Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4LFT4

Protein Details
Accession A0A4S4LFT4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-48DSDSDSTRPVKRRKTKNECSGSSGNHydrophilic
479-506SGKSTATKTNTRKSKNKVDERKESKLAVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 7, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
IPR000445  HhH_motif  
IPR044298  MIG/MutY  
Gene Ontology GO:0051539  F:4 iron, 4 sulfur cluster binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0000701  F:purine-specific mismatch base pair DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00633  HHH  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MSSTRTRTKSKPVTHVYDSDSDADSDSDSTRPVKRRKTKNECSGSSGNACQMEPGKAPVHPASIHVIANTKAIRSSLLDWYSGVHESRGMPWRKPFDATLDVQGRSQRAYEVWISEIMLQQTQVATVIPYYNRWMNKYPTITDLANSDIESVNAIWKGLGYYSRAARLLSGAKKIVEEYNGLFPDTAKDMMANVPGIGRYSAGAISSIAYNHCEPVLDGNVNRLLSRVLALHANPKAKSTLDILWDGAAAMVKSADEPGNINQALIELGATVCKVRDPDCQSCPLNAYCAAYLETQGHQPEEQDIEELCTLCEPAIPGEVTGVTRYPMKVERKRAREEVDVVNVVEWLSPQNRRYFLLVRRPDTGLLAGLHEFPSRTNVKDSDTPSKLHSIGQDILRDMLVNPPQTYHPASPKRQQPKASPSPKTLQITKMKPAGDVLHIFSHIRKTYRVQWILLEGGDPNSEEPPGLKADYASLLIDSGKSTATKTNTRKSKNKVDERKESKLAVRPVLKRLALRWVKYEDVEDANIGTGIMKVWKKVNELWVDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.74
3 0.68
4 0.62
5 0.55
6 0.48
7 0.4
8 0.32
9 0.27
10 0.23
11 0.19
12 0.15
13 0.14
14 0.12
15 0.13
16 0.17
17 0.24
18 0.32
19 0.41
20 0.5
21 0.59
22 0.7
23 0.79
24 0.86
25 0.9
26 0.91
27 0.92
28 0.85
29 0.83
30 0.76
31 0.69
32 0.63
33 0.54
34 0.47
35 0.38
36 0.34
37 0.29
38 0.27
39 0.26
40 0.23
41 0.25
42 0.23
43 0.22
44 0.27
45 0.26
46 0.27
47 0.24
48 0.25
49 0.26
50 0.27
51 0.27
52 0.23
53 0.24
54 0.21
55 0.25
56 0.24
57 0.19
58 0.17
59 0.17
60 0.17
61 0.18
62 0.2
63 0.23
64 0.24
65 0.24
66 0.23
67 0.24
68 0.25
69 0.24
70 0.21
71 0.14
72 0.14
73 0.15
74 0.21
75 0.28
76 0.3
77 0.31
78 0.39
79 0.45
80 0.45
81 0.47
82 0.42
83 0.4
84 0.42
85 0.4
86 0.41
87 0.39
88 0.38
89 0.37
90 0.38
91 0.32
92 0.28
93 0.26
94 0.19
95 0.14
96 0.17
97 0.18
98 0.17
99 0.17
100 0.17
101 0.17
102 0.17
103 0.19
104 0.16
105 0.14
106 0.12
107 0.11
108 0.11
109 0.1
110 0.09
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.14
118 0.19
119 0.21
120 0.25
121 0.3
122 0.32
123 0.39
124 0.41
125 0.39
126 0.37
127 0.39
128 0.35
129 0.31
130 0.27
131 0.22
132 0.19
133 0.17
134 0.15
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.1
139 0.1
140 0.09
141 0.09
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.12
149 0.14
150 0.17
151 0.18
152 0.17
153 0.17
154 0.18
155 0.23
156 0.23
157 0.24
158 0.23
159 0.23
160 0.23
161 0.25
162 0.23
163 0.18
164 0.16
165 0.15
166 0.19
167 0.19
168 0.19
169 0.18
170 0.16
171 0.16
172 0.17
173 0.15
174 0.09
175 0.08
176 0.09
177 0.1
178 0.11
179 0.09
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.06
