Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4LC09

Protein Details
Accession A0A4S4LC09    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-34LEEARNPPPRRRQETPGSDDHydrophilic
667-686SLQPLLSPYRRERRRQLSPGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 9.5, cyto 7.5, mito 3, plas 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
IPR003903  UIM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50330  UIM  
Amino Acid Sequences MDEDEELRRAIELSLEEARNPPPRRRQETPGSDDDDDDDDDAEAQFQRDLEAAIKASKQGAPQPSAHGRHSDSTSGLPAPTTTRPVIAEAADGGARTRAAAAATAAARADDFKRTREEGEAQQQPGAAPAKRQRHSPPVEVELSQESASACSEARAGASSSTSALYWEGELRQTANRLVDKDKDTRPVFRLSEILGPKSDIAFAILSSYSNMVSWLYDFFDQRTPIVIINQSEDGNAGVVELAPNMLMTKPFLRGGRGCMHIKLILSVWLQDIPMRPTPVRHDDDGKASDFPGTLERVLHSLNVPAALTKFIDGDFANMPIEALSELGMRWDWTKVRVKLVASLAGKHEGWDEVERTGHPALMKAVQELGAETPKGKELVLECQGSSIGTYTTEWMNEFHCSARGETAKTWMDKPRSERAKEAWPAVKIVFPSTQTVKDSVLGIAGAGTMFCRKEQWEGKKFPRELFYDSNSKRGRVLMHSKVRLSNRTNDDMSLNLADDRRDVPREGIDGPIDIGGEGGGCGGGVGIVNYEMGIVIALQSEEEAERVACWRRPARNAMAPSRSLLPSSRFSTMPHQHPHSHPHHELSRHLPRTAPIAVAAQDVINPRILDASIRDVCERLSSEQKAEVLIHAMNLLKLAKYLLLFFSFSLSLSLSLALSHSPFSPSLQPLLSPYRRERRRQLSPG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.23
4 0.25
5 0.31
6 0.37
7 0.41
8 0.46
9 0.49
10 0.59
11 0.67
12 0.71
13 0.75
14 0.76
15 0.81
16 0.8
17 0.76
18 0.72
19 0.64
20 0.58
21 0.52
22 0.43
23 0.34
24 0.27
25 0.2
26 0.13
27 0.13
28 0.12
29 0.12
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.11
37 0.11
38 0.13
39 0.14
40 0.15
41 0.16
42 0.17
43 0.19
44 0.2
45 0.22
46 0.26
47 0.32
48 0.33
49 0.34
50 0.41
51 0.47
52 0.49
53 0.49
54 0.46
55 0.43
56 0.44
57 0.46
58 0.4
59 0.33
60 0.3
61 0.31
62 0.27
63 0.24
64 0.19
65 0.17
66 0.19
67 0.2
68 0.22
69 0.2
70 0.21
71 0.22
72 0.24
73 0.25
74 0.21
75 0.19
76 0.14
77 0.15
78 0.13
79 0.12
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.08
84 0.08
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.11
90 0.11
91 0.12
92 0.11
93 0.1
94 0.1
95 0.12
96 0.13
97 0.17
98 0.19
99 0.21
100 0.27
101 0.3
102 0.32
103 0.35
104 0.38
105 0.37
106 0.45
107 0.49
108 0.44
109 0.42
110 0.41
111 0.35
112 0.35
113 0.32
114 0.23
115 0.23
116 0.31
117 0.4
118 0.41
119 0.47
120 0.5
121 0.56
122 0.61
123 0.61
124 0.59
125 0.55
126 0.56
127 0.5
128 0.45
129 0.37
130 0.33
131 0.26
132 0.2
133 0.15
134 0.13
135 0.13
136 0.11
137 0.09
138 0.07
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.09
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.09
156 0.1
157 0.11
158 0.12
159 0.13
160 0.15
161 0.17
162 0.2
163 0.21
164 0.23
165 0.26
166 0.3
167 0.33
168 0.38
169 0.39
170 0.43
171 0.43
172 0.46
173 0.46
174 0.47
175 0.43
176 0.38
177 0.36
178 0.29
179 0.34
180 0.31
181 0.29
182 0.23
183 0.22
184 0.21
185 0.2
186 0.18
187 0.1
188 0.1
189 0.08
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.1
206 0.11
207 0.15
208 0.16
209 0.15
210 0.17
211 0.17
212 0.16
213 0.17
214 0.18
215 0.15
216 0.16
217 0.18
218 0.15
219 0.14
220 0.13
221 0.11
222 0.09
223 0.08
224 0.05
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.04
234 0.04
235 0.06
236 0.07
237 0.09
238 0.12
239 0.13
240 0.16
241 0.17
242 0.21
243 0.25
244 0.29
245 0.29
246 0.26
247 0.27
248 0.25
249 0.24
250 0.2
251 0.16
252 0.14
253 0.13
254 0.13
255 0.12
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.13
260 0.13
261 0.15
262 0.17
263 0.17
264 0.18
265 0.24
266 0.3
267 0.31
268 0.3
269 0.32
270 0.31
271 0.36
272 0.36
273 0.31
274 0.24
275 0.21
276 0.2
277 0.15
278 0.14
279 0.11
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.05
299 0.07
300 0.07
301 0.09
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.08
307 0.06
308 0.06
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.05
318 0.07
319 0.07
320 0.12
321 0.2
322 0.21
323 0.24
324 0.27
325 0.27
326 0.29
327 0.3
328 0.31
329 0.24
330 0.23
331 0.21
332 0.21
333 0.2
334 0.16
335 0.15
336 0.09
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.09
341 0.1
342 0.09
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.09
347 0.09
348 0.1
349 0.12
350 0.13
351 0.1
352 0.11
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.09
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.14
367 0.18
368 0.18
369 0.17
370 0.17
371 0.17
372 0.15
373 0.14
374 0.09
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.08
383 0.09
384 0.09
385 0.1
386 0.09
387 0.11
388 0.12
389 0.12
390 0.16
391 0.16
392 0.17
393 0.17
394 0.23
395 0.23
396 0.23
397 0.26
398 0.28
399 0.31
400 0.33
401 0.38
402 0.42
403 0.47
404 0.47
405 0.48
406 0.45
407 0.5
408 0.49
409 0.5
410 0.44
411 0.37
412 0.37
413 0.33
414 0.31
415 0.22
416 0.22
417 0.18
418 0.15
419 0.17
420 0.18
421 0.2
422 0.19
423 0.2
424 0.19
425 0.18
426 0.17
427 0.14
428 0.12
429 0.09
430 0.08
431 0.06
432 0.05
433 0.04
434 0.03
435 0.03
436 0.05
437 0.05
438 0.06
439 0.07
440 0.08
441 0.16
442 0.25
443 0.34
444 0.42
445 0.5
446 0.58
447 0.66
448 0.67
449 0.63
450 0.6
451 0.54
452 0.51
453 0.48
454 0.44
455 0.45
456 0.43
457 0.49
458 0.45
459 0.42
460 0.37
461 0.35
462 0.33
463 0.31
464 0.39
465 0.39
466 0.47
467 0.5
468 0.51
469 0.55
470 0.57
471 0.56
472 0.51
473 0.51
474 0.47
475 0.49
476 0.47
477 0.42
478 0.39
479 0.32
480 0.3
481 0.22
482 0.17
483 0.13
484 0.13
485 0.12
486 0.12
487 0.14
488 0.15
489 0.17
490 0.17
491 0.17
492 0.19
493 0.21
494 0.2
495 0.21
496 0.18
497 0.15
498 0.15
499 0.13
500 0.11
501 0.08
502 0.07
503 0.05
504 0.04
505 0.04
506 0.03
507 0.03
508 0.02
509 0.02
510 0.02
511 0.02
512 0.02
513 0.02
514 0.03
515 0.03
516 0.03
517 0.03
518 0.03
519 0.03
520 0.03
521 0.03
522 0.03
523 0.03
524 0.03
525 0.03
526 0.03
527 0.03
528 0.04
529 0.04
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.06
534 0.09
535 0.14
536 0.16
537 0.23
538 0.3
539 0.36
540 0.42
541 0.49
542 0.54
543 0.58
544 0.62
545 0.63
546 0.61
547 0.55
548 0.51
549 0.49
550 0.41
551 0.34
552 0.31
553 0.27
554 0.28
555 0.3
556 0.31
557 0.27
558 0.3
559 0.38
560 0.43
561 0.47
562 0.49
563 0.51
564 0.54
565 0.57
566 0.64
567 0.61
568 0.61
569 0.56
570 0.55
571 0.57
572 0.54
573 0.55
574 0.55
575 0.58
576 0.53
577 0.51
578 0.46
579 0.41
580 0.43
581 0.4
582 0.31
583 0.22
584 0.21
585 0.21
586 0.2
587 0.19
588 0.13
589 0.14
590 0.16
591 0.15
592 0.15
593 0.14
594 0.14
595 0.14
596 0.14
597 0.14
598 0.13
599 0.21
600 0.21
601 0.23
602 0.24
603 0.23
604 0.23
605 0.26
606 0.26
607 0.23
608 0.29
609 0.3
610 0.31
611 0.35
612 0.35
613 0.33
614 0.3
615 0.26
616 0.21
617 0.18
618 0.16
619 0.14
620 0.14
621 0.12
622 0.13
623 0.13
624 0.1
625 0.11
626 0.11
627 0.11
628 0.11
629 0.13
630 0.14
631 0.15
632 0.16
633 0.16
634 0.18
635 0.16
636 0.16
637 0.15
638 0.13
639 0.12
640 0.12
641 0.12
642 0.09
643 0.09
644 0.09
645 0.09
646 0.09
647 0.1
648 0.11
649 0.12
650 0.13
651 0.16
652 0.22
653 0.23
654 0.26
655 0.25
656 0.25
657 0.28
658 0.37
659 0.4
660 0.4
661 0.47
662 0.55
663 0.62
664 0.7
665 0.76
666 0.76