Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4LIH5

Protein Details
Accession A0A4S4LIH5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-48INPAQTAKSSSKRTRKRFSQEQLMVLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
234-243RRGKSRPRGR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 9.5, mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001356  Homeobox_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00046  Homeodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50071  HOMEOBOX_2  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MSRPSISRSSSLSSSSSATNVDINPAQTAKSSSKRTRKRFSQEQLMVLEQAYHKTSHPTRQEREAVAAQTGMDVKSVTIWLQNKRQTERKVALGNATNRNIFKSLALYHVQYPPSTLLATHDFDRRTPFPPIYPHTPSTVMPTKVHLPSQTSSSLFSLDRIASRAESPTGTPRTPTHLKRHADGTARPKSSGALWEAMPSSPLLPEADTAVDASTGSPSGSPSARGYLDFTSSRRGKSRPRGRRTLEWACAAARMSTDKGVLAPLNDFRQRHPATTFDTDSMVSDDRTEDVDTEVESVGDSHEAITPDNSQTMLTFSLSPVRISGDMAIPKSDAAKSRTVSLKDKCIEEDTDIMDAALALCGLLSGRRE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.24
4 0.19
5 0.18
6 0.19
7 0.17
8 0.2
9 0.2
10 0.2
11 0.21
12 0.2
13 0.2
14 0.18
15 0.22
16 0.24
17 0.31
18 0.39
19 0.47
20 0.57
21 0.67
22 0.76
23 0.82
24 0.86
25 0.88
26 0.89
27 0.88
28 0.88
29 0.84
30 0.78
31 0.71
32 0.62
33 0.53
34 0.42
35 0.36
36 0.25
37 0.22
38 0.19
39 0.16
40 0.15
41 0.23
42 0.28
43 0.34
44 0.43
45 0.5
46 0.53
47 0.6
48 0.66
49 0.59
50 0.61
51 0.56
52 0.47
53 0.38
54 0.34
55 0.25
56 0.2
57 0.2
58 0.14
59 0.1
60 0.08
61 0.07
62 0.08
63 0.09
64 0.08
65 0.12
66 0.17
67 0.23
68 0.31
69 0.37
70 0.42
71 0.48
72 0.56
73 0.55
74 0.59
75 0.57
76 0.56
77 0.55
78 0.51
79 0.5
80 0.48
81 0.5
82 0.48
83 0.47
84 0.43
85 0.38
86 0.39
87 0.34
88 0.28
89 0.22
90 0.18
91 0.17
92 0.18
93 0.2
94 0.19
95 0.21
96 0.25
97 0.25
98 0.21
99 0.22
100 0.19
101 0.18
102 0.16
103 0.13
104 0.12
105 0.15
106 0.17
107 0.17
108 0.21
109 0.2
110 0.21
111 0.27
112 0.26
113 0.26
114 0.28
115 0.28
116 0.27
117 0.32
118 0.37
119 0.38
120 0.41
121 0.38
122 0.37
123 0.38
124 0.34
125 0.35
126 0.37
127 0.32
128 0.27
129 0.29
130 0.31
131 0.3
132 0.32
133 0.26
134 0.23
135 0.21
136 0.24
137 0.24
138 0.19
139 0.19
140 0.18
141 0.19
142 0.15
143 0.15
144 0.13
145 0.12
146 0.12
147 0.11
148 0.11
149 0.1
150 0.11
151 0.11
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.16
156 0.19
157 0.18
158 0.19
159 0.19
160 0.26
161 0.32
162 0.36
163 0.38
164 0.43
165 0.45
166 0.45
167 0.48
168 0.45
169 0.42
170 0.42
171 0.42
172 0.41
173 0.4
174 0.39
175 0.35
176 0.31
177 0.28
178 0.26
179 0.19
180 0.13
181 0.12
182 0.13
183 0.13
184 0.13
185 0.12
186 0.09
187 0.08
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.05
206 0.07
207 0.07
208 0.09
209 0.09
210 0.12
211 0.12
212 0.13
213 0.15
214 0.14
215 0.17
216 0.17
217 0.17
218 0.23
219 0.24
220 0.26
221 0.28
222 0.31
223 0.37
224 0.47
225 0.57
226 0.59
227 0.66
228 0.73
229 0.75
230 0.8
231 0.79
232 0.77
233 0.7
234 0.62
235 0.55
236 0.46
237 0.41
238 0.33
239 0.24
240 0.16
241 0.14
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.12
248 0.12
249 0.1
250 0.11
251 0.13
252 0.18
253 0.22
254 0.22
255 0.23
256 0.32
257 0.33
258 0.34
259 0.33
260 0.31
261 0.33
262 0.39
263 0.39
264 0.29
265 0.29
266 0.26
267 0.25
268 0.24
269 0.19
270 0.13
271 0.12
272 0.11
273 0.11
274 0.13
275 0.12
276 0.1
277 0.1
278 0.11
279 0.1
280 0.11
281 0.1
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.12
293 0.13
294 0.14
295 0.15
296 0.14
297 0.12
298 0.11
299 0.13
300 0.12
301 0.12
302 0.11
303 0.11
304 0.18
305 0.19
306 0.19
307 0.17
308 0.19
309 0.18
310 0.18
311 0.19
312 0.18
313 0.21
314 0.22
315 0.22
316 0.2
317 0.2
318 0.21
319 0.22
320 0.22
321 0.22
322 0.28
323 0.28
324 0.35
325 0.42
326 0.44
327 0.5
328 0.5
329 0.56
330 0.53
331 0.55
332 0.51
333 0.47
334 0.45
335 0.4
336 0.37
337 0.3
338 0.27
339 0.25
340 0.21
341 0.17
342 0.14
343 0.11
344 0.08
345 0.05
346 0.04
347 0.03
348 0.04
349 0.04