.12
381	0.1
382	0.09
383	0.09
384	0.05
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.06
393	0.08
394	0.08
395	0.15
396	0.19
397	0.25
398	0.31
399	0.33
400	0.37
401	0.39
402	0.44
403	0.44
404	0.45
405	0.47
406	0.47
407	0.47
408	0.47
409	0.48
410	0.43
411	0.44
412	0.44
413	0.4
414	0.4
415	0.4
416	0.43
417	0.45
418	0.51
419	0.47
420	0.47
421	0.53
422	0.51
423	0.53
424	0.53
425	0.53
426	0.52
427	0.57
428	0.53
429	0.5
430	0.48
431	0.46
432	0.44
433	0.4
434	0.4
435	0.33
436	0.34
437	0.33
438	0.33
439	0.3
440	0.27
441	0.28
442	0.24
443	0.24
444	0.26
445	0.23
446	0.23
447	0.23
448	0.21
449	0.24
450	0.24
451	0.28
452	0.28
453	0.28
454	0.27
455	0.33
456	0.34
457	0.38
458	0.42
459	0.47
460	0.52
461	0.62
462	0.72
463	0.77
464	0.85
465	0.85
466	0.9
467	0.91
468	0.9
469	0.9
470	0.88
471	0.86
472	0.84
473	0.77
474	0.67
475	0.58
476	0.54
477	0.44
478	0.38
479	0.29
480	0.21

A0A4U0TWJ0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer