FuNGI

A0A4S4L2M5

Protein Details

Accession

A0A4S4L2M5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
394-418	RVPTPEPTTRPKRNRKLTRHAKGLE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
405-409	KRNRK

Subcellular Location(s)

nucl 9, cyto 7, pero 7, cyto_pero 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MHSTLISISKLDADGYKVLIGNNRLTILSPSGKFLGSIERFNDIYATRWHGHCASLADTAFSAEKLSLSDIHRRLGHVNYGYLRKMIRDGKLVGMALDETRSEEEECVPCVLAKIWHTPIPHQRQSELATAFGDRFHMDIWGPAKVRASGHGLYALTIVDDATRWLQMSVMQRKSDSFARYVAWQTFLKTNFGITIKQLQSDNDGAFLSSEFKSYLESMGTEQRLTVHDTPQQNGVAERTHGTIFNAIRANMNNSALPTWLWGECLGYVTFIYNRTPNAALNYRSPYEARFGQIPDLSDIYQFGQPCVVRLETAPKLGDCGTMCRWLGPDEKSNGHRIYHPTQHKISIERNIVILKPQTPDVQEEKECVDIGPDSENVENLQQQTNLPSVPDERVPTPEPTTRPKRNRKLTRHAKGLELMDEDPDDQPAEEEANEVNHVEAMLASGGDPLDDPMTISQLGKRADGDYWWSAMHEEVRILEKRGTWEYAYPPPNSNIIESKFVFRTKRNADGSIEKYKARLVARGFTQVDGVDYYSDDTFAPVTRLSSVRSILSYAAANNWEIHQINIKSAYLYGELEDDETIFMRPPQHYELDGIQPGQVLRLQKALYGLKQAGRRWYQVLVNMLTNAGMTRSNYDNAVFYRHHPNGDISILFSHVDDLTLISNETSRIRMLKDKIGAQVEYTDGGEINWLLGVEIKRDRTKCTIMMRQFSYPETILTRYGFKDACPTNTPMDPHLRLSIEQCPTTNDEIAEMSKRPYAAAVGALRYAADVTQPDIAYAVGQLARYLRNPGFTHWTACKHVYQYLRLTKENWLVLGGNGYGLIGYSDADGMSTEGRHAISGYVFKLFGSAISWSSKRQTLVVLSTTEAKYVALTHAAREAIWLRALLSQVFKLESLPVEIHCDNQSAIALSAENRFHARTKHIDIQYHFIRQCVADGKILVPYVPTDDQEADIFTKALPPIKVKHFTDRLGLRV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.17
3	0.18
4	0.17
5	0.18
6	0.23
7	0.25
8	0.25
9	0.25
10	0.25
11	0.24
12	0.24
13	0.25
14	0.25
15	0.28
16	0.25
17	0.27
18	0.27
19	0.27
20	0.26
21	0.24
22	0.29
23	0.26
24	0.29
25	0.28
26	0.3
27	0.3
28	0.3
29	0.32
30	0.22
31	0.23
32	0.23
33	0.28
34	0.27
35	0.28
36	0.32
37	0.3
38	0.31
39	0.31
40	0.29
41	0.25
42	0.26
43	0.26
44	0.22
45	0.21
46	0.22
47	0.19
48	0.16
49	0.14
50	0.09
51	0.09
52	0.1
53	0.12
54	0.15
55	0.18
56	0.27
57	0.29
58	0.34
59	0.35
60	0.36
61	0.38
62	0.37
63	0.41
64	0.34
65	0.37
66	0.38
67	0.41
68	0.4
69	0.39
70	0.35
71	0.29
72	0.34
73	0.35
74	0.34
75	0.36
76	0.37
77	0.38
78	0.41
79	0.4
80	0.32
81	0.27
82	0.23
83	0.17
84	0.16
85	0.12
86	0.1
87	0.11
88	0.13
89	0.13
90	0.14
91	0.18
92	0.19
93	0.2
94	0.2
95	0.19
96	0.17
97	0.17
98	0.17
99	0.17
100	0.18
101	0.23
102	0.25
103	0.29
104	0.3
105	0.37
106	0.46
107	0.52
108	0.56
109	0.52
110	0.49
111	0.5
112	0.52
113	0.52
114	0.42
115	0.33
116	0.27
117	0.26
118	0.25
119	0.21
120	0.18
121	0.11
122	0.11
123	0.1
124	0.1
125	0.09
126	0.13
127	0.15
128	0.19
129	0.2
130	0.21
131	0.23
132	0.24
133	0.24
134	0.23
135	0.27
136	0.22
137	0.23
138	0.25
139	0.23
140	0.2
141	0.2
142	0.17
143	0.11
144	0.1
145	0.09
146	0.05
147	0.05
148	0.06
149	0.07
150	0.08
151	0.08
152	0.08
153	0.09
154	0.13
155	0.23
156	0.31
157	0.35
158	0.35
159	0.36
160	0.37
161	0.41
162	0.42
163	0.35
164	0.28
165	0.25
166	0.25
167	0.28
168	0.31
169	0.28
170	0.27
171	0.24
172	0.25
173	0.29
174	0.28
175	0.28
176	0.24
177	0.23
178	0.22
179	0.23
180	0.22
181	0.19
182	0.26
183	0.25
184	0.27
185	0.28
186	0.24
187	0.27
188	0.29
189	0.27
190	0.19
191	0.18
192	0.15
193	0.14
194	0.14
195	0.13
196	0.1
197	0.11
198	0.1
199	0.1
200	0.12
201	0.12
202	0.13
203	0.1
204	0.11
205	0.12
206	0.19
207	0.2
208	0.18
209	0.17
210	0.18
211	0.18
212	0.24
213	0.24
214	0.21
215	0.26
216	0.29
217	0.3
218	0.32
219	0.32
220	0.26
221	0.25
222	0.23
223	0.18
224	0.17
225	0.17
226	0.15
227	0.15
228	0.14
229	0.14
230	0.18
231	0.17
232	0.21
233	0.22
234	0.2
235	0.21
236	0.22
237	0.25
238	0.22
239	0.23
240	0.19
241	0.18
242	0.18
243	0.16
244	0.15
245	0.12
246	0.11
247	0.1
248	0.1
249	0.09
250	0.09
251	0.09
252	0.11
253	0.1
254	0.08
255	0.08
256	0.09
257	0.1
258	0.11
259	0.12
260	0.12
261	0.13
262	0.15
263	0.16
264	0.16
265	0.21
266	0.25
267	0.25
268	0.28
269	0.32
270	0.29
271	0.3
272	0.29
273	0.25
274	0.24
275	0.24
276	0.21
277	0.2
278	0.2
279	0.22
280	0.23
281	0.23
282	0.2
283	0.2
284	0.18
285	0.15
286	0.15
287	0.13
288	0.14
289	0.13
290	0.11
291	0.14
292	0.13
293	0.14
294	0.16
295	0.14
296	0.12
297	0.13
298	0.2
299	0.17
300	0.2
301	0.2
302	0.17
303	0.19
304	0.18
305	0.2
306	0.14
307	0.17
308	0.17
309	0.2
310	0.2
311	0.19
312	0.2
313	0.19
314	0.23
315	0.22
316	0.25
317	0.25
318	0.29
319	0.31
320	0.36
321	0.35
322	0.32
323	0.33
324	0.33
325	0.35
326	0.4
327	0.44
328	0.44
329	0.44
330	0.47
331	0.45
332	0.44
333	0.43
334	0.41
335	0.38
336	0.33
337	0.32
338	0.29
339	0.27
340	0.25
341	0.22
342	0.17
343	0.15
344	0.16
345	0.17
346	0.17
347	0.21
348	0.22
349	0.25
350	0.23
351	0.23
352	0.23
353	0.22
354	0.21
355	0.16
356	0.13
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.09
363	0.09
364	0.09
365	0.1
366	0.1
367	0.1
368	0.11
369	0.1
370	0.11
371	0.12
372	0.13
373	0.12
374	0.1
375	0.1
376	0.1
377	0.11
378	0.13
379	0.13
380	0.13
381	0.17
382	0.19
383	0.21
384	0.23
385	0.25
386	0.27
387	0.33
388	0.42
389	0.47
390	0.55
391	0.64
392	0.71
393	0.77
394	0.85
395	0.86
396	0.88
397	0.89
398	0.88
399	0.86
400	0.77
401	0.68
402	0.62
403	0.53
404	0.43
405	0.34
406	0.26
407	0.17
408	0.16
409	0.14
410	0.1
411	0.1
412	0.08
413	0.06
414	0.06
415	0.05
416	0.06
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.06
421	0.06
422	0.06
423	0.05
424	0.05
425	0.05
426	0.04
427	0.04
428	0.03
429	0.03
430	0.03
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.03
435	0.03
436	0.03
437	0.04
438	0.04
439	0.04
440	0.04
441	0.05
442	0.06
443	0.06
444	0.07
445	0.11
446	0.12
447	0.12
448	0.13
449	0.13
450	0.12
451	0.13
452	0.15
453	0.11
454	0.12
455	0.11
456	0.11
457	0.1
458	0.1
459	0.11
460	0.07
461	0.06
462	0.06
463	0.1
464	0.1
465	0.12
466	0.12
467	0.13
468	0.15
469	0.16
470	0.17
471	0.14
472	0.16
473	0.18
474	0.24
475	0.26
476	0.25
477	0.25
478	0.25
479	0.26
480	0.25
481	0.23
482	0.19
483	0.17
484	0.2
485	0.19
486	0.21
487	0.2
488	0.23
489	0.24
490	0.22
491	0.29
492	0.28
493	0.36
494	0.36
495	0.36
496	0.36
497	0.4
498	0.43
499	0.42
500	0.4
501	0.32
502	0.3
503	0.28
504	0.3
505	0.24
506	0.24
507	0.18
508	0.21
509	0.22
510	0.28
511	0.27
512	0.23
513	0.23
514	0.18
515	0.17
516	0.13
517	0.12
518	0.06
519	0.06
520	0.07
521	0.06
522	0.07
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.07
528	0.06
529	0.06
530	0.08
531	0.09
532	0.1
533	0.12
534	0.12
535	0.12
536	0.12
537	0.13
538	0.11
539	0.11
540	0.1
541	0.08
542	0.09
543	0.09
544	0.09
545	0.08
546	0.09
547	0.1
548	0.09
549	0.1
550	0.14
551	0.14
552	0.14
553	0.15
554	0.15
555	0.13
556	0.13
557	0.14
558	0.09
559	0.09
560	0.08
561	0.07
562	0.07
563	0.08
564	0.07
565	0.06
566	0.05
567	0.06
568	0.06
569	0.05
570	0.06
571	0.09
572	0.09
573	0.12
574	0.15
575	0.16
576	0.16
577	0.18
578	0.19
579	0.2
580	0.2
581	0.18
582	0.15
583	0.14
584	0.13
585	0.12
586	0.12
587	0.09
588	0.09
589	0.13
590	0.12
591	0.13
592	0.17
593	0.18
594	0.17
595	0.2
596	0.21
597	0.22
598	0.27
599	0.28
600	0.31
601	0.32
602	0.33
603	0.31
604	0.32
605	0.3
606	0.29
607	0.31
608	0.25
609	0.22
610	0.21
611	0.19
612	0.15
613	0.13
614	0.1
615	0.07
616	0.06
617	0.06
618	0.09
619	0.11
620	0.12
621	0.12
622	0.13
623	0.14
624	0.14
625	0.18
626	0.16
627	0.17
628	0.25
629	0.26
630	0.26
631	0.25
632	0.26
633	0.24
634	0.25
635	0.22
636	0.14
637	0.13
638	0.13
639	0.12
640	0.1
641	0.09
642	0.07
643	0.07
644	0.06
645	0.07
646	0.06
647	0.07
648	0.07
649	0.06
650	0.06
651	0.07
652	0.08
653	0.09
654	0.09
655	0.1
656	0.12
657	0.19
658	0.22
659	0.27
660	0.3
661	0.32
662	0.36
663	0.37
664	0.35
665	0.29
666	0.27
667	0.21
668	0.18
669	0.15
670	0.1
671	0.08
672	0.07
673	0.07
674	0.06
675	0.05
676	0.04
677	0.04
678	0.04
679	0.07
680	0.08
681	0.11
682	0.14
683	0.19
684	0.24
685	0.26
686	0.3
687	0.32
688	0.35
689	0.38
690	0.43
691	0.48
692	0.48
693	0.54
694	0.53
695	0.51
696	0.48
697	0.43
698	0.39
699	0.3
700	0.26
701	0.21
702	0.2
703	0.19
704	0.18
705	0.2
706	0.17
707	0.21
708	0.19
709	0.17
710	0.24
711	0.24
712	0.28
713	0.29
714	0.31
715	0.3
716	0.33
717	0.34
718	0.3
719	0.35
720	0.32
721	0.3
722	0.31
723	0.29
724	0.27
725	0.28
726	0.32
727	0.28
728	0.28
729	0.26
730	0.25
731	0.28
732	0.3
733	0.28
734	0.2
735	0.18
736	0.18
737	0.19
738	0.19
739	0.16
740	0.15
741	0.15
742	0.15
743	0.14
744	0.14
745	0.13
746	0.11
747	0.15
748	0.16
749	0.15
750	0.15
751	0.15
752	0.14
753	0.13
754	0.12
755	0.07
756	0.07
757	0.06
758	0.08
759	0.12
760	0.12
761	0.12
762	0.12
763	0.12
764	0.1
765	0.1
766	0.1
767	0.07
768	0.07
769	0.08
770	0.1
771	0.12
772	0.13
773	0.18
774	0.18
775	0.23
776	0.25
777	0.28
778	0.34
779	0.34
780	0.38
781	0.37
782	0.41
783	0.39
784	0.4
785	0.4
786	0.34
787	0.39
788	0.38
789	0.39
790	0.43
791	0.47
792	0.49
793	0.48
794	0.47
795	0.48
796	0.49
797	0.45
798	0.36
799	0.29
800	0.25
801	0.23
802	0.24
803	0.17
804	0.11
805	0.09
806	0.09
807	0.06
808	0.06
809	0.06
810	0.04
811	0.04
812	0.04
813	0.05
814	0.05
815	0.05
816	0.05
817	0.06
818	0.07
819	0.07
820	0.07
821	0.08
822	0.09
823	0.09
824	0.09
825	0.09
826	0.11
827	0.13
828	0.14
829	0.14
830	0.14
831	0.14
832	0.14
833	0.13
834	0.11
835	0.1
836	0.1
837	0.11
838	0.16
839	0.17
840	0.19
841	0.23
842	0.26
843	0.26
844	0.25
845	0.27
846	0.27
847	0.3
848	0.31
849	0.28
850	0.26
851	0.31
852	0.3
853	0.26
854	0.22
855	0.17
856	0.14
857	0.14
858	0.15
859	0.15
860	0.15
861	0.16
862	0.2
863	0.2
864	0.19
865	0.21
866	0.21
867	0.17
868	0.18
869	0.17
870	0.14
871	0.17
872	0.18
873	0.17
874	0.17
875	0.17
876	0.17
877	0.18
878	0.17
879	0.15
880	0.16
881	0.15
882	0.16
883	0.16
884	0.15
885	0.21
886	0.21
887	0.23
888	0.23
889	0.23
890	0.2
891	0.19
892	0.19
893	0.14
894	0.14
895	0.12
896	0.12
897	0.12
898	0.17
899	0.17
900	0.17
901	0.18
902	0.2
903	0.23
904	0.26
905	0.31
906	0.34
907	0.41
908	0.49
909	0.53
910	0.58
911	0.57
912	0.62
913	0.61
914	0.62
915	0.54
916	0.45
917	0.41
918	0.34
919	0.36
920	0.33
921	0.29
922	0.23
923	0.24
924	0.24
925	0.26
926	0.25
927	0.21
928	0.16
929	0.15
930	0.18
931	0.19
932	0.19
933	0.19
934	0.2
935	0.22
936	0.21
937	0.23
938	0.19
939	0.18
940	0.17
941	0.14
942	0.17
943	0.18
944	0.22
945	0.23
946	0.26
947	0.32
948	0.41
949	0.5
950	0.49
951	0.57
952	0.59
953	0.58
954	0.63

A0A4S4L2M5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer