Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0U1C4

Protein Details
Accession A0A4U0U1C4    Localization Confidence High Confidence Score 21.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
238-260DDDETSRRKKKKKSHKWAGGGADBasic
369-394QESNTSVKRPRGRPRRQPPRQDTLDQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
244-258RRKKKKKSHKWAGGG
272-330KKPSRPQRAIPRPTLPPEPVITKPKEQPKKPVAKHIRKSDTQAGSKAASKQLQKPVPAK
376-385KRPRGRPRRQ
431-446RRKERGTAMKTAKKAQ
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MAPRPSSPTSLLWAHQLKREHGYLLERVQQVEAAGKQHEERLKTAETTAIEAAHHDVAALSEQVKALSEDGIKKRLAKVEKDVVSKLEAMEAEGEATMLKVASLEKDKLQAEDEKRKNFIKEKALLTRMNDLEAGLAAYQRTLESAGRQVDDENMKKIMAQLDSLCHQVKKGGAEMIRLEGSVRLLEAANKELREVNDNLAAKVVQMAARRKSVPPELPSRPASADIEQTPQGDLDEDDDETSRRKKKKKSHKWAGGGADRDIIGQSPDLFKKPSRPQRAIPRPTLPPEPVITKPKEQPKKPVAKHIRKSDTQAGSKAASKQLQKPVPAKLPRKSDPQTVGEPEKPVIRAGKGWFEVAVTPSQSEPESQESNTSVKRPRGRPRRQPPRQDTLDQLHVEGQRLTRNARQQLTQGRAIPQKRKAEDDEPADVRRKERGTAMKTAKKAQSKGKEEPDVFSSPVTSPQRGTTQLNPPAKMRSKDALLGAAPVPAAAAPRRRVIEQVDYGQLLEKYMQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.43
3 0.46
4 0.45
5 0.46
6 0.47
7 0.41
8 0.37
9 0.39
10 0.39
11 0.39
12 0.43
13 0.39
14 0.38
15 0.36
16 0.33
17 0.28
18 0.27
19 0.24
20 0.19
21 0.19
22 0.2
23 0.21
24 0.27
25 0.31
26 0.29
27 0.29
28 0.31
29 0.33
30 0.33
31 0.32
32 0.3
33 0.27
34 0.27
35 0.26
36 0.21
37 0.18
38 0.17
39 0.19
40 0.15
41 0.14
42 0.1
43 0.09
44 0.09
45 0.1
46 0.1
47 0.08
48 0.08
49 0.09
50 0.09
51 0.1
52 0.1
53 0.09
54 0.11
55 0.15
56 0.22
57 0.26
58 0.3
59 0.3
60 0.32
61 0.36
62 0.41
63 0.44
64 0.41
65 0.46
66 0.51
67 0.56
68 0.57
69 0.54
70 0.48
71 0.44
72 0.4
73 0.31
74 0.25
75 0.18
76 0.15
77 0.14
78 0.13
79 0.11
80 0.1
81 0.09
82 0.06
83 0.06
84 0.05
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.05
89 0.09
90 0.13
91 0.15
92 0.16
93 0.22
94 0.23
95 0.23
96 0.26
97 0.3
98 0.33
99 0.43
100 0.48
101 0.48
102 0.51
103 0.53
104 0.56
105 0.56
106 0.56
107 0.54
108 0.54
109 0.56
110 0.59
111 0.61
112 0.58
113 0.53
114 0.53
115 0.45
116 0.39
117 0.32
118 0.24
119 0.19
120 0.16
121 0.14
122 0.07
123 0.07
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.05
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.09
132 0.14
133 0.16
134 0.17
135 0.17
136 0.17
137 0.2
138 0.26
139 0.26
140 0.23
141 0.22
142 0.21
143 0.21
144 0.23
145 0.21
146 0.16
147 0.15
148 0.14
149 0.16
150 0.17
151 0.2
152 0.2
153 0.16
154 0.15
155 0.16
156 0.17
157 0.16
158 0.17
159 0.18
160 0.18
161 0.2
162 0.21
163 0.21
164 0.19
165 0.17
166 0.15
167 0.11
168 0.11
169 0.09
170 0.08
171 0.06
172 0.06
173 0.08
174 0.09
175 0.12
176 0.13
177 0.13
178 0.14
179 0.16
180 0.16
181 0.19
182 0.19
183 0.18
184 0.21
185 0.22
186 0.21
187 0.19
188 0.18
189 0.14
190 0.13
191 0.12
192 0.09
193 0.13
194 0.18
195 0.2
196 0.23
197 0.25
198 0.25
199 0.29
200 0.32
201 0.33
202 0.33
203 0.38
204 0.39
205 0.42
206 0.43
207 0.4
208 0.35
209 0.31
210 0.29
211 0.22
212 0.21
213 0.17
214 0.18
215 0.18
216 0.17
217 0.15
218 0.13
219 0.12
220 0.09
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.15
230 0.2
231 0.26
232 0.34
233 0.42
234 0.52
235 0.64
236 0.73
237 0.8
238 0.84
239 0.87
240 0.85
241 0.83
242 0.79
243 0.72
244 0.62
245 0.51
246 0.4
247 0.3
248 0.24
249 0.17
250 0.11
251 0.07
252 0.05
253 0.06
254 0.08
255 0.09
256 0.1
257 0.11
258 0.12
259 0.2
260 0.3
261 0.39
262 0.45
263 0.49
264 0.55
265 0.65
266 0.75
267 0.72
268 0.68
269 0.63
270 0.58
271 0.58
272 0.54
273 0.44
274 0.35
275 0.31
276 0.29
277 0.29
278 0.31
279 0.3
280 0.3
281 0.35
282 0.43
283 0.5
284 0.49
285 0.54
286 0.58
287 0.66
288 0.64
289 0.69
290 0.7
291 0.72
292 0.78
293 0.78
294 0.75
295 0.67
296 0.71
297 0.68
298 0.64
299 0.56
300 0.5
301 0.42
302 0.37
303 0.38
304 0.34
305 0.29
306 0.27
307 0.28
308 0.33
309 0.39
310 0.42
311 0.44
312 0.45
313 0.47
314 0.51
315 0.57
316 0.57
317 0.55
318 0.59
319 0.58
320 0.64
321 0.61
322 0.59
323 0.56
324 0.53
325 0.51
326 0.47
327 0.48
328 0.42
329 0.4
330 0.33
331 0.3
332 0.26
333 0.24
334 0.21
335 0.17
336 0.19
337 0.2
338 0.25
339 0.23
340 0.23
341 0.21
342 0.19
343 0.19
344 0.17
345 0.17
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.12
350 0.11
351 0.11
352 0.12
353 0.15
354 0.17
355 0.16
356 0.19
357 0.19
358 0.23
359 0.24
360 0.26
361 0.27
362 0.33
363 0.41
364 0.48
365 0.57
366 0.65
367 0.73
368 0.8
369 0.85
370 0.89
371 0.91
372 0.93
373 0.91
374 0.89
375 0.85
376 0.77
377 0.72
378 0.67
379 0.64
380 0.53
381 0.46
382 0.41
383 0.36
384 0.34
385 0.29
386 0.25
387 0.22
388 0.23
389 0.26
390 0.27
391 0.34
392 0.39
393 0.4
394 0.41
395 0.43
396 0.5
397 0.51
398 0.51
399 0.46
400 0.45
401 0.5
402 0.55
403 0.56
404 0.56
405 0.6
406 0.57
407 0.6
408 0.6
409 0.58
410 0.58
411 0.56
412 0.55
413 0.49
414 0.5
415 0.51
416 0.46
417 0.42
418 0.42
419 0.38
420 0.34
421 0.38
422 0.44
423 0.43
424 0.52
425 0.6
426 0.6
427 0.62
428 0.67
429 0.67
430 0.65
431 0.66
432 0.66
433 0.66
434 0.67
435 0.72
436 0.73
437 0.75
438 0.68
439 0.65
440 0.6
441 0.53
442 0.46
443 0.37
444 0.3
445 0.22
446 0.3
447 0.31
448 0.28
449 0.26
450 0.3
451 0.34
452 0.36
453 0.41
454 0.39
455 0.44
456 0.52
457 0.57
458 0.55
459 0.52
460 0.58
461 0.61
462 0.57
463 0.53
464 0.5
465 0.47
466 0.5
467 0.49
468 0.44
469 0.36
470 0.36
471 0.3
472 0.25
473 0.2
474 0.15
475 0.14
476 0.09
477 0.12
478 0.14
479 0.21
480 0.23
481 0.29
482 0.33
483 0.34
484 0.38
485 0.41
486 0.45
487 0.44
488 0.46
489 0.44
490 0.41
491 0.4
492 0.4
493 0.34