Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4KYW2

Protein Details
Accession A0A4S4KYW2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1147-1172SIVVVGQARQRKRKRSKQQTEVEAGGHydrophilic
1225-1244SSVLRSGKTKAKNLKGRAFEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1159-1164RKRKRS
Subcellular Location(s) mito 9.5, nucl 9, cyto_mito 7.5, cyto 4.5, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002562  3'-5'_exonuclease_dom  
IPR012588  Exosome-assoc_fac_Rrp6_N  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR002121  HRDC_dom  
IPR044876  HRDC_dom_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR045092  Rrp6-like  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0000175  F:3'-5'-RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0000467  P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF01612  DNA_pol_A_exo1  
PF00570  HRDC  
PF08066  PMC2NT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50967  HRDC  
CDD cd06147  Rrp6p_like_exo  
Amino Acid Sequences MSSLIHASTSLLRSRSQFVSLIDRLKNICRDDILLYSLSHDTPDLEHSVKQLGACTKETIGCLSAPLPLRNDQPFFSCSVAVLKSGNCRPFSSLKTGNGPVQVGRWHAFRKKESDDNVFDGLGGQDLDGDINWKELWNTKSSARFLPQELKDVTNARSLIYFSDHSSWDLASAIHEHLPHSHQLGFMASSTPFVTGQPFTLLRNGTVQSSGAVGIALSSPPSETVLRFDGLVQLTRSLPVHRAEGNLIFELGESLPARILLKAIQDHKLPDDKSKDVEYYIGTRDAATADEKTPPRLLRIIAGSPSRGSIAVEEVAAPLVGSLVEFYFRPKSLPVQLPSDFLLGGANSDVLFGALVDNIEYNLSGSPSSFPISRINKSDTGSPESYESSFIMSAEQGFVLTAGKTGKAYVPWKCTVPGTFGGXAISRRTIKINMSAEAESSKAALKFSPSFDSYNADLQAAALGATRLAAALPADIGFHRSLDSDFAQAIELCSEKTLKLTNRLLELSMMNSAKETCSKGKKKLEDQEDVLDSYQSLVGDVLDQLFEHADMSLDELLGRTKPAAMPVKPTPQASTSYFSAKQGRLDPALMHAMHLPKPQLKFRRKVDNANDSIWTATLKHKYNAKVPLGYVFHDTVNEDDSYGSVPKKPHPYLYEIEHISYPHRMFEHEEAISPKSFEETPFTWVDTKGSLDTMLDKLRHAREIAVDLEHHSYRSFAGFLCLMQISTREEDFIVDTLSLREELEDLNEVFTDPNVVKVFHGAESDIVWLQQDLNIYIVNLFDTYHASKLLDFPKHGLAALLEMYCDFIPDKRYQLADWRIRPLPEEMLKYARSDTHFLLYIYDSLRNALLDRAGGQPDLVRATLVRSQQTALRTYEREVYDITTGLGPGGWNTLATKWGRRLSGTRRAVFRAVHAWRDALARAEDESTRYVLPNHHLFQLAERPPSDMNALLGVFRSVPPLLWRNRLRRIKXEDLNKMNDVVAQVPLESPAESAEKMNSVPMLSEKTSASVKNLLPDLWTSKASIVATSSSLLGSQTDKSKHQADLCSSTRSSLFPAGWITAPAYVRKTASSTRYSEVVARIHSALITAPSVPKAMGINASVKEGDASIQSSGGTQSSSVPESEQIEIPFVPAVQRQPHIAATTEIADSIVVVGQARQRKRKRSKQQTEVEAGGEEGGEDDRSDSKKLKGKFRSTADVDGKPETPEPEPFDYASAPNFLDGPVKDNSSVLRSGKTKAKNLKGRAFEYGNFPAQPRAFNEVKGANKSHTFRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.33
3 0.32
4 0.32
5 0.3
6 0.37
7 0.39
8 0.43
9 0.4
10 0.41
11 0.41
12 0.44
13 0.48
14 0.42
15 0.4
16 0.35
17 0.36
18 0.36
19 0.35
20 0.32
21 0.27
22 0.24
23 0.23
24 0.23
25 0.2
26 0.18
27 0.15
28 0.14
29 0.13
30 0.17
31 0.18
32 0.18
33 0.19
34 0.2
35 0.23
36 0.23
37 0.22
38 0.24
39 0.25
40 0.28
41 0.29
42 0.3
43 0.29
44 0.3
45 0.31
46 0.27
47 0.24
48 0.2
49 0.19
50 0.17
51 0.2
52 0.22
53 0.24
54 0.25
55 0.27
56 0.32
57 0.37
58 0.39
59 0.35
60 0.35
61 0.34
62 0.33
63 0.31
64 0.26
65 0.21
66 0.22
67 0.22
68 0.19
69 0.19
70 0.19
71 0.25
72 0.32
73 0.37
74 0.35
75 0.36
76 0.4
77 0.45
78 0.47
79 0.47
80 0.47
81 0.47
82 0.51
83 0.53
84 0.52
85 0.48
86 0.45
87 0.37
88 0.33
89 0.31
90 0.28
91 0.27
92 0.28
93 0.32
94 0.37
95 0.44
96 0.46
97 0.52
98 0.55
99 0.61
100 0.63
101 0.64
102 0.63
103 0.59
104 0.56
105 0.47
106 0.4
107 0.32
108 0.25
109 0.18
110 0.13
111 0.08
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.05
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.17
123 0.19
124 0.21
125 0.24
126 0.28
127 0.35
128 0.38
129 0.42
130 0.41
131 0.42
132 0.43
133 0.5
134 0.46
135 0.46
136 0.46
137 0.42
138 0.41
139 0.4
140 0.38
141 0.34
142 0.32
143 0.25
144 0.24
145 0.23
146 0.2
147 0.21
148 0.2
149 0.17
150 0.21
151 0.21
152 0.21
153 0.21
154 0.2
155 0.16
156 0.15
157 0.12
158 0.1
159 0.11
160 0.12
161 0.13
162 0.14
163 0.14
164 0.16
165 0.19
166 0.2
167 0.2
168 0.19
169 0.18
170 0.18
171 0.19
172 0.17
173 0.15
174 0.14
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.11
180 0.11
181 0.13
182 0.12
183 0.13
184 0.16
185 0.17
186 0.17
187 0.21
188 0.22
189 0.2
190 0.23
191 0.23
192 0.19
193 0.19
194 0.18
195 0.14
196 0.14
197 0.13
198 0.09
199 0.08
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.09
209 0.1
210 0.1
211 0.14
212 0.16
213 0.16
214 0.16
215 0.16
216 0.18
217 0.19
218 0.21
219 0.18
220 0.17
221 0.17
222 0.19
223 0.19
224 0.16
225 0.18
226 0.18
227 0.21
228 0.2
229 0.22
230 0.23
231 0.25
232 0.26
233 0.23
234 0.21
235 0.17
236 0.15
237 0.15
238 0.12
239 0.11
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.11
245 0.09
246 0.1
247 0.09
248 0.13
249 0.18
250 0.21
251 0.24
252 0.26
253 0.27
254 0.31
255 0.36
256 0.33
257 0.35
258 0.37
259 0.36
260 0.37
261 0.39
262 0.35
263 0.29
264 0.3
265 0.24
266 0.22
267 0.23
268 0.21
269 0.18
270 0.17
271 0.17
272 0.15
273 0.14
274 0.13
275 0.12
276 0.12
277 0.19
278 0.2
279 0.22
280 0.27
281 0.26
282 0.27
283 0.28
284 0.27
285 0.25
286 0.28
287 0.28
288 0.28
289 0.29
290 0.27
291 0.24
292 0.24
293 0.21
294 0.16
295 0.14
296 0.1
297 0.11
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.08
304 0.07
305 0.04
306 0.04
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.04
312 0.05
313 0.08
314 0.11
315 0.12
316 0.13
317 0.14
318 0.19
319 0.26
320 0.33
321 0.34
322 0.36
323 0.37
324 0.38
325 0.38
326 0.34
327 0.26
328 0.18
329 0.16
330 0.09
331 0.09
332 0.07
333 0.06
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.05
347 0.04
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.07
354 0.08
355 0.11
356 0.1
357 0.12
358 0.2
359 0.26
360 0.29
361 0.32
362 0.35
363 0.37
364 0.37
365 0.41
366 0.36
367 0.38
368 0.35
369 0.32
370 0.29
371 0.27
372 0.26
373 0.22
374 0.18
375 0.13
376 0.12
377 0.11
378 0.1
379 0.09
380 0.08
381 0.07
382 0.07
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.06
390 0.07
391 0.07
392 0.08
393 0.09
394 0.13
395 0.18
396 0.22
397 0.28
398 0.29
399 0.3
400 0.31
401 0.32
402 0.28
403 0.27
404 0.23
405 0.21
406 0.2
407 0.19
408 0.2
409 0.19
410 0.19
411 0.17
412 0.18
413 0.16
414 0.17
415 0.18
416 0.18
417 0.24
418 0.26
419 0.26
420 0.26
421 0.25
422 0.23
423 0.22
424 0.21
425 0.13
426 0.11
427 0.11
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.12
432 0.14
433 0.16
434 0.19
435 0.19
436 0.2
437 0.21
438 0.24
439 0.22
440 0.23
441 0.21
442 0.17
443 0.15
444 0.13
445 0.13
446 0.09
447 0.07
448 0.04
449 0.04
450 0.03
451 0.04
452 0.03
453 0.03
454 0.03
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.04
461 0.04
462 0.06
463 0.06
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.08
468 0.1
469 0.11
470 0.1
471 0.1
472 0.1
473 0.1
474 0.09
475 0.09
476 0.07
477 0.06
478 0.05
479 0.06
480 0.07
481 0.06
482 0.07
483 0.12
484 0.14
485 0.22
486 0.25
487 0.27
488 0.29
489 0.29
490 0.28
491 0.24
492 0.23
493 0.16
494 0.16
495 0.14
496 0.11
497 0.11
498 0.11
499 0.1
500 0.12
501 0.14
502 0.16
503 0.26
504 0.32
505 0.4
506 0.48
507 0.54
508 0.6
509 0.66
510 0.66
511 0.61
512 0.59
513 0.54
514 0.47
515 0.41
516 0.33
517 0.24
518 0.17
519 0.13
520 0.11
521 0.07
522 0.06
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.05
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.03
535 0.04
536 0.03
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.06
545 0.04
546 0.05
547 0.05
548 0.12
549 0.17
550 0.17
551 0.23
552 0.27
553 0.33
554 0.34
555 0.35
556 0.3
557 0.26
558 0.29
559 0.26
560 0.26
561 0.21
562 0.24
563 0.24
564 0.25
565 0.28
566 0.25
567 0.25
568 0.25
569 0.26
570 0.23
571 0.23
572 0.2
573 0.17
574 0.2
575 0.17
576 0.14
577 0.14
578 0.14
579 0.15
580 0.17
581 0.16
582 0.16
583 0.19
584 0.25
585 0.33
586 0.38
587 0.44
588 0.49
589 0.58
590 0.58
591 0.65
592 0.66
593 0.66
594 0.62
595 0.55
596 0.5
597 0.39
598 0.36
599 0.27
600 0.19
601 0.11
602 0.12
603 0.17
604 0.18
605 0.2
606 0.25
607 0.28
608 0.34
609 0.39
610 0.37
611 0.33
612 0.31
613 0.34
614 0.3
615 0.28
616 0.24
617 0.18
618 0.16
619 0.15
620 0.15
621 0.1
622 0.11
623 0.1
624 0.07
625 0.06
626 0.06
627 0.07
628 0.08
629 0.08
630 0.1
631 0.11
632 0.16
633 0.24
634 0.24
635 0.28
636 0.29
637 0.34
638 0.33
639 0.36
640 0.36
641 0.29
642 0.29
643 0.25
644 0.23
645 0.19
646 0.2
647 0.16
648 0.12
649 0.12
650 0.12
651 0.14
652 0.17
653 0.19
654 0.16
655 0.17
656 0.18
657 0.19
658 0.18
659 0.15
660 0.13
661 0.11
662 0.11
663 0.1
664 0.13
665 0.12
666 0.16
667 0.16
668 0.17
669 0.17
670 0.17
671 0.17
672 0.13
673 0.12
674 0.09
675 0.09
676 0.08
677 0.07
678 0.08
679 0.1
680 0.12
681 0.11
682 0.11
683 0.15
684 0.16
685 0.18
686 0.16
687 0.15
688 0.14
689 0.16
690 0.17
691 0.13
692 0.12
693 0.12
694 0.15
695 0.14
696 0.13
697 0.1
698 0.1
699 0.09
700 0.1
701 0.09
702 0.06
703 0.07
704 0.07
705 0.07
706 0.08
707 0.08
708 0.07
709 0.07
710 0.08
711 0.08
712 0.1
713 0.1
714 0.09
715 0.09
716 0.09
717 0.1
718 0.09
719 0.07
720 0.06
721 0.06
722 0.06
723 0.06
724 0.06
725 0.05
726 0.05
727 0.05
728 0.05
729 0.06
730 0.07
731 0.07
732 0.07
733 0.07
734 0.07
735 0.07
736 0.06
737 0.08
738 0.06
739 0.09
740 0.1
741 0.1
742 0.1
743 0.11
744 0.13
745 0.11
746 0.12
747 0.09
748 0.08
749 0.08
750 0.09
751 0.08
752 0.07
753 0.06
754 0.06
755 0.06
756 0.06
757 0.06
758 0.06
759 0.06
760 0.06
761 0.06
762 0.07
763 0.06
764 0.05
765 0.05
766 0.05
767 0.05
768 0.08
769 0.09
770 0.09
771 0.1
772 0.1
773 0.1
774 0.15
775 0.2
776 0.2
777 0.19
778 0.21
779 0.23
780 0.23
781 0.23
782 0.18
783 0.12
784 0.1
785 0.11
786 0.09
787 0.06
788 0.06
789 0.07
790 0.07
791 0.07
792 0.06
793 0.07
794 0.1
795 0.12
796 0.15
797 0.16
798 0.17
799 0.17
800 0.26
801 0.33
802 0.38
803 0.39
804 0.42
805 0.42
806 0.41
807 0.42
808 0.36
809 0.33
810 0.29
811 0.29
812 0.26
813 0.28
814 0.28
815 0.27
816 0.26
817 0.23
818 0.21
819 0.22
820 0.21
821 0.19
822 0.2
823 0.19
824 0.2
825 0.17
826 0.17
827 0.15
828 0.15
829 0.12
830 0.12
831 0.12
832 0.11
833 0.1
834 0.09
835 0.08
836 0.07
837 0.09
838 0.1
839 0.11
840 0.11
841 0.1
842 0.1
843 0.11
844 0.12
845 0.1
846 0.08
847 0.07
848 0.1
849 0.14
850 0.16
851 0.17
852 0.16
853 0.17
854 0.2
855 0.23
856 0.23
857 0.22
858 0.23
859 0.23
860 0.24
861 0.3
862 0.27
863 0.26
864 0.23
865 0.22
866 0.19
867 0.18
868 0.17
869 0.1
870 0.1
871 0.08
872 0.08
873 0.06
874 0.05
875 0.06
876 0.05
877 0.05
878 0.06
879 0.07
880 0.11
881 0.12
882 0.16
883 0.21
884 0.25
885 0.26
886 0.27
887 0.34
888 0.38
889 0.47
890 0.51
891 0.5
892 0.5
893 0.52
894 0.53
895 0.46
896 0.41
897 0.39
898 0.34
899 0.33
900 0.3
901 0.27
902 0.25
903 0.26
904 0.24
905 0.18
906 0.15
907 0.13
908 0.13
909 0.14
910 0.13
911 0.14
912 0.14
913 0.13
914 0.13
915 0.13
916 0.14
917 0.15
918 0.2
919 0.25
920 0.25
921 0.26
922 0.27
923 0.26
924 0.28
925 0.35
926 0.32
927 0.29
928 0.27
929 0.27
930 0.26
931 0.27
932 0.25
933 0.16
934 0.13
935 0.13
936 0.12
937 0.1
938 0.1
939 0.09
940 0.08
941 0.08
942 0.1
943 0.08
944 0.08
945 0.13
946 0.19
947 0.23
948 0.32
949 0.39
950 0.45
951 0.56
952 0.64
953 0.65
954 0.65
955 0.7
956 0.71
957 0.72
958 0.75
959 0.73
960 0.71
961 0.67
962 0.6
963 0.52
964 0.43
965 0.35
966 0.26
967 0.19
968 0.12
969 0.11
970 0.1
971 0.1
972 0.1
973 0.09
974 0.08
975 0.08
976 0.1
977 0.1
978 0.11
979 0.11
980 0.11
981 0.11
982 0.12
983 0.11
984 0.09
985 0.1
986 0.11
987 0.14
988 0.14
989 0.16
990 0.15
991 0.17
992 0.2
993 0.2
994 0.21
995 0.23
996 0.23
997 0.25
998 0.26
999 0.24
1000 0.22
1001 0.24
1002 0.25
1003 0.21
1004 0.21
1005 0.17
1006 0.17
1007 0.2
1008 0.19
1009 0.17
1010 0.15
1011 0.13
1012 0.14
1013 0.13
1014 0.13
1015 0.09
1016 0.09
1017 0.09
1018 0.09
1019 0.09
1020 0.12
1021 0.17
1022 0.2
1023 0.22
1024 0.27
1025 0.3
1026 0.34
1027 0.37
1028 0.4
1029 0.39
1030 0.44
1031 0.45
1032 0.45
1033 0.41
1034 0.39
1035 0.35
1036 0.3
1037 0.28
1038 0.24
1039 0.21
1040 0.18
1041 0.2
1042 0.2
1043 0.19
1044 0.19
1045 0.17
1046 0.16
1047 0.17
1048 0.18
1049 0.19
1050 0.19
1051 0.2
1052 0.2
1053 0.23
1054 0.25
1055 0.3
1056 0.33
1057 0.35
1058 0.35
1059 0.36
1060 0.36
1061 0.36
1062 0.34
1063 0.31
1064 0.27
1065 0.25
1066 0.23
1067 0.22
1068 0.2
1069 0.17
1070 0.13
1071 0.12
1072 0.11
1073 0.1
1074 0.1
1075 0.11
1076 0.12
1077 0.11
1078 0.12
1079 0.12
1080 0.12
1081 0.13
1082 0.14
1083 0.18
1084 0.18
1085 0.2
1086 0.19
1087 0.17
1088 0.16
1089 0.14
1090 0.13
1091 0.1
1092 0.11
1093 0.09
1094 0.09
1095 0.09
1096 0.1
1097 0.1
1098 0.1
1099 0.09
1100 0.08
1101 0.1
1102 0.13
1103 0.14
1104 0.14
1105 0.14
1106 0.16
1107 0.19
1108 0.21
1109 0.21
1110 0.18
1111 0.2
1112 0.19
1113 0.19
1114 0.16
1115 0.14
1116 0.13
1117 0.13
1118 0.18
1119 0.21
1120 0.22
1121 0.24
1122 0.27
1123 0.29
1124 0.29
1125 0.27
1126 0.24
1127 0.21
1128 0.21
1129 0.19
1130 0.16
1131 0.13
1132 0.11
1133 0.1
1134 0.09
1135 0.07
1136 0.05
1137 0.06
1138 0.08
1139 0.13
1140 0.21
1141 0.28
1142 0.38
1143 0.46
1144 0.57
1145 0.68
1146 0.78
1147 0.84
1148 0.88
1149 0.92
1150 0.92
1151 0.93
1152 0.91
1153 0.87
1154 0.78
1155 0.67
1156 0.56
1157 0.45
1158 0.34
1159 0.24
1160 0.15
1161 0.09
1162 0.07
1163 0.06
1164 0.06
1165 0.07
1166 0.12
1167 0.15
1168 0.18
1169 0.21
1170 0.27
1171 0.34
1172 0.41
1173 0.5
1174 0.56
1175 0.63
1176 0.69
1177 0.73
1178 0.75
1179 0.73
1180 0.75
1181 0.72
1182 0.67
1183 0.61
1184 0.55
1185 0.49
1186 0.42
1187 0.4
1188 0.33
1189 0.29
1190 0.3
1191 0.32
1192 0.34
1193 0.35
1194 0.34
1195 0.33
1196 0.32
1197 0.31
1198 0.27
1199 0.23
1200 0.18
1201 0.16
1202 0.16
1203 0.14
1204 0.18
1205 0.16
1206 0.18
1207 0.19
1208 0.21
1209 0.21
1210 0.22
1211 0.23
1212 0.22
1213 0.27
1214 0.25
1215 0.29
1216 0.29
1217 0.34
1218 0.41
1219 0.47
1220 0.53
1221 0.57
1222 0.66
1223 0.69
1224 0.76
1225 0.8
1226 0.79
1227 0.75
1228 0.74
1229 0.68
1230 0.6
1231 0.58
1232 0.54
1233 0.5
1234 0.43
1235 0.41
1236 0.4
1237 0.37
1238 0.38
1239 0.35
1240 0.36
1241 0.34
1242 0.33
1243 0.39
1244 0.38
1245 0.43
1246 0.46
1247 0.44
1248 0.42
1249 0.48