Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4LCB6

Protein Details
Accession A0A4S4LCB6    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-33LLCPPSSPRPHHQQQQQQRPRQPAHVFHydrophilic
457-479MVMPVWYRPGKRPHPRPSPIADDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
266-272KRKKIKK
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 7, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000014  PAS  
IPR035965  PAS-like_dom_sf  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
PS50112  PAS  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences YTWPSTLLCPPSSPRPHHQQQQQQRPRQPAHVFEFTKRKRWADILIAELPDTVLLILDPSGLIQYSGAGLRDVLGWDSDELLERDVLNIINDDDKRAFHDRFQVSITFHQNLSSFTRLKCKPSAPDGAQKELLFEIRGNALYIQDDSECKCFFFMAKPYPSRNMAILNTFLELQIENERLRQRLSDLQAQQHVSSPGALSSYPISGGSAQQTQSNPYTYTAPLEDSMSSSATHGVFDSRAGAGSNFVLTNVPTVNARDEDDDDGGKRKKIKKSHLANQYVCVICGRTDSPEWRKGPKGPKTLCNACGLRWAKRAKKGDDAPGSMSGSGSGSGSGSGAGAGKGKWGGAGRGVGWDVWRRRKRTWAYCARCVVGDAGFIRLVGSSSLSNASAKVNANASGSANAVIGAPSHAHYMQRAQAAAGTETAHSIPSPTHPSFSHSHDRTAPQSQFQAPMSMPMVMXPVWYRPGKRPHPRPSPIADDGASEYAPSEDAACRIRVYSRAVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.59
3 0.67
4 0.73
5 0.78
6 0.79
7 0.81
8 0.86
9 0.88
10 0.88
11 0.87
12 0.87
13 0.82
14 0.81
15 0.76
16 0.73
17 0.7
18 0.7
19 0.66
20 0.63
21 0.69
22 0.64
23 0.67
24 0.65
25 0.6
26 0.56
27 0.57
28 0.56
29 0.54
30 0.54
31 0.5
32 0.48
33 0.46
34 0.4
35 0.35
36 0.29
37 0.19
38 0.15
39 0.08
40 0.04
41 0.04
42 0.04
43 0.04
44 0.04
45 0.04
46 0.04
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.05
51 0.05
52 0.06
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.1
60 0.09
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.1
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.12
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.14
78 0.15
79 0.17
80 0.17
81 0.17
82 0.22
83 0.27
84 0.27
85 0.25
86 0.34
87 0.33
88 0.34
89 0.36
90 0.34
91 0.31
92 0.36
93 0.38
94 0.31
95 0.29
96 0.29
97 0.27
98 0.26
99 0.29
100 0.28
101 0.25
102 0.24
103 0.34
104 0.34
105 0.39
106 0.42
107 0.42
108 0.43
109 0.46
110 0.54
111 0.49
112 0.56
113 0.55
114 0.54
115 0.52
116 0.46
117 0.41
118 0.33
119 0.29
120 0.21
121 0.17
122 0.13
123 0.12
124 0.12
125 0.11
126 0.11
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.1
133 0.11
134 0.14
135 0.14
136 0.13
137 0.13
138 0.12
139 0.12
140 0.16
141 0.21
142 0.26
143 0.32
144 0.36
145 0.4
146 0.44
147 0.45
148 0.42
149 0.37
150 0.33
151 0.28
152 0.25
153 0.24
154 0.2
155 0.18
156 0.17
157 0.15
158 0.11
159 0.1
160 0.09
161 0.1
162 0.12
163 0.11
164 0.15
165 0.18
166 0.18
167 0.19
168 0.18
169 0.18
170 0.23
171 0.27
172 0.31
173 0.32
174 0.35
175 0.38
176 0.39
177 0.36
178 0.32
179 0.28
180 0.2
181 0.17
182 0.14
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.09
195 0.11
196 0.11
197 0.13
198 0.14
199 0.16
200 0.17
201 0.18
202 0.17
203 0.16
204 0.17
205 0.15
206 0.16
207 0.14
208 0.13
209 0.12
210 0.12
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.1
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.05
238 0.06
239 0.05
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.1
246 0.11
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.16
251 0.16
252 0.17
253 0.22
254 0.28
255 0.34
256 0.42
257 0.51
258 0.56
259 0.64
260 0.71
261 0.75
262 0.76
263 0.7
264 0.64
265 0.6
266 0.5
267 0.4
268 0.31
269 0.22
270 0.14
271 0.14
272 0.13
273 0.09
274 0.11
275 0.18
276 0.23
277 0.3
278 0.33
279 0.35
280 0.38
281 0.43
282 0.5
283 0.53
284 0.57
285 0.54
286 0.58
287 0.62
288 0.64
289 0.59
290 0.56
291 0.48
292 0.39
293 0.44
294 0.4
295 0.36
296 0.38
297 0.43
298 0.42
299 0.5
300 0.57
301 0.51
302 0.58
303 0.59
304 0.61
305 0.59
306 0.55
307 0.49
308 0.44
309 0.41
310 0.32
311 0.27
312 0.18
313 0.12
314 0.1
315 0.08
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.05
325 0.06
326 0.05
327 0.06
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.09
332 0.09
333 0.1
334 0.12
335 0.11
336 0.12
337 0.13
338 0.11
339 0.12
340 0.19
341 0.23
342 0.33
343 0.39
344 0.43
345 0.45
346 0.55
347 0.63
348 0.66
349 0.71
350 0.71
351 0.72
352 0.75
353 0.76
354 0.67
355 0.57
356 0.48
357 0.39
358 0.28
359 0.23
360 0.16
361 0.14
362 0.12
363 0.12
364 0.11
365 0.1
366 0.1
367 0.07
368 0.08
369 0.06
370 0.07
371 0.09
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.11
376 0.14
377 0.15
378 0.15
379 0.16
380 0.17
381 0.18
382 0.18
383 0.18
384 0.15
385 0.14
386 0.13
387 0.11
388 0.1
389 0.09
390 0.08
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.1
396 0.11
397 0.11
398 0.13
399 0.17
400 0.2
401 0.22
402 0.22
403 0.19
404 0.21
405 0.22
406 0.21
407 0.18
408 0.14
409 0.12
410 0.13
411 0.13
412 0.11
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.13
417 0.21
418 0.2
419 0.24
420 0.24
421 0.28
422 0.31
423 0.37
424 0.43
425 0.38
426 0.42
427 0.44
428 0.48
429 0.48
430 0.54
431 0.49
432 0.43
433 0.46
434 0.43
435 0.43
436 0.39
437 0.37
438 0.29
439 0.3
440 0.27
441 0.24
442 0.21
443 0.18
444 0.18
445 0.15
446 0.16
447 0.13
448 0.19
449 0.23
450 0.27
451 0.33
452 0.42
453 0.52
454 0.62
455 0.72
456 0.74
457 0.8
458 0.84
459 0.83
460 0.8
461 0.78
462 0.72
463 0.65
464 0.55
465 0.46
466 0.43
467 0.38
468 0.3
469 0.21
470 0.17
471 0.13
472 0.13
473 0.11
474 0.1
475 0.09
476 0.13
477 0.16
478 0.17
479 0.17
480 0.18
481 0.21
482 0.23