Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0U3U8

Protein Details
Accession A0A4U0U3U8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
420-452RETLIPEAPRRPRNRNQKKSSSRPRGQRLYTDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
428-444PRRPRNRNQKKSSSRPR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 5, mito 3, plas 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030671  Sec61-beta/Sbh  
IPR016482  SecG/Sec61-beta/Sbh  
Gene Ontology GO:0005784  C:Sec61 translocon complex  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF03911  Sec61_beta  
Amino Acid Sequences MSFYDNESFGRQSSWEQQAPPSRSGAGSAMSQQSDTTAFASQFEEIERATDNLMKSGKWLPGAMMPAGGSGTRRDSVPAIGRGSDNYSDPRMGGSSRHHSVSDYEGGRPGSAGLQGYYAGQRFPGGRQSEAEQMLQAKRRMAAQRERELRNYHQEQQYNRVAVSGAKSDRAMSPNTMSEEDRRELIARQHRALYGDNSSLYGAEGSGQRRQSQDVRVSGAGRGASPLAFDPFGQAQAGAEGAAVQMPPRDRANSTASPASNSATQQSYNLLNEAQQSSRTSASSPGESPPLGQGQKGSMAGVAPIGTRPMQQQAAGLNKRSTTPLTPSSLSYGFNAESQNPNIKDERSPSSASNPPLEKGVGGLGGWGGSNSGVWGSGKGSLAVQPSLAKELKWRIAVKDVFTATNLPRQLPSLNRHHNRETLIPEAPRRPRNRNQKKSSSRPRGQRLYTDESPGLKVDPFVVMVLSIGFIISVVMLHILAKLTKRFSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.35
3 0.36
4 0.43
5 0.51
6 0.54
7 0.51
8 0.46
9 0.39
10 0.35
11 0.36
12 0.3
13 0.22
14 0.19
15 0.22
16 0.24
17 0.22
18 0.22
19 0.2
20 0.19
21 0.19
22 0.18
23 0.15
24 0.13
25 0.13
26 0.14
27 0.16
28 0.15
29 0.14
30 0.15
31 0.14
32 0.11
33 0.12
34 0.13
35 0.12
36 0.13
37 0.16
38 0.15
39 0.19
40 0.2
41 0.19
42 0.2
43 0.25
44 0.26
45 0.24
46 0.24
47 0.21
48 0.24
49 0.27
50 0.23
51 0.19
52 0.16
53 0.15
54 0.15
55 0.13
56 0.1
57 0.1
58 0.13
59 0.13
60 0.13
61 0.15
62 0.16
63 0.21
64 0.27
65 0.3
66 0.28
67 0.29
68 0.29
69 0.29
70 0.31
71 0.27
72 0.23
73 0.21
74 0.22
75 0.21
76 0.2
77 0.2
78 0.17
79 0.17
80 0.18
81 0.22
82 0.27
83 0.29
84 0.31
85 0.3
86 0.3
87 0.31
88 0.32
89 0.33
90 0.26
91 0.25
92 0.26
93 0.26
94 0.25
95 0.23
96 0.19
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.1
104 0.12
105 0.11
106 0.1
107 0.09
108 0.11
109 0.11
110 0.13
111 0.2
112 0.2
113 0.2
114 0.22
115 0.25
116 0.3
117 0.3
118 0.29
119 0.22
120 0.24
121 0.27
122 0.31
123 0.29
124 0.25
125 0.24
126 0.3
127 0.35
128 0.38
129 0.44
130 0.47
131 0.55
132 0.61
133 0.63
134 0.62
135 0.61
136 0.58
137 0.59
138 0.56
139 0.54
140 0.52
141 0.53
142 0.51
143 0.53
144 0.53
145 0.45
146 0.39
147 0.32
148 0.26
149 0.22
150 0.22
151 0.21
152 0.16
153 0.16
154 0.16
155 0.17
156 0.2
157 0.2
158 0.2
159 0.16
160 0.18
161 0.19
162 0.21
163 0.22
164 0.2
165 0.21
166 0.24
167 0.23
168 0.21
169 0.19
170 0.18
171 0.18
172 0.25
173 0.31
174 0.3
175 0.31
176 0.32
177 0.32
178 0.33
179 0.33
180 0.28
181 0.22
182 0.19
183 0.18
184 0.16
185 0.15
186 0.13
187 0.11
188 0.09
189 0.06
190 0.06
191 0.09
192 0.1
193 0.14
194 0.15
195 0.17
196 0.18
197 0.21
198 0.24
199 0.27
200 0.31
201 0.28
202 0.3
203 0.3
204 0.3
205 0.27
206 0.24
207 0.18
208 0.13
209 0.11
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.04
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.05
233 0.05
234 0.07
235 0.08
236 0.1
237 0.11
238 0.15
239 0.21
240 0.21
241 0.23
242 0.25
243 0.24
244 0.24
245 0.24
246 0.21
247 0.16
248 0.15
249 0.14
250 0.12
251 0.12
252 0.11
253 0.12
254 0.13
255 0.12
256 0.12
257 0.1
258 0.1
259 0.12
260 0.13
261 0.11
262 0.11
263 0.12
264 0.13
265 0.14
266 0.13
267 0.12
268 0.15
269 0.16
270 0.17
271 0.17
272 0.16
273 0.17
274 0.17
275 0.16
276 0.14
277 0.17
278 0.16
279 0.15
280 0.14
281 0.13
282 0.15
283 0.15
284 0.13
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.07
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.08
296 0.12
297 0.12
298 0.12
299 0.14
300 0.17
301 0.26
302 0.27
303 0.29
304 0.26
305 0.26
306 0.26
307 0.27
308 0.25
309 0.19
310 0.22
311 0.23
312 0.26
313 0.27
314 0.27
315 0.29
316 0.28
317 0.26
318 0.21
319 0.19
320 0.15
321 0.16
322 0.17
323 0.15
324 0.17
325 0.18
326 0.25
327 0.24
328 0.26
329 0.26
330 0.27
331 0.28
332 0.29
333 0.32
334 0.29
335 0.3
336 0.29
337 0.33
338 0.37
339 0.37
340 0.38
341 0.34
342 0.3
343 0.3
344 0.29
345 0.22
346 0.17
347 0.16
348 0.1
349 0.08
350 0.08
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.05
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.05
362 0.06
363 0.06
364 0.1
365 0.1
366 0.1
367 0.11
368 0.13
369 0.15
370 0.15
371 0.15
372 0.14
373 0.14
374 0.19
375 0.19
376 0.16
377 0.2
378 0.27
379 0.31
380 0.35
381 0.37
382 0.34
383 0.43
384 0.45
385 0.42
386 0.42
387 0.38
388 0.32
389 0.31
390 0.33
391 0.26
392 0.29
393 0.28
394 0.23
395 0.22
396 0.23
397 0.27
398 0.29
399 0.34
400 0.38
401 0.48
402 0.54
403 0.6
404 0.62
405 0.63
406 0.6
407 0.59
408 0.52
409 0.46
410 0.45
411 0.43
412 0.44
413 0.48
414 0.53
415 0.56
416 0.59
417 0.63
418 0.68
419 0.75
420 0.81
421 0.83
422 0.85
423 0.87
424 0.91
425 0.93
426 0.94
427 0.94
428 0.91
429 0.91
430 0.91
431 0.9
432 0.84
433 0.81
434 0.78
435 0.76
436 0.7
437 0.65
438 0.58
439 0.5
440 0.47
441 0.39
442 0.33
443 0.24
444 0.22
445 0.17
446 0.15
447 0.14
448 0.12
449 0.11
450 0.09
451 0.09
452 0.09
453 0.07
454 0.06
455 0.05
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.03
461 0.03
462 0.04
463 0.04
464 0.05
465 0.06
466 0.07
467 0.1
468 0.14
469 0.19