FuNGI

A0A4U0U2Q3

Protein Details

Accession

A0A4U0U2Q3

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-52	MPTIRRKANTSIFNKKKPLKRPPQQAQTHTGA	Hydrophilic
188-213	APTGEAGKKPTKKKPQKKVEDVYYDE	Hydrophilic
419-446	AEDEERKKQKKLRRKLKRKEMRHEYESD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
36-40	KKPLK
194-205	GKKPTKKKPQKK
423-438	ERKKQKKLRRKLKRKE

Subcellular Location(s)

nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSASPSNPTPGSTSATPNAAMPTIRRKANTSIFNKKKPLKRPPQQAQTHTGAGQVPMSETQALGPHASVRPTANGQRAPPNPDDDPSLYTEYPIYINKSALARDLHHHAFKMNTDERKADGRPVEVNPYDEQVFTRPVRLHRRLARDKAEGADQSAAASDVDDKEREVREAKKAERQAEREANQAQIAPTGEAGKKPTKKKPQKKVEDVYYDESNPKHQLRSQLRYAEARPWHLEDFEGKQKWIGSYEQPLSNTNVMFEVADGGFKMVPVEKWYKMVRSDRVSTMDMGQVEKIMQAKHTAPRWFMNSHEAADAARAEAFALKREQIQNARRQPKQEDEDGPSFVKQEDYRADVDEIDFEFNDEFQDDDEGFIYGDVPDEDTKEIEKRIRKEMRDANLGGTGVKDEDKDWDEEEQNEKRAEDEERKKQKKLRRKLKRKEMRHEYESDTDDENKYEESSEDEDSEEEREREEKERKEKEAAQANDEKSGSSTKGTSTPTGRLEKKAVPGASLKRDAELSELSGNESSRKKAKFNGTKGSNGAARSLSPDAARRMPSGYGSGSETDTSRPGRTKLKLKNSPPGSPNDGSRAASPSGSRAQSPALSPPVAQPFPTLDEIKAAIPPAGIAIGELVKRFKLRLGDKGTDFITMVKNVGRQDPATKKIVRRD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.32
3	0.31
4	0.29
5	0.28
6	0.24
7	0.23
8	0.21
9	0.28
10	0.32
11	0.36
12	0.37
13	0.4
14	0.47
15	0.54
16	0.6
17	0.59
18	0.64
19	0.69
20	0.75
21	0.81
22	0.81
23	0.81
24	0.81
25	0.84
26	0.84
27	0.85
28	0.88
29	0.89
30	0.9
31	0.91
32	0.87
33	0.82
34	0.77
35	0.7
36	0.59
37	0.5
38	0.41
39	0.32
40	0.27
41	0.2
42	0.16
43	0.14
44	0.15
45	0.13
46	0.12
47	0.12
48	0.14
49	0.15
50	0.14
51	0.13
52	0.16
53	0.18
54	0.19
55	0.2
56	0.18
57	0.21
58	0.26
59	0.32
60	0.36
61	0.38
62	0.4
63	0.47
64	0.5
65	0.52
66	0.49
67	0.49
68	0.43
69	0.41
70	0.42
71	0.35
72	0.34
73	0.32
74	0.34
75	0.28
76	0.27
77	0.25
78	0.21
79	0.21
80	0.21
81	0.22
82	0.19
83	0.19
84	0.22
85	0.23
86	0.23
87	0.24
88	0.24
89	0.22
90	0.24
91	0.31
92	0.33
93	0.33
94	0.33
95	0.3
96	0.3
97	0.3
98	0.35
99	0.35
100	0.35
101	0.36
102	0.37
103	0.38
104	0.41
105	0.4
106	0.38
107	0.34
108	0.32
109	0.33
110	0.34
111	0.39
112	0.34
113	0.36
114	0.3
115	0.31
116	0.28
117	0.24
118	0.23
119	0.18
120	0.22
121	0.2
122	0.24
123	0.25
124	0.32
125	0.42
126	0.47
127	0.54
128	0.56
129	0.66
130	0.7
131	0.75
132	0.74
133	0.68
134	0.65
135	0.58
136	0.55
137	0.45
138	0.37
139	0.31
140	0.23
141	0.19
142	0.16
143	0.14
144	0.09
145	0.09
146	0.08
147	0.08
148	0.1
149	0.1
150	0.11
151	0.15
152	0.16
153	0.18
154	0.21
155	0.23
156	0.3
157	0.37
158	0.4
159	0.44
160	0.49
161	0.54
162	0.58
163	0.58
164	0.59
165	0.6
166	0.58
167	0.55
168	0.51
169	0.45
170	0.37
171	0.34
172	0.25
173	0.18
174	0.18
175	0.12
176	0.11
177	0.13
178	0.13
179	0.13
180	0.18
181	0.24
182	0.3
183	0.37
184	0.47
185	0.55
186	0.66
187	0.75
188	0.82
189	0.85
190	0.88
191	0.91
192	0.9
193	0.87
194	0.83
195	0.77
196	0.71
197	0.62
198	0.53
199	0.45
200	0.37
201	0.31
202	0.29
203	0.26
204	0.24
205	0.24
206	0.33
207	0.39
208	0.45
209	0.48
210	0.48
211	0.49
212	0.5
213	0.49
214	0.46
215	0.4
216	0.38
217	0.34
218	0.32
219	0.3
220	0.26
221	0.26
222	0.21
223	0.23
224	0.27
225	0.26
226	0.23
227	0.24
228	0.24
229	0.24
230	0.24
231	0.21
232	0.16
233	0.21
234	0.24
235	0.25
236	0.26
237	0.26
238	0.27
239	0.27
240	0.24
241	0.18
242	0.15
243	0.12
244	0.11
245	0.09
246	0.08
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.05
255	0.06
256	0.09
257	0.14
258	0.14
259	0.18
260	0.2
261	0.22
262	0.27
263	0.32
264	0.34
265	0.35
266	0.38
267	0.36
268	0.39
269	0.37
270	0.32
