FuNGI

A0A4S4KCF6

Protein Details

Accession

A0A4S4KCF6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
111-141	FKRRDARESILKQRKEKREKGKERANAAQQE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
116-134	ARESILKQRKEKREKGKER

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto 8, pero 5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2 PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

VEDALHKMRNSRNSALTLKDFEDELAAVALVRALPMEYSSFRSALLLLTNFDFKTVKDAFLQEQKNRQPHAADSALALSSAHKVSTPAKPSSQSIVCEFCDIKGHTEAQCFKRRDARESILKQRKEKREKGKERANAAQQETSASAPTSVQSAEFAGNASTHDYTNPHSPLLSDAGSDWIVDTGATCHMTPHRHWFNTYTPNHTPIQLANNQIIYSVGLGSYKSNNESKPSSPPEKVELWEEKAEQAAGLIYQKLEHGMQILVQKYMDDPIKMWGELEKMQHQDNPASRFIAYDQFFSITKKEDESLTALTARVEDALHKMRNSRNSALTLKDFEDELAAVALVRALPMEYSSFRSALLLLTNFDFKTVKDAFLQEQKYWIYMILSLSAASSTRDDKGGEYMPREWDQFCNSEGIHRQHTIRAEPHQNGVAERANRTLVEGITTMLNEAHLPATFWWDAVAAFVHVHNRSPTSAVQGKTPFELWHKSKPDVSHFRVFGCTSYVHVKKDLRRQLESHTQKCVFLGYPAHFKGWTFWNPITCKEVISDSAQFDERVFPGNSRTPVDLQVPSPPETSNPIDPIEQVGVESNSDDDDTVPLPPLPDSPATPTMPPPQNSPPPVTPVTPAHPSTKRERSPSDLPPESAKKPKVQSSAPEWRPRSRPLTSFRDALINPLMDYPGRRIPRPAPEIHPAPQPAPVSDTEPVQVQQSDEEDRDELDLMSEDEMQAEALMFTGLMDFGANAGLEDQYIAFEDAFDYVFKSTNHFQHVFSAEVRKQHGPEPYQWKDIRGRPDAHLWEQAAMEEFISLVENGTFTPVRLPSDRKTIGCRWVFKLKRKADGSVDRYKARLVAKGFSQRPGLEFSQVFAPTAKWAALRAILALAALEDLELYSIDISTAFLNGDLDHDVYMDQPEGFEEYYGAGFVLKLVKAIYGLKQAGRQWHKKLDSVLKGMGFTLVHCDNSIWVYRREDVRIIIPVYVDDMTIAAKSKDQYLFVKEELEKHFKLHDLGPTSFLLGVRVERDRSKRLLSLSQRQYIIDILERFEMSNCTTVTTPLPDGHRLSKAMAPKDAEEIAFMKTVPYRQLVGALMYLAVATRPDISYAVGVLARFSSNPGPGHWKAAKHLCRYLQGTKDMKLTYAPDPHAPELFTTFSDADHGGDEDNRRSTSGMVVKMGTGAISWASRLQTIVTLSTTEAEYISAVQSGQEIIWLRNLLSEFGYEFTGPSTLYVDNQSALAVARNPEHHGRMKHLDLRHYWLRDVVEAGDIDIKYLPTKSMPADIMTKALGRLKVVEMRGMLGLYD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.56
3	0.54
4	0.49
5	0.44
6	0.39
7	0.34
8	0.28
9	0.25
10	0.19
11	0.15
12	0.12
13	0.1
14	0.08
15	0.07
16	0.08
17	0.06
18	0.06
19	0.05
20	0.05
21	0.05
22	0.06
23	0.1
24	0.12
25	0.17
26	0.2
27	0.2
28	0.2
29	0.21
30	0.2
31	0.18
32	0.21
33	0.17
34	0.16
35	0.18
36	0.21
37	0.2
38	0.22
39	0.2
40	0.16
41	0.22
42	0.22
43	0.22
44	0.22
45	0.26
46	0.29
47	0.38
48	0.46
49	0.44
50	0.52
51	0.59
52	0.63
53	0.63
54	0.61
55	0.55
56	0.5
57	0.52
58	0.45
59	0.37
60	0.3
61	0.29
62	0.26
63	0.22
64	0.19
65	0.12
66	0.13
67	0.14
68	0.12
69	0.11
70	0.14
71	0.19
72	0.27
73	0.32
74	0.34
75	0.38
76	0.41
77	0.44
78	0.49
79	0.48
80	0.43
81	0.41
82	0.41
83	0.37
84	0.38
85	0.35
86	0.28
87	0.31
88	0.29
89	0.29
90	0.28
91	0.31
92	0.3
93	0.37
94	0.44
95	0.44
96	0.52
97	0.51
98	0.52
99	0.58
100	0.59
101	0.58
102	0.59
103	0.6
104	0.61
105	0.66
106	0.73
107	0.74
108	0.76
109	0.78
110	0.8
111	0.82
112	0.82
113	0.84
114	0.84
115	0.86
116	0.9
117	0.91
118	0.91
119	0.88
120	0.85
121	0.84
122	0.81
123	0.77
124	0.71
125	0.63
126	0.53
127	0.47
128	0.41
129	0.33
130	0.25
131	0.18
132	0.14
133	0.12
134	0.12
135	0.11
136	0.1
137	0.1
138	0.09
139	0.1
140	0.11
141	0.1
142	0.11
143	0.1
144	0.09
145	0.1
146	0.12
147	0.12
148	0.11
149	0.13
150	0.14
151	0.17
152	0.24
153	0.25
154	0.23
155	0.22
156	0.22
157	0.23
158	0.25
159	0.22
160	0.14
161	0.13
162	0.16
163	0.16
164	0.15
165	0.12
166	0.09
167	0.08
168	0.08
169	0.08
170	0.06
171	0.09
172	0.1
173	0.1
174	0.12
175	0.17
176	0.21
177	0.24
178	0.33
179	0.4
180	0.41
181	0.43
182	0.45
183	0.49
184	0.55
185	0.55
186	0.53
187	0.47
188	0.49
189	0.48
190	0.44
191	0.38
192	0.31
193	0.35
194	0.31
195	0.3
196	0.29
197	0.29
198	0.27
199	0.25
200	0.23
201	0.16
202	0.12
203	0.09
204	0.07
205	0.06
206	0.07
207	0.09
208	0.12
209	0.13
210	0.17
211	0.21
212	0.22
213	0.27
214	0.3
215	0.31
216	0.37
217	0.43
218	0.46
219	0.45
220	0.46
221	0.46
222	0.45
223	0.44
224	0.42
225	0.4
226	0.38
227	0.38
228	0.36
229	0.31
230	0.29
231	0.27
232	0.2
233	0.15
234	0.1
235	0.08
236	0.08
237	0.08
238	0.07
239	0.08
240	0.08
241	0.1
242	0.1
243	0.09
244	0.09
245	0.09
246	0.11
247	0.16
248	0.17
249	0.16
250	0.15
251	0.15
252	0.14
253	0.19
254	0.18
255	0.14
256	0.13
257	0.18
258	0.2
259	0.2
260	0.2
261	0.17
262	0.18
263	0.21
264	0.25
265	0.25
266	0.25
267	0.26
268	0.28
269	0.29
270	0.32
271	0.34
272	0.34
273	0.31
274	0.3
275	0.28
276	0.26
277	0.26
278	0.28
279	0.23
280	0.2
281	0.19
282	0.2
283	0.21
284	0.21
285	0.21
286	0.17
287	0.17
288	0.18
289	0.18
290	0.17
291	0.18
292	0.2
293	0.2
294	0.17
295	0.17
296	0.16
297	0.15
298	0.14
299	0.12
300	0.09
301	0.08
302	0.08
303	0.12
304	0.19
305	0.21
306	0.22
307	0.29
308	0.35
309	0.44
310	0.5
311	0.51
312	0.5
313	0.54
314	0.57
315	0.56
316	0.54
317	0.49
318	0.44
319	0.39
320	0.34
321	0.28
322	0.25
323	0.19
324	0.15
325	0.12
326	0.1
327	0.08
328	0.07
329	0.08
330	0.06
331	0.06
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.06
336	0.1
337	0.12
338	0.17
339	0.2
340	0.2
341	0.2
342	0.21
343	0.2
344	0.18
345	0.21
346	0.17
347	0.16
348	0.18
349	0.21
350	0.2
351	0.22
352	0.2
353	0.16
354	0.22
355	0.22
356	0.22
357	0.22
358	0.26
359	0.29
360	0.36
361	0.39
362	0.31
363	0.33
364	0.32
365	0.29
366	0.26
367	0.2
368	0.13
369	0.12
370	0.12
371	0.1
372	0.09
373	0.09
374	0.08
375	0.08
376	0.08
377	0.07
378	0.08
379	0.09
380	0.1
381	0.11
382	0.11
383	0.12
384	0.15
385	0.2
386	0.21
387	0.22
388	0.23
389	0.26
390	0.27
391	0.28
392	0.25
393	0.23
394	0.23
395	0.22
396	0.2
397	0.19
398	0.17
399	0.2
400	0.25
401	0.26
402	0.26
403	0.27
404	0.27
405	0.29
406	0.32
407	0.32
408	0.29
409	0.32
410	0.35
411	0.35
412	0.36
413	0.35
414	0.33
415	0.3
416	0.29
417	0.27
418	0.22
419	0.22
420	0.21
421	0.18
422	0.18
423	0.18
424	0.17
425	0.12
426	0.12
427	0.11
428	0.1
429	0.09
430	0.09
431	0.09
432	0.07
433	0.07
434	0.05
435	0.06
436	0.06
437	0.05
438	0.06
439	0.06
440	0.1
441	0.1
442	0.1
443	0.1
444	0.09
445	0.09
446	0.09
447	0.09
448	0.05
449	0.05
450	0.06
451	0.1
452	0.1
453	0.11
454	0.12
455	0.13
456	0.13
457	0.15
458	0.15
459	0.18
460	0.23
461	0.22
462	0.26
463	0.28
464	0.28
465	0.27
466	0.28
467	0.22
468	0.2
469	0.27
470	0.26
471	0.32
472	0.36
473	0.36
474	0.39
475	0.4
476	0.46
477	0.48
478	0.5
479	0.47
480	0.44
481	0.43
482	0.42
483	0.4
484	0.31
485	0.24
486	0.18
487	0.14
488	0.21
489	0.22
490	0.21
491	0.25
492	0.3
493	0.34
494	0.43
495	0.49
496	0.46
497	0.47
498	0.47
499	0.49
500	0.55
501	0.57
502	0.5
503	0.5
504	0.46
505	0.43
506	0.41
507	0.36
508	0.26
509	0.19
510	0.2
511	0.15
512	0.21
513	0.21
514	0.22
515	0.2
516	0.2
517	0.2
518	0.22
519	0.23
520	0.22
521	0.22
522	0.28
523	0.29
524	0.31
525	0.32
526	0.26
527	0.23
528	0.19
529	0.19
530	0.15
531	0.16
532	0.17
533	0.14
534	0.15
535	0.15
536	0.14
537	0.14
538	0.14
539	0.11
540	0.13
541	0.13
542	0.12
543	0.15
544	0.19
545	0.21
546	0.21
547	0.22
548	0.19
549	0.21
550	0.24
551	0.21
552	0.18
553	0.21
554	0.21
555	0.21
556	0.21
557	0.18
558	0.16
559	0.2
560	0.22
561	0.18
562	0.18
563	0.17
564	0.17
565	0.17
566	0.17
567	0.13
568	0.1
569	0.09
570	0.08
571	0.07
572	0.06
573	0.06
574	0.05
575	0.05
576	0.05
577	0.05
578	0.04
579	0.05
580	0.05
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.06
585	0.06
586	0.07
587	0.08
588	0.08
589	0.09
590	0.12
591	0.16
592	0.17
593	0.17
594	0.19
595	0.24
596	0.28
597	0.28
598	0.29
599	0.3
600	0.35
601	0.37
602	0.38
603	0.32
604	0.32
605	0.33
606	0.29
607	0.26
608	0.23
609	0.24
610	0.24
611	0.25
612	0.26
613	0.28
614	0.31
615	0.36
616	0.43
617	0.43
618	0.44
619	0.45
620	0.46
621	0.48
622	0.51
623	0.52
624	0.44
625	0.41
626	0.41
627	0.43
628	0.39
629	0.39
630	0.35
631	0.32
632	0.34
633	0.39
634	0.39
635	0.36
636	0.37
637	0.39
638	0.48
639	0.48
640	0.52
641	0.49
642	0.5
643	0.51
644	0.52
645	0.49
646	0.42
647	0.43
648	0.42
649	0.47
650	0.45
651	0.43
652	0.39
653	0.38
654	0.34
655	0.3
656	0.25
657	0.17
658	0.15
659	0.13
660	0.13
661	0.09
662	0.1
663	0.1
664	0.15
665	0.16
666	0.16
667	0.19
668	0.23
669	0.32
670	0.36
671	0.36
672	0.34
673	0.38
674	0.4
675	0.39
676	0.39
677	0.32
678	0.28
679	0.29
680	0.24
681	0.19
682	0.18
683	0.17
684	0.16
685	0.15
686	0.15
687	0.12
688	0.12
689	0.12
690	0.11
691	0.11
692	0.08
693	0.08
694	0.09
695	0.1
696	0.1
697	0.1
698	0.1
699	0.09
700	0.1
701	0.09
702	0.07
703	0.06
704	0.06
705	0.05
706	0.06
707	0.06
708	0.05
709	0.05
710	0.05
711	0.04
712	0.04
713	0.04
714	0.03
715	0.03
716	0.03
717	0.02
718	0.02
719	0.03
720	0.02
721	0.02
722	0.02
723	0.02
724	0.02
725	0.03
726	0.03
727	0.03
728	0.03
729	0.03
730	0.03
731	0.03
732	0.03
733	0.03
734	0.04
735	0.04
736	0.04
737	0.04
738	0.04
739	0.05
740	0.05
741	0.05
742	0.05
743	0.05
744	0.08
745	0.08
746	0.12
747	0.15
748	0.18
749	0.24
750	0.24
751	0.24
752	0.27
753	0.29
754	0.27
755	0.24
756	0.27
757	0.23
758	0.25
759	0.27
760	0.25
761	0.24
762	0.26
763	0.31
764	0.28
765	0.33
766	0.4
767	0.4
768	0.46
769	0.45
770	0.44
771	0.45
772	0.48
773	0.48
774	0.44
775	0.43
776	0.38
777	0.45
778	0.45
779	0.4
780	0.39
781	0.32
782	0.28
783	0.25
784	0.23
785	0.17
786	0.13
787	0.1
788	0.07
789	0.06
790	0.05
791	0.05
792	0.05
793	0.04
794	0.04
795	0.04
796	0.04
797	0.07
798	0.07
799	0.06
800	0.09
801	0.1
802	0.13
803	0.15
804	0.2
805	0.2
806	0.3
807	0.33
808	0.31
809	0.37
810	0.38
811	0.44
812	0.45
813	0.46
814	0.42
815	0.49
816	0.54
