Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4LKB5

Protein Details
Accession A0A4S4LKB5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
176-207TPNCKARLHKHCCKNYRKSKSTCPACRRQWNVHydrophilic
273-303MTQTQNKNGKGKKSTKKTKGRAKRDATPESDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
280-296NGKGKKSTKKTKGRAKR
Subcellular Location(s) mito 19, nucl 6.5, cyto_nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011513  Nse1  
IPR014857  Nse1_RING_C4HC3-type  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF07574  SMC_Nse1  
PF08746  zf-RING-like  
Amino Acid Sequences MVSTKVHSNDIYRLFLQAAMSRRVMTESVSKKLWQLCTEAVAKADPTKNIQPGNSQNEWNLFIDKITRMLDPLSLEFRIFTDELTGERMYAIVNAKGDEVAQLASDYNPVEIAFFKAIVEQIVIAPNNAFSVSSLAALREIAHLKTSMTKAQGEVTLASFVARGWLIVTKGFVCATPNCKARLHKHCCKNYRKSKSTCPACRRQWNVDENENEDEALRPIGEAAVKDGQDERRRTRHTSGGDGDDDGDIDESYDMNQTQPSQTQSQSQSQSQMTQTQNKNGKGKKSTKKTKGRAKRDATPESDEEVDDMFEDDTMDIDNLTRIREPASRLHRRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.28
4 0.25
5 0.25
6 0.25
7 0.26
8 0.25
9 0.24
10 0.25
11 0.24
12 0.21
13 0.26
14 0.27
15 0.31
16 0.32
17 0.33
18 0.35
19 0.41
20 0.44
21 0.36
22 0.36
23 0.33
24 0.35
25 0.37
26 0.33
27 0.28
28 0.24
29 0.23
30 0.25
31 0.26
32 0.23
33 0.27
34 0.32
35 0.36
36 0.38
37 0.38
38 0.4
39 0.45
40 0.51
41 0.48
42 0.44
43 0.4
44 0.4
45 0.42
46 0.35
47 0.28
48 0.21
49 0.18
50 0.19
51 0.18
52 0.18
53 0.17
54 0.16
55 0.15
56 0.15
57 0.17
58 0.16
59 0.17
60 0.17
61 0.16
62 0.16
63 0.15
64 0.15
65 0.17
66 0.15
67 0.12
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.15
72 0.15
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.09
77 0.11
78 0.12
79 0.1
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.09
86 0.08
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.08
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.05
108 0.06
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.07
117 0.04
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.08
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.13
133 0.14
134 0.14
135 0.15
136 0.15
137 0.15
138 0.16
139 0.17
140 0.14
141 0.13
142 0.11
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.07
147 0.05
148 0.06
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.1
162 0.13
163 0.19
164 0.21
165 0.23
166 0.26
167 0.31
168 0.38
169 0.47
170 0.52
171 0.55
172 0.62
173 0.68
174 0.75
175 0.79
176 0.81
177 0.81
178 0.83
179 0.83
180 0.79
181 0.8
182 0.81
183 0.82
184 0.81
185 0.78
186 0.78
187 0.77
188 0.81
189 0.76
190 0.73
191 0.7
192 0.67
193 0.64
194 0.61
195 0.54
196 0.48
197 0.45
198 0.38
199 0.3
200 0.23
201 0.19
202 0.13
203 0.11
204 0.08
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.07
209 0.06
210 0.09
211 0.12
212 0.12
213 0.13
214 0.16
215 0.22
216 0.28
217 0.34
218 0.37
219 0.42
220 0.47
221 0.52
222 0.54
223 0.54
224 0.51
225 0.53
226 0.5
227 0.46
228 0.42
229 0.37
230 0.33
231 0.25
232 0.21
233 0.14
234 0.11
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.09
245 0.11
246 0.14
247 0.18
248 0.2
249 0.21
250 0.27
251 0.31
252 0.37
253 0.39
254 0.38
255 0.4
256 0.38
257 0.4
258 0.36
259 0.39
260 0.36
261 0.41
262 0.43
263 0.47
264 0.54
265 0.56
266 0.63
267 0.6
268 0.64
269 0.65
270 0.71
271 0.73
272 0.76
273 0.81
274 0.83
275 0.88
276 0.9
277 0.91
278 0.92
279 0.92
280 0.92
281 0.88
282 0.87
283 0.86
284 0.83
285 0.78
286 0.73
287 0.65
288 0.58
289 0.51
290 0.42
291 0.33
292 0.26
293 0.2
294 0.14
295 0.12
296 0.09
297 0.07
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.07
303 0.06
304 0.07
305 0.1
306 0.1
307 0.13
308 0.14
309 0.13
310 0.17
311 0.21
312 0.25
313 0.31
314 0.41