271	0.28
272	0.24
273	0.19
274	0.17
275	0.14
276	0.1
277	0.09
278	0.1
279	0.1
280	0.08
281	0.08
282	0.1
283	0.13
284	0.17
285	0.22
286	0.23
287	0.24
288	0.26
289	0.29
290	0.28
291	0.27
292	0.27
293	0.23
294	0.22
295	0.2
296	0.17
297	0.14
298	0.14
299	0.12
300	0.07
301	0.06
302	0.05
303	0.04
304	0.07
305	0.07
306	0.08
307	0.09
308	0.09
309	0.12
310	0.14
311	0.17
312	0.23
313	0.28
314	0.36
315	0.44
316	0.51
317	0.5
318	0.52
319	0.52
320	0.52
321	0.5
322	0.46
323	0.4
324	0.38
325	0.38
326	0.37
327	0.34
328	0.26
329	0.23
330	0.18
331	0.16
332	0.11
333	0.12
334	0.12
335	0.14
336	0.15
337	0.16
338	0.16
339	0.14
340	0.14
341	0.12
342	0.11
343	0.09
344	0.08
345	0.07
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.05
350	0.05
351	0.04
352	0.06
353	0.05
354	0.05
355	0.06
356	0.06
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.05
364	0.05
365	0.06
366	0.07
367	0.07
368	0.08
369	0.09
370	0.12
371	0.16
372	0.21
373	0.23
374	0.33
375	0.4
376	0.4
377	0.47
378	0.53
379	0.53
380	0.54
381	0.51
382	0.42
383	0.37
384	0.36
385	0.27
386	0.19
387	0.14
388	0.09
389	0.08
390	0.07
391	0.06
392	0.09
393	0.11
394	0.12
395	0.13
396	0.15
397	0.16
398	0.17
399	0.23
400	0.22
401	0.24
402	0.23
403	0.22
404	0.2
405	0.21
406	0.23
407	0.27
408	0.33
409	0.41
410	0.51
411	0.56
412	0.6
413	0.65
414	0.7
415	0.71
416	0.74
417	0.74
418	0.75
419	0.82
420	0.88
421	0.92
422	0.94
423	0.93
424	0.93
425	0.93
426	0.9
427	0.83
428	0.76
429	0.7
430	0.64
431	0.56
432	0.47
433	0.38
434	0.32
435	0.28
436	0.24
437	0.2
438	0.15
439	0.13
440	0.11
441	0.1
442	0.11
443	0.13
444	0.14
445	0.14
446	0.14
447	0.14
448	0.14
449	0.16
450	0.14
451	0.12
452	0.11
453	0.13
454	0.14
455	0.21
456	0.28
457	0.34
458	0.42
459	0.49
460	0.51
461	0.57
462	0.59
463	0.6
464	0.62
465	0.56
466	0.52
467	0.52
468	0.5
469	0.47
470	0.42
471	0.34
472	0.26
473	0.26
474	0.21
475	0.15
476	0.15
477	0.13
478	0.18
479	0.21
480	0.23
481	0.24
482	0.28
483	0.33
484	0.4
485	0.41
486	0.4
487	0.42
488	0.42
489	0.45
490	0.46
491	0.4
492	0.35
493	0.38
494	0.41
495	0.42
496	0.44
497	0.39
498	0.33
499	0.33
500	0.32
501	0.28
502	0.23
503	0.19
504	0.15
505	0.15
506	0.16
507	0.16
508	0.16
509	0.19
510	0.2
511	0.21
512	0.26
513	0.29
514	0.31
515	0.37
516	0.48
517	0.53
518	0.59
519	0.65
520	0.62
521	0.64
522	0.63
523	0.59
524	0.52
525	0.42
526	0.36
527	0.26
528	0.22
529	0.22
530	0.22
531	0.19
532	0.18
533	0.22
534	0.24
535	0.28
536	0.3
537	0.27
538	0.27
539	0.27
540	0.27
541	0.25
542	0.22
543	0.19
544	0.19
545	0.19
546	0.18
547	0.18
548	0.17
549	0.16
550	0.19
551	0.2
552	0.22
553	0.24
554	0.27
555	0.34
556	0.41
557	0.49
558	0.55
559	0.64
560	0.7
561	0.73
562	0.79
563	0.77
564	0.77
565	0.71
566	0.68
567	0.64
568	0.57
569	0.53
570	0.49
571	0.46
572	0.39
573	0.38
574	0.35
575	0.28
576	0.27
577	0.25
578	0.24
579	0.27
580	0.27
581	0.26
582	0.24
583	0.26
584	0.27
585	0.28
586	0.29
587	0.27
588	0.26
589	0.26
590	0.3
591	0.35
592	0.34
593	0.32
594	0.28
595	0.26
596	0.3
597	0.34
598	0.3
599	0.21
600	0.23
601	0.24
602	0.24
603	0.22
604	0.19
605	0.15
606	0.13
607	0.12
608	0.1
609	0.09
610	0.08
611	0.06
612	0.07
613	0.09
614	0.11
615	0.12
616	0.13
617	0.15
618	0.17
619	0.17
620	0.2
621	0.27
622	0.31
623	0.4
624	0.47
625	0.52
626	0.53
627	0.56
628	0.52
629	0.44
630	0.39
631	0.33
632	0.28
633	0.22
634	0.21
635	0.2
636	0.23
637	0.24
638	0.28
639	0.29
640	0.27
641	0.36
642	0.42
643	0.45
644	0.49
645	0.53

A0A4U0U2Q3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer