Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4LJT0

Protein Details
Accession A0A4S4LJT0    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-271GRESRDWRRRSPPPLPRRYPDDRRRRSYSRSPPRGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-77PARGRSRSRSPVRGIRSPPPASYRRRSSPPSRPKH
240-270RDWRRRSPPPLPRRYPDDRRRRSYSRSPPRG
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12363  RRM_TRA2  
Amino Acid Sequences MSLRAQYSEGAPAPVDPYSDAYNAPPSSAIAPPLDPRDRDPLPARGRSRSRSPVRGIRSPPPASYRRRSSPPSRPKHAPINPNPTNVLGVFGLSIRTTERDLDEEFSRFGRVEKVTIVYDQRSDRSRGFGFIKLATVEDASRCVAELNGIDLNGRRIRVDYSVTDRPHAPTPGEYMGHRRAPTGRERERGDRREPYGRDVYRDRDVRRDYDDRDRYERLDRFDRYAERDRDRDPYGRESRDWRRRSPPPLPRRYPDDRRRRSYSRSPPRGSSPVRGGSIRDYDAPPPPSGAINGDPRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.12
4 0.14
5 0.16
6 0.17
7 0.17
8 0.17
9 0.23
10 0.23
11 0.22
12 0.19
13 0.18
14 0.19
15 0.2
16 0.2
17 0.15
18 0.17
19 0.2
20 0.27
21 0.3
22 0.29
23 0.31
24 0.37
25 0.36
26 0.41
27 0.42
28 0.45
29 0.47
30 0.55
31 0.55
32 0.56
33 0.62
34 0.62
35 0.66
36 0.66
37 0.68
38 0.67
39 0.71
40 0.7
41 0.7
42 0.73
43 0.69
44 0.66
45 0.67
46 0.62
47 0.58
48 0.56
49 0.56
50 0.56
51 0.59
52 0.59
53 0.57
54 0.62
55 0.65
56 0.68
57 0.71
58 0.75
59 0.75
60 0.75
61 0.74
62 0.73
63 0.76
64 0.74
65 0.74
66 0.72
67 0.74
68 0.7
69 0.66
70 0.61
71 0.51
72 0.45
73 0.34
74 0.27
75 0.16
76 0.12
77 0.1
78 0.09
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.07
84 0.08
85 0.1
86 0.11
87 0.12
88 0.14
89 0.16
90 0.17
91 0.17
92 0.17
93 0.16
94 0.16
95 0.13
96 0.13
97 0.14
98 0.13
99 0.13
100 0.14
101 0.16
102 0.16
103 0.17
104 0.19
105 0.15
106 0.18
107 0.18
108 0.2
109 0.2
110 0.22
111 0.21
112 0.24
113 0.24
114 0.24
115 0.25
116 0.25
117 0.24
118 0.22
119 0.22
120 0.17
121 0.17
122 0.13
123 0.11
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.06
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.09
143 0.09
144 0.11
145 0.12
146 0.14
147 0.14
148 0.19
149 0.25
150 0.26
151 0.27
152 0.26
153 0.27
154 0.28
155 0.27
156 0.21
157 0.15
158 0.18
159 0.19
160 0.2
161 0.18
162 0.2
163 0.24
164 0.27
165 0.26
166 0.24
167 0.24
168 0.27
169 0.34
170 0.39
171 0.4
172 0.43
173 0.47
174 0.55
175 0.62
176 0.64
177 0.63
178 0.59
179 0.58
180 0.6
181 0.57
182 0.54
183 0.54
184 0.49
185 0.48
186 0.45
187 0.45
188 0.44
189 0.49
190 0.44
191 0.43
192 0.46
193 0.44
194 0.47
195 0.47
196 0.44
197 0.49
198 0.54
199 0.5
200 0.53
201 0.52
202 0.48
203 0.51
204 0.5
205 0.46
206 0.47
207 0.44
208 0.42
209 0.46
210 0.47
211 0.45
212 0.51
213 0.52
214 0.5
215 0.52
216 0.5
217 0.5
218 0.51
219 0.49
220 0.44
221 0.46
222 0.49
223 0.49
224 0.49
225 0.52
226 0.59
227 0.64
228 0.64
229 0.61
230 0.63
231 0.68
232 0.74
233 0.76
234 0.75
235 0.76
236 0.82
237 0.83
238 0.79
239 0.78
240 0.8
241 0.8
242 0.8
243 0.8
244 0.79
245 0.8
246 0.83
247 0.82
248 0.81
249 0.81
250 0.82
251 0.82
252 0.82
253 0.8
254 0.76
255 0.77
256 0.78
257 0.72
258 0.68
259 0.65
260 0.61
261 0.59
262 0.54
263 0.49
264 0.45
265 0.45
266 0.4
267 0.36
268 0.31
269 0.32
270 0.38
271 0.39
272 0.34
273 0.31
274 0.3
275 0.28
276 0.27
277 0.27
278 0.25