817	0.57
818	0.63
819	0.58
820	0.62
821	0.61
822	0.6
823	0.58
824	0.61
825	0.59
826	0.58
827	0.57
828	0.49
829	0.47
830	0.44
831	0.4
832	0.32
833	0.31
834	0.23
835	0.22
836	0.26
837	0.35
838	0.36
839	0.34
840	0.35
841	0.31
842	0.3
843	0.33
844	0.28
845	0.23
846	0.22
847	0.2
848	0.22
849	0.22
850	0.21
851	0.16
852	0.15
853	0.12
854	0.13
855	0.13
856	0.08
857	0.09
858	0.09
859	0.1
860	0.1
861	0.09
862	0.08
863	0.08
864	0.07
865	0.06
866	0.05
867	0.03
868	0.03
869	0.03
870	0.02
871	0.02
872	0.03
873	0.03
874	0.03
875	0.03
876	0.03
877	0.03
878	0.03
879	0.04
880	0.04
881	0.05
882	0.05
883	0.05
884	0.05
885	0.05
886	0.06
887	0.07
888	0.07
889	0.06
890	0.07
891	0.06
892	0.07
893	0.07
894	0.07
895	0.06
896	0.05
897	0.06
898	0.07
899	0.07
900	0.07
901	0.06
902	0.06
903	0.07
904	0.07
905	0.06
906	0.05
907	0.04
908	0.05
909	0.08
910	0.07
911	0.07
912	0.07
913	0.08
914	0.09
915	0.11
916	0.12
917	0.16
918	0.17
919	0.18
920	0.22
921	0.25
922	0.33
923	0.39
924	0.44
925	0.44
926	0.52
927	0.53
928	0.52
929	0.57
930	0.57
931	0.54
932	0.51
933	0.48
934	0.4
935	0.37
936	0.34
937	0.29
938	0.19
939	0.14
940	0.15
941	0.13
942	0.12
943	0.13
944	0.13
945	0.12
946	0.14
947	0.18
948	0.16
949	0.18
950	0.21
951	0.25
952	0.28
953	0.3
954	0.3
955	0.27
956	0.27
957	0.28
958	0.26
959	0.23
960	0.2
961	0.17
962	0.17
963	0.15
964	0.12
965	0.07
966	0.07
967	0.07
968	0.07
969	0.08
970	0.06
971	0.08
972	0.09
973	0.14
974	0.16
975	0.19
976	0.21
977	0.25
978	0.28
979	0.26
980	0.32
981	0.27
982	0.32
983	0.35
984	0.39
985	0.34
986	0.32
987	0.34
988	0.3
989	0.31
990	0.28
991	0.28
992	0.28
993	0.28
994	0.29
995	0.27
996	0.26
997	0.25
998	0.22
999	0.17
1000	0.12
1001	0.12
1002	0.13
1003	0.16
1004	0.18
1005	0.23
1006	0.28
1007	0.32
1008	0.35
1009	0.38
1010	0.38
1011	0.4
1012	0.46
1013	0.49
1014	0.54
1015	0.56
1016	0.58
1017	0.55
1018	0.51
1019	0.48
1020	0.4
1021	0.33
1022	0.28
1023	0.22
1024	0.18
1025	0.18
1026	0.18
1027	0.18
1028	0.17
1029	0.17
1030	0.13
1031	0.17
1032	0.15
1033	0.15
1034	0.15
1035	0.17
1036	0.18
1037	0.19
1038	0.19
1039	0.19
1040	0.22
1041	0.24
1042	0.27
1043	0.3
1044	0.31
1045	0.29
1046	0.3
1047	0.3
1048	0.34
1049	0.34
1050	0.34
1051	0.32
1052	0.3
1053	0.33
1054	0.31
1055	0.27
1056	0.22
1057	0.2
1058	0.17
1059	0.15
1060	0.14
1061	0.12
1062	0.13
1063	0.15
1064	0.16
1065	0.17
1066	0.18
1067	0.17
1068	0.21
1069	0.2
1070	0.19
1071	0.17
1072	0.15
1073	0.12
1074	0.1
1075	0.1
1076	0.06
1077	0.06
1078	0.05
1079	0.05
1080	0.06
1081	0.07
1082	0.08
1083	0.09
1084	0.1
1085	0.1
1086	0.1
1087	0.11
1088	0.1
1089	0.1
1090	0.09
1091	0.1
1092	0.09
1093	0.09
1094	0.12
1095	0.13
1096	0.17
1097	0.18
1098	0.2
1099	0.27
1100	0.28
1101	0.36
1102	0.37
1103	0.36
1104	0.39
1105	0.48
1106	0.54
1107	0.51
1108	0.57
1109	0.54
1110	0.57
1111	0.6
1112	0.61
1113	0.57
1114	0.58
1115	0.56
1116	0.52
1117	0.53
1118	0.47
1119	0.41
1120	0.37
1121	0.34
1122	0.32
1123	0.35
1124	0.34
1125	0.33
1126	0.38
1127	0.39
1128	0.38
1129	0.35
1130	0.3
1131	0.26
1132	0.25
1133	0.2
1134	0.19
1135	0.17
1136	0.15
1137	0.17
1138	0.16
1139	0.14
1140	0.13
1141	0.13
1142	0.11
1143	0.14
1144	0.17
1145	0.19
1146	0.22
1147	0.22
1148	0.22
1149	0.22
1150	0.22
1151	0.26
1152	0.29
1153	0.28
1154	0.26
1155	0.26
1156	0.25
1157	0.25
1158	0.25
1159	0.17
1160	0.1
1161	0.08
1162	0.08
1163	0.07
1164	0.08
1165	0.1
1166	0.11
1167	0.12
1168	0.12
1169	0.12
1170	0.14
1171	0.15
1172	0.16
1173	0.15
1174	0.15
1175	0.15
1176	0.16
1177	0.15
1178	0.12
1179	0.11
1180	0.09
1181	0.09
1182	0.09
1183	0.09
1184	0.08
1185	0.08
1186	0.07
1187	0.08
1188	0.08
1189	0.07
1190	0.1
1191	0.11
1192	0.12
1193	0.16
1194	0.17
1195	0.16
1196	0.19
1197	0.2
1198	0.17
1199	0.16
1200	0.17
1201	0.14
1202	0.14
1203	0.16
1204	0.12
1205	0.12
1206	0.12
1207	0.12
1208	0.11
1209	0.1
1210	0.12
1211	0.11
1212	0.12
1213	0.15
1214	0.15
1215	0.15
1216	0.15
1217	0.14
1218	0.12
1219	0.12
1220	0.13
1221	0.12
1222	0.14
1223	0.17
1224	0.19
1225	0.24
1226	0.29
1227	0.34
1228	0.39
1229	0.4
1230	0.45
1231	0.49
1232	0.55
1233	0.57
1234	0.57
1235	0.59
1236	0.55
1237	0.6
1238	0.61
1239	0.56
1240	0.5
1241	0.47
1242	0.43
1243	0.37
1244	0.35
1245	0.28
1246	0.23
1247	0.2
1248	0.2
1249	0.21
1250	0.19
1251	0.18
1252	0.17
1253	0.17
1254	0.15
1255	0.16
1256	0.17
1257	0.14
1258	0.17
1259	0.18
1260	0.23
1261	0.24
1262	0.26
1263	0.29
1264	0.29
1265	0.29
1266	0.27
1267	0.26
1268	0.23
1269	0.26
1270	0.25
1271	0.21
1272	0.24
1273	0.26
1274	0.32
1275	0.32
1276	0.33
1277	0.28
1278	0.28
1279	0.28

A0A4S4KCF6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer