FuNGI

A0A4V3XCC1

Protein Details

Accession

A0A4V3XCC1

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
272-305	RRTINKKTRSGDKKHKKVSKLLRRSKVKSKNAPS	Basic
572-593	DDENEKTKEKRQKNKGTESEDV	Acidic
702-724	REGREKFGSKKGKKGKDVPSSST	Basic
740-770	SSTVRGKKKASLIEKQRRMRKHNENQKKRRK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
272-304	RRTINKKTRSGDKKXHKKVSKLLRRSKVKSKNA
687-690	KKAK
697-725	MASVREGREGREKFGSKKGKKGKDVPSSS
728-730	REK
746-772	RGKKKASLIEKQRRMRKHNENQKKRRK

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 10.333, mito 7.5, cyto_mito 4.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C IPR012977 SDA1_N
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF08158 NUC130_3NT PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

MVRSHAGRGALLSYNLPQLQNLIKRDPAAYKEEFLQQWNHYKSILNIFQANPVEQSDQFRDMVTFISQVAPCYPNETMNFPAELSSLLLNHYGELNSDTKKSLLSNLIILRKKDVLSPTELLKTLFPLLPRTSSSSLRSFIRKTILTEIRTANAQRVNLKLNRAMQAMLFRMVEQGADMDVVFDKGKKPVRVGDVSYHAGEDALWAVFLTKDLWKKGIWNDAKSVSIVSLGCFHPITKVQSAAFHFFLDDEEEENSSDEDEDGPSVKSLEHRRTINKKTRSGDKKXHKKVSKLLRRSKVKSKNAPSARANFAALQLLQDPQTFAEKLFDNLSRFDKRFTLEHKLLCMQVLCRTLGTHHLSVLPFYTYLLKYLTASQLRIPTILAALASSVHALTPPDVLTPVLRKISHEFVHPGVGGEVITAGLNAVYEVCRRQPLAMEEDLLGDLVEYRKSKEKXCDICRERSITPVQARDAVHAKAERKKASMKGATFQPLEFGKEKRGNTSIIEGLDLLEDHIRKLKEADEGESAAGSDDEENDWTGWEVASESSDSSSASEGWLDVSSDSENELKLSDSDDENEKTKEKRQKNKGTESEDVDVDEGIDRDGNKDKVDAEKNEDPVQTDPSQSIAATKILTPADFALLNDLRSKAAGSSSSKRKRGEVSKSILPTGDGDEAVLLGELDILGPRKKAKATYEERMASVREGREGREKFGSKKGKKGKDVPSSSTNREKTRNKPLMMIMASSTVRGKKKASLIEKQRRMRKHNENQKKRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.24
3	0.23
4	0.2
5	0.21
6	0.28
7	0.33
8	0.36
9	0.35
10	0.35
11	0.37
12	0.41
13	0.42
14	0.39
15	0.39
16	0.37
17	0.35
18	0.35
19	0.4
20	0.38
21	0.36
22	0.37
23	0.36
24	0.43
25	0.44
26	0.42
27	0.36
28	0.36
29	0.38
30	0.42
31	0.41
32	0.35
33	0.36
34	0.36
35	0.41
36	0.41
37	0.38
38	0.3
39	0.27
40	0.27
41	0.24
42	0.29
43	0.27
44	0.28
45	0.28
46	0.27
47	0.25
48	0.22
49	0.22
50	0.18
51	0.14
52	0.11
53	0.17
54	0.16
55	0.17
56	0.2
57	0.2
58	0.19
59	0.23
60	0.23
61	0.23
62	0.24
63	0.27
64	0.27
65	0.28
66	0.28
67	0.24
68	0.23
69	0.18
70	0.17
71	0.14
72	0.12
73	0.1
74	0.1
75	0.12
76	0.11
77	0.11
78	0.12
79	0.1
80	0.1
81	0.13
82	0.15
83	0.16
84	0.17
85	0.18
86	0.17
87	0.18
88	0.18
89	0.2
90	0.22
91	0.22
92	0.26
93	0.31
94	0.4
95	0.43
96	0.42
97	0.41
98	0.39
99	0.38
100	0.37
101	0.35
102	0.3
103	0.32
104	0.33
105	0.33
106	0.34
107	0.34
108	0.3
109	0.26
110	0.25
111	0.22
112	0.21
113	0.19
114	0.2
115	0.22
116	0.24
117	0.26
118	0.3
119	0.3
120	0.33
121	0.36
122	0.35
123	0.36
124	0.37
125	0.41
126	0.37
127	0.37
128	0.39
129	0.37
130	0.36
131	0.42
132	0.45
133	0.41
134	0.44
135	0.42
136	0.37
137	0.38
138	0.36
139	0.31
140	0.28
141	0.28
142	0.27
143	0.28
144	0.34
145	0.34
146	0.37
147	0.37
148	0.38
149	0.39
150	0.37
151	0.34
152	0.28
153	0.29
154	0.27
155	0.24
156	0.2
157	0.16
158	0.16
159	0.15
160	0.14
161	0.09
162	0.08
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.05
167	0.06
168	0.07
169	0.07
170	0.08
171	0.09
172	0.15
173	0.22
174	0.23
175	0.26
176	0.31
177	0.37
178	0.41
179	0.42
180	0.41
181	0.4
182	0.41
183	0.38
184	0.32
185	0.25
186	0.21
187	0.17
188	0.12
189	0.08
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.05
195	0.06
196	0.07
197	0.1
198	0.14
199	0.16
200	0.18
201	0.18
202	0.22
203	0.26
204	0.34
205	0.35
206	0.34
207	0.37
208	0.37
209	0.37
210	0.33
211	0.29
212	0.19
213	0.16
214	0.14
215	0.11
216	0.12
217	0.12
218	0.13
219	0.13
220	0.13
221	0.13
222	0.16
223	0.2
224	0.18
225	0.2
226	0.2
227	0.24
228	0.27
229	0.28
230	0.26
231	0.21
232	0.19
233	0.17
234	0.17
235	0.15
236	0.12
237	0.09
238	0.09
239	0.1
240	0.1
241	0.11
242	0.1
243	0.08
244	0.08
245	0.07
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.07
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.13
255	0.19
256	0.25
257	0.3
258	0.33
259	0.42
260	0.51
261	0.6
262	0.64
263	0.66
264	0.67
265	0.66
266	0.73
267	0.73
268	0.74
269	0.75
270	0.77
271	0.78
272	0.81
273	0.83
274	0.77
275	0.77
276	0.79
277	0.79
278	0.79
279	0.79
280	0.79
281	0.81
282	0.82
283	0.83
284	0.83
285	0.81
286	0.8
287	0.78
288	0.78
289	0.75
290	0.76
291	0.7
292	0.65
293	0.59
294	0.5
295	0.43
296	0.34
297	0.28
298	0.23
299	0.18
300	0.13
301	0.1
302	0.1
303	0.09
304	0.09
305	0.08
306	0.07
307	0.1
308	0.09
309	0.09
310	0.11
311	0.11
312	0.12
313	0.14
314	0.16
315	0.15
316	0.17
317	0.22
318	0.24
319	0.24
320	0.24
321	0.24
322	0.23
323	0.26
324	0.28
325	0.32
326	0.31
327	0.32
328	0.33
329	0.32
330	0.31
331	0.27
332	0.23
333	0.15
334	0.16
335	0.16
336	0.14
337	0.13
338	0.13
339	0.12
340	0.18
341	0.21
342	0.17
343	0.15
344	0.18
345	0.18
346	0.18
347	0.18
348	0.12
349	0.08
350	0.08
351	0.11
352	0.08
353	0.09
354	0.1
355	0.09
356	0.1
357	0.11
358	0.16
359	0.14
360	0.15
361	0.16
362	0.18
363	0.18
364	0.18
365	0.16
366	0.11
367	0.1
368	0.1
369	0.07
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.03
376	0.03
377	0.03
378	0.04
379	0.04
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.06
385	0.06
386	0.08
387	0.1
388	0.12
389	0.12
390	0.13
391	0.16
392	0.21
393	0.21
394	0.21
395	0.21
396	0.19
397	0.21
398	0.19
399	0.17
400	0.11
401	0.1
402	0.08
403	0.06
404	0.05
405	0.04
406	0.03
407	0.03
408	0.03
409	0.02
410	0.02
411	0.02
412	0.03
413	0.03
414	0.04
415	0.05
416	0.06
417	0.08
418	0.08
419	0.09
420	0.12
421	0.14
422	0.18
423	0.17
424	0.17
425	0.16
426	0.16
427	0.16
428	0.12
429	0.1
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.07
434	0.07
435	0.09
436	0.17
437	0.18
438	0.21
439	0.29
440	0.36
441	0.42
442	0.53
443	0.61
444	0.58
445	0.66
446	0.66
447	0.59
448	0.56
449	0.5
450	0.46
451	0.4
452	0.38
453	0.3
454	0.32
455	0.31
456	0.29
457	0.29
458	0.23
459	0.22
460	0.23
461	0.26
462	0.28
463	0.34
464	0.33
465	0.33
466	0.37
467	0.39
468	0.44
469	0.47
470	0.41
471	0.4
472	0.42
473	0.44
474	0.4
475	0.35
476	0.29
477	0.24
478	0.26
479	0.24
480	0.21
481	0.23
482	0.29
483	0.3
484	0.3
485	0.32
486	0.3
487	0.29
488	0.31
489	0.26
490	0.2
491	0.2
492	0.15
493	0.14
494	0.12
495	0.11
496	0.08
497	0.07
498	0.07
499	0.07
500	0.12
501	0.12
502	0.12
503	0.14
504	0.15
505	0.19
506	0.21
507	0.23
508	0.21
509	0.21
510	0.21
511	0.2
512	0.17
513	0.11
514	0.1
515	0.07
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.06
520	0.07
521	0.07
522	0.07
523	0.07
524	0.07
525	0.06
526	0.06
527	0.06
528	0.05
529	0.06
530	0.06
531	0.06
532	0.06
533	0.07
534	0.07
535	0.07
536	0.08
537	0.07
538	0.07
539	0.07
540	0.06
541	0.07
542	0.07
543	0.07
544	0.06
545	0.07
546	0.07
547	0.07
548	0.09
549	0.08
550	0.08
551	0.08
552	0.08
553	0.08
554	0.08
555	0.1
556	0.1
557	0.1
558	0.13
559	0.17
560	0.18
561	0.2
562	0.22
563	0.23
564	0.24
565	0.31
566	0.39
567	0.45
568	0.53
569	0.62
570	0.71
571	0.78
572	0.86
573	0.86
574	0.83
575	0.79
576	0.73
577	0.65
578	0.54
579	0.45
580	0.35
581	0.26
582	0.19
583	0.14
584	0.09
585	0.07
586	0.08
587	0.07
588	0.1
589	0.16
590	0.17
591	0.16
592	0.18
593	0.19
594	0.26
595	0.32
596	0.33
597	0.35
598	0.39
599	0.42
600	0.45
601	0.44
602	0.38
603	0.33
604	0.36
605	0.28
606	0.24
607	0.21
608	0.19
609	0.19
610	0.16
611	0.16
612	0.12
613	0.13
614	0.12
615	0.13
616	0.15
617	0.15
618	0.15
619	0.14
620	0.13
621	0.14
622	0.14
623	0.13
624	0.16
625	0.16
626	0.17
627	0.19
628	0.19
629	0.17
630	0.17
631	0.17
632	0.11
633	0.13
634	0.17
635	0.21
636	0.29
637	0.4
638	0.49
639	0.55
640	0.56
641	0.58
642	0.63
643	0.66
644	0.68
645	0.66
646	0.64
647	0.65
648	0.65
649	0.62
650	0.53
651	0.44
652	0.35
653	0.29
654	0.24
655	0.16
656	0.14
657	0.12
658	0.12
659	0.11
660	0.09
661	0.05
662	0.03
663	0.04
664	0.03
665	0.03
666	0.05
667	0.08
668	0.09
669	0.11
670	0.14
671	0.18
672	0.22
673	0.27
674	0.32
675	0.41
676	0.47
677	0.54
678	0.61
679	0.6
680	0.58
681	0.55
682	0.49
683	0.42
684	0.4
685	0.32
686	0.3
687	0.29
688	0.31
689	0.39
690	0.39
691	0.4
692	0.44
693	0.47
694	0.44
695	0.53
696	0.61
697	0.56
698	0.64
699	0.7
700	0.71
701	0.76
702	0.81
703	0.81
704	0.81
705	0.83
706	0.79
707	0.78
708	0.76
709	0.73
710	0.74
711	0.7
712	0.66
713	0.69
714	0.7
715	0.7
716	0.74
717	0.77
718	0.69
719	0.68
720	0.65
721	0.65
722	0.58
723	0.5
724	0.4
725	0.36
726	0.34
727	0.29
728	0.29
729	0.27
730	0.29
731	0.31
732	0.33
733	0.35
734	0.43
735	0.51
736	0.56
737	0.6
738	0.67
739	0.75
740	0.82
741	0.84
742	0.85
743	0.85
744	0.84
745	0.84
746	0.84
747	0.84
748	0.86
749	0.88
750	0.9

A0A4V3XCC1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer