Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4LGD9

Protein Details
Accession A0A4S4LGD9    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
85-107YYGGRRSRSKSPPRRGDDRSRRGBasic
234-257VGGASIKKQRTWRQYMNRRGGFNRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-157DRDRGKDRNRDRDRDLGRDRDRDRDRDRDRTGSRRGGADVGVGRGGRYYGGRRSRSKSPPRRGDDRSRRGHGRDRYDDRRDADRERRDERRDSDRDRDGRDGRREREKEVPPPRTTRADR
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MKKGKTTRTRPLVTITLHMSARDERRRGERNWEADDRDRDRGKDRNRDRDRDLGRDRDRDRDRDRDRTGSRRGGADVGVGRGGRYYGGRRSRSKSPPRRGDDRSRRGHGRDRYDDRRDADRERRDERRDSDRDRDGRDGRREREKEVPPPRTTRADRDRERDRDALGRPEVSTHPSGPGSRRMDSDPDLDTREEGEEAEEAEPEVDEEEAVMKAMMGFGGFDSTKGKPIEGNEVGGASIKKQRTWRQYMNRRGGFNRPLDKIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.46
3 0.4
4 0.36
5 0.34
6 0.3
7 0.3
8 0.37
9 0.41
10 0.4
11 0.41
12 0.49
13 0.56
14 0.56
15 0.6
16 0.6
17 0.58
18 0.63
19 0.63
20 0.6
21 0.61
22 0.66
23 0.61
24 0.6
25 0.56
26 0.51
27 0.52
28 0.56
29 0.57
30 0.59
31 0.64
32 0.67
33 0.72
34 0.77
35 0.76
36 0.77
37 0.73
38 0.72
39 0.69
40 0.68
41 0.65
42 0.67
43 0.64
44 0.65
45 0.65
46 0.64
47 0.63
48 0.64
49 0.64
50 0.65
51 0.68
52 0.67
53 0.68
54 0.67
55 0.68
56 0.65
57 0.6
58 0.52
59 0.48
60 0.4
61 0.34
62 0.29
63 0.23
64 0.17
65 0.16
66 0.14
67 0.12
68 0.11
69 0.11
70 0.08
71 0.09
72 0.12
73 0.19
74 0.27
75 0.34
76 0.39
77 0.44
78 0.52
79 0.61
80 0.68
81 0.71
82 0.73
83 0.77
84 0.79
85 0.82
86 0.79
87 0.8
88 0.8
89 0.79
90 0.76
91 0.72
92 0.7
93 0.66
94 0.68
95 0.64
96 0.62
97 0.61
98 0.61
99 0.63
100 0.64
101 0.64
102 0.58
103 0.57
104 0.52
105 0.49
106 0.5
107 0.49
108 0.49
109 0.5
110 0.55
111 0.53
112 0.55
113 0.53
114 0.54
115 0.53
116 0.53
117 0.54
118 0.54
119 0.53
120 0.51
121 0.52
122 0.48
123 0.49
124 0.53
125 0.53
126 0.5
127 0.57
128 0.55
129 0.52
130 0.56
131 0.53
132 0.54
133 0.57
134 0.6
135 0.53
136 0.56
137 0.56
138 0.55
139 0.53
140 0.52
141 0.52
142 0.55
143 0.57
144 0.6
145 0.65
146 0.62
147 0.65
148 0.57
149 0.49
150 0.45
151 0.43
152 0.42
153 0.34
154 0.3
155 0.25
156 0.26
157 0.25
158 0.23
159 0.22
160 0.16
161 0.17
162 0.18
163 0.2
164 0.2
165 0.27
166 0.28
167 0.28
168 0.29
169 0.29
170 0.31
171 0.32
172 0.32
173 0.26
174 0.24
175 0.24
176 0.23
177 0.21
178 0.18
179 0.16
180 0.14
181 0.11
182 0.1
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.08
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.03
204 0.04
205 0.04
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.11
210 0.12
211 0.18
212 0.18
213 0.19
214 0.18
215 0.21
216 0.3
217 0.28
218 0.3
219 0.24
220 0.24
221 0.24
222 0.24
223 0.21
224 0.14
225 0.2
226 0.2
227 0.24
228 0.33
229 0.42
230 0.5
231 0.59
232 0.67
233 0.71
234 0.8
235 0.86
236 0.89
237 0.85
238 0.81
239 0.76
240 0.74
241 0.71
242 0.69
243 0.66