FuNGI

A0A4V3XBT1

Protein Details

Accession

A0A4V3XBT1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1022-1042	HSGNGKRRKYLIKWKGYPSSA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 8, cyto_nucl 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR023780 Chromo_domain IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF00385 Chromo PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH PF00665 rve PF08284 RVP_2 PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE PS50878 RT_POL
CDD	cd00303 retropepsin_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MRIPVQVKVYGQTVLSNALIDSGAEGKFIDSKFVAKHRIPVRKLVKPIPVHNVDGTPNQNGTITHYTLRPLLFGNKLTMAFLLVTSLGKEDIILGLPWLKQRNPLINWKEGTISIRRTTTATSLAQRTTKTIKPLKDSIPAHYHNFIHLFKKKAAERFPIERPYDHAIDLKPDFIPRDCKLYSMTPQEEVALDEFLTENLRKGYIRPSKSPMASPFFFVDKKDGTLRPCQDYRALNEGTIKNAYPLPLIGDLMDKLRNAKYFTKLDLRSGYNNIRIKEGDQHKAAFKTIRGLFEPTVMFFGLCNSPATFQMFMNDIFRVIITEEAILIYMDDILIFSDNLEDLRRKTNRVLNVLQENNLFLKPEKCVFEVQEVEFLGMIIRPNNIHMDPVKLAGIQQWPEPHTVKQLRSFLGFCNFYRRFIPNYSSIAYPLNELTRTNEPWKWNELRTNAFTTLKDLFSSQPALLIPDKNKPFILETDASKVASGAVLYQANSNGDLQPCGFISEAFGPAQQRYEVYDRELLGIIRGLTAWRHYLLGAPHTMIIWCDHKNLSYFRAARRLTPHQSRWNLFLSQFDISITHKPGKDIPGADSLSRRSDYGTEPDEERTLLPDALFIGRIDVDLHNRIKDAQTTDQLANTILRAKTLNIPSPFKFSLDDWTIDSNLLLFRKHIYIPDNKDLKQQILHLFHDLPSFGHPGIFKTTSLIHQHYWWPGLTIFVKNFINGCAACQQMKINTHPTTPPLTPIPADPSALPFQSVSIDFITDLPLSNSFDSLMVIVDHDSSKGIVLCPCNKTIDALGTALLYHQNVYRRFGLPKRIISDRGPQFASHVFQTLCSRLGIKSKLSTAYHPQTDGQTERANQEIEAYLRIYCGTAPNTWAESIPDLEFSHNLQTHSVTKTSPFNIILGYNPIPIPPAIEPTNLPSLSERLRDKVWLEATHLHFPNRSRKLSPKREGPFTIEQVLSPLNYRLTLPKAWRIHPVFHASLLTPFAETDSHGPSFTQPPPDLIDGHEEFEIEAIVSHSGNGKRRKYLIKWKGYPSSANEWLKETDFENAPEILNDYKTLHFL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.18
3	0.16
4	0.13
5	0.13
6	0.12
7	0.1
8	0.1
9	0.1
10	0.1
11	0.1
12	0.1
13	0.1
14	0.15
15	0.15
16	0.18
17	0.15
18	0.19
19	0.24
20	0.31
21	0.38
22	0.35
23	0.44
24	0.49
25	0.59
26	0.58
27	0.63
28	0.66
29	0.66
30	0.72
31	0.71
32	0.71
33	0.67
34	0.71
35	0.7
36	0.66
37	0.61
38	0.56
39	0.51
40	0.45
41	0.44
42	0.41
43	0.35
44	0.3
45	0.28
46	0.26
47	0.24
48	0.28
49	0.27
50	0.27
51	0.26
52	0.26
53	0.28
54	0.3
55	0.3
56	0.24
57	0.21
58	0.24
59	0.26
60	0.27
61	0.28
62	0.28
63	0.28
64	0.27
65	0.25
66	0.2
67	0.16
68	0.14
69	0.12
70	0.09
71	0.09
72	0.09
73	0.09
74	0.08
75	0.08
76	0.08
77	0.07
78	0.08
79	0.09
80	0.08
81	0.08
82	0.11
83	0.13
84	0.18
85	0.22
86	0.22
87	0.28
88	0.35
89	0.43
90	0.45
91	0.54
92	0.55
93	0.58
94	0.58
95	0.53
96	0.48
97	0.41
98	0.4
99	0.36
100	0.36
101	0.32
102	0.32
103	0.32
104	0.32
105	0.32
106	0.31
107	0.3
108	0.29
109	0.31
110	0.33
111	0.36
112	0.38
113	0.36
114	0.38
115	0.38
116	0.38
117	0.42
118	0.45
119	0.47
120	0.51
121	0.57
122	0.57
123	0.61
124	0.59
125	0.56
126	0.58
127	0.55
128	0.53
129	0.51
130	0.46
131	0.4
132	0.43
133	0.39
134	0.39
135	0.41
136	0.41
137	0.39
138	0.47
139	0.49
140	0.51
141	0.56
142	0.56
143	0.57
144	0.59
145	0.64
146	0.64
147	0.61
148	0.54
149	0.52
150	0.5
151	0.45
152	0.4
153	0.36
154	0.28
155	0.31
156	0.31
157	0.28
158	0.23
159	0.23
160	0.24
161	0.23
162	0.29
163	0.25
164	0.31
165	0.29
166	0.3
167	0.32
168	0.34
169	0.38
170	0.4
171	0.41
172	0.35
173	0.35
174	0.35
175	0.31
176	0.27
177	0.22
178	0.13
179	0.11
180	0.09
181	0.09
182	0.08
183	0.11
184	0.1
185	0.1
186	0.1
187	0.12
188	0.12
189	0.14
190	0.24
191	0.3
192	0.35
193	0.39
194	0.45
195	0.51
196	0.53
197	0.57
198	0.54
199	0.52
200	0.47
201	0.44
202	0.4
203	0.37
204	0.35
205	0.31
206	0.29
207	0.23
208	0.25
209	0.28
210	0.29
211	0.29
212	0.37
213	0.4
214	0.42
215	0.43
216	0.42
217	0.42
218	0.43
219	0.44
220	0.42
221	0.38
222	0.32
223	0.38
224	0.36
225	0.33
226	0.31
227	0.26
228	0.21
229	0.21
230	0.21
231	0.14
232	0.14
233	0.13
234	0.12
235	0.12
236	0.11
237	0.11
238	0.11
239	0.13
240	0.14
241	0.12
242	0.13
243	0.16
244	0.19
245	0.22
246	0.26
247	0.31
248	0.32
249	0.37
250	0.43
251	0.41
252	0.43
253	0.44
254	0.43
255	0.4
256	0.43
257	0.43
258	0.42
259	0.45
260	0.41
261	0.38
262	0.35
263	0.33
264	0.37
265	0.39
266	0.37
267	0.35
268	0.37
269	0.38
270	0.38
271	0.39
272	0.32
273	0.27
274	0.29
275	0.29
276	0.3
277	0.28
278	0.31
279	0.29
280	0.29
281	0.29
282	0.21
283	0.2
284	0.17
285	0.15
286	0.1
287	0.13
288	0.1
289	0.1
290	0.11
291	0.1
292	0.11
293	0.13
294	0.15
295	0.14
296	0.13
297	0.14
298	0.14
299	0.14
300	0.15
301	0.14
302	0.11
303	0.1
304	0.1
305	0.09
306	0.08
307	0.07
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.05
314	0.05
315	0.04
316	0.03
317	0.03
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.05
327	0.07
328	0.08
329	0.1
330	0.18
331	0.2
332	0.23
333	0.29
334	0.34
335	0.39
336	0.44
337	0.45
338	0.42
339	0.48
340	0.47
341	0.43
342	0.37
343	0.32
344	0.27
345	0.24
346	0.19
347	0.12
348	0.13
349	0.13
350	0.17
351	0.18
352	0.18
353	0.2
354	0.21
355	0.25
356	0.27
357	0.25
358	0.24
359	0.22
360	0.2
361	0.18
362	0.16
363	0.11
364	0.08
365	0.08
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.08
370	0.11
371	0.11
372	0.12
373	0.12
374	0.15
375	0.15
376	0.16
377	0.15
378	0.12
379	0.12
380	0.13
381	0.16
382	0.14
383	0.15
384	0.17
385	0.17
386	0.21
387	0.23
388	0.2
389	0.26
390	0.3
391	0.31
392	0.35
393	0.38
394	0.35
395	0.36
396	0.36
397	0.29
398	0.3
399	0.3
400	0.23
401	0.3
402	0.29
403	0.28
404	0.3
405	0.31
406	0.28
407	0.29
408	0.32
409	0.26
410	0.29
411	0.29
412	0.26
413	0.25
414	0.23
415	0.2
416	0.18
417	0.14
418	0.13
419	0.11
420	0.11
421	0.14
422	0.16
423	0.19
424	0.22
425	0.25
426	0.26
427	0.28
428	0.34
429	0.34
430	0.33
431	0.36
432	0.35
433	0.36
434	0.37
435	0.38
436	0.34
437	0.32
438	0.29
439	0.27
440	0.25
441	0.21
442	0.18
443	0.16
444	0.14
445	0.14
446	0.16
447	0.12
448	0.11
449	0.11
450	0.13
451	0.13
452	0.15
453	0.16
454	0.21
455	0.23
456	0.22
457	0.23
458	0.21
459	0.21
460	0.2
461	0.23
462	0.18
463	0.18
464	0.21
465	0.21
466	0.2
467	0.18
468	0.17
469	0.12
470	0.09
471	0.08
472	0.04
473	0.06
474	0.06
475	0.06
476	0.07
477	0.08
478	0.08
479	0.08
480	0.09
481	0.08
482	0.08
483	0.08
484	0.08
485	0.08
486	0.08
487	0.08
488	0.07
489	0.06
490	0.07
491	0.08
492	0.09
493	0.08
494	0.09
495	0.09
496	0.09
497	0.1
498	0.09
499	0.08
500	0.1
501	0.13
502	0.13
503	0.14
504	0.16
505	0.16
506	0.17
507	0.17
508	0.14
509	0.11
510	0.11
511	0.09
512	0.06
513	0.06
514	0.05
515	0.05
516	0.06
517	0.07
518	0.06
519	0.07
520	0.07
521	0.09
522	0.1
523	0.11
524	0.11
525	0.1
526	0.1
527	0.09
528	0.09
529	0.07
530	0.08
531	0.09
532	0.1
533	0.11
534	0.11
535	0.12
536	0.14
537	0.16
538	0.16
539	0.2
540	0.22
541	0.22
542	0.31
543	0.3
544	0.31
545	0.35
546	0.4
547	0.41
548	0.46
549	0.5
550	0.5
551	0.56
552	0.54
553	0.51
554	0.47
555	0.41
556	0.34
557	0.29
558	0.23
559	0.18
560	0.17
561	0.13
562	0.11
563	0.11
564	0.14
565	0.15
566	0.16
567	0.16
568	0.17
569	0.2
570	0.22
571	0.23
572	0.21
573	0.21
574	0.23
575	0.23
576	0.23
577	0.22
578	0.21
579	0.2
580	0.2
581	0.18
582	0.13
583	0.14
584	0.15
585	0.18
586	0.19
587	0.18
588	0.19
589	0.2
590	0.19
591	0.17
592	0.15
593	0.13
594	0.12
595	0.1
596	0.09
597	0.08
598	0.09
599	0.09
600	0.09
601	0.07
602	0.06
603	0.06
604	0.06
605	0.07
606	0.07
607	0.1
608	0.14
609	0.15
610	0.15
611	0.15
612	0.16
613	0.15
614	0.18
615	0.19
616	0.18
617	0.19
618	0.23
619	0.23
620	0.22
621	0.22
622	0.19
623	0.16
624	0.13
625	0.15
626	0.11
627	0.12
628	0.12
629	0.13
630	0.18
631	0.22
632	0.28
633	0.27
634	0.31
635	0.31
636	0.37
637	0.36
638	0.3
639	0.28
640	0.22
641	0.25
642	0.24
643	0.24
644	0.19
645	0.2
646	0.19
647	0.18
648	0.17
649	0.11
650	0.11
651	0.1
652	0.09
653	0.08
654	0.09
655	0.11
656	0.12
657	0.14
658	0.17
659	0.24
660	0.3
661	0.39
662	0.42
663	0.4
664	0.46
665	0.44
666	0.42
667	0.36
668	0.33
669	0.32
670	0.31
671	0.32
672	0.29
673	0.28
674	0.27
675	0.26
676	0.22
677	0.15
678	0.13
679	0.14
680	0.11
681	0.12
682	0.11
683	0.12
684	0.17
685	0.17
686	0.15
687	0.15
688	0.16
689	0.19
690	0.24
691	0.25
692	0.21
693	0.22
694	0.26
695	0.26
696	0.26
697	0.22
698	0.18
699	0.16
700	0.18
701	0.18
702	0.17
703	0.16
704	0.18
705	0.18
706	0.17
707	0.18
708	0.15
709	0.16
710	0.13
711	0.15
712	0.14
713	0.15
714	0.15
715	0.16
716	0.16
717	0.18
718	0.21
719	0.23
720	0.27
721	0.27
722	0.29
723	0.29
724	0.3
725	0.31
726	0.28
727	0.28
728	0.22
729	0.22
730	0.21
731	0.21
732	0.24
733	0.2
734	0.21
735	0.18
736	0.19
737	0.2
738	0.19
739	0.19
740	0.13
741	0.12
742	0.13
743	0.14
744	0.12
745	0.1
746	0.1
747	0.09
748	0.1
749	0.11
750	0.09
751	0.09
752	0.08
753	0.1
754	0.11
755	0.11
756	0.11
757	0.1
758	0.1
759	0.1
760	0.09
761	0.08
762	0.06
763	0.06
764	0.06
765	0.07
766	0.07
767	0.07
768	0.07
769	0.06
770	0.07
771	0.08
772	0.09
773	0.11
774	0.16
775	0.21
776	0.24
777	0.25
778	0.26
779	0.26
780	0.26
781	0.24
782	0.23
783	0.18
784	0.16
785	0.14
786	0.12
787	0.12
788	0.11
789	0.11
790	0.08
791	0.07
792	0.1
793	0.16
794	0.18
795	0.22
796	0.25
797	0.27
798	0.32
799	0.36
800	0.43
801	0.44
802	0.48
803	0.49
804	0.49
805	0.51
806	0.49
807	0.54
808	0.5
809	0.48
810	0.43
811	0.38
812	0.37
813	0.36
814	0.34
815	0.25
816	0.23
817	0.18
818	0.19
819	0.23
820	0.22
821	0.2
822	0.18
823	0.18
824	0.17
825	0.23
826	0.24
827	0.24
828	0.26
829	0.28
830	0.34
831	0.34
832	0.37
833	0.39
834	0.43
835	0.42
836	0.41
837	0.39
838	0.35
839	0.38
840	0.36
841	0.3
842	0.27
843	0.27
844	0.27
845	0.28
846	0.26
847	0.21
848	0.22
849	0.2
850	0.17
851	0.17
852	0.16
853	0.13
854	0.12
855	0.13
856	0.11
857	0.09
858	0.13
859	0.13
860	0.14
861	0.15
862	0.18
863	0.19
864	0.19
865	0.19
866	0.16
867	0.16
868	0.17
869	0.16
870	0.15
871	0.14
872	0.15
873	0.16
874	0.16
875	0.21
876	0.22
877	0.22
878	0.21
879	0.23
880	0.25
881	0.27
882	0.27
883	0.21
884	0.22
885	0.27
886	0.28
887	0.29
888	0.26
889	0.24
890	0.24
891	0.24
892	0.22
893	0.22
894	0.21
895	0.19
896	0.18
897	0.17
898	0.17
899	0.16
900	0.17
901	0.13
902	0.17
903	0.17
904	0.18
905	0.19
906	0.22
907	0.3
908	0.27
909	0.26
910	0.23
911	0.25
912	0.28
913	0.33
914	0.32
915	0.28
916	0.3
917	0.32
918	0.32
919	0.35
920	0.37
921	0.32
922	0.34
923	0.38
924	0.42
925	0.47
926	0.48
927	0.42
928	0.4
929	0.44
930	0.5
931	0.5
932	0.49
933	0.46
934	0.55
935	0.64
936	0.72
937	0.76
938	0.75
939	0.75
940	0.78
941	0.76
942	0.73
943	0.7
944	0.63
945	0.59
946	0.49
947	0.42
948	0.36
949	0.34
950	0.27
951	0.2
952	0.18
953	0.14
954	0.15
955	0.16
956	0.19
957	0.22
958	0.27
959	0.31
960	0.38
961	0.42
962	0.44
963	0.53
964	0.52
965	0.53
966	0.53
967	0.56
968	0.48
969	0.44
970	0.43
971	0.34
972	0.32
973	0.29
974	0.23
975	0.16
976	0.14
977	0.13
978	0.12
979	0.13
980	0.14
981	0.17
982	0.17
983	0.17
984	0.18
985	0.2
986	0.26
987	0.29
988	0.33
989	0.29
990	0.3
991	0.34
992	0.36
993	0.33
994	0.28
995	0.32
996	0.26
997	0.27
998	0.25
999	0.21
1000	0.18
1001	0.18
1002	0.16
1003	0.08
1004	0.07
1005	0.06
1006	0.07
1007	0.07
1008	0.08
1009	0.14
1010	0.19
1011	0.27
1012	0.36
1013	0.4
1014	0.46
1015	0.54
1016	0.62
1017	0.66
1018	0.72
1019	0.75
1020	0.77
1021	0.8
1022	0.82
1023	0.83
1024	0.78
1025	0.74
1026	0.69
1027	0.67
1028	0.66
1029	0.62
1030	0.55
1031	0.49
1032	0.48
1033	0.45
1034	0.4
1035	0.32
1036	0.29
1037	0.27
1038	0.27
1039	0.26
1040	0.24
1041	0.23
1042	0.21
1043	0.23
1044	0.19
1045	0.17
1046	0.17
1047	0.17

A0A4V3XBT1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer