Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4LDS8

Protein Details
Accession A0A4S4LDS8    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
343-376MTDVKGKEEDKKKKDNKPKDTKPQQQQQQAQSAFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
284-305GSGRGGGRGPGRGRGGRGGRGR
352-361DKKKKDNKPK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MQTRSNASLINSFNSVLHPDNNLFFVPYQTYHHRQVHRTLLNWHNNKRQHPLHVDQALQDLQYLFPSATVHARNKLDMSVDVAKTFANVPKFAEDGSNYTIFSTHITLAIRAAKGSFALTRVPNPVQQDEVEKDEQLLNTITFVMLEALKAHYDIKSMASVAITKAHLFMIECKNDKHFNKTLDKIKQTKERLDNLSHAINDASYISAIVKATPKAFQSIVDSSTNAIDTYNLINPVAPRRLTPTMLLMALREGHLKHNLLNPVKKSEQANYANNNSNSGKEGGSGRGGGRGPGRGRGGRGGRGRGSNQGSAYSECKCYNCGGKDHYSKMCPSPKRDQANEAMTDVKGKEEDKKKKDNKPKDTKPQQQQQQAQSAFIEEITDETAWSAQTDQHICIDAFNSGASLHLTPEKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.25
3 0.21
4 0.21
5 0.22
6 0.23
7 0.23
8 0.25
9 0.23
10 0.21
11 0.19
12 0.19
13 0.19
14 0.18
15 0.23
16 0.29
17 0.34
18 0.42
19 0.5
20 0.54
21 0.56
22 0.62
23 0.66
24 0.64
25 0.61
26 0.61
27 0.63
28 0.66
29 0.7
30 0.7
31 0.69
32 0.7
33 0.72
34 0.73
35 0.68
36 0.67
37 0.66
38 0.64
39 0.64
40 0.62
41 0.58
42 0.5
43 0.48
44 0.4
45 0.32
46 0.28
47 0.19
48 0.14
49 0.13
50 0.13
51 0.09
52 0.08
53 0.09
54 0.1
55 0.15
56 0.2
57 0.23
58 0.29
59 0.31
60 0.32
61 0.32
62 0.32
63 0.28
64 0.23
65 0.26
66 0.26
67 0.25
68 0.23
69 0.22
70 0.2
71 0.19
72 0.21
73 0.19
74 0.15
75 0.15
76 0.17
77 0.19
78 0.2
79 0.19
80 0.2
81 0.17
82 0.18
83 0.21
84 0.2
85 0.18
86 0.17
87 0.17
88 0.15
89 0.15
90 0.14
91 0.1
92 0.12
93 0.12
94 0.13
95 0.15
96 0.18
97 0.17
98 0.15
99 0.15
100 0.12
101 0.12
102 0.13
103 0.12
104 0.09
105 0.13
106 0.14
107 0.17
108 0.21
109 0.22
110 0.24
111 0.27
112 0.27
113 0.24
114 0.24
115 0.26
116 0.23
117 0.27
118 0.24
119 0.21
120 0.21
121 0.21
122 0.2
123 0.17
124 0.16
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.08
129 0.06
130 0.07
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.08
139 0.07
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.08
147 0.09
148 0.08
149 0.11
150 0.1
151 0.09
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.15
157 0.18
158 0.22
159 0.23
160 0.23
161 0.27
162 0.33
163 0.34
164 0.35
165 0.34
166 0.36
167 0.42
168 0.47
169 0.52
170 0.52
171 0.58
172 0.56
173 0.58
174 0.6
175 0.58
176 0.59
177 0.57
178 0.56
179 0.54
180 0.5
181 0.47
182 0.4
183 0.38
184 0.3
185 0.24
186 0.18
187 0.13
188 0.11
189 0.09
190 0.06
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.07
198 0.08
199 0.09
200 0.11
201 0.11
202 0.13
203 0.13
204 0.13
205 0.15
206 0.16
207 0.18
208 0.17
209 0.16
210 0.15
211 0.15
212 0.14
213 0.1
214 0.08
215 0.06
216 0.06
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.09
222 0.1
223 0.14
224 0.16
225 0.15
226 0.14
227 0.2
228 0.22
229 0.23
230 0.23
231 0.21
232 0.19
233 0.2
234 0.19
235 0.13
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.09
240 0.09
241 0.11
242 0.14
243 0.15
244 0.16
245 0.21
246 0.27
247 0.31
248 0.35
249 0.34
250 0.37
251 0.37
252 0.39
253 0.36
254 0.33
255 0.37
256 0.38
257 0.42
258 0.41
259 0.45
260 0.49
261 0.47
262 0.47
263 0.38
264 0.33
265 0.29
266 0.26
267 0.21
268 0.15
269 0.17
270 0.14
271 0.15
272 0.16
273 0.14
274 0.17
275 0.17
276 0.17
277 0.17
278 0.21
279 0.21
280 0.25
281 0.29
282 0.26
283 0.28
284 0.34
285 0.36
286 0.38
287 0.42
288 0.42
289 0.41
290 0.44
291 0.44
292 0.44
293 0.45
294 0.4
295 0.36
296 0.33
297 0.31
298 0.29
299 0.3
300 0.24
301 0.24
302 0.22
303 0.22
304 0.21
305 0.22
306 0.28
307 0.29
308 0.32
309 0.34
310 0.41
311 0.47
312 0.51
313 0.53
314 0.49
315 0.48
316 0.52
317 0.55
318 0.53
319 0.53
320 0.58
321 0.62
322 0.67
323 0.68
324 0.65
325 0.64
326 0.64
327 0.59
328 0.5
329 0.43
330 0.34
331 0.34
332 0.28
333 0.21
334 0.17
335 0.16
336 0.24
337 0.33
338 0.43
339 0.48
340 0.59
341 0.67
342 0.76
343 0.86
344 0.87
345 0.88
346 0.89
347 0.92
348 0.92
349 0.94
350 0.94
351 0.93
352 0.93
353 0.91
354 0.9
355 0.87
356 0.83
357 0.82
358 0.73
359 0.64
360 0.53
361 0.46
362 0.36
363 0.27
364 0.2
365 0.1
366 0.1
367 0.11
368 0.1
369 0.08
370 0.09
371 0.1
372 0.09
373 0.1
374 0.1
375 0.1
376 0.17
377 0.19
378 0.2
379 0.21
380 0.24
381 0.23
382 0.24
383 0.23
384 0.17
385 0.15
386 0.13
387 0.11
388 0.08
389 0.09
390 0.1
391 0.09
392 0.11