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.1
203 0.12
204 0.11
205 0.11
206 0.13
207 0.16
208 0.16
209 0.16
210 0.13
211 0.1
212 0.09
213 0.1
214 0.08
215 0.07
216 0.08
217 0.09
218 0.14
219 0.17
220 0.21
221 0.2
222 0.2
223 0.21
224 0.19
225 0.2
226 0.18
227 0.17
228 0.16
229 0.17
230 0.16
231 0.15
232 0.14
233 0.13
234 0.1
235 0.07
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.07
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.07
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.04
261 0.05
262 0.06
263 0.14
264 0.2
265 0.26
266 0.28
267 0.33
268 0.33
269 0.33
270 0.34
271 0.27
272 0.22
273 0.18
274 0.17
275 0.12
276 0.12
277 0.13
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.1
286 0.1
287 0.11
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.08
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.06
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.06
311 0.07
312 0.07
313 0.1
314 0.16
315 0.25
316 0.32
317 0.43
318 0.51
319 0.56
320 0.62
321 0.65
322 0.63
323 0.58
324 0.55
325 0.48
326 0.43
327 0.38
328 0.32
329 0.26
330 0.22
331 0.17
332 0.13
333 0.09
334 0.07
335 0.09
336 0.13
337 0.15
338 0.19
339 0.21
340 0.23
341 0.27
342 0.31
343 0.36
344 0.42
345 0.47
346 0.46
347 0.47
348 0.47
349 0.43
350 0.37
351 0.31
352 0.22
353 0.16
354 0.14
355 0.12
356 0.11
357 0.12
358 0.11
359 0.1
360 0.09
361 0.14
362 0.14
363 0.16
364 0.19
365 0.19
366 0.23
367 0.29
368 0.34
369 0.38
370 0.38
371 0.38
372 0.36
373 0.38
374 0.35
375 0.31
376 0.28
377 0.23
378 0.25
379 0.27
380 0.26
381 0.23
382 0.23
383 0.21
384 0.19
385 0.15
386 0.16
387 0.17
388 0.17
389 0.17
390 0.18
391 0.19
392 0.23
393 0.27
394 0.25
395 0.31
396 0.38
397 0.43
398 0.5
399 0.58
400 0.64
401 0.67
402 0.7
403 0.69
404 0.71
405 0.76
406 0.78
407 0.73
408 0.69
409 0.68
410 0.69
411 0.65
412 0.59
413 0.56
414 0.56
415 0.55
416 0.56
417 0.55
418 0.48
419 0.44
420 0.42
421 0.36
422 0.32
423 0.29
424 0.26
425 0.22
426 0.23
427 0.23
428 0.22
429 0.26
430 0.26
431 0.25
432 0.26
433 0.29
434 0.37
435 0.47
436 0.49
437 0.43
438 0.42
439 0.43
440 0.42
441 0.36
442 0.28
443 0.18
444 0.16
445 0.15
446 0.13
447 0.11
448 0.1
449 0.1
450 0.09
451 0.09
452 0.1
453 0.12
454 0.13
455 0.12
456 0.11
457 0.13
458 0.15
459 0.15
460 0.13
461 0.1
462 0.1
463 0.11
464 0.11
465 0.09
466 0.08
467 0.09
468 0.09
469 0.1
470 0.16
471 0.21
472 0.31
473 0.38
474 0.47
475 0.56
476 0.65
477 0.72
478 0.75
479 0.81
480 0.82
481 0.85
482 0.86
483 0.86
484 0.88
485 0.88
486 0.87
487 0.81
488 0.74
489 0.7
490 0.68
491 0.65
492 0.62
493 0.62
494 0.59
495 0.6
496 0.64
497 0.6
498 0.54
499 0.5
500 0.52
501 0.51
502 0.49
503 0.49
504 0.46
505 0.46
506 0.45
507 0.45
508 0.38
509 0.34
510 0.32
511 0.26
512 0.22
513 0.19
514 0.18
515 0.15
516 0.11
517 0.08
518 0.08
519 0.14
520 0.15
521 0.17
522 0.23
523 0.28
524 0.32
525 0.37
526 0.45