Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0UD26

Protein Details
Accession A0A4U0UD26    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
246-274LPSTHTFKPPPRKPSRKRRRLDPGKAAALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
253-273KPPPRKPSRKRRRLDPGKAAA
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 10, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MQPSSLARSISPPPTRKQSKSLLKAPESAVEHDTGDINAETNPPVELLDGAPTLAAVEAGQAQIQDHLDYFAKHLGNTARQQPGPRLDIEDFQNLYKRNQHSQGCHFVIHQHDHPISGVHYDLRLQFSESSAISFAVPYGMPGNANSIRPNRMAIETRVHNLWNNLIESASHATGSLLIWDTGEYEVLPRPQKQHRLTDDELSDAEEPTDQRPQNERLATAFQSRHIHLRLHGTRLPPNYTLALRLPSTHTFKPPPRKPSRKRRRLDPGKAAALAKQKAMPVSSDTEDENPANSDPASRSPQADWDAALASEDDDDDETTAALIRATNAYPGATNTINSIHQRHWFLTLDRSSSGFHKARSGPEKGRWVGGWAGEPFFVRGRDVERSVVTGRNADEVMRDEGVERFVGRKMWRAILE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.67
3 0.67
4 0.69
5 0.7
6 0.72
7 0.75
8 0.77
9 0.76
10 0.71
11 0.71
12 0.65
13 0.62
14 0.54
15 0.48
16 0.42
17 0.33
18 0.3
19 0.26
20 0.24
21 0.17
22 0.16
23 0.13
24 0.11
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.11
29 0.11
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.08
35 0.1
36 0.1
37 0.09
38 0.09
39 0.08
40 0.08
41 0.07
42 0.06
43 0.03
44 0.04
45 0.05
46 0.06
47 0.06
48 0.06
49 0.07
50 0.09
51 0.1
52 0.09
53 0.09
54 0.11
55 0.12
56 0.12
57 0.14
58 0.17
59 0.17
60 0.16
61 0.21
62 0.23
63 0.28
64 0.32
65 0.38
66 0.38
67 0.4
68 0.43
69 0.45
70 0.47
71 0.43
72 0.39
73 0.37
74 0.33
75 0.35
76 0.36
77 0.35
78 0.3
79 0.29
80 0.32
81 0.29
82 0.3
83 0.33
84 0.34
85 0.35
86 0.42
87 0.47
88 0.49
89 0.54
90 0.61
91 0.55
92 0.52
93 0.45
94 0.41
95 0.4
96 0.38
97 0.33
98 0.3
99 0.28
100 0.28
101 0.27
102 0.24
103 0.2
104 0.16
105 0.15
106 0.09
107 0.1
108 0.11
109 0.13
110 0.14
111 0.14
112 0.15
113 0.15
114 0.15
115 0.17
116 0.15
117 0.13
118 0.12
119 0.12
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.12
131 0.13
132 0.15
133 0.18
134 0.2
135 0.22
136 0.23
137 0.24
138 0.2
139 0.22
140 0.24
141 0.23
142 0.27
143 0.26
144 0.27
145 0.27
146 0.26
147 0.23
148 0.21
149 0.21
150 0.16
151 0.15
152 0.13
153 0.12
154 0.11
155 0.12
156 0.13
157 0.11
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.07
174 0.1
175 0.13
176 0.14
177 0.19
178 0.25
179 0.34
180 0.38
181 0.45
182 0.46
183 0.52
184 0.52
185 0.52
186 0.46
187 0.38
188 0.33
189 0.26
190 0.22
191 0.14
192 0.12
193 0.08
194 0.08
195 0.09
196 0.15
197 0.14
198 0.15
199 0.2
200 0.23
201 0.28
202 0.28
203 0.27
204 0.23
205 0.26
206 0.25
207 0.25
208 0.22
209 0.21
210 0.23
211 0.23
212 0.25
213 0.24
214 0.24
215 0.21
216 0.3
217 0.29
218 0.31
219 0.33
220 0.31
221 0.34
222 0.36
223 0.38
224 0.29
225 0.28
226 0.25
227 0.22
228 0.22
229 0.18
230 0.18
231 0.15
232 0.15
233 0.17
234 0.2
235 0.25
236 0.25
237 0.28
238 0.32
239 0.39
240 0.49
241 0.52
242 0.59
243 0.64
244 0.74
245 0.8
246 0.85
247 0.89
248 0.88
249 0.87
250 0.87
251 0.88
252 0.88
253 0.87
254 0.86
255 0.82
256 0.75
257 0.71
258 0.61
259 0.54
260 0.5
261 0.41
262 0.32
263 0.26
264 0.24
265 0.23
266 0.23
267 0.19
268 0.15
269 0.18
270 0.18
271 0.17
272 0.17
273 0.18
274 0.19
275 0.18
276 0.16
277 0.14
278 0.13
279 0.12
280 0.11
281 0.12
282 0.11
283 0.16
284 0.2
285 0.2
286 0.22
287 0.21
288 0.27
289 0.28
290 0.27
291 0.23
292 0.19
293 0.18
294 0.16
295 0.16
296 0.1
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.05
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.05
307 0.06
308 0.06
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.08
313 0.08
314 0.1
315 0.09
316 0.1
317 0.1
318 0.11
319 0.14
320 0.12
321 0.12
322 0.13
323 0.15
324 0.18
325 0.2
326 0.23
327 0.22
328 0.28
329 0.31
330 0.3
331 0.32
332 0.32
333 0.31
334 0.37
335 0.37
336 0.34
337 0.31
338 0.32
339 0.29
340 0.28
341 0.35
342 0.29
343 0.27
344 0.32
345 0.34
346 0.42
347 0.47
348 0.53
349 0.51
350 0.56
351 0.64
352 0.57
353 0.57
354 0.49
355 0.45
356 0.4
357 0.35
358 0.33
359 0.25
360 0.25
361 0.22
362 0.22
363 0.21
364 0.21
365 0.2
366 0.16
367 0.16
368 0.2
369 0.25
370 0.27
371 0.29
372 0.27
373 0.3
374 0.32
375 0.34
376 0.31
377 0.28
378 0.27
379 0.27
380 0.26
381 0.22
382 0.22
383 0.21
384 0.24
385 0.21
386 0.2
387 0.18
388 0.19
389 0.2
390 0.19
391 0.16
392 0.14
393 0.16
394 0.22
395 0.22
396 0.29
397 